Genes within 1Mb (chr6:138988684:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.88e-01 0.025 0.0928 0.186 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00838 0.0708 0.186 B L1
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 8.89e-01 0.00992 0.0707 0.186 B L1
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 3.91e-02 -0.185 0.0894 0.186 B L1
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 4.08e-02 -0.163 0.079 0.186 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 3.06e-02 -0.101 0.0463 0.186 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0824 0.115 0.186 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 6.21e-01 0.0357 0.0723 0.186 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0774 0.0803 0.186 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 6.68e-01 0.0441 0.103 0.186 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 7.55e-01 0.0216 0.069 0.186 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 8.24e-01 0.0145 0.0651 0.186 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.55e-01 -0.122 0.0854 0.186 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 2.62e-01 0.0756 0.0672 0.186 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 4.76e-02 -0.0977 0.049 0.186 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 7.08e-01 0.0317 0.0844 0.186 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 8.58e-01 0.015 0.0833 0.186 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 2.53e-01 0.128 0.112 0.186 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0253 0.0734 0.186 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 8.83e-01 -0.011 0.0748 0.186 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0628 0.0802 0.186 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 2.21e-01 0.0924 0.0753 0.186 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0645 0.0428 0.186 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 3.55e-01 0.0755 0.0815 0.186 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 8.72e-01 -0.016 0.0992 0.186 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0204 0.115 0.182 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 5.27e-01 -0.051 0.0805 0.182 DC L1
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 3.46e-01 -0.089 0.0942 0.182 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 9.11e-01 0.0118 0.105 0.182 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 4.28e-01 0.0737 0.0928 0.182 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 2.41e-01 0.107 0.0907 0.182 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0359 0.108 0.182 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 6.38e-02 -0.203 0.109 0.182 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 9.91e-01 0.000972 0.0823 0.186 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0295 0.0569 0.186 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.12e-01 -0.119 0.0747 0.186 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 1.71e-01 0.147 0.107 0.186 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0527 0.0629 0.186 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 8.74e-01 -0.013 0.082 0.186 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 6.86e-02 0.158 0.0861 0.186 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 2.26e-01 -0.135 0.112 0.186 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 4.04e-02 0.206 0.0999 0.187 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 9.09e-01 0.0102 0.0889 0.187 NK L1
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 5.80e-02 0.143 0.0748 0.187 NK L1
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0589 0.0871 0.187 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0503 0.083 0.187 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 6.21e-01 -0.03 0.0606 0.187 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 2.39e-01 0.0949 0.0803 0.187 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0679 0.119 0.186 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0487 0.0771 0.186 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 4.29e-01 0.0753 0.0951 0.186 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0611 0.0865 0.186 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0561 0.093 0.186 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0306 0.0609 0.186 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 3.38e-01 0.0684 0.0712 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.39e-01 0.045 0.135 0.189 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 2.69e-01 0.131 0.118 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 6.51e-02 -0.113 0.0609 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 6.29e-02 -0.239 0.127 0.189 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 8.01e-01 0.034 0.135 0.189 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 8.83e-01 0.018 0.122 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 2.08e-01 -0.132 0.104 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 2.24e-01 -0.16 0.131 0.189 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 2.84e-01 -0.141 0.131 0.189 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 1.89e-01 0.151 0.115 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 6.98e-01 -0.031 0.0797 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 9.16e-01 0.0107 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.90e-01 -0.131 0.0993 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.67e-03 -0.276 0.106 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 7.49e-01 0.0293 0.0915 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 2.95e-01 0.117 0.112 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0129 0.103 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 7.95e-01 0.029 0.112 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00821 0.118 0.188 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 3.20e-01 0.0885 0.0887 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0438 0.111 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0653 0.102 0.188 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 1.20e-01 -0.172 0.11 0.188 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 2.36e-01 -0.104 0.0873 0.188 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0553 0.112 0.188 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 4.28e-01 0.0814 0.103 0.188 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 9.57e-01 0.0068 0.126 0.188 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0952 0.111 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 8.29e-01 0.0168 0.0779 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0416 0.106 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.55e-02 -0.233 0.0953 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 6.46e-01 0.0411 0.0894 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0373 0.0625 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 8.83e-01 0.0172 0.117 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 5.17e-01 0.0552 0.0851 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0809 0.112 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 2.96e-01 0.114 0.109 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0225 0.0747 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0333 0.0898 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0917 0.103 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0064 0.0982 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0683 0.0721 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0985 0.114 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 8.27e-01 0.0255 0.117 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 9.39e-02 -0.179 0.106 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0334 0.115 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 1.51e-01 0.143 0.0993 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 2.28e-01 0.147 0.121 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0559 0.117 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.01e-01 0.014 0.113 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00457 0.103 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 3.60e-01 0.095 0.103 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 6.16e-01 0.0537 0.107 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.25e-01 0.0384 0.109 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 7.19e-01 0.0245 0.068 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 3.56e-01 -0.083 0.0896 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.82e-01 -0.113 0.0844 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 2.16e-01 0.0929 0.0749 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0661 0.0504 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 5.26e-01 0.0546 0.0858 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 7.74e-01 -0.025 0.0869 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 2.86e-01 0.112 0.105 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00391 0.0784 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 2.48e-01 -0.114 0.098 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 2.26e-01 -0.102 0.0839 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0608 0.0798 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0797 0.0612 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 5.71e-01 0.0519 0.0913 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 6.40e-01 0.0461 0.0986 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0931 0.119 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 6.34e-01 0.0388 0.0815 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 7.52e-01 -0.03 0.0947 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 6.35e-02 -0.172 0.0923 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 2.18e-01 0.125 0.101 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 1.07e-01 -0.116 0.0719 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0213 0.0949 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 5.27e-01 0.0629 0.0992 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 1.96e-01 0.16 0.123 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0195 0.0884 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0742 0.11 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0326 0.0901 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0637 0.0964 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0947 0.0778 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 5.41e-01 0.0555 0.0908 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0963 0.109 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0436 0.117 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0431 0.0749 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 2.46e-01 -0.104 0.0898 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0653 0.0904 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 1.21e-01 0.14 0.0902 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 3.67e-01 -0.043 0.0475 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 2.52e-01 0.11 0.0959 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0876 0.11 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 4.35e-01 0.103 0.132 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 4.44e-01 0.0714 0.093 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 3.27e-01 0.121 0.123 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0835 0.0967 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.41e-01 0.0075 0.101 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 5.69e-03 -0.275 0.0984 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0768 0.103 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0227 0.109 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 1.55e-01 0.173 0.121 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 2.54e-01 0.126 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0631 0.126 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 8.40e-01 0.0231 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 5.98e-01 0.0627 0.119 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 1.82e-02 -0.215 0.0902 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 5.33e-01 0.062 0.0994 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 2.15e-01 -0.14 0.113 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 2.05e-01 -0.161 0.127 0.186 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 8.03e-01 0.022 0.0882 0.186 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 1.60e-01 0.164 0.116 0.186 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 8.11e-01 0.0231 0.0967 0.186 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0635 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 5.38e-01 0.0472 0.0765 0.186 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0399 0.0901 0.186 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 9.74e-01 0.00396 0.122 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 6.32e-01 0.0496 0.103 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 8.30e-01 0.0239 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0629 0.11 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0646 0.103 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 6.28e-03 -0.257 0.093 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 3.07e-01 0.104 0.101 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 1.27e-01 0.167 0.109 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00547 0.0975 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 1.96e-02 0.203 0.0862 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 9.26e-02 -0.159 0.0938 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 8.60e-01 0.0159 0.0895 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0273 0.0606 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 1.04e-01 0.131 0.0803 0.188 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 9.21e-01 0.0124 0.125 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 4.46e-01 0.0814 0.107 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 9.97e-02 0.156 0.0942 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.78e-01 0.157 0.117 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 6.40e-01 -0.054 0.116 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0769 0.0949 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 2.19e-01 0.125 0.101 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 3.20e-02 0.244 0.113 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0572 0.0983 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 3.34e-01 0.0885 0.0915 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 2.55e-01 -0.112 0.0981 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 6.58e-01 -0.045 0.102 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 6.14e-01 -0.033 0.0654 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 7.36e-01 0.0288 0.0854 0.188 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0476 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0566 0.13 0.193 PB L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0982 0.193 PB L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0257 0.159 0.193 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 3.20e-01 -0.14 0.141 0.193 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.193 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 2.82e-01 0.155 0.144 0.193 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 1.53e-01 -0.155 0.108 0.193 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0766 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 1.96e-01 -0.159 0.123 0.185 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0975 0.0982 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0641 0.0909 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0737 0.0971 0.185 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 1.35e-01 -0.171 0.114 0.185 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 8.25e-01 0.0163 0.0738 0.185 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 2.01e-01 0.113 0.0876 0.185 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.05e-01 0.0436 0.115 0.186 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 9.20e-01 0.00794 0.0785 0.186 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0261 0.123 0.186 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 7.70e-01 0.0279 0.0954 0.186 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 4.88e-01 0.0685 0.0986 0.186 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00236 0.0841 0.186 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 4.74e-01 0.0672 0.0938 0.186 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -250969 sc-eQTL 1.97e-01 0.138 0.107 0.186 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0269 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 1.76e-01 -0.113 0.083 0.185 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0934 0.11 0.185 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 5.27e-01 0.0686 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0357 0.125 0.185 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 2.21e-01 0.125 0.102 0.185 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 8.64e-01 0.0186 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 8.42e-02 -0.206 0.119 0.185 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0819 0.0896 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0335 0.0644 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.77e-01 -0.1 0.0738 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 1.09e-01 0.173 0.107 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 8.94e-02 0.163 0.0958 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 6.45e-01 0.0374 0.0811 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 4.24e-01 0.0678 0.0847 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0887 0.113 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 3.60e-01 0.0956 0.104 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 7.31e-01 0.0245 0.0714 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 2.14e-01 -0.11 0.0879 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0333 0.112 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.00e-03 -0.274 0.104 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 7.55e-01 0.0288 0.0919 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 1.07e-01 0.146 0.0905 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0664 0.122 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 1.46e-01 0.205 0.14 0.176 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 1.08e-01 0.215 0.133 0.176 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 7.97e-01 0.0323 0.125 0.176 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0373 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.65e-01 0.00604 0.139 0.176 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0532 0.104 0.176 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 7.56e-01 0.0375 0.12 0.176 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 8.30e-01 0.0263 0.122 0.184 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 2.30e-01 0.0984 0.0818 0.184 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.95e-01 0.13 0.1 0.184 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 5.65e-01 0.0638 0.111 0.184 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 3.11e-01 -0.116 0.114 0.184 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 4.64e-01 0.0765 0.104 0.184 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 1.31e-01 0.153 0.101 0.184 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0534 0.124 0.184 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 6.06e-01 0.0579 0.112 0.181 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0693 0.0668 0.181 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00164 0.103 0.181 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 9.94e-01 0.000823 0.108 0.181 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0821 0.0811 0.181 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 4.46e-02 -0.196 0.097 0.181 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 4.31e-02 0.167 0.0823 0.181 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0882 0.12 0.181 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 8.54e-01 0.0234 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 5.26e-01 0.0627 0.0987 0.195 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0964 0.107 0.195 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0665 0.0983 0.195 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.43e-01 0.00711 0.0997 0.195 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 1.30e-01 0.165 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 8.98e-02 0.217 0.127 0.195 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 1.34e-01 -0.148 0.0981 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 2.46e-01 0.128 0.11 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 4.82e-01 0.0539 0.0765 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0201 0.101 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 3.82e-02 -0.203 0.0974 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 2.17e-03 -0.31 0.0998 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0404 0.0707 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 8.21e-01 0.0265 0.117 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0242 0.0993 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 6.34e-01 -0.055 0.115 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 6.70e-01 0.044 0.103 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 8.36e-01 0.0148 0.0715 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0514 0.105 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 1.51e-02 -0.233 0.0951 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0167 0.0822 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0475 0.0576 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -303314 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.121 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 5.39e-01 0.054 0.0877 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -282678 sc-eQTL 5.35e-02 -0.198 0.102 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0229 0.0833 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0359 0.0621 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 7.95e-02 -0.131 0.0742 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 2.80e-01 0.118 0.109 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 9.77e-01 0.00257 0.0899 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 5.74e-01 0.045 0.0799 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 2.65e-01 0.0976 0.0873 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0857 0.117 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 7.78e-01 0.032 0.113 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0225 0.0606 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 7.03e-01 0.0369 0.0968 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 296113 sc-eQTL 5.93e-01 0.0577 0.108 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0481 0.067 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0977 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 8.12e-02 0.147 0.084 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 296136 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0312 0.119 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 sc-eQTL 2.91e-02 0.23 0.105 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 585153 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00125 0.092 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 881265 sc-eQTL 1.97e-02 0.18 0.0766 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -146396 sc-eQTL 2.33e-01 -0.108 0.0901 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 423 sc-eQTL 8.03e-01 0.0221 0.0883 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -40061 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0511 0.0569 0.188 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -385964 sc-eQTL 2.81e-01 0.0889 0.0822 0.188 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 215175 eQTL 0.0366 0.0404 0.0193 0.0 0.0 0.184
ENSG00000112378 PERP 881265 eQTL 0.0385 -0.0672 0.0324 0.00106 0.0 0.184
ENSG00000135597 REPS1 423 eQTL 9.18e-24 -0.2 0.0194 0.01 0.0103 0.184
ENSG00000146386 ABRACL -40061 eQTL 0.0149 0.0684 0.0281 0.0 0.0 0.184


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina