logo

Genes within 1Mb (chr6:138979251:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 7.22e-01 0.0314 0.0882 0.231 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0144 0.0673 0.231 B L1
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 3.33e-01 0.0651 0.0671 0.231 B L1
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 1.82e-01 -0.114 0.0854 0.231 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 2.88e-02 -0.165 0.075 0.231 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 6.59e-02 -0.0817 0.0442 0.231 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0564 0.109 0.231 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 3.47e-01 0.0646 0.0686 0.231 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0255 0.0764 0.231 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 1.81e-01 0.131 0.0974 0.231 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.00e-01 0.0254 0.0657 0.231 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0115 0.0619 0.231 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0907 0.0814 0.231 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000921 0.0641 0.231 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 4.28e-02 -0.095 0.0466 0.231 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 6.44e-01 0.0372 0.0803 0.231 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 1.53e-01 0.113 0.0788 0.231 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 2.79e-01 0.115 0.106 0.231 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0372 0.0695 0.231 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00883 0.0708 0.231 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 9.76e-01 0.00225 0.076 0.231 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00187 0.0715 0.231 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0575 0.0405 0.231 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 3.52e-01 0.0719 0.0771 0.231 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 5.90e-01 0.0505 0.0938 0.231 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 6.77e-01 0.0453 0.108 0.227 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.64e-01 -0.023 0.0763 0.227 DC L1
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00884 0.0894 0.227 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 2.42e-01 0.116 0.0992 0.227 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 5.08e-01 0.0583 0.0879 0.227 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 3.35e-01 0.083 0.086 0.227 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00958 0.102 0.227 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 2.75e-01 -0.114 0.104 0.227 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 7.91e-01 0.0207 0.078 0.231 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00538 0.054 0.231 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0827 0.071 0.231 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 4.20e-01 0.0822 0.102 0.231 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0322 0.0597 0.231 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.76e-01 -0.105 0.0774 0.231 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 7.84e-03 0.217 0.0808 0.231 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 7.67e-02 -0.187 0.105 0.231 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 7.34e-02 0.169 0.0941 0.232 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.61e-01 0.0254 0.0835 0.232 NK L1
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 4.25e-02 0.143 0.0702 0.232 NK L1
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 7.74e-01 0.0236 0.0819 0.232 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 7.41e-01 0.0258 0.078 0.232 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0667 0.0568 0.232 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 1.63e-01 0.106 0.0754 0.232 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 8.59e-01 -0.02 0.112 0.231 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0693 0.0725 0.231 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 4.10e-01 0.0739 0.0895 0.231 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0545 0.0813 0.231 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0513 0.0875 0.231 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0298 0.0573 0.231 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 2.76e-01 0.0732 0.0669 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 7.36e-01 0.0433 0.128 0.237 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 2.53e-01 0.128 0.112 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0716 0.0581 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.58e-01 -0.112 0.122 0.237 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0328 0.128 0.237 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 2.92e-01 0.122 0.115 0.237 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0677 0.0989 0.237 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0724 0.124 0.237 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 3.55e-01 -0.115 0.124 0.237 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 3.04e-01 0.112 0.109 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00572 0.0754 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 1.82e-01 0.128 0.0956 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0862 0.0941 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 3.48e-02 -0.214 0.101 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 7.56e-01 0.027 0.0866 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 8.07e-02 0.185 0.105 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0976 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 9.08e-01 0.0122 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 3.13e-01 0.114 0.113 0.233 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 8.78e-01 0.013 0.0849 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 4.16e-01 -0.086 0.106 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0295 0.0975 0.233 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 1.73e-01 -0.144 0.105 0.233 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0564 0.0835 0.233 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0131 0.107 0.233 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 1.40e-01 0.145 0.0975 0.233 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 7.06e-01 0.0455 0.12 0.233 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0673 0.105 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.65e-01 0.022 0.0736 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 4.52e-01 0.0752 0.0997 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 4.74e-02 -0.181 0.0905 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 8.60e-01 0.0149 0.0845 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0175 0.0591 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0158 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 2.64e-01 0.0899 0.0803 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0536 0.106 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 1.05e-01 0.168 0.103 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 8.17e-01 0.0164 0.0709 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 3.36e-01 -0.082 0.0851 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0322 0.0976 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0407 0.0931 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0496 0.0685 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 1.59e-01 -0.153 0.108 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 3.54e-01 0.103 0.111 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 8.34e-02 -0.176 0.101 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0266 0.108 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 4.07e-01 0.0774 0.0931 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0293 0.114 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00178 0.109 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.07e-01 0.0124 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 9.14e-01 0.0104 0.0964 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 6.93e-01 0.0383 0.0968 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 5.67e-01 0.0572 0.0998 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 1.45e-01 0.151 0.103 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 6.82e-01 0.0265 0.0645 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 1.39e-01 -0.126 0.0848 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0925 0.0802 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 7.44e-01 0.0233 0.0714 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0728 0.0478 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 6.09e-01 0.0418 0.0816 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 2.21e-01 0.101 0.0822 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 2.45e-01 0.117 0.1 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 9.21e-01 0.0074 0.075 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0346 0.094 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0796 0.0804 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0821 0.0762 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0792 0.0585 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 4.73e-01 0.0628 0.0873 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 3.75e-01 0.0838 0.0943 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0338 0.114 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 6.65e-01 0.0336 0.0774 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0429 0.09 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 1.67e-01 -0.122 0.0881 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 1.87e-01 0.127 0.096 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.16e-02 -0.172 0.0677 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 9.17e-01 0.00939 0.0902 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 9.41e-01 0.00704 0.0944 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 2.83e-01 0.126 0.117 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0273 0.0839 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0665 0.105 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 4.07e-01 0.0709 0.0854 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 4.01e-01 -0.077 0.0915 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 9.39e-02 -0.124 0.0736 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 2.79e-01 0.0934 0.0861 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0956 0.103 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00637 0.111 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0532 0.0708 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0952 0.0849 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0336 0.0855 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 4.72e-01 0.0618 0.0857 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0419 0.0449 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 1.92e-01 0.119 0.0906 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.104 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 3.51e-01 0.117 0.125 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 6.64e-01 0.0383 0.088 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 1.35e-01 0.174 0.116 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0744 0.0915 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0933 0.095 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 2.20e-03 -0.287 0.0926 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0305 0.0975 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0064 0.103 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 3.50e-01 0.107 0.114 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 9.19e-01 -0.012 0.119 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 4.39e-01 0.0829 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 7.91e-01 0.0296 0.111 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.75e-01 -0.116 0.0855 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 7.92e-02 0.163 0.0926 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0215 0.106 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0782 0.121 0.232 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000143 0.084 0.232 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 4.42e-01 0.0855 0.111 0.232 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 8.05e-01 0.0228 0.092 0.232 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0563 0.099 0.232 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 5.48e-01 0.0438 0.0728 0.232 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 8.87e-01 0.0123 0.0858 0.232 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 6.23e-01 0.0557 0.113 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 8.12e-01 0.023 0.0963 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 9.27e-01 0.00939 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 8.82e-01 0.0153 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0299 0.0956 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 2.71e-02 -0.194 0.0871 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 2.10e-01 0.118 0.0941 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 1.87e-01 0.136 0.103 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.25e-01 0.0322 0.0914 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 6.27e-03 0.222 0.0805 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0124 0.0886 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 6.10e-01 0.0429 0.084 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0516 0.0568 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 8.60e-02 0.13 0.0753 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0814 0.118 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 3.14e-01 0.101 0.101 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.0893 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.12e-02 0.237 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00847 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.73e-01 -0.122 0.0894 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 6.80e-02 0.175 0.0951 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 2.17e-02 0.243 0.105 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0453 0.0917 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 5.39e-01 0.0525 0.0854 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0362 0.0917 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0529 0.0947 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0855 0.0607 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 6.98e-01 0.031 0.0797 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 1.37e-01 -0.209 0.14 0.241 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 2.98e-01 0.131 0.125 0.241 PB L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 1.14e-01 0.15 0.0945 0.241 PB L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.75e-01 -0.136 0.153 0.241 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 4.77e-02 -0.269 0.134 0.241 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 8.51e-01 0.018 0.0956 0.241 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 3.38e-01 0.134 0.139 0.241 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 1.77e-01 -0.142 0.104 0.241 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 4.10e-01 -0.116 0.141 0.241 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 3.52e-01 -0.109 0.116 0.228 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0751 0.0928 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 8.27e-01 0.0188 0.0859 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 1.98e-01 -0.118 0.0915 0.228 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 3.65e-01 -0.098 0.108 0.228 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0751 0.0696 0.228 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 4.08e-02 0.169 0.0823 0.228 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 3.68e-01 0.0982 0.109 0.231 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 9.79e-01 0.00192 0.0745 0.231 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 3.17e-01 -0.117 0.117 0.231 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 8.14e-01 0.0213 0.0906 0.231 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 7.20e-01 0.0336 0.0938 0.231 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0999 0.0796 0.231 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 5.01e-01 0.0601 0.0891 0.231 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -260402 sc-eQTL 1.10e-01 0.163 0.101 0.231 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 6.35e-01 0.0531 0.112 0.227 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0762 0.08 0.227 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0448 0.106 0.227 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 4.75e-02 0.206 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 3.97e-01 -0.102 0.12 0.227 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 3.02e-01 0.101 0.0978 0.227 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 7.01e-01 -0.04 0.104 0.227 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 1.75e-01 -0.156 0.114 0.227 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 2.31e-01 -0.103 0.0858 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0281 0.0618 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0813 0.0709 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 5.08e-01 0.0687 0.104 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 7.17e-01 0.0336 0.0925 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0346 0.0778 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 2.98e-01 0.0847 0.0811 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 2.16e-01 -0.134 0.108 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 1.86e-01 0.131 0.099 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 4.15e-01 0.0555 0.0679 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0785 0.0838 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0483 0.106 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.11e-02 -0.17 0.1 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0682 0.0875 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 7.91e-03 0.229 0.0853 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 3.89e-01 -0.1 0.116 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 3.33e-01 0.125 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 4.76e-01 0.0879 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 8.42e-01 0.0228 0.114 0.224 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 2.41e-01 -0.144 0.122 0.224 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0121 0.127 0.224 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0177 0.0956 0.224 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 4.37e-01 0.0856 0.11 0.224 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 8.52e-01 0.022 0.117 0.224 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 2.06e-01 0.0995 0.0785 0.224 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 5.40e-01 0.0591 0.0963 0.224 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 4.76e-01 0.0758 0.106 0.224 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 3.51e-01 -0.102 0.11 0.224 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 7.84e-01 0.0275 0.1 0.224 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 6.76e-02 0.177 0.0965 0.224 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0665 0.119 0.224 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 4.42e-01 0.0822 0.107 0.224 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0953 0.0634 0.224 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 8.65e-01 0.0166 0.0977 0.224 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 2.59e-01 0.116 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0967 0.0771 0.224 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 3.58e-03 -0.269 0.0913 0.224 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 8.27e-03 0.207 0.0778 0.224 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0459 0.114 0.224 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00877 0.123 0.237 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 4.17e-01 0.0778 0.0956 0.237 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.10e-01 -0.106 0.104 0.237 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0569 0.0953 0.237 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.77e-01 0.00277 0.0966 0.237 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 6.83e-01 0.0432 0.106 0.237 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 1.29e-01 0.188 0.123 0.237 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 2.46e-01 -0.111 0.0954 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 1.34e-01 0.157 0.104 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.23e-01 0.0257 0.0724 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 8.06e-01 0.0235 0.0955 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 2.17e-01 -0.115 0.0928 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 8.93e-03 -0.251 0.095 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 6.04e-01 0.0347 0.0669 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.11 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 9.20e-01 0.00939 0.094 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 8.27e-01 -0.024 0.109 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 6.05e-01 0.0504 0.0974 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.49e-01 0.0216 0.0676 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 8.08e-01 0.0242 0.0992 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 5.23e-02 -0.176 0.0903 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0545 0.0776 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0305 0.0545 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -312747 sc-eQTL 2.45e-01 -0.133 0.114 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 2.39e-01 0.0976 0.0826 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -292111 sc-eQTL 1.44e-01 -0.142 0.0969 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00363 0.0793 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0177 0.0591 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 1.50e-01 -0.102 0.0708 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 8.10e-01 0.025 0.104 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00924 0.0855 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0386 0.076 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 1.20e-01 0.129 0.0828 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 1.46e-01 -0.162 0.111 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 5.88e-01 0.0585 0.108 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0287 0.0576 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 3.94e-01 0.0786 0.092 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 286680 sc-eQTL 3.02e-01 0.106 0.102 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0432 0.0637 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 3.67e-02 -0.194 0.0924 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 3.61e-02 0.168 0.0796 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 286703 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0126 0.113 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 sc-eQTL 8.67e-02 0.169 0.0983 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 575720 sc-eQTL 7.22e-01 0.0306 0.0858 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 871832 sc-eQTL 3.00e-02 0.156 0.0716 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155829 sc-eQTL 9.91e-01 0.00101 0.0844 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9010 sc-eQTL 3.81e-01 0.0722 0.0823 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -49494 sc-eQTL 1.37e-01 -0.079 0.0529 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -395397 sc-eQTL 1.48e-01 0.111 0.0765 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 205742 eQTL 0.0205 0.0412 0.0178 0.0 0.0 0.234
ENSG00000135540 NHSL1 286680 eQTL 0.0398 0.0563 0.0273 0.0 0.0 0.234
ENSG00000135597 REPS1 -9010 eQTL 5.31e-19 -0.164 0.0181 0.0 0.0 0.234

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -9010 1.72e-05 2.19e-05 5.33e-06 1.31e-05 4.53e-06 1.13e-05 3.31e-05 3.72e-06 2.07e-05 1.09e-05 2.82e-05 1.07e-05 3.91e-05 1e-05 5.8e-06 1.33e-05 1.31e-05 1.91e-05 7.47e-06 6.6e-06 1.16e-05 2.31e-05 2.29e-05 9.41e-06 3.46e-05 6.12e-06 9.38e-06 9.24e-06 2.61e-05 3.24e-05 1.38e-05 1.64e-06 2.95e-06 7.58e-06 9.85e-06 6.2e-06 3.57e-06 3.14e-06 5.37e-06 3.81e-06 1.78e-06 2.7e-05 2.68e-06 4.49e-07 2.43e-06 3.41e-06 3.71e-06 1.69e-06 1.5e-06