logo

Genes within 1Mb (chr6:138978323:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0666 0.0853 0.25 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0169 0.0652 0.25 B L1
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 2.02e-01 0.083 0.0649 0.25 B L1
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0397 0.083 0.25 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 1.50e-02 -0.178 0.0724 0.25 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 9.23e-02 -0.0724 0.0428 0.25 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 7.12e-01 -0.039 0.106 0.25 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 3.71e-01 0.0596 0.0664 0.25 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 5.92e-01 0.0397 0.074 0.25 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 5.73e-01 0.0534 0.0947 0.25 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 6.65e-01 0.0275 0.0636 0.25 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 8.05e-01 0.0148 0.0599 0.25 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0277 0.079 0.25 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 5.53e-01 0.0368 0.062 0.25 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0625 0.0453 0.25 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 7.06e-01 0.0293 0.0777 0.25 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 1.64e-01 0.106 0.0763 0.25 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 6.71e-01 0.0446 0.105 0.25 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0291 0.0686 0.25 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 9.55e-01 0.00391 0.0699 0.25 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 3.44e-01 0.071 0.0748 0.25 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.59e-01 0.00362 0.0705 0.25 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0591 0.04 0.25 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 3.09e-01 0.0776 0.076 0.25 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 4.79e-01 0.0656 0.0925 0.25 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0291 0.106 0.248 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0274 0.0742 0.248 DC L1
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 8.15e-01 0.0203 0.087 0.248 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 1.86e-01 0.128 0.0964 0.248 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 2.16e-01 0.106 0.0853 0.248 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 4.10e-01 0.0691 0.0837 0.248 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0335 0.0995 0.248 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 2.79e-01 -0.109 0.101 0.248 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0618 0.0757 0.25 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 8.54e-01 0.00969 0.0524 0.25 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0535 0.069 0.25 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 5.60e-01 0.0578 0.0989 0.25 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.92e-01 0.000586 0.058 0.25 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0825 0.0753 0.25 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 9.80e-03 0.205 0.0786 0.25 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 1.13e-01 -0.163 0.102 0.25 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 2.97e-01 0.0961 0.0918 0.251 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.93e-01 0.000665 0.0811 0.251 NK L1
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 8.71e-02 0.118 0.0684 0.251 NK L1
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 4.34e-01 0.0623 0.0795 0.251 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 3.13e-01 0.0765 0.0756 0.251 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0371 0.0553 0.251 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.23e-01 0.113 0.0731 0.251 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0569 0.11 0.25 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0611 0.0712 0.25 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 3.80e-01 0.0772 0.0878 0.25 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0102 0.0799 0.25 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0591 0.0859 0.25 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 8.45e-01 -0.011 0.0563 0.25 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.48e-01 0.0953 0.0656 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 6.66e-01 0.0537 0.124 0.255 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 2.72e-01 0.12 0.109 0.255 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0339 0.0565 0.255 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0494 0.118 0.255 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0466 0.124 0.255 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 1.82e-01 0.15 0.112 0.255 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0742 0.096 0.255 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0259 0.121 0.255 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0481 0.121 0.255 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 9.62e-01 0.00511 0.106 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0224 0.0734 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 1.75e-01 0.126 0.093 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0412 0.0917 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 8.65e-02 -0.169 0.0983 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 7.30e-01 0.0291 0.0843 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 9.51e-02 0.172 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000477 0.095 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 4.55e-01 0.0769 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 7.39e-01 0.0365 0.109 0.252 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 8.89e-01 0.0115 0.0823 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0639 0.103 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00928 0.0946 0.252 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 1.41e-01 -0.151 0.102 0.252 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0394 0.0811 0.252 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00793 0.103 0.252 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 2.18e-01 0.117 0.0948 0.252 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 2.88e-01 0.124 0.116 0.252 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 1.29e-01 -0.155 0.101 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 6.26e-01 0.035 0.0717 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 5.47e-01 0.0585 0.0972 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0881 0.0887 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00286 0.0823 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00344 0.0576 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0314 0.108 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 3.63e-01 0.0714 0.0783 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0181 0.103 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 1.69e-01 0.139 0.101 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 8.39e-01 0.014 0.0691 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0221 0.083 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.31e-01 0.0457 0.095 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 7.08e-01 -0.034 0.0907 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0346 0.0668 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0938 0.106 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 6.09e-01 0.0552 0.108 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0988 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0883 0.106 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 4.72e-01 0.066 0.0916 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0308 0.112 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 7.50e-01 0.0342 0.107 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0389 0.104 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00768 0.0948 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 7.57e-01 0.0295 0.0952 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0287 0.0982 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 5.67e-01 0.0575 0.1 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 6.39e-01 0.0294 0.0625 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 1.93e-01 -0.108 0.0823 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 9.72e-01 0.00269 0.078 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 3.97e-01 0.0586 0.069 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0484 0.0464 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 7.69e-01 0.0233 0.0791 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 1.23e-01 0.123 0.0795 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 3.14e-01 0.0983 0.0974 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00712 0.0727 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00119 0.0911 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0296 0.0781 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0341 0.074 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0749 0.0567 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 6.21e-01 0.042 0.0846 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 5.33e-01 0.0571 0.0914 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0316 0.111 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 5.91e-01 0.0406 0.0756 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0342 0.0879 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0819 0.0862 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 1.71e-01 0.129 0.0937 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 2.34e-02 -0.151 0.0663 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 6.68e-01 0.0378 0.088 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 8.50e-01 0.0174 0.0921 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 7.89e-01 0.0307 0.114 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00779 0.0818 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0486 0.102 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 2.07e-01 0.105 0.0831 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 4.74e-01 -0.064 0.0892 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 1.46e-01 -0.105 0.0719 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.34e-01 0.126 0.0836 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 1.81e-01 -0.135 0.1 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0703 0.109 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0584 0.0695 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0512 0.0837 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 7.35e-01 0.0285 0.0841 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 6.03e-01 0.0439 0.0843 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0466 0.0441 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.75e-01 0.121 0.089 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 8.70e-01 0.0168 0.102 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 7.65e-01 0.037 0.123 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 7.54e-01 0.0272 0.0867 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 2.03e-02 0.264 0.113 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0358 0.0903 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0797 0.0937 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 3.84e-03 -0.268 0.0915 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00189 0.0961 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 7.79e-01 0.0285 0.101 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.01e-01 0.0943 0.112 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 1.98e-01 0.131 0.102 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0727 0.116 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 3.01e-01 0.109 0.105 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.63e-01 0.00508 0.109 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 8.08e-02 -0.147 0.0836 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.84e-02 0.215 0.0903 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0239 0.104 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0916 0.117 0.251 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00766 0.0815 0.251 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 3.72e-01 0.0963 0.108 0.251 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.92e-01 0.0355 0.0893 0.251 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0628 0.0961 0.251 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 5.28e-01 0.0446 0.0707 0.251 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 6.08e-01 0.0427 0.0832 0.251 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 9.55e-01 0.00626 0.11 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 8.14e-01 0.0221 0.094 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 7.91e-01 0.0267 0.101 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.49e-01 0.0456 0.1 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0374 0.0933 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 2.93e-02 -0.187 0.085 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.39e-01 0.136 0.0918 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 3.26e-01 0.098 0.0997 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00376 0.0887 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 4.27e-03 0.225 0.0779 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 7.93e-01 0.0226 0.0859 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 2.91e-01 0.0859 0.0812 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0401 0.0551 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.31e-01 0.111 0.0731 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0875 0.115 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 4.09e-01 0.081 0.0979 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 2.96e-01 0.0911 0.0869 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 9.79e-03 0.276 0.106 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00999 0.106 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 1.23e-01 -0.134 0.0868 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 6.68e-02 0.171 0.0925 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 2.66e-01 0.115 0.103 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0572 0.089 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 5.40e-01 0.0509 0.083 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00145 0.0891 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 7.59e-01 0.0283 0.092 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0346 0.0592 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 3.40e-01 0.0738 0.0772 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 1.67e-01 -0.18 0.13 0.259 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 4.02e-01 0.0976 0.116 0.259 PB L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 1.61e-01 0.124 0.0879 0.259 PB L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0439 0.142 0.259 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 3.18e-02 -0.27 0.124 0.259 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 5.89e-01 0.0479 0.0885 0.259 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 3.93e-01 0.111 0.129 0.259 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 7.36e-02 -0.173 0.0961 0.259 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0736 0.131 0.259 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0985 0.114 0.246 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0695 0.0911 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 6.35e-01 0.0401 0.0843 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0248 0.0902 0.246 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0589 0.106 0.246 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0134 0.0685 0.246 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 3.88e-02 0.168 0.0808 0.246 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 6.22e-01 0.0523 0.106 0.25 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00266 0.0723 0.25 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0946 0.114 0.25 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.17e-01 0.044 0.0879 0.25 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00246 0.091 0.25 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 5.36e-01 -0.048 0.0774 0.25 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 5.52e-01 0.0515 0.0864 0.25 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -261330 sc-eQTL 1.39e-01 0.146 0.0984 0.25 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00949 0.109 0.249 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0694 0.0783 0.249 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0112 0.104 0.249 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 2.21e-02 0.232 0.1 0.249 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0135 0.117 0.249 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 3.31e-01 0.0932 0.0957 0.249 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0557 0.102 0.249 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 2.47e-01 -0.13 0.112 0.249 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.49e-02 -0.167 0.0826 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0106 0.0599 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0642 0.0688 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 6.32e-01 0.0481 0.1 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 3.50e-01 0.0838 0.0894 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0261 0.0754 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 4.48e-01 0.0598 0.0787 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 2.79e-01 -0.114 0.105 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.32e-01 0.0755 0.096 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 4.49e-01 0.0499 0.0657 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0693 0.0811 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0558 0.103 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 1.51e-01 -0.14 0.097 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0472 0.0847 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 7.60e-03 0.222 0.0825 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0892 0.113 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 4.26e-01 0.101 0.126 0.248 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 5.71e-01 0.0683 0.12 0.248 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 6.46e-01 0.0516 0.112 0.248 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0504 0.12 0.248 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00305 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 7.72e-01 0.0272 0.0936 0.248 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 2.91e-01 0.114 0.107 0.248 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0136 0.113 0.244 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 1.84e-01 0.101 0.0755 0.244 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 5.91e-01 0.0499 0.0927 0.244 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 5.06e-01 0.0681 0.102 0.244 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0643 0.106 0.244 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 7.82e-01 0.0267 0.0964 0.244 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 7.20e-02 0.168 0.0929 0.244 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0561 0.115 0.244 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 9.60e-01 0.00527 0.104 0.244 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0728 0.0617 0.244 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 3.29e-01 0.0927 0.0946 0.244 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 3.11e-01 0.101 0.0995 0.244 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0578 0.075 0.244 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 1.12e-02 -0.228 0.0891 0.244 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 6.20e-03 0.209 0.0754 0.244 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0382 0.111 0.244 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 5.30e-01 -0.075 0.119 0.26 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 4.15e-01 0.0756 0.0926 0.26 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 2.54e-01 -0.115 0.101 0.26 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0689 0.0922 0.26 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00733 0.0936 0.26 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 6.32e-01 0.049 0.102 0.26 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.85e-01 0.159 0.12 0.26 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 8.95e-02 -0.157 0.0919 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 5.59e-01 0.0595 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 7.42e-01 0.0232 0.0704 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 5.86e-01 0.0506 0.0927 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 4.33e-01 -0.071 0.0903 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 1.17e-02 -0.235 0.0924 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 5.20e-01 0.0418 0.0649 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00141 0.0913 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 5.50e-01 0.0636 0.106 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0216 0.095 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 6.84e-01 0.0268 0.0659 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 7.20e-01 0.0347 0.0968 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0723 0.0887 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0605 0.0757 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0163 0.0531 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -313675 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0955 0.111 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 4.25e-01 0.0645 0.0807 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -293039 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0933 0.0948 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 2.98e-01 -0.08 0.0766 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00389 0.0572 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0888 0.0686 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 9.76e-01 0.00303 0.101 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 7.22e-01 0.0295 0.0828 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0271 0.0736 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.62e-01 0.113 0.0803 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 1.91e-01 -0.141 0.108 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0201 0.105 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0162 0.0559 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 1.55e-01 0.127 0.089 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 285752 sc-eQTL 2.96e-01 0.104 0.0992 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0256 0.0619 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 7.56e-02 -0.161 0.0899 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 2.88e-02 0.17 0.0772 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 285775 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00451 0.11 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 204814 sc-eQTL 2.87e-01 0.102 0.0956 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 574792 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00195 0.0831 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 870904 sc-eQTL 6.95e-02 0.127 0.0696 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -156757 sc-eQTL 6.25e-01 0.04 0.0817 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -9938 sc-eQTL 1.00e-01 0.131 0.0794 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -50422 sc-eQTL 3.72e-01 -0.046 0.0514 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -396325 sc-eQTL 1.15e-01 0.117 0.0741 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 -9938 eQTL 7.24e-19 -0.163 0.0179 0.0 0.0 0.247

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -9938 2.59e-05 2.61e-05 4.66e-06 1.32e-05 3.99e-06 1.02e-05 3.25e-05 3.8e-06 2.22e-05 1.19e-05 3.05e-05 1.14e-05 3.85e-05 1.12e-05 5.8e-06 1.37e-05 1.19e-05 1.93e-05 6.26e-06 5.45e-06 1.12e-05 2.44e-05 2.41e-05 6.56e-06 3.29e-05 5.98e-06 1.04e-05 9.99e-06 2.5e-05 2.06e-05 1.51e-05 1.51e-06 2.23e-06 5.98e-06 8.71e-06 4.5e-06 2.36e-06 2.85e-06 3.64e-06 2.86e-06 1.55e-06 3.32e-05 2.81e-06 2.03e-07 1.95e-06 3.07e-06 3.43e-06 1.34e-06 1.38e-06