Genes within 1Mb (chr6:138973661:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 6.14e-01 0.0418 0.0827 0.274 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0827 0.0629 0.274 B L1
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 3.78e-01 0.0557 0.063 0.274 B L1
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0483 0.0804 0.274 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 1.22e-02 -0.177 0.0701 0.274 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0573 0.0416 0.274 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00942 0.102 0.274 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.87e-01 0.0558 0.0644 0.274 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 9.91e-01 0.000798 0.0717 0.274 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 3.21e-01 0.0912 0.0916 0.274 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0569 0.0615 0.274 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0562 0.058 0.274 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0788 0.0764 0.274 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0118 0.0602 0.274 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0596 0.0439 0.274 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 4.64e-01 0.0552 0.0753 0.274 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 3.38e-01 0.0712 0.0741 0.274 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 8.42e-02 0.172 0.0992 0.274 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 6.63e-02 -0.12 0.0649 0.274 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0398 0.0666 0.274 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0121 0.0715 0.274 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0102 0.0673 0.274 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0489 0.0382 0.274 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.37e-01 0.0698 0.0725 0.274 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 8.32e-01 0.0188 0.0883 0.274 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 8.14e-01 0.0237 0.101 0.27 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00678 0.0707 0.27 DC L1
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0212 0.0828 0.27 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 2.83e-01 0.0989 0.0919 0.27 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 3.05e-01 0.0837 0.0813 0.27 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 2.94e-01 0.0838 0.0796 0.27 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 5.68e-01 0.0541 0.0947 0.27 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 9.58e-02 -0.16 0.0957 0.27 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 3.13e-01 0.0734 0.0726 0.274 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0209 0.0504 0.274 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0195 0.0664 0.274 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 1.15e-01 0.15 0.0946 0.274 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0316 0.0557 0.274 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0373 0.0725 0.274 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 6.55e-03 0.207 0.0754 0.274 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0861 0.0988 0.274 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.92e-01 0.0945 0.0894 0.275 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0443 0.0789 0.275 NK L1
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 1.18e-01 0.105 0.0666 0.275 NK L1
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00253 0.0774 0.275 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 9.56e-01 0.00409 0.0737 0.275 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 3.63e-01 -0.049 0.0537 0.275 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.11e-01 0.0725 0.0714 0.275 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0832 0.105 0.274 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0994 0.0674 0.274 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00822 0.0836 0.274 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00518 0.0759 0.274 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 5.66e-01 0.0469 0.0816 0.274 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 7.11e-01 0.0198 0.0534 0.274 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 2.73e-01 0.0686 0.0624 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 5.35e-01 0.075 0.121 0.278 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 6.21e-01 0.0525 0.106 0.278 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0537 0.0549 0.278 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0656 0.115 0.278 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.53e-01 0.0224 0.121 0.278 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 5.08e-01 0.0723 0.109 0.278 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0718 0.0933 0.278 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 9.19e-01 -0.012 0.118 0.278 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000387 0.118 0.278 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.45e-01 0.119 0.102 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 5.63e-01 -0.041 0.0708 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 2.76e-01 0.0982 0.09 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0765 0.0885 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 1.91e-02 -0.223 0.0944 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 4.58e-01 0.0605 0.0813 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 1.60e-01 0.14 0.0993 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 4.33e-01 0.072 0.0916 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 5.46e-01 0.06 0.0993 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 9.52e-01 0.00636 0.105 0.276 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0041 0.0794 0.276 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 2.46e-01 -0.115 0.0986 0.276 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0307 0.0912 0.276 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.73e-02 -0.169 0.0982 0.276 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 4.88e-01 0.0543 0.0781 0.276 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 7.79e-01 0.0281 0.0997 0.276 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.73e-01 0.125 0.0913 0.276 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 6.15e-01 0.0567 0.112 0.276 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0147 0.0984 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0477 0.0691 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 5.42e-01 0.0572 0.0937 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 2.10e-01 -0.107 0.0855 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.95e-01 0.0105 0.0794 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 9.78e-01 0.0015 0.0555 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 5.31e-01 0.0653 0.104 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 4.47e-01 0.0576 0.0756 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 8.82e-01 0.0148 0.0993 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 5.08e-02 0.189 0.0963 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0325 0.0664 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 8.41e-01 -0.016 0.0799 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 8.07e-01 0.0223 0.0915 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0773 0.0871 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0296 0.0642 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 2.63e-01 -0.114 0.101 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.02e-01 0.107 0.104 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 1.43e-01 -0.139 0.0948 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 1.63e-01 -0.139 0.0994 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00652 0.0863 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 6.76e-01 -0.044 0.105 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0429 0.101 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 7.66e-01 0.0292 0.0979 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0273 0.0892 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 6.11e-01 0.0457 0.0896 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 7.71e-01 0.0269 0.0924 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 3.28e-01 0.0949 0.0968 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 3.55e-01 -0.056 0.0604 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 1.65e-01 -0.111 0.0795 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0792 0.0752 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00655 0.0669 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0188 0.045 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 4.32e-01 0.0601 0.0763 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 2.14e-01 0.0959 0.077 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 1.70e-01 0.129 0.0941 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 5.70e-01 -0.04 0.0703 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0222 0.0882 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0974 0.0753 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0175 0.0717 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0831 0.0548 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.70e-01 0.0736 0.0818 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 6.83e-01 0.0362 0.0885 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 7.76e-01 0.0304 0.107 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0249 0.0727 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0368 0.0846 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0904 0.0828 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 3.03e-01 0.0933 0.0903 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 4.85e-02 -0.127 0.064 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 9.14e-01 0.00918 0.0847 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 8.40e-01 0.0179 0.0887 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 1.34e-01 0.165 0.11 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 7.28e-02 -0.141 0.0782 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0652 0.0982 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.08e-01 0.0532 0.0802 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0373 0.086 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.15e-01 -0.11 0.0692 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.71e-01 0.0725 0.0808 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 1.39e-01 -0.144 0.0967 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 9.57e-01 0.00562 0.104 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 1.00e-01 -0.109 0.0658 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0793 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00625 0.08 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 4.95e-01 0.0547 0.0801 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0136 0.0421 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.35e-01 0.127 0.0846 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 7.28e-01 0.0339 0.0973 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.63e-01 0.131 0.116 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 7.52e-01 -0.026 0.082 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 2.04e-01 0.137 0.108 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 1.36e-01 -0.127 0.0849 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0493 0.0887 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.06e-03 -0.286 0.086 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0137 0.0909 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0152 0.0959 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 6.19e-02 0.2 0.107 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 9.10e-01 0.0111 0.0977 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0854 0.111 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0391 0.101 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 5.48e-01 0.063 0.105 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 2.29e-01 -0.097 0.0804 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 9.02e-02 0.148 0.0871 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 5.72e-01 0.0565 0.0997 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.113 0.275 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0424 0.0785 0.275 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0197 0.104 0.275 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 4.81e-01 0.0607 0.086 0.275 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00902 0.0927 0.275 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 4.25e-01 0.0544 0.0681 0.275 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 6.34e-01 0.0382 0.0802 0.275 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0747 0.106 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0311 0.0903 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0303 0.0967 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 4.82e-01 0.0676 0.0961 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0068 0.0897 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.51e-01 -0.119 0.0822 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.18e-01 0.138 0.0881 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 1.57e-01 0.138 0.097 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 8.18e-01 -0.02 0.0866 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 3.31e-03 0.226 0.076 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0472 0.0838 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 4.24e-01 0.0636 0.0794 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0531 0.0537 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.99e-01 0.0921 0.0715 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0865 0.112 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 7.65e-01 0.0285 0.0951 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 2.94e-01 0.0888 0.0843 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 7.61e-02 0.185 0.104 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0427 0.103 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0967 0.0845 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.62e-01 0.126 0.0901 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.00e-01 0.129 0.1 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 2.13e-01 -0.108 0.0863 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 6.43e-01 0.0375 0.0807 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0504 0.0865 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 2.16e-01 -0.11 0.0891 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0409 0.0575 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 8.03e-01 0.0188 0.0752 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.61e-01 -0.146 0.129 0.278 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 9.44e-01 0.00809 0.116 0.278 PB L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 5.07e-01 0.0585 0.0878 0.278 PB L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 4.45e-01 -0.108 0.141 0.278 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 4.59e-02 -0.249 0.123 0.278 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 7.62e-01 0.0267 0.088 0.278 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 9.84e-01 0.00261 0.128 0.278 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.98e-01 -0.124 0.096 0.278 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 3.36e-01 -0.125 0.129 0.278 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.97e-01 -0.112 0.107 0.272 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0889 0.0855 0.272 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00781 0.0793 0.272 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0678 0.0846 0.272 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0293 0.0998 0.272 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0281 0.0643 0.272 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.08e-02 0.194 0.0755 0.272 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.92e-01 0.108 0.102 0.274 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0696 0.274 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 2.50e-02 -0.246 0.109 0.274 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 8.04e-01 0.0211 0.085 0.274 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 4.92e-01 0.0606 0.0879 0.274 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0612 0.0749 0.274 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 5.30e-01 0.0526 0.0836 0.274 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -265992 sc-eQTL 3.98e-01 0.0809 0.0956 0.274 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 4.93e-01 0.0716 0.104 0.271 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0439 0.0747 0.271 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0609 0.0991 0.271 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 1.58e-01 0.137 0.0965 0.271 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0889 0.112 0.271 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.75e-01 0.124 0.091 0.271 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 7.42e-01 0.032 0.097 0.271 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 5.24e-02 -0.207 0.106 0.271 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 5.60e-01 -0.047 0.0805 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 5.93e-01 -0.031 0.0578 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00596 0.0666 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 2.85e-01 0.104 0.0967 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 6.58e-01 0.0383 0.0865 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 8.11e-01 0.0174 0.0728 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 2.16e-01 0.0942 0.0759 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0869 0.101 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 6.46e-02 0.171 0.092 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 7.86e-01 0.0173 0.0634 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0062 0.0784 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 9.15e-01 0.0106 0.0993 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 2.13e-01 -0.117 0.0936 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0113 0.0817 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 7.60e-03 0.214 0.0795 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 8.60e-01 0.0192 0.109 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 8.02e-01 0.0302 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 4.08e-01 0.095 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00123 0.107 0.264 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 2.75e-01 -0.125 0.114 0.264 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0307 0.118 0.264 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 9.01e-01 0.0111 0.0891 0.264 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 6.02e-01 0.0536 0.103 0.264 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 9.13e-01 0.0119 0.109 0.269 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 6.19e-01 0.0365 0.0732 0.269 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.36e-01 0.0555 0.0895 0.269 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 2.20e-01 0.121 0.0984 0.269 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 1.85e-01 -0.135 0.102 0.269 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.87e-01 0.123 0.0927 0.269 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 4.87e-02 0.178 0.0896 0.269 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0728 0.111 0.269 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 6.06e-01 0.0509 0.0986 0.267 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0805 0.0586 0.267 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00412 0.0901 0.267 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 1.04e-01 0.154 0.0941 0.267 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0749 0.0712 0.267 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 9.64e-02 -0.143 0.0854 0.267 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 2.52e-03 0.218 0.0713 0.267 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 8.78e-01 0.0162 0.105 0.267 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 5.35e-01 -0.071 0.114 0.28 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 1.95e-01 0.115 0.0884 0.28 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 2.18e-01 -0.119 0.0964 0.28 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0425 0.0884 0.28 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.30e-01 0.0192 0.0896 0.28 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 9.31e-01 0.00852 0.098 0.28 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.45e-02 0.242 0.114 0.28 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 1.10e-01 -0.142 0.0882 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.77e-01 0.106 0.0977 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00381 0.0678 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00984 0.0894 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0853 0.087 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 3.69e-03 -0.26 0.0886 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 1.48e-01 0.0905 0.0623 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 1.59e-01 0.146 0.103 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 5.34e-01 0.0548 0.0879 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 7.71e-01 0.0298 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.88e-01 0.0974 0.0913 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0415 0.0634 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 6.41e-01 0.0436 0.0932 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0958 0.0854 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0465 0.0729 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00434 0.0512 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -318337 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0474 0.107 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.54e-01 0.0722 0.0777 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -297701 sc-eQTL 3.31e-01 -0.089 0.0913 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 4.14e-01 0.0606 0.0741 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0379 0.0553 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 7.41e-01 -0.022 0.0666 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 4.52e-01 0.0732 0.0972 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 8.89e-01 0.0112 0.0801 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 8.06e-01 0.0175 0.0712 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 6.81e-02 0.142 0.0774 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0637 0.104 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 5.07e-01 0.0664 0.0999 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0387 0.0534 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 5.32e-01 0.0534 0.0853 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 281090 sc-eQTL 2.50e-02 0.212 0.0938 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0619 0.059 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0975 0.0863 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 1.75e-02 0.176 0.0736 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 281113 sc-eQTL 7.59e-01 0.0322 0.105 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 200152 sc-eQTL 2.14e-01 0.116 0.093 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 570130 sc-eQTL 7.11e-01 -0.03 0.081 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 866242 sc-eQTL 5.71e-02 0.13 0.0677 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -161419 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0322 0.0796 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -14600 sc-eQTL 6.02e-01 0.0406 0.0778 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55084 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0628 0.05 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -400987 sc-eQTL 3.08e-01 0.074 0.0724 0.276 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 281090 eQTL 0.0189 0.0618 0.0263 0.0 0.0 0.263
ENSG00000135597 REPS1 -14600 eQTL 3.22e-18 -0.155 0.0174 0.0 0.0 0.263


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -14600 2.13e-05 2.95e-05 4.1e-06 1.32e-05 3.23e-06 9.84e-06 3.35e-05 3.41e-06 1.94e-05 9.82e-06 3.02e-05 1.11e-05 3.78e-05 1.15e-05 5.36e-06 1.33e-05 1.4e-05 1.79e-05 4.64e-06 4.27e-06 9.16e-06 2.44e-05 2.41e-05 5.48e-06 3.87e-05 5.78e-06 8.84e-06 7.58e-06 2.14e-05 2.06e-05 1.36e-05 1.12e-06 1.32e-06 4.26e-06 9.4e-06 3.28e-06 1.77e-06 2.39e-06 3.24e-06 2.03e-06 1.08e-06 4.33e-05 2.83e-06 1.88e-07 1.95e-06 2.79e-06 2.62e-06 7e-07 4.78e-07