Genes within 1Mb (chr6:138973055:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0407 0.0823 0.252 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0326 0.0628 0.252 B L1
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0446 0.0627 0.252 B L1
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0836 0.0799 0.252 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 6.42e-02 0.131 0.0702 0.252 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.64e-02 0.0825 0.0412 0.252 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 3.08e-02 0.219 0.101 0.252 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.32e-01 0.0504 0.0641 0.252 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0376 0.0713 0.252 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00823 0.0928 0.252 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 3.01e-01 0.0643 0.0621 0.252 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 5.59e-02 0.112 0.0582 0.252 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 2.25e-01 0.0937 0.0771 0.252 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0031 0.0608 0.252 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0367 0.0445 0.252 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0342 0.0761 0.252 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0264 0.0751 0.252 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0534 0.0999 0.252 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 3.63e-01 0.0595 0.0654 0.252 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 1.73e-01 0.0907 0.0664 0.252 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 5.61e-01 0.0416 0.0715 0.252 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00955 0.0673 0.252 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 6.58e-02 -0.0703 0.038 0.252 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 7.73e-01 -0.021 0.0728 0.252 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 5.68e-01 0.0505 0.0883 0.252 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 3.45e-01 0.0932 0.0986 0.257 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 3.30e-01 0.0677 0.0693 0.257 DC L1
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 2.54e-01 0.0927 0.0811 0.257 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 9.63e-01 0.00417 0.0906 0.257 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.09e-01 0.0299 0.0801 0.257 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 1.74e-01 -0.107 0.0781 0.257 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0384 0.0931 0.257 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 7.82e-01 0.0263 0.0947 0.257 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0571 0.0711 0.252 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 7.77e-01 0.014 0.0493 0.252 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 6.41e-01 0.0303 0.065 0.252 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0307 0.0931 0.252 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 3.86e-01 0.0473 0.0544 0.252 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.55e-04 -0.256 0.0687 0.252 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0641 0.0749 0.252 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 5.84e-02 0.183 0.096 0.252 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 6.35e-01 -0.041 0.0864 0.251 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00895 0.0761 0.251 NK L1
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 7.69e-01 0.019 0.0646 0.251 NK L1
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.12e-01 0.0613 0.0746 0.251 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.45e-01 0.00494 0.0711 0.251 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.39e-02 -0.104 0.0514 0.251 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 5.97e-01 0.0365 0.069 0.251 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00335 0.105 0.252 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 5.61e-02 0.129 0.0671 0.252 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 1.84e-01 0.111 0.0831 0.252 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0103 0.0758 0.252 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 8.51e-01 0.0153 0.0815 0.252 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0367 0.0533 0.252 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0626 0.0624 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 1.92e-01 -0.152 0.116 0.25 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 1.10e-01 -0.163 0.102 0.25 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0163 0.0532 0.25 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 6.07e-01 0.0573 0.111 0.25 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0419 0.117 0.25 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 3.23e-01 0.104 0.105 0.25 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 2.15e-01 0.112 0.0899 0.25 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 1.61e-01 0.159 0.113 0.25 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 3.19e-01 -0.113 0.113 0.25 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 6.00e-01 0.053 0.101 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 4.64e-01 0.0512 0.0698 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0646 0.0889 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0842 0.0872 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.63e-01 0.0285 0.0943 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0686 0.0801 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 8.20e-01 0.0224 0.0983 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0674 0.0904 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0948 0.0978 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 8.05e-01 0.0253 0.102 0.25 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 6.87e-01 -0.031 0.077 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 4.24e-01 0.0768 0.0959 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 3.99e-01 0.0747 0.0884 0.25 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 8.54e-02 0.165 0.0953 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 3.04e-01 -0.078 0.0757 0.25 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 9.18e-01 0.00992 0.0968 0.25 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0459 0.0889 0.25 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 2.99e-01 -0.113 0.109 0.25 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0284 0.096 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 4.77e-01 -0.048 0.0674 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0805 0.0913 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0654 0.0836 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 2.06e-01 0.0978 0.0771 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.27e-02 0.109 0.0536 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 7.63e-03 0.269 0.0997 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 6.70e-01 0.0315 0.0738 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0109 0.0968 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 9.56e-01 0.00519 0.0931 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0533 0.0636 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 1.56e-01 0.108 0.0762 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0269 0.0876 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0281 0.0836 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.70e-01 0.068 0.0614 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 7.93e-01 0.0256 0.0975 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 1.90e-01 -0.13 0.0991 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0548 0.0912 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 3.37e-01 0.0959 0.0995 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0713 0.0861 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 8.11e-01 0.0252 0.105 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 2.58e-01 0.114 0.1 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 2.11e-01 0.122 0.0974 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 7.31e-01 0.0307 0.0891 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.59e-01 0.0663 0.0894 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 8.68e-02 0.158 0.0917 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 5.63e-01 0.0563 0.0971 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 2.87e-01 0.0645 0.0604 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 4.38e-01 0.062 0.0799 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.41e-01 0.0582 0.0754 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00795 0.067 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 9.45e-01 0.0031 0.0451 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00451 0.0766 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0187 0.0774 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 2.12e-01 -0.118 0.0946 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 7.18e-01 0.0256 0.0706 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00906 0.0886 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.61e-01 0.0561 0.0758 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0187 0.072 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0645 0.0552 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 2.64e-01 -0.092 0.0821 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 2.17e-01 -0.11 0.0886 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0116 0.107 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 9.87e-01 0.00114 0.0727 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 3.12e-01 0.0856 0.0844 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 8.11e-01 0.0199 0.083 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.11e-01 0.0101 0.0905 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0161 0.0645 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 9.06e-01 -0.01 0.0847 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0681 0.0885 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 9.95e-01 0.000675 0.107 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 4.78e-01 0.0543 0.0765 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 2.16e-02 0.218 0.0944 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00223 0.0781 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 6.26e-01 0.0408 0.0835 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0823 0.0674 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0552 0.0786 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 7.19e-02 0.169 0.0937 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 9.30e-01 0.00912 0.104 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 1.28e-01 0.101 0.0663 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 9.54e-01 0.00462 0.0802 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 5.19e-01 0.0519 0.0804 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.34e-01 0.00665 0.0807 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0534 0.0422 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 8.55e-01 0.0156 0.0856 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 9.75e-01 0.00311 0.098 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 3.20e-01 0.113 0.114 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0525 0.0799 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 1.58e-01 0.149 0.105 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 5.47e-01 0.0501 0.0832 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 1.49e-01 -0.125 0.0861 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 6.44e-02 0.159 0.0855 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0941 0.0884 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 2.82e-01 -0.101 0.0933 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 8.18e-01 0.025 0.108 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 3.15e-01 0.0987 0.098 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 4.07e-01 0.0929 0.112 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.87e-01 0.0703 0.101 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0831 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 1.74e-01 -0.11 0.0808 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0264 0.0882 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 7.76e-01 0.0285 0.1 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 7.27e-01 0.0396 0.113 0.251 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 9.49e-02 0.131 0.0781 0.251 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 8.80e-03 0.271 0.102 0.251 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0686 0.086 0.251 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 4.42e-01 0.0714 0.0926 0.251 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0758 0.068 0.251 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 7.47e-01 -0.026 0.0803 0.251 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0332 0.101 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 4.01e-01 0.0724 0.0861 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 9.74e-01 -0.003 0.0922 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 9.64e-01 0.0041 0.0918 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00355 0.0856 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 7.03e-01 0.0301 0.0788 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0854 0.0844 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0368 0.0935 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0215 0.083 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0461 0.0744 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 2.03e-01 0.102 0.0802 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 6.69e-01 0.0326 0.0762 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.72e-02 -0.102 0.0512 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.21e-01 0.0683 0.0687 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 4.29e-01 0.086 0.108 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0076 0.0925 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0743 0.0821 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 6.49e-01 0.0463 0.102 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.14e-01 0.0368 0.1 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0272 0.0824 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 5.90e-02 0.166 0.0873 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 2.31e-01 -0.115 0.0962 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 9.64e-01 0.00373 0.0832 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 7.98e-01 0.0198 0.0775 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0111 0.0831 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0615 0.0857 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0597 0.0551 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00662 0.0722 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 4.79e-02 -0.237 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.27 PB L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 7.55e-01 0.0256 0.0817 0.27 PB L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0461 0.131 0.27 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 1.67e-02 0.277 0.114 0.27 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0686 0.0815 0.27 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 9.91e-01 0.00136 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.80e-01 0.0789 0.0896 0.27 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 1.73e-01 0.164 0.12 0.27 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 7.70e-01 0.0319 0.109 0.252 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 5.54e-01 0.0513 0.0866 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 9.18e-01 0.00826 0.0802 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 9.40e-01 0.00643 0.0857 0.252 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0368 0.101 0.252 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 5.16e-01 0.0423 0.065 0.252 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 1.22e-01 -0.12 0.0771 0.252 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 5.15e-01 0.0658 0.101 0.252 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 6.37e-01 0.0326 0.0689 0.252 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 2.20e-04 0.395 0.105 0.252 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 7.19e-01 0.0302 0.0839 0.252 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 1.73e-01 0.118 0.0864 0.252 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0418 0.0739 0.252 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0127 0.0825 0.252 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -266598 sc-eQTL 2.58e-01 -0.107 0.0941 0.252 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 2.56e-01 0.112 0.0981 0.259 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 3.99e-01 0.0595 0.0705 0.259 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 3.69e-01 0.0841 0.0935 0.259 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 7.26e-01 0.0321 0.0916 0.259 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 4.31e-01 0.0833 0.105 0.259 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 1.76e-01 -0.117 0.0859 0.259 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0466 0.0915 0.259 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 8.64e-01 0.0174 0.101 0.259 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0264 0.0775 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 7.76e-01 0.0159 0.0557 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 7.27e-01 0.0224 0.0641 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0794 0.0932 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.66e-01 0.0036 0.0833 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 1.12e-04 -0.266 0.0677 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0313 0.0733 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 4.44e-02 0.196 0.0968 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0219 0.0886 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0614 0.0605 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 7.22e-01 0.0266 0.0749 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 1.65e-01 0.132 0.0945 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00496 0.0898 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 1.03e-02 -0.199 0.0769 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0801 0.0771 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 3.52e-01 0.0968 0.104 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 7.77e-01 0.0357 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0575 0.12 0.23 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00747 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 1.70e-01 -0.169 0.123 0.23 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 1.49e-01 0.134 0.0923 0.23 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.58e-01 0.0796 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0427 0.106 0.251 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 4.91e-01 -0.049 0.0711 0.251 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.70e-01 0.0629 0.0869 0.251 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0293 0.0959 0.251 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 6.60e-01 0.0436 0.0991 0.251 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 2.73e-02 -0.199 0.0894 0.251 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0974 0.0876 0.251 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 7.31e-01 0.0371 0.108 0.251 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0138 0.0958 0.253 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 6.99e-01 0.0221 0.0571 0.253 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0181 0.0875 0.253 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 2.72e-01 -0.101 0.0918 0.253 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 5.25e-02 0.134 0.0687 0.253 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.36e-03 -0.236 0.0819 0.253 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0624 0.0708 0.253 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 1.74e-01 0.139 0.102 0.253 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 8.26e-01 0.024 0.109 0.254 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 8.78e-01 -0.013 0.0849 0.254 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 6.94e-01 0.0364 0.0924 0.254 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 9.99e-01 5.44e-05 0.0845 0.254 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 3.65e-01 0.0776 0.0854 0.254 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 6.93e-01 -0.037 0.0935 0.254 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 6.26e-01 0.0537 0.11 0.254 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 9.96e-01 0.000439 0.0849 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00532 0.0977 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00225 0.0676 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 8.09e-01 0.0216 0.0891 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0299 0.0869 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 5.84e-01 0.0493 0.09 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 6.08e-01 -0.032 0.0624 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 4.92e-01 0.0711 0.103 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0603 0.0876 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 2.37e-01 -0.121 0.102 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0578 0.0899 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0682 0.0622 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0602 0.0916 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0656 0.084 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 5.81e-01 0.0396 0.0717 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 5.07e-02 0.098 0.0499 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -318943 sc-eQTL 2.41e-02 0.237 0.104 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.91e-01 0.0528 0.0765 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0253 0.0899 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0263 0.0716 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 7.18e-01 0.0193 0.0533 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 5.51e-01 0.0383 0.0642 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0358 0.0938 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00593 0.0772 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 9.79e-05 -0.263 0.0663 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0666 0.0751 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 9.13e-02 0.17 0.1 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0463 0.0973 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 6.83e-01 0.0213 0.052 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 7.53e-01 0.0261 0.0831 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 280484 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0252 0.0924 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 7.62e-02 0.102 0.0571 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 5.86e-03 -0.23 0.0827 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0974 0.0723 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 280507 sc-eQTL 2.45e-01 0.119 0.102 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 199546 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0414 0.0896 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 569524 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0144 0.0777 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 865636 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00546 0.0656 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -162025 sc-eQTL 4.26e-01 0.0608 0.0763 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -15206 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00501 0.0747 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -55690 sc-eQTL 4.01e-02 -0.0986 0.0477 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -401593 sc-eQTL 4.84e-01 0.0488 0.0696 0.252 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA -162025 eQTL 0.0491 -0.0212 0.0107 0.0 0.0 0.242
ENSG00000135540 NHSL1 280484 eQTL 0.0307 -0.0598 0.0276 0.0 0.0 0.242
ENSG00000135597 REPS1 -15206 eQTL 7.48e-08 0.102 0.0188 0.00477 0.00269 0.242
ENSG00000146386 ABRACL -55690 eQTL 5.19e-14 -0.194 0.0254 0.0 0.0 0.242
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 eQTL 6.60e-03 -0.102 0.0376 0.00179 0.0 0.242


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -15206 3.32e-05 2.99e-05 5.15e-06 1.38e-05 4.31e-06 1.09e-05 3.71e-05 3.86e-06 2.5e-05 1.33e-05 3.47e-05 1.23e-05 4.26e-05 1.24e-05 6.5e-06 1.59e-05 1.32e-05 2.1e-05 6.7e-06 5.52e-06 1.29e-05 2.81e-05 2.63e-05 7.18e-06 3.73e-05 6.8e-06 1.14e-05 1.1e-05 2.78e-05 2.06e-05 1.83e-05 1.65e-06 2.25e-06 6.01e-06 9.6e-06 4.5e-06 2.62e-06 2.96e-06 4e-06 3.19e-06 1.63e-06 3.78e-05 3.34e-06 2.5e-07 2.11e-06 3.29e-06 3.35e-06 1.42e-06 1.41e-06
ENSG00000146386 ABRACL -55690 2.34e-05 2.41e-05 3.3e-06 1.2e-05 3.02e-06 7.51e-06 2.6e-05 3.4e-06 1.84e-05 9.85e-06 2.63e-05 8.28e-06 3.55e-05 9.05e-06 5.5e-06 1.13e-05 8.8e-06 1.49e-05 4.67e-06 4.38e-06 9.03e-06 2.08e-05 1.9e-05 5.06e-06 2.91e-05 5.36e-06 8.23e-06 8.17e-06 2.03e-05 1.58e-05 1.33e-05 1.01e-06 1.56e-06 4.56e-06 7.51e-06 3.71e-06 1.79e-06 2.61e-06 3.21e-06 2.66e-06 9.79e-07 3.1e-05 2.65e-06 1.7e-07 1.55e-06 2.74e-06 2.6e-06 1.16e-06 1.03e-06
ENSG00000226571 AL592429.2 -298307 6.01e-06 5.67e-06 8.35e-07 3.42e-06 1.12e-06 1.59e-06 5.27e-06 9.98e-07 5.1e-06 2.5e-06 5.67e-06 3.49e-06 8.24e-06 1.97e-06 1.02e-06 3.69e-06 2.06e-06 2.88e-06 1.45e-06 9.49e-07 2.62e-06 4.83e-06 3.49e-06 1.65e-06 5.16e-06 1.21e-06 2.43e-06 1.69e-06 4.24e-06 3.81e-06 2.83e-06 4.55e-07 6.52e-07 1.8e-06 2.19e-06 9.6e-07 8.9e-07 4.21e-07 1.04e-06 4.56e-07 1.67e-07 7.37e-06 4.73e-07 1.38e-07 5.77e-07 1.14e-06 8.5e-07 3.35e-07 5.44e-07