logo

Genes within 1Mb (chr6:138971856:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 7.22e-01 0.0314 0.0882 0.231 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0144 0.0673 0.231 B L1
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 3.33e-01 0.0651 0.0671 0.231 B L1
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 1.82e-01 -0.114 0.0854 0.231 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 2.88e-02 -0.165 0.075 0.231 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 6.59e-02 -0.0817 0.0442 0.231 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0564 0.109 0.231 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 3.47e-01 0.0646 0.0686 0.231 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0255 0.0764 0.231 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 1.81e-01 0.131 0.0974 0.231 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.00e-01 0.0254 0.0657 0.231 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0115 0.0619 0.231 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0907 0.0814 0.231 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000921 0.0641 0.231 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 4.28e-02 -0.095 0.0466 0.231 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 6.44e-01 0.0372 0.0803 0.231 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 1.53e-01 0.113 0.0788 0.231 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 2.79e-01 0.115 0.106 0.231 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0372 0.0695 0.231 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00883 0.0708 0.231 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 9.76e-01 0.00225 0.076 0.231 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00187 0.0715 0.231 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0575 0.0405 0.231 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 3.52e-01 0.0719 0.0771 0.231 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 5.90e-01 0.0505 0.0938 0.231 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 6.77e-01 0.0453 0.108 0.227 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.64e-01 -0.023 0.0763 0.227 DC L1
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00884 0.0894 0.227 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 2.42e-01 0.116 0.0992 0.227 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 5.08e-01 0.0583 0.0879 0.227 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 3.35e-01 0.083 0.086 0.227 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00958 0.102 0.227 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 2.75e-01 -0.114 0.104 0.227 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 7.91e-01 0.0207 0.078 0.231 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00538 0.054 0.231 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0827 0.071 0.231 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 4.20e-01 0.0822 0.102 0.231 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0322 0.0597 0.231 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.76e-01 -0.105 0.0774 0.231 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 7.84e-03 0.217 0.0808 0.231 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 7.67e-02 -0.187 0.105 0.231 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 7.34e-02 0.169 0.0941 0.232 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.61e-01 0.0254 0.0835 0.232 NK L1
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 4.25e-02 0.143 0.0702 0.232 NK L1
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 7.74e-01 0.0236 0.0819 0.232 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 7.41e-01 0.0258 0.078 0.232 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0667 0.0568 0.232 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 1.63e-01 0.106 0.0754 0.232 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 8.59e-01 -0.02 0.112 0.231 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0693 0.0725 0.231 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 4.10e-01 0.0739 0.0895 0.231 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0545 0.0813 0.231 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0513 0.0875 0.231 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0298 0.0573 0.231 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 2.76e-01 0.0732 0.0669 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 7.36e-01 0.0433 0.128 0.237 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 2.53e-01 0.128 0.112 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0716 0.0581 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.58e-01 -0.112 0.122 0.237 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0328 0.128 0.237 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 2.92e-01 0.122 0.115 0.237 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0677 0.0989 0.237 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0724 0.124 0.237 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 3.55e-01 -0.115 0.124 0.237 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 3.04e-01 0.112 0.109 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00572 0.0754 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 1.82e-01 0.128 0.0956 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0862 0.0941 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 3.48e-02 -0.214 0.101 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 7.56e-01 0.027 0.0866 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 8.07e-02 0.185 0.105 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0976 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 9.08e-01 0.0122 0.106 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 3.13e-01 0.114 0.113 0.233 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 8.78e-01 0.013 0.0849 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 4.16e-01 -0.086 0.106 0.233 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0295 0.0975 0.233 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 1.73e-01 -0.144 0.105 0.233 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0564 0.0835 0.233 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0131 0.107 0.233 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 1.40e-01 0.145 0.0975 0.233 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 7.06e-01 0.0455 0.12 0.233 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0673 0.105 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.65e-01 0.022 0.0736 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 4.52e-01 0.0752 0.0997 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 4.74e-02 -0.181 0.0905 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 8.60e-01 0.0149 0.0845 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0175 0.0591 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0158 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 2.64e-01 0.0899 0.0803 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0536 0.106 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 1.05e-01 0.168 0.103 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 8.17e-01 0.0164 0.0709 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 3.36e-01 -0.082 0.0851 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0322 0.0976 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0407 0.0931 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0496 0.0685 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 1.59e-01 -0.153 0.108 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 3.54e-01 0.103 0.111 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 8.34e-02 -0.176 0.101 0.232 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0266 0.108 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 4.07e-01 0.0774 0.0931 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0293 0.114 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00178 0.109 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.07e-01 0.0124 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 9.14e-01 0.0104 0.0964 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 6.93e-01 0.0383 0.0968 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 5.67e-01 0.0572 0.0998 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 1.45e-01 0.151 0.103 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 6.82e-01 0.0265 0.0645 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 1.39e-01 -0.126 0.0848 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0925 0.0802 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 7.44e-01 0.0233 0.0714 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0728 0.0478 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 6.09e-01 0.0418 0.0816 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 2.21e-01 0.101 0.0822 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 2.45e-01 0.117 0.1 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 9.21e-01 0.0074 0.075 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0346 0.094 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0796 0.0804 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0821 0.0762 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0792 0.0585 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 4.73e-01 0.0628 0.0873 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 3.75e-01 0.0838 0.0943 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0338 0.114 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 6.65e-01 0.0336 0.0774 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0429 0.09 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 1.67e-01 -0.122 0.0881 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 1.87e-01 0.127 0.096 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.16e-02 -0.172 0.0677 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 9.17e-01 0.00939 0.0902 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 9.41e-01 0.00704 0.0944 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 2.83e-01 0.126 0.117 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0273 0.0839 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0665 0.105 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 4.07e-01 0.0709 0.0854 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 4.01e-01 -0.077 0.0915 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 9.39e-02 -0.124 0.0736 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 2.79e-01 0.0934 0.0861 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0956 0.103 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00637 0.111 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0532 0.0708 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0952 0.0849 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0336 0.0855 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 4.72e-01 0.0618 0.0857 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0419 0.0449 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 1.92e-01 0.119 0.0906 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 9.23e-01 0.0101 0.104 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 3.51e-01 0.117 0.125 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 6.64e-01 0.0383 0.088 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 1.35e-01 0.174 0.116 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0744 0.0915 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0933 0.095 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 2.20e-03 -0.287 0.0926 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0305 0.0975 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0064 0.103 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 3.50e-01 0.107 0.114 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 9.19e-01 -0.012 0.119 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 4.39e-01 0.0829 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 7.91e-01 0.0296 0.111 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.75e-01 -0.116 0.0855 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 7.92e-02 0.163 0.0926 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0215 0.106 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0782 0.121 0.232 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000143 0.084 0.232 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 4.42e-01 0.0855 0.111 0.232 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 8.05e-01 0.0228 0.092 0.232 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0563 0.099 0.232 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 5.48e-01 0.0438 0.0728 0.232 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 8.87e-01 0.0123 0.0858 0.232 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 6.23e-01 0.0557 0.113 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 8.12e-01 0.023 0.0963 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 9.27e-01 0.00939 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 8.82e-01 0.0153 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0299 0.0956 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 2.71e-02 -0.194 0.0871 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 2.10e-01 0.118 0.0941 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 1.87e-01 0.136 0.103 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.25e-01 0.0322 0.0914 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 6.27e-03 0.222 0.0805 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0124 0.0886 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 6.10e-01 0.0429 0.084 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0516 0.0568 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 8.60e-02 0.13 0.0753 0.233 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0814 0.118 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 3.14e-01 0.101 0.101 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.0893 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.12e-02 0.237 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00847 0.109 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.73e-01 -0.122 0.0894 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 6.80e-02 0.175 0.0951 0.231 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 2.17e-02 0.243 0.105 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0453 0.0917 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 5.39e-01 0.0525 0.0854 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0362 0.0917 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0529 0.0947 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0855 0.0607 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 6.98e-01 0.031 0.0797 0.233 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 1.37e-01 -0.209 0.14 0.241 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 2.98e-01 0.131 0.125 0.241 PB L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 1.14e-01 0.15 0.0945 0.241 PB L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.75e-01 -0.136 0.153 0.241 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 4.77e-02 -0.269 0.134 0.241 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 8.51e-01 0.018 0.0956 0.241 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 3.38e-01 0.134 0.139 0.241 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 1.77e-01 -0.142 0.104 0.241 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 4.10e-01 -0.116 0.141 0.241 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 3.52e-01 -0.109 0.116 0.228 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0751 0.0928 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 8.27e-01 0.0188 0.0859 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 1.98e-01 -0.118 0.0915 0.228 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 3.65e-01 -0.098 0.108 0.228 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0751 0.0696 0.228 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 4.08e-02 0.169 0.0823 0.228 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 3.68e-01 0.0982 0.109 0.231 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 9.79e-01 0.00192 0.0745 0.231 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 3.17e-01 -0.117 0.117 0.231 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 8.14e-01 0.0213 0.0906 0.231 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 7.20e-01 0.0336 0.0938 0.231 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0999 0.0796 0.231 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 5.01e-01 0.0601 0.0891 0.231 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -267797 sc-eQTL 1.10e-01 0.163 0.101 0.231 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 6.35e-01 0.0531 0.112 0.227 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0762 0.08 0.227 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0448 0.106 0.227 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 4.75e-02 0.206 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 3.97e-01 -0.102 0.12 0.227 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 3.02e-01 0.101 0.0978 0.227 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 7.01e-01 -0.04 0.104 0.227 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 1.75e-01 -0.156 0.114 0.227 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 2.31e-01 -0.103 0.0858 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0281 0.0618 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0813 0.0709 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 5.08e-01 0.0687 0.104 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 7.17e-01 0.0336 0.0925 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0346 0.0778 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 2.98e-01 0.0847 0.0811 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 2.16e-01 -0.134 0.108 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 1.86e-01 0.131 0.099 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 4.15e-01 0.0555 0.0679 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0785 0.0838 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0483 0.106 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.11e-02 -0.17 0.1 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0682 0.0875 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 7.91e-03 0.229 0.0853 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 3.89e-01 -0.1 0.116 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 3.33e-01 0.125 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 4.76e-01 0.0879 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 8.42e-01 0.0228 0.114 0.224 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 2.41e-01 -0.144 0.122 0.224 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0121 0.127 0.224 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0177 0.0956 0.224 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 4.37e-01 0.0856 0.11 0.224 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 8.52e-01 0.022 0.117 0.224 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 2.06e-01 0.0995 0.0785 0.224 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 5.40e-01 0.0591 0.0963 0.224 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 4.76e-01 0.0758 0.106 0.224 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 3.51e-01 -0.102 0.11 0.224 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 7.84e-01 0.0275 0.1 0.224 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 6.76e-02 0.177 0.0965 0.224 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0665 0.119 0.224 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 4.42e-01 0.0822 0.107 0.224 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0953 0.0634 0.224 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 8.65e-01 0.0166 0.0977 0.224 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 2.59e-01 0.116 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0967 0.0771 0.224 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 3.58e-03 -0.269 0.0913 0.224 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 8.27e-03 0.207 0.0778 0.224 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0459 0.114 0.224 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00877 0.123 0.237 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 4.17e-01 0.0778 0.0956 0.237 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.10e-01 -0.106 0.104 0.237 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0569 0.0953 0.237 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.77e-01 0.00277 0.0966 0.237 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 6.83e-01 0.0432 0.106 0.237 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 1.29e-01 0.188 0.123 0.237 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 2.46e-01 -0.111 0.0954 0.237 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 1.34e-01 0.157 0.104 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.23e-01 0.0257 0.0724 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 8.06e-01 0.0235 0.0955 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 2.17e-01 -0.115 0.0928 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 8.93e-03 -0.251 0.095 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 6.04e-01 0.0347 0.0669 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.11 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 9.20e-01 0.00939 0.094 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 8.27e-01 -0.024 0.109 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 6.05e-01 0.0504 0.0974 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.49e-01 0.0216 0.0676 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 8.08e-01 0.0242 0.0992 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 5.23e-02 -0.176 0.0903 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0545 0.0776 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0305 0.0545 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -320142 sc-eQTL 2.45e-01 -0.133 0.114 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 2.39e-01 0.0976 0.0826 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -299506 sc-eQTL 1.44e-01 -0.142 0.0969 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00363 0.0793 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0177 0.0591 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 1.50e-01 -0.102 0.0708 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 8.10e-01 0.025 0.104 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00924 0.0855 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0386 0.076 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 1.20e-01 0.129 0.0828 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 1.46e-01 -0.162 0.111 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 5.88e-01 0.0585 0.108 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0287 0.0576 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 3.94e-01 0.0786 0.092 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 279285 sc-eQTL 3.02e-01 0.106 0.102 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0432 0.0637 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 3.67e-02 -0.194 0.0924 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 3.61e-02 0.168 0.0796 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 279308 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0126 0.113 0.231 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 sc-eQTL 8.67e-02 0.169 0.0983 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 568325 sc-eQTL 7.22e-01 0.0306 0.0858 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 864437 sc-eQTL 3.00e-02 0.156 0.0716 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163224 sc-eQTL 9.91e-01 0.00101 0.0844 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16405 sc-eQTL 3.81e-01 0.0722 0.0823 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -56889 sc-eQTL 1.37e-01 -0.079 0.0529 0.233 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -402792 sc-eQTL 1.48e-01 0.111 0.0765 0.233 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 198347 eQTL 0.0195 0.0415 0.0177 0.0 0.0 0.233
ENSG00000135597 REPS1 -16405 eQTL 1.8e-19 -0.166 0.018 0.0 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -16405 3.49e-05 2.96e-05 3.39e-06 1.31e-05 4.43e-06 1.2e-05 4.07e-05 3.72e-06 2.47e-05 1.07e-05 3.16e-05 1.33e-05 3.98e-05 1.1e-05 5.24e-06 1.33e-05 1.42e-05 1.96e-05 6.27e-06 4.81e-06 9.96e-06 2.55e-05 2.63e-05 6.73e-06 4.44e-05 6.06e-06 9.09e-06 8.93e-06 2.67e-05 2.02e-05 1.59e-05 1.63e-06 1.67e-06 4.87e-06 9.11e-06 3.76e-06 2.08e-06 2.7e-06 3.34e-06 2.3e-06 1.52e-06 3.32e-05 2.92e-06 3.63e-07 2.12e-06 2.77e-06 3.07e-06 1.29e-06 7.87e-07