logo

Genes within 1Mb (chr6:138971472:G:GA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 8.20e-01 0.02 0.0882 0.229 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00118 0.0673 0.229 B L1
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 3.13e-01 0.0678 0.067 0.229 B L1
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 1.49e-01 -0.124 0.0853 0.229 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 2.35e-02 -0.171 0.0749 0.229 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.36e-02 -0.0895 0.0441 0.229 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0691 0.109 0.229 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.51e-01 0.0789 0.0685 0.229 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0326 0.0764 0.229 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 2.40e-01 0.115 0.0978 0.229 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 6.42e-01 0.0307 0.0658 0.229 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0196 0.0621 0.229 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0996 0.0815 0.229 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0108 0.0643 0.229 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 3.38e-02 -0.0997 0.0467 0.229 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 5.37e-01 0.0498 0.0805 0.229 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 1.71e-01 0.108 0.079 0.229 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.05e-01 0.109 0.106 0.229 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0178 0.0695 0.229 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00697 0.0708 0.229 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00252 0.076 0.229 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0116 0.0715 0.229 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0611 0.0405 0.229 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.49e-01 0.089 0.077 0.229 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 6.20e-01 0.0465 0.0938 0.229 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 7.79e-01 0.0304 0.108 0.225 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00658 0.0762 0.225 DC L1
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 8.85e-01 0.0129 0.0893 0.225 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 2.32e-01 0.119 0.099 0.225 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 5.08e-01 0.0582 0.0878 0.225 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.67e-01 0.0627 0.086 0.225 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00281 0.102 0.225 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 2.91e-01 -0.11 0.104 0.225 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 6.95e-01 0.0306 0.0779 0.229 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 9.08e-01 0.00624 0.0539 0.229 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0812 0.0709 0.229 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 4.53e-01 0.0764 0.102 0.229 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0392 0.0596 0.229 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.40e-01 -0.114 0.0772 0.229 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 5.94e-03 0.224 0.0806 0.229 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 5.81e-02 -0.2 0.105 0.229 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 7.57e-02 0.168 0.0943 0.23 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 5.96e-01 0.0445 0.0837 0.23 NK L1
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 5.97e-02 0.133 0.0705 0.23 NK L1
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 8.48e-01 0.0157 0.0821 0.23 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 9.35e-01 0.0064 0.0782 0.23 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0729 0.0569 0.23 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 1.47e-01 0.11 0.0755 0.23 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0342 0.112 0.229 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0553 0.0724 0.229 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 3.87e-01 0.0774 0.0893 0.229 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0468 0.0812 0.229 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0497 0.0874 0.229 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0347 0.0572 0.229 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.64e-01 0.0749 0.0668 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 7.14e-01 0.0471 0.128 0.235 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 2.00e-01 0.144 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0723 0.0582 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.74e-01 -0.134 0.122 0.235 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0386 0.128 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.22e-01 0.0933 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0617 0.0992 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0688 0.125 0.235 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 3.66e-01 -0.113 0.125 0.235 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.19e-01 0.108 0.108 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 8.55e-01 0.0138 0.0753 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 1.51e-01 0.138 0.0954 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0802 0.094 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 3.61e-02 -0.212 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 7.36e-01 0.0292 0.0865 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 6.98e-02 0.192 0.105 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 6.25e-01 0.0477 0.0974 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 9.77e-01 0.00308 0.106 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.17e-01 0.112 0.112 0.231 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 6.88e-01 0.0339 0.0844 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 2.78e-01 -0.114 0.105 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0254 0.097 0.231 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 1.05e-01 -0.17 0.104 0.231 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0386 0.0831 0.231 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0243 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 9.47e-02 0.163 0.0969 0.231 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 6.22e-01 0.059 0.12 0.231 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0784 0.105 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 5.96e-01 0.0391 0.0737 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 3.84e-01 0.0871 0.0999 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 3.21e-02 -0.195 0.0905 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 8.05e-01 0.0209 0.0847 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0284 0.0592 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0187 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.29e-01 0.097 0.0804 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0695 0.106 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 1.17e-01 0.162 0.103 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 8.44e-01 0.014 0.0709 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0998 0.0849 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0198 0.0975 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0455 0.093 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0573 0.0684 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 1.43e-01 -0.159 0.108 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.98e-01 0.115 0.11 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 7.33e-02 -0.182 0.101 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 7.25e-01 -0.038 0.108 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 4.67e-01 0.0677 0.0929 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0375 0.113 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 9.18e-01 0.0109 0.106 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 8.51e-01 0.0181 0.0962 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 6.07e-01 0.0498 0.0966 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 5.20e-01 0.0641 0.0996 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 2.08e-01 0.131 0.103 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 6.15e-01 0.0326 0.0647 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 1.11e-01 -0.136 0.085 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.04e-01 -0.102 0.0803 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 9.29e-01 0.00636 0.0715 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0743 0.0479 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 5.32e-01 0.0511 0.0817 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 2.33e-01 0.0987 0.0824 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.14e-01 0.102 0.101 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 7.69e-01 0.0221 0.0752 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0403 0.0943 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0891 0.0806 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0901 0.0764 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0887 0.0586 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 4.26e-01 0.0698 0.0875 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 4.92e-01 0.065 0.0946 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 7.46e-01 -0.037 0.114 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 6.30e-01 0.0376 0.0778 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0613 0.0905 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 1.58e-01 -0.125 0.0885 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 1.19e-01 0.151 0.0963 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.34e-02 -0.17 0.0681 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 8.43e-01 0.018 0.0907 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 9.42e-01 0.00695 0.0949 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 2.94e-01 0.123 0.117 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000696 0.0838 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0647 0.104 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 4.00e-01 0.0719 0.0853 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0871 0.0913 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 9.24e-02 -0.124 0.0735 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.14e-01 0.107 0.0858 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0862 0.103 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0187 0.111 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0563 0.071 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0734 0.0853 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 7.27e-01 -0.03 0.0858 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 5.61e-01 0.0501 0.086 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0464 0.045 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 1.63e-01 0.127 0.0908 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0133 0.104 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.60e-01 0.115 0.125 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 5.85e-01 0.0482 0.088 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 1.48e-01 0.168 0.116 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0746 0.0915 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0966 0.095 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.88e-03 -0.292 0.0926 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0216 0.0975 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0283 0.103 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.114 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 2.38e-01 0.123 0.103 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000398 0.118 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 4.23e-01 0.0858 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 7.86e-01 0.0302 0.111 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.75e-01 -0.116 0.0854 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 5.39e-02 0.179 0.0923 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0144 0.106 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.51e-01 -0.113 0.121 0.229 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 9.66e-01 0.00361 0.084 0.229 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 5.31e-01 0.0697 0.111 0.229 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 7.14e-01 0.0338 0.092 0.229 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0444 0.099 0.229 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 5.37e-01 0.045 0.0728 0.229 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 7.63e-01 0.0259 0.0858 0.229 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 4.98e-01 0.0767 0.113 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 6.62e-01 0.0422 0.0963 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0024 0.103 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 9.57e-01 0.00552 0.103 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 7.78e-01 -0.027 0.0957 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 2.06e-02 -0.203 0.087 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.75e-01 0.103 0.0943 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 2.20e-01 0.127 0.103 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 5.98e-01 0.0483 0.0915 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 9.44e-03 0.212 0.0808 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0143 0.0888 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 6.49e-01 0.0384 0.0841 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 2.92e-01 -0.06 0.0568 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 7.63e-02 0.134 0.0754 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0639 0.118 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 2.09e-01 0.127 0.1 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 1.67e-01 0.124 0.0893 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 4.22e-02 0.224 0.11 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00542 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.60e-01 -0.126 0.0895 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 7.48e-02 0.171 0.0953 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 2.22e-02 0.243 0.105 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 8.11e-01 -0.022 0.0919 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 5.59e-01 0.05 0.0856 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0369 0.0919 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0786 0.0947 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0959 0.0608 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 6.46e-01 0.0366 0.0798 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 1.25e-01 -0.214 0.139 0.237 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 2.12e-01 0.155 0.124 0.237 PB L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 7.30e-02 0.169 0.0936 0.237 PB L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 3.68e-01 -0.137 0.152 0.237 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 4.17e-02 -0.274 0.133 0.237 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 8.09e-01 0.023 0.0949 0.237 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 4.42e-01 0.107 0.138 0.237 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.04e-01 -0.132 0.104 0.237 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 4.45e-01 -0.107 0.14 0.237 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.51e-01 -0.108 0.116 0.226 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0592 0.0925 0.226 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 6.99e-01 0.0332 0.0856 0.226 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.51e-01 -0.105 0.0912 0.226 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0957 0.108 0.226 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0766 0.0693 0.226 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 4.48e-02 0.166 0.082 0.226 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.98e-01 0.0922 0.109 0.229 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 8.52e-01 0.0139 0.0746 0.229 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 2.80e-01 -0.127 0.117 0.229 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 8.32e-01 0.0193 0.0907 0.229 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 6.12e-01 0.0477 0.0938 0.229 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 2.05e-01 -0.101 0.0796 0.229 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 4.32e-01 0.0702 0.0891 0.229 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -268181 sc-eQTL 8.63e-02 0.175 0.101 0.229 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 6.70e-01 0.0477 0.112 0.224 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0556 0.08 0.224 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0343 0.106 0.224 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 4.83e-02 0.204 0.103 0.224 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 3.92e-01 -0.103 0.12 0.224 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.64e-01 0.0718 0.0978 0.224 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0434 0.104 0.224 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 2.16e-01 -0.142 0.114 0.224 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0861 0.0859 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 7.34e-01 -0.021 0.0618 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0794 0.0709 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 5.58e-01 0.0608 0.104 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 8.33e-01 0.0195 0.0925 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0408 0.0778 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 2.24e-01 0.0988 0.0811 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 1.62e-01 -0.152 0.108 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 1.76e-01 0.134 0.0988 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 3.17e-01 0.068 0.0678 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0781 0.0837 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0503 0.106 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 8.34e-02 -0.174 0.0999 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0724 0.0873 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 6.28e-03 0.235 0.0851 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 3.67e-01 -0.105 0.116 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.33e-01 0.125 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 4.76e-01 0.0879 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 8.42e-01 0.0228 0.114 0.224 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.41e-01 -0.144 0.122 0.224 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0121 0.127 0.224 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0177 0.0956 0.224 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 4.37e-01 0.0856 0.11 0.224 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 9.55e-01 0.00659 0.117 0.222 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 1.51e-01 0.113 0.0781 0.222 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 4.73e-01 0.0689 0.0959 0.222 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 4.73e-01 0.0759 0.106 0.222 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 3.03e-01 -0.113 0.109 0.222 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 9.02e-01 0.0123 0.0998 0.222 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 6.19e-02 0.18 0.0961 0.222 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0679 0.119 0.222 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 3.57e-01 0.0985 0.107 0.222 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0938 0.0633 0.222 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 8.88e-01 0.0137 0.0976 0.222 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 2.50e-01 0.118 0.102 0.222 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0945 0.077 0.222 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 2.95e-03 -0.274 0.0911 0.222 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 7.22e-03 0.211 0.0776 0.222 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0617 0.114 0.222 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0204 0.123 0.234 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 4.33e-01 0.0749 0.0953 0.234 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0683 0.104 0.234 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0536 0.0949 0.234 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0092 0.0963 0.234 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 6.15e-01 0.0529 0.105 0.234 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 1.14e-01 0.195 0.123 0.234 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 2.65e-01 -0.106 0.0951 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 1.49e-01 0.151 0.104 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 5.21e-01 0.0465 0.0723 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 9.82e-01 0.0022 0.0954 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 2.08e-01 -0.117 0.0927 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 4.18e-03 -0.274 0.0946 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.66e-01 0.0487 0.0668 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 3.11e-01 0.112 0.11 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 6.94e-01 0.037 0.0939 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0233 0.109 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 6.74e-01 0.0412 0.0977 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 6.32e-01 0.0325 0.0677 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 9.05e-01 0.0119 0.0995 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 5.07e-02 -0.178 0.0906 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0489 0.0778 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0384 0.0546 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -320526 sc-eQTL 2.29e-01 -0.137 0.114 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 1.93e-01 0.108 0.0828 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -299890 sc-eQTL 1.04e-01 -0.158 0.0971 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 9.27e-01 0.00729 0.0793 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00654 0.0591 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 1.49e-01 -0.102 0.0708 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 8.80e-01 0.0157 0.104 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0234 0.0855 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0439 0.076 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 9.22e-02 0.14 0.0827 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 1.13e-01 -0.176 0.111 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 6.25e-01 0.0527 0.108 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0212 0.0575 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 3.69e-01 0.0826 0.0918 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 278901 sc-eQTL 2.83e-01 0.11 0.102 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0446 0.0636 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 2.56e-02 -0.207 0.0921 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 3.23e-02 0.171 0.0794 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 278924 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0273 0.113 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 sc-eQTL 1.03e-01 0.162 0.0986 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 567941 sc-eQTL 5.64e-01 0.0497 0.086 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 864053 sc-eQTL 3.85e-02 0.15 0.0719 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -163608 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00783 0.0846 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -16789 sc-eQTL 5.32e-01 0.0517 0.0826 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -57273 sc-eQTL 9.34e-02 -0.0893 0.053 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -403176 sc-eQTL 1.27e-01 0.118 0.0767 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 197963 eQTL 0.0177 0.0422 0.0178 0.0 0.0 0.234
ENSG00000135540 NHSL1 278901 eQTL 0.0462 0.0546 0.0274 0.0 0.0 0.234
ENSG00000135597 REPS1 -16789 eQTL 2.3e-19 -0.166 0.0181 0.0 0.0 0.234

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -16789 0.000129 4.74e-05 4.47e-06 1.62e-05 2.96e-06 1.68e-05 7.63e-05 1.91e-06 2.88e-05 7.9e-06 3.3e-05 1.39e-05 4.49e-05 1.07e-05 4.91e-06 1.34e-05 1.38e-05 2.91e-05 5.69e-06 3.13e-06 9.65e-06 3.5e-05 3.93e-05 4.21e-06 3.83e-05 6.6e-06 8.33e-06 5.4e-06 4.39e-05 1.69e-05 1.46e-05 4.86e-07 1.24e-06 6.33e-06 6.89e-06 3e-06 2.62e-06 1.93e-06 3.15e-06 2.18e-06 1.2e-06 0.000105 4.5e-06 5.27e-07 7.57e-07 2.33e-06 4.06e-06 6.82e-07 5.43e-07