logo

Genes within 1Mb (chr6:138967827:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0442 0.0832 0.246 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0313 0.0635 0.246 B L1
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0351 0.0634 0.246 B L1
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 1.33e-01 -0.121 0.0805 0.246 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 6.55e-02 0.131 0.071 0.246 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 5.63e-02 0.08 0.0417 0.246 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 5.11e-02 0.2 0.102 0.246 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 3.09e-01 0.066 0.0647 0.246 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0279 0.0721 0.246 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00817 0.0946 0.246 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 3.06e-01 0.065 0.0633 0.246 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 4.94e-02 0.117 0.0593 0.246 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 4.20e-01 0.0637 0.0788 0.246 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0132 0.062 0.246 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0381 0.0454 0.246 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00886 0.0777 0.246 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0522 0.0765 0.246 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0365 0.102 0.246 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 3.59e-01 0.061 0.0664 0.246 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 1.22e-01 0.105 0.0674 0.246 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 8.74e-01 0.0115 0.0728 0.246 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 9.85e-01 0.00125 0.0685 0.246 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 4.67e-02 -0.0773 0.0386 0.246 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 7.73e-01 0.0214 0.074 0.246 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 6.26e-01 0.0438 0.0898 0.246 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 2.76e-01 0.109 0.0997 0.25 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 4.00e-01 0.0592 0.0702 0.25 DC L1
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 2.85e-01 0.0881 0.0821 0.25 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0313 0.0916 0.25 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 5.42e-01 0.0494 0.081 0.25 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.20e-01 -0.123 0.0789 0.25 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000606 0.0942 0.25 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 7.02e-01 0.0367 0.0958 0.25 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0704 0.0716 0.246 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 8.03e-01 0.0124 0.0497 0.246 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 9.48e-01 0.00425 0.0655 0.246 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0285 0.0938 0.246 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 5.63e-01 0.0318 0.0549 0.246 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 3.07e-04 -0.254 0.0693 0.246 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0529 0.0755 0.246 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 4.52e-02 0.195 0.0966 0.246 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0528 0.0875 0.245 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00831 0.0772 0.245 NK L1
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 8.40e-01 0.0133 0.0655 0.245 NK L1
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 6.07e-01 0.039 0.0757 0.245 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.66e-01 0.0122 0.0721 0.245 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 2.49e-02 -0.117 0.052 0.245 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 3.21e-01 0.0695 0.0698 0.245 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 9.02e-01 0.013 0.106 0.246 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 8.98e-02 0.116 0.0679 0.246 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 2.03e-01 0.107 0.0841 0.246 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 5.23e-01 -0.049 0.0766 0.246 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 6.43e-01 0.0383 0.0824 0.246 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0534 0.0539 0.246 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0371 0.0632 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 1.83e-01 -0.158 0.118 0.242 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 1.28e-01 -0.159 0.104 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0118 0.0541 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.89e-01 0.0304 0.113 0.242 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0204 0.119 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 4.64e-01 0.0787 0.107 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 2.08e-01 0.116 0.0915 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 1.41e-01 0.17 0.115 0.242 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0977 0.115 0.242 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 6.06e-01 0.0528 0.102 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 4.76e-01 0.0505 0.0707 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 5.95e-01 -0.048 0.09 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 2.26e-01 -0.107 0.0882 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.57e-01 0.0173 0.0955 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 4.76e-01 -0.058 0.0812 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 8.74e-01 0.0159 0.0996 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0494 0.0916 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0887 0.099 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.61e-01 0.0316 0.104 0.244 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0316 0.078 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 3.98e-01 0.0823 0.0971 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 6.61e-01 0.0393 0.0896 0.244 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 7.53e-02 0.172 0.0964 0.244 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0758 0.0767 0.244 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0175 0.098 0.244 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0443 0.0901 0.244 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0945 0.11 0.244 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.89e-01 -0.026 0.097 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0558 0.0681 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0849 0.0922 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 2.36e-01 -0.1 0.0843 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 2.44e-01 0.0911 0.078 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 5.59e-02 0.104 0.0542 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 9.19e-03 0.265 0.101 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 4.89e-01 0.0516 0.0745 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0129 0.0978 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 8.55e-01 0.0172 0.0942 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0527 0.0643 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 1.51e-01 0.111 0.0771 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0616 0.0886 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0155 0.0846 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 3.33e-01 0.0603 0.0622 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 8.53e-01 0.0183 0.0986 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 3.18e-01 -0.101 0.1 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0298 0.0924 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 2.85e-01 0.108 0.101 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0543 0.0874 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 7.52e-01 0.0338 0.107 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 4.08e-01 0.0846 0.102 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 2.81e-01 0.107 0.0989 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 8.22e-01 0.0203 0.0904 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 2.63e-01 0.102 0.0906 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 1.08e-01 0.15 0.0931 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.42e-01 0.0603 0.0986 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 2.98e-01 0.064 0.0614 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 3.60e-01 0.0745 0.0811 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 6.94e-01 0.0303 0.0767 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0156 0.068 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 9.23e-01 0.00444 0.0458 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 7.41e-01 0.0258 0.0778 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0415 0.0786 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 1.57e-01 -0.136 0.0961 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 7.14e-01 0.0264 0.0718 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00188 0.0901 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 6.47e-01 0.0354 0.0771 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0181 0.0732 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0551 0.0562 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0651 0.0836 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 2.54e-01 -0.103 0.0902 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00291 0.108 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0045 0.0737 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 3.44e-01 0.081 0.0855 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00524 0.0841 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00609 0.0916 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0292 0.0653 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 9.00e-01 0.0108 0.0858 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0904 0.0895 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 9.37e-01 0.00854 0.109 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 4.14e-01 0.0635 0.0775 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 2.26e-02 0.22 0.0957 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0289 0.0791 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 7.13e-01 0.0312 0.0847 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0779 0.0683 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0198 0.0798 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 5.83e-02 0.181 0.0949 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.35e-01 0.0358 0.106 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 1.07e-01 0.109 0.0672 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 6.61e-01 0.0357 0.0812 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.89e-01 0.0219 0.0816 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 6.79e-01 0.0339 0.0818 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0607 0.0427 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 5.42e-01 0.053 0.0867 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 9.99e-01 0.000144 0.0993 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 2.52e-01 0.132 0.115 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 6.22e-01 -0.04 0.081 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 1.02e-01 0.175 0.106 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.60e-01 0.0258 0.0843 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 9.96e-02 -0.144 0.0871 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 6.98e-02 0.158 0.0866 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0598 0.0897 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 2.87e-01 -0.101 0.0945 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 9.94e-01 0.00087 0.11 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 5.17e-01 0.0645 0.0995 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 4.33e-01 0.0891 0.113 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 5.53e-01 0.0608 0.102 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0823 0.107 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.61e-01 -0.115 0.0819 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 7.68e-01 0.0264 0.0894 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0184 0.102 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.64e-01 0.0663 0.115 0.245 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 1.23e-01 0.122 0.0791 0.245 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 6.84e-03 0.283 0.103 0.245 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0999 0.0869 0.245 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 3.43e-01 0.0891 0.0937 0.245 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0922 0.0688 0.245 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00827 0.0813 0.245 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0336 0.102 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 4.04e-01 0.0728 0.0871 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 7.16e-01 -0.034 0.0934 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0204 0.0929 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 9.35e-01 0.00712 0.0867 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 9.22e-01 0.00779 0.0799 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0561 0.0856 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0448 0.0946 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0234 0.084 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0598 0.0752 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 3.16e-01 0.0816 0.0813 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 6.88e-01 0.031 0.0772 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 3.53e-02 -0.11 0.0517 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 1.29e-01 0.106 0.0693 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 4.61e-01 0.0799 0.108 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 9.16e-01 0.00979 0.0924 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0788 0.0819 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 8.29e-01 0.0219 0.101 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 6.12e-01 0.0508 0.1 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0404 0.0823 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 3.63e-02 0.183 0.0869 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 2.47e-01 -0.113 0.0973 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 9.65e-01 0.00374 0.0841 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 7.13e-01 0.0289 0.0783 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0411 0.084 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0723 0.0866 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0737 0.0557 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 8.46e-01 0.0142 0.073 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 4.79e-02 -0.237 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.27 PB L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 7.55e-01 0.0256 0.0817 0.27 PB L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0461 0.131 0.27 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 1.67e-02 0.277 0.114 0.27 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0686 0.0815 0.27 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 9.91e-01 0.00136 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 3.80e-01 0.0789 0.0896 0.27 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 1.73e-01 0.164 0.12 0.27 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0185 0.11 0.246 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 7.05e-01 0.0333 0.0878 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0192 0.0812 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0492 0.0867 0.246 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0268 0.102 0.246 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 7.47e-01 0.0213 0.0659 0.246 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 1.73e-01 -0.107 0.0782 0.246 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.42e-01 0.0625 0.102 0.246 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 5.83e-01 0.0384 0.0699 0.246 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 2.82e-04 0.394 0.107 0.246 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 8.81e-01 0.0128 0.0851 0.246 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 1.79e-01 0.118 0.0877 0.246 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0357 0.075 0.246 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 8.70e-01 0.0137 0.0837 0.246 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -271826 sc-eQTL 2.35e-01 -0.114 0.0954 0.246 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 2.17e-01 0.123 0.0993 0.251 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 5.97e-01 0.0378 0.0714 0.251 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 4.22e-01 0.0762 0.0946 0.251 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0149 0.0927 0.251 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 4.04e-01 0.0893 0.107 0.251 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 8.52e-02 -0.15 0.0867 0.251 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.0927 0.251 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 7.86e-01 0.0279 0.102 0.251 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0404 0.0781 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 7.64e-01 0.0169 0.0561 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 9.43e-01 0.00465 0.0646 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0723 0.0939 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00351 0.084 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.69e-04 -0.262 0.0683 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0296 0.0738 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 3.67e-02 0.205 0.0975 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0107 0.0895 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0621 0.0611 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 8.66e-01 0.0128 0.0756 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 1.28e-01 0.146 0.0953 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0359 0.0907 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.09e-02 -0.199 0.0776 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0659 0.0779 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 3.33e-01 0.102 0.105 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.43e-01 0.0421 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0581 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 2.46e-01 0.132 0.113 0.221 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0364 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 2.99e-01 -0.131 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.78e-01 0.128 0.0944 0.221 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 2.13e-01 0.136 0.109 0.221 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0571 0.107 0.244 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0457 0.0716 0.244 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.71e-01 0.0255 0.0876 0.244 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0512 0.0965 0.244 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 5.93e-01 0.0534 0.0998 0.244 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 2.91e-02 -0.198 0.09 0.244 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0994 0.0882 0.244 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 6.75e-01 0.0454 0.108 0.244 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0286 0.097 0.247 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 5.93e-01 0.031 0.0578 0.247 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0504 0.0886 0.247 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 2.49e-01 -0.107 0.0929 0.247 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 8.00e-02 0.123 0.0697 0.247 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 3.45e-03 -0.245 0.0828 0.247 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0494 0.0717 0.247 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 1.62e-01 0.145 0.103 0.247 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 7.43e-01 0.0365 0.111 0.246 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 9.82e-01 0.002 0.0866 0.246 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 5.79e-01 0.0523 0.0942 0.246 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 8.33e-01 0.0182 0.0862 0.246 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 1.73e-01 0.119 0.0868 0.246 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0226 0.0954 0.246 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 5.56e-01 0.0661 0.112 0.246 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 7.89e-01 0.0232 0.0865 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00377 0.0988 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 9.97e-01 0.000275 0.0685 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 6.47e-01 0.0413 0.0902 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0659 0.0878 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 6.11e-01 0.0464 0.0911 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0288 0.0632 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 6.09e-01 0.0536 0.105 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0433 0.0887 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 3.24e-01 -0.102 0.103 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0518 0.0909 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0723 0.0629 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0595 0.0925 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 2.20e-01 -0.104 0.0847 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 5.79e-01 0.0403 0.0725 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 6.18e-02 0.0947 0.0504 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -324171 sc-eQTL 3.81e-02 0.22 0.105 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 3.49e-01 0.0724 0.0772 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0168 0.0909 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0377 0.072 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 7.80e-01 0.015 0.0537 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 7.43e-01 0.0213 0.0646 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0233 0.0945 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0255 0.0777 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 1.55e-04 -0.258 0.0668 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0602 0.0756 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 7.46e-02 0.18 0.101 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0599 0.0983 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 5.87e-01 0.0286 0.0525 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 8.68e-01 -0.014 0.084 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 275256 sc-eQTL 6.45e-01 -0.043 0.0933 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 9.67e-02 0.0964 0.0578 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 5.31e-03 -0.235 0.0835 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 2.52e-01 -0.084 0.0731 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 275279 sc-eQTL 2.19e-01 0.127 0.103 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 194318 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0497 0.0908 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 564296 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0119 0.0788 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 860408 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00512 0.0665 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -167253 sc-eQTL 6.03e-01 0.0404 0.0774 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -20434 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00435 0.0757 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -60918 sc-eQTL 2.90e-02 -0.106 0.0483 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -406821 sc-eQTL 2.40e-01 0.0829 0.0704 0.246 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 275256 eQTL 0.0244 -0.0625 0.0277 0.0 0.0 0.241
ENSG00000135597 REPS1 -20434 pQTL 0.0463 0.0581 0.0291 0.0 0.0 0.249
ENSG00000135597 REPS1 -20434 eQTL 2.26e-08 0.106 0.0188 0.00756 0.00638 0.241
ENSG00000146386 ABRACL -60918 eQTL 5.52e-14 -0.195 0.0255 0.0 0.0 0.241
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 eQTL 8.97e-03 -0.0989 0.0378 0.00157 0.0 0.241

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -20434 2.1e-05 2.61e-05 4.31e-06 1.31e-05 4.14e-06 1.07e-05 3.35e-05 3.51e-06 2.24e-05 1.1e-05 2.88e-05 1.19e-05 3.88e-05 1.07e-05 5.8e-06 1.26e-05 1.24e-05 1.83e-05 6.78e-06 5.18e-06 9.65e-06 2.37e-05 2.35e-05 6.73e-06 3.6e-05 5.77e-06 9.54e-06 9.24e-06 2.65e-05 2.19e-05 1.46e-05 1.67e-06 2.15e-06 5.74e-06 9.3e-06 4.56e-06 2.48e-06 2.85e-06 3.62e-06 2.99e-06 1.69e-06 2.9e-05 2.63e-06 3.55e-07 1.98e-06 2.97e-06 3.4e-06 1.43e-06 1.1e-06
ENSG00000146386 ABRACL -60918 1.07e-05 1.43e-05 1.96e-06 8.21e-06 2.39e-06 5.45e-06 1.55e-05 2.2e-06 1.2e-05 5.89e-06 1.58e-05 6.61e-06 2.18e-05 4.75e-06 3.95e-06 6.97e-06 6.57e-06 9.51e-06 3.53e-06 3.04e-06 6.05e-06 1.15e-05 1.13e-05 3.54e-06 2.31e-05 4.34e-06 6.59e-06 5.13e-06 1.41e-05 1.19e-05 8.13e-06 9.78e-07 1.14e-06 3.64e-06 5.77e-06 2.86e-06 1.76e-06 1.99e-06 1.96e-06 1.42e-06 9.78e-07 1.65e-05 1.38e-06 2.62e-07 8.27e-07 1.85e-06 1.8e-06 7.16e-07 4.32e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -303535 1.29e-06 1.22e-06 3.28e-07 1.17e-06 2.98e-07 4.79e-07 1.34e-06 3.28e-07 1.39e-06 3.77e-07 1.52e-06 5.98e-07 2.12e-06 2.89e-07 5.56e-07 7.17e-07 8.95e-07 5.47e-07 7.7e-07 6.36e-07 4.57e-07 1.22e-06 9.29e-07 6.2e-07 2.05e-06 3.63e-07 6.85e-07 7.16e-07 1.23e-06 1.24e-06 6.29e-07 2.86e-07 2.19e-07 7.11e-07 5.92e-07 3.91e-07 6.91e-07 2.92e-07 4.53e-07 2.66e-07 2.12e-07 1.51e-06 1.14e-07 1.96e-07 1.59e-07 1.22e-07 2.41e-07 6.95e-08 6.27e-08