logo

Genes within 1Mb (chr6:138964189:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0284 0.0834 0.25 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0359 0.0636 0.25 B L1
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0447 0.0635 0.25 B L1
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 2.67e-01 -0.09 0.0808 0.25 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.50e-02 0.127 0.0711 0.25 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.09e-01 0.0673 0.0418 0.25 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 5.39e-02 0.198 0.102 0.25 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.36e-01 0.0507 0.0649 0.25 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0435 0.0722 0.25 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 9.03e-01 0.0115 0.0945 0.25 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 3.73e-01 0.0566 0.0633 0.25 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 4.54e-02 0.119 0.0593 0.25 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 2.57e-01 0.0893 0.0786 0.25 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0223 0.062 0.25 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0444 0.0454 0.25 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00918 0.0776 0.25 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0258 0.0765 0.25 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0412 0.102 0.25 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 3.34e-01 0.0644 0.0666 0.25 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 1.65e-01 0.0942 0.0677 0.25 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.50e-01 0.0436 0.0729 0.25 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0426 0.0686 0.25 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 2.87e-02 -0.0851 0.0386 0.25 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 8.21e-01 0.0168 0.0742 0.25 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 6.41e-01 0.042 0.0901 0.25 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 2.28e-01 0.121 0.0996 0.255 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 3.74e-01 0.0625 0.0702 0.255 DC L1
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 1.88e-01 0.108 0.082 0.255 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0179 0.0917 0.255 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 6.98e-01 0.0315 0.0811 0.255 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.77e-01 -0.107 0.0791 0.255 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0238 0.0942 0.255 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 8.70e-01 0.0156 0.0958 0.255 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0456 0.0717 0.25 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 8.78e-01 0.00763 0.0496 0.25 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 6.81e-01 0.0269 0.0654 0.25 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0263 0.0937 0.25 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 3.99e-01 0.0463 0.0548 0.25 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 4.81e-04 -0.246 0.0694 0.25 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0624 0.0754 0.25 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 5.50e-02 0.186 0.0966 0.25 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0461 0.0877 0.249 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00812 0.0773 0.249 NK L1
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 8.45e-01 0.0129 0.0656 0.249 NK L1
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 4.45e-01 0.058 0.0757 0.249 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.41e-01 0.0239 0.0722 0.249 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.92e-02 -0.123 0.052 0.249 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.03e-01 0.0586 0.07 0.249 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 9.39e-01 0.00812 0.106 0.25 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 8.24e-02 0.119 0.0681 0.25 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 2.74e-01 0.0925 0.0844 0.25 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 9.48e-01 0.00505 0.0769 0.25 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 8.96e-01 0.0108 0.0827 0.25 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0532 0.054 0.25 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0486 0.0633 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 2.16e-01 -0.147 0.118 0.247 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 1.58e-01 -0.147 0.104 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0156 0.0541 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 7.55e-01 0.0355 0.113 0.247 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0461 0.119 0.247 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.83e-01 0.0937 0.107 0.247 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 1.85e-01 0.122 0.0914 0.247 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 2.56e-01 0.131 0.115 0.247 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 3.32e-01 -0.112 0.115 0.247 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 5.57e-01 0.0601 0.102 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 4.56e-01 0.0528 0.0708 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 5.50e-01 -0.054 0.0901 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0691 0.0885 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.97e-01 0.0247 0.0956 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0393 0.0813 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 9.17e-01 0.0104 0.0997 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0738 0.0916 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0991 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 5.79e-01 0.0577 0.104 0.248 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0271 0.0781 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 3.63e-01 0.0886 0.0972 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.32e-01 0.0561 0.0897 0.248 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 6.56e-02 0.179 0.0965 0.248 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0819 0.0768 0.248 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0194 0.0982 0.248 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0369 0.0902 0.248 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0982 0.111 0.248 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0148 0.0969 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0653 0.068 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0788 0.0922 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0763 0.0844 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 3.22e-01 0.0774 0.078 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 6.84e-02 0.0994 0.0543 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 1.29e-02 0.253 0.101 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 5.48e-01 0.0448 0.0745 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0204 0.0978 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.00e-01 0.0239 0.0941 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0529 0.0642 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 1.54e-01 0.11 0.0769 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0252 0.0885 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0241 0.0845 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.55e-01 0.0576 0.0621 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 6.84e-01 0.0401 0.0985 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 2.79e-01 -0.109 0.1 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0553 0.0922 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 2.92e-01 0.107 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0565 0.0875 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 6.88e-01 0.0429 0.107 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.102 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 3.10e-01 0.101 0.0991 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 8.78e-01 0.0139 0.0905 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 2.29e-01 0.109 0.0906 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 7.76e-02 0.165 0.0931 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 4.25e-01 0.0788 0.0986 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 3.39e-01 0.0589 0.0615 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 2.89e-01 0.0862 0.0811 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 4.71e-01 0.0554 0.0767 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0202 0.0681 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00419 0.0458 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 7.61e-01 0.0237 0.0778 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0123 0.0787 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 2.05e-01 -0.122 0.0964 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 7.43e-01 0.0237 0.072 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 9.18e-01 0.00935 0.0903 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 3.92e-01 0.0663 0.0773 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0176 0.0734 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0686 0.0562 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0624 0.0838 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 3.43e-01 -0.086 0.0905 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 7.87e-01 0.0293 0.108 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0199 0.0738 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 4.11e-01 0.0706 0.0856 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 9.72e-01 0.00291 0.0842 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0335 0.0917 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0276 0.0654 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0015 0.0859 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0939 0.0897 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00987 0.109 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 3.55e-01 0.0719 0.0776 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 1.57e-02 0.233 0.0957 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00776 0.0792 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 8.54e-01 0.0156 0.0848 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0865 0.0684 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 8.22e-01 -0.018 0.0799 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 5.93e-02 0.18 0.0951 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 7.37e-01 0.0357 0.106 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 1.17e-01 0.106 0.0674 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 8.58e-01 0.0146 0.0815 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.50e-01 0.049 0.0818 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 9.99e-01 0.000111 0.0821 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0623 0.0428 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 5.43e-01 0.053 0.0869 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 9.67e-01 0.00409 0.0996 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 2.84e-01 0.124 0.115 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0536 0.0811 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 1.88e-01 0.141 0.107 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.24e-01 0.0539 0.0844 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 8.65e-02 -0.15 0.0871 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 5.33e-02 0.169 0.0867 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 3.74e-01 -0.08 0.0897 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 2.22e-01 -0.116 0.0946 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.00e-01 0.0278 0.109 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 4.81e-01 0.0703 0.0994 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 4.10e-01 0.0936 0.113 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.52e-01 0.0611 0.102 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 3.88e-01 -0.092 0.107 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.35e-01 -0.123 0.0818 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 7.49e-01 0.0286 0.0893 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 9.76e-01 0.00312 0.102 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.45e-01 0.0225 0.115 0.249 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 1.90e-01 0.104 0.0792 0.249 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 2.31e-02 0.238 0.104 0.249 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0572 0.0871 0.249 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 5.35e-01 0.0583 0.0938 0.249 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0715 0.0689 0.249 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 6.76e-01 -0.034 0.0812 0.249 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0184 0.102 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 6.19e-01 0.0434 0.0872 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0118 0.0934 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 8.38e-01 -0.019 0.0929 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 8.05e-01 0.0214 0.0866 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 9.42e-01 0.00578 0.0798 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0713 0.0855 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 6.51e-01 -0.043 0.0948 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 8.87e-01 -0.012 0.0842 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 4.26e-01 -0.06 0.0753 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 2.28e-01 0.0982 0.0813 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 5.50e-01 0.0463 0.0772 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.95e-02 -0.122 0.0517 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 1.80e-01 0.0935 0.0695 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 4.45e-01 0.0831 0.108 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 9.77e-01 0.00265 0.0925 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0724 0.0821 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 7.54e-01 0.0318 0.102 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 6.23e-01 0.0493 0.1 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 5.94e-01 -0.044 0.0824 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.33e-02 0.177 0.0872 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 2.88e-01 -0.104 0.0973 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 9.75e-01 0.00261 0.0841 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 6.64e-01 0.0341 0.0783 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0133 0.084 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0645 0.0866 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0717 0.0557 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 9.01e-01 0.00906 0.073 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 6.08e-02 -0.227 0.12 0.274 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 2.94e-01 -0.113 0.108 0.274 PB L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 7.43e-01 0.027 0.0823 0.274 PB L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0446 0.132 0.274 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 2.64e-02 0.259 0.115 0.274 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0703 0.0821 0.274 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 9.36e-01 0.0096 0.12 0.274 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.54e-01 0.0679 0.0903 0.274 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 1.24e-01 0.186 0.12 0.274 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000473 0.11 0.25 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 7.47e-01 0.0285 0.088 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0289 0.0813 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0338 0.0869 0.25 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0362 0.102 0.25 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 7.77e-01 0.0187 0.066 0.25 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 1.63e-01 -0.11 0.0783 0.25 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 4.44e-01 0.0785 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 7.23e-01 0.0249 0.07 0.25 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 1.72e-04 0.408 0.107 0.25 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 6.74e-01 0.0359 0.0851 0.25 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 2.16e-01 0.109 0.0878 0.25 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0486 0.075 0.25 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 9.88e-01 0.00127 0.0838 0.25 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -275464 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0937 0.0956 0.25 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 1.74e-01 0.136 0.0995 0.256 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 4.86e-01 0.05 0.0716 0.256 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 2.87e-01 0.101 0.0948 0.256 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 9.49e-01 0.00598 0.0931 0.256 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 6.07e-01 0.0553 0.107 0.256 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 1.40e-01 -0.129 0.0872 0.256 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0276 0.093 0.256 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 9.11e-01 0.0114 0.103 0.256 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0165 0.078 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 8.21e-01 0.0127 0.0561 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 6.93e-01 0.0255 0.0645 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0702 0.0938 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 8.64e-01 0.0144 0.0838 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.17e-04 -0.25 0.0684 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0378 0.0737 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 3.05e-02 0.212 0.0973 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.55e-01 0.0163 0.0894 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 2.80e-01 -0.066 0.061 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 8.15e-01 0.0177 0.0756 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 1.67e-01 0.132 0.0953 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0249 0.0906 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 9.67e-03 -0.202 0.0775 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0812 0.0778 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 4.58e-01 0.078 0.105 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 7.08e-01 0.0479 0.128 0.224 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0557 0.122 0.224 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 2.27e-01 0.137 0.113 0.224 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0385 0.121 0.224 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 3.36e-01 -0.121 0.125 0.224 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 2.10e-01 0.118 0.0941 0.224 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 2.44e-01 0.127 0.109 0.224 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0453 0.107 0.249 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0489 0.0717 0.249 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 6.29e-01 0.0424 0.0878 0.249 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 7.49e-01 -0.031 0.0968 0.249 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 6.09e-01 0.0512 0.1 0.249 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.84e-02 -0.188 0.0903 0.249 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0858 0.0884 0.249 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 6.71e-01 0.0461 0.109 0.249 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 7.66e-01 -0.029 0.0972 0.251 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 5.27e-01 0.0367 0.0579 0.251 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0236 0.0888 0.251 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 2.31e-01 -0.112 0.093 0.251 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 5.28e-02 0.136 0.0697 0.251 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 3.34e-03 -0.246 0.0829 0.251 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0644 0.0718 0.251 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 1.41e-01 0.152 0.103 0.251 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.41e-01 0.0223 0.111 0.251 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0179 0.0865 0.251 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.08e-01 0.0624 0.094 0.251 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 8.56e-01 0.0156 0.0861 0.251 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 1.92e-01 0.114 0.0867 0.251 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0202 0.0953 0.251 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 5.93e-01 0.0599 0.112 0.251 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 8.08e-01 0.0211 0.0865 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 9.09e-01 0.0113 0.099 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 9.33e-01 0.00578 0.0685 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 6.54e-01 0.0405 0.0903 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0328 0.088 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 5.48e-01 0.055 0.0912 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0224 0.0632 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 6.65e-01 0.0455 0.105 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0606 0.0888 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 2.31e-01 -0.124 0.103 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0434 0.091 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0808 0.0629 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0563 0.0927 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0733 0.085 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 7.13e-01 0.0267 0.0726 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 8.92e-02 0.0863 0.0506 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -327809 sc-eQTL 3.55e-02 0.223 0.106 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 3.98e-01 0.0655 0.0773 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 sc-eQTL 6.92e-01 -0.036 0.091 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00925 0.072 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 8.48e-01 0.0103 0.0537 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 5.58e-01 0.0378 0.0645 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0278 0.0944 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00917 0.0777 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 2.25e-04 -0.251 0.0669 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0716 0.0755 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 8.81e-02 0.172 0.101 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0563 0.0982 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 5.91e-01 0.0282 0.0525 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 9.16e-01 0.00883 0.0839 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 271618 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0398 0.0933 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 6.48e-02 0.107 0.0576 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 8.48e-03 -0.222 0.0837 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0888 0.073 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 271641 sc-eQTL 2.33e-01 0.123 0.103 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 190680 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0441 0.0909 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 560658 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00636 0.0789 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 856770 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00815 0.0665 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -170891 sc-eQTL 4.23e-01 0.0622 0.0775 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -24072 sc-eQTL 9.39e-01 0.00585 0.0758 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -64556 sc-eQTL 2.17e-02 -0.112 0.0483 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -410459 sc-eQTL 3.09e-01 0.072 0.0705 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 271618 eQTL 0.0255 -0.062 0.0277 0.0 0.0 0.243
ENSG00000135597 REPS1 -24072 pQTL 0.0456 0.0583 0.0291 0.0 0.0 0.251
ENSG00000135597 REPS1 -24072 eQTL 7.15e-08 0.102 0.0188 0.00487 0.00273 0.243
ENSG00000146386 ABRACL -64556 eQTL 1.18e-13 -0.192 0.0255 0.0 0.0 0.243
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 eQTL 6.59e-03 -0.103 0.0378 0.00188 0.0 0.243

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -24072 2.55e-05 2.7e-05 5.11e-06 1.44e-05 3.44e-06 1.01e-05 3.12e-05 3.66e-06 2.22e-05 9.72e-06 2.66e-05 1.25e-05 3.65e-05 1.06e-05 5.8e-06 1.2e-05 1.34e-05 2.07e-05 6.06e-06 5.35e-06 9.55e-06 2.19e-05 2.41e-05 5.75e-06 3.63e-05 6.28e-06 8.89e-06 8.05e-06 2.52e-05 1.7e-05 1.51e-05 1.61e-06 1.92e-06 5.59e-06 9.41e-06 4.57e-06 2.05e-06 2.79e-06 4.54e-06 2.3e-06 1.58e-06 2.81e-05 2.93e-06 2.86e-07 1.76e-06 2.87e-06 3.35e-06 1.34e-06 1.03e-06
ENSG00000146386 ABRACL -64556 1.43e-05 2.1e-05 3.05e-06 1.24e-05 2.4e-06 6.44e-06 2.15e-05 2.9e-06 1.67e-05 6.93e-06 1.99e-05 8.28e-06 2.89e-05 7.53e-06 5.1e-06 9.23e-06 8.68e-06 1.49e-05 4.02e-06 4.17e-06 6.92e-06 1.44e-05 1.66e-05 4.01e-06 2.89e-05 5.22e-06 7.54e-06 5.54e-06 1.77e-05 1.27e-05 1.16e-05 1.19e-06 1.4e-06 4.09e-06 7.46e-06 3.35e-06 1.79e-06 2.26e-06 3.56e-06 1.5e-06 1.01e-06 2.28e-05 2.48e-06 2.52e-07 7.6e-07 2.36e-06 2.47e-06 6.83e-07 4.79e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -307173 3.39e-06 4.67e-06 8.35e-07 3.14e-06 7.62e-07 9.66e-07 2.41e-06 7.12e-07 4.15e-06 2.12e-06 3.95e-06 3.37e-06 7.71e-06 2.11e-06 1.38e-06 2.63e-06 1.58e-06 3.22e-06 1.41e-06 1.31e-06 1.45e-06 4.6e-06 3.37e-06 9.73e-07 4.81e-06 1.15e-06 1.84e-06 1.75e-06 3.09e-06 3.08e-06 2.05e-06 3.78e-07 4.53e-07 1.82e-06 2.03e-06 8.73e-07 7.83e-07 4.2e-07 8.69e-07 4.07e-07 2.14e-07 3.95e-06 6.49e-07 1.8e-07 3.38e-07 9.82e-07 8.12e-07 2.41e-07 2.98e-07