logo

Genes within 1Mb (chr6:138958963:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 6.14e-01 0.0418 0.0827 0.274 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0827 0.0629 0.274 B L1
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 3.78e-01 0.0557 0.063 0.274 B L1
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0483 0.0804 0.274 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 1.22e-02 -0.177 0.0701 0.274 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0573 0.0416 0.274 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00942 0.102 0.274 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.87e-01 0.0558 0.0644 0.274 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 9.91e-01 0.000798 0.0717 0.274 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 3.21e-01 0.0912 0.0916 0.274 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0569 0.0615 0.274 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0562 0.058 0.274 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0788 0.0764 0.274 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0118 0.0602 0.274 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0596 0.0439 0.274 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 4.64e-01 0.0552 0.0753 0.274 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 3.38e-01 0.0712 0.0741 0.274 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 8.42e-02 0.172 0.0992 0.274 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 6.63e-02 -0.12 0.0649 0.274 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0398 0.0666 0.274 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0121 0.0715 0.274 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0102 0.0673 0.274 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0489 0.0382 0.274 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.37e-01 0.0698 0.0725 0.274 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 8.32e-01 0.0188 0.0883 0.274 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 8.14e-01 0.0237 0.101 0.27 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00678 0.0707 0.27 DC L1
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0212 0.0828 0.27 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 2.83e-01 0.0989 0.0919 0.27 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 3.05e-01 0.0837 0.0813 0.27 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 2.94e-01 0.0838 0.0796 0.27 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 5.68e-01 0.0541 0.0947 0.27 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 9.58e-02 -0.16 0.0957 0.27 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 3.13e-01 0.0734 0.0726 0.274 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0209 0.0504 0.274 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0195 0.0664 0.274 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 1.15e-01 0.15 0.0946 0.274 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0316 0.0557 0.274 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0373 0.0725 0.274 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 6.55e-03 0.207 0.0754 0.274 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0861 0.0988 0.274 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.92e-01 0.0945 0.0894 0.275 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0443 0.0789 0.275 NK L1
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 1.18e-01 0.105 0.0666 0.275 NK L1
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00253 0.0774 0.275 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 9.56e-01 0.00409 0.0737 0.275 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 3.63e-01 -0.049 0.0537 0.275 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.11e-01 0.0725 0.0714 0.275 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0832 0.105 0.274 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0994 0.0674 0.274 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00822 0.0836 0.274 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00518 0.0759 0.274 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 5.66e-01 0.0469 0.0816 0.274 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 7.11e-01 0.0198 0.0534 0.274 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 2.73e-01 0.0686 0.0624 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 5.35e-01 0.075 0.121 0.278 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 6.21e-01 0.0525 0.106 0.278 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0537 0.0549 0.278 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0656 0.115 0.278 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.53e-01 0.0224 0.121 0.278 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 5.08e-01 0.0723 0.109 0.278 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0718 0.0933 0.278 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 9.19e-01 -0.012 0.118 0.278 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000387 0.118 0.278 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.45e-01 0.119 0.102 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 5.63e-01 -0.041 0.0708 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 2.76e-01 0.0982 0.09 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0765 0.0885 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 1.91e-02 -0.223 0.0944 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 4.58e-01 0.0605 0.0813 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 1.60e-01 0.14 0.0993 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 4.33e-01 0.072 0.0916 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 5.46e-01 0.06 0.0993 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 9.52e-01 0.00636 0.105 0.276 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0041 0.0794 0.276 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 2.46e-01 -0.115 0.0986 0.276 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0307 0.0912 0.276 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.73e-02 -0.169 0.0982 0.276 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 4.88e-01 0.0543 0.0781 0.276 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 7.79e-01 0.0281 0.0997 0.276 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.73e-01 0.125 0.0913 0.276 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 6.15e-01 0.0567 0.112 0.276 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0147 0.0984 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0477 0.0691 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 5.42e-01 0.0572 0.0937 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 2.10e-01 -0.107 0.0855 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.95e-01 0.0105 0.0794 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 9.78e-01 0.0015 0.0555 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 5.31e-01 0.0653 0.104 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 4.47e-01 0.0576 0.0756 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 8.82e-01 0.0148 0.0993 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 5.08e-02 0.189 0.0963 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0325 0.0664 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 8.41e-01 -0.016 0.0799 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 8.07e-01 0.0223 0.0915 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0773 0.0871 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0296 0.0642 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 2.63e-01 -0.114 0.101 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.02e-01 0.107 0.104 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 1.43e-01 -0.139 0.0948 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 1.63e-01 -0.139 0.0994 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00652 0.0863 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 6.76e-01 -0.044 0.105 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0429 0.101 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 7.66e-01 0.0292 0.0979 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0273 0.0892 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 6.11e-01 0.0457 0.0896 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 7.71e-01 0.0269 0.0924 0.27 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 3.28e-01 0.0949 0.0968 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 3.55e-01 -0.056 0.0604 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 1.65e-01 -0.111 0.0795 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0792 0.0752 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00655 0.0669 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0188 0.045 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 4.32e-01 0.0601 0.0763 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 2.14e-01 0.0959 0.077 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 1.70e-01 0.129 0.0941 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 5.70e-01 -0.04 0.0703 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0222 0.0882 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0974 0.0753 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0175 0.0717 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0831 0.0548 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.70e-01 0.0736 0.0818 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 6.83e-01 0.0362 0.0885 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 7.76e-01 0.0304 0.107 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0249 0.0727 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0368 0.0846 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0904 0.0828 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 3.03e-01 0.0933 0.0903 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 4.85e-02 -0.127 0.064 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 9.14e-01 0.00918 0.0847 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 8.40e-01 0.0179 0.0887 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 1.34e-01 0.165 0.11 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 7.28e-02 -0.141 0.0782 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0652 0.0982 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.08e-01 0.0532 0.0802 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0373 0.086 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.15e-01 -0.11 0.0692 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.71e-01 0.0725 0.0808 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 1.39e-01 -0.144 0.0967 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 9.57e-01 0.00562 0.104 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 1.00e-01 -0.109 0.0658 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0793 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00625 0.08 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 4.95e-01 0.0547 0.0801 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0136 0.0421 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.35e-01 0.127 0.0846 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 7.28e-01 0.0339 0.0973 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.63e-01 0.131 0.116 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 7.52e-01 -0.026 0.082 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 2.04e-01 0.137 0.108 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 1.36e-01 -0.127 0.0849 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0493 0.0887 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.06e-03 -0.286 0.086 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0137 0.0909 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0152 0.0959 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 6.19e-02 0.2 0.107 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 9.10e-01 0.0111 0.0977 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0854 0.111 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0391 0.101 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 5.48e-01 0.063 0.105 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 2.29e-01 -0.097 0.0804 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 9.02e-02 0.148 0.0871 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 5.72e-01 0.0565 0.0997 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.113 0.275 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0424 0.0785 0.275 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0197 0.104 0.275 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 4.81e-01 0.0607 0.086 0.275 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00902 0.0927 0.275 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 4.25e-01 0.0544 0.0681 0.275 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 6.34e-01 0.0382 0.0802 0.275 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0747 0.106 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0311 0.0903 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0303 0.0967 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 4.82e-01 0.0676 0.0961 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0068 0.0897 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.51e-01 -0.119 0.0822 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.18e-01 0.138 0.0881 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 1.57e-01 0.138 0.097 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 8.18e-01 -0.02 0.0866 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 3.31e-03 0.226 0.076 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0472 0.0838 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 4.24e-01 0.0636 0.0794 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0531 0.0537 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.99e-01 0.0921 0.0715 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0865 0.112 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 7.65e-01 0.0285 0.0951 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 2.94e-01 0.0888 0.0843 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 7.61e-02 0.185 0.104 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0427 0.103 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0967 0.0845 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.62e-01 0.126 0.0901 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.00e-01 0.129 0.1 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 2.13e-01 -0.108 0.0863 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 6.43e-01 0.0375 0.0807 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0504 0.0865 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 2.16e-01 -0.11 0.0891 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0409 0.0575 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 8.03e-01 0.0188 0.0752 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.61e-01 -0.146 0.129 0.278 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 9.44e-01 0.00809 0.116 0.278 PB L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 5.07e-01 0.0585 0.0878 0.278 PB L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 4.45e-01 -0.108 0.141 0.278 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 4.59e-02 -0.249 0.123 0.278 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 7.62e-01 0.0267 0.088 0.278 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 9.84e-01 0.00261 0.128 0.278 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.98e-01 -0.124 0.096 0.278 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 3.36e-01 -0.125 0.129 0.278 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.97e-01 -0.112 0.107 0.272 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0889 0.0855 0.272 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00781 0.0793 0.272 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0678 0.0846 0.272 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0293 0.0998 0.272 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0281 0.0643 0.272 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.08e-02 0.194 0.0755 0.272 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.92e-01 0.108 0.102 0.274 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0696 0.274 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 2.50e-02 -0.246 0.109 0.274 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 8.04e-01 0.0211 0.085 0.274 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 4.92e-01 0.0606 0.0879 0.274 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0612 0.0749 0.274 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 5.30e-01 0.0526 0.0836 0.274 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -280690 sc-eQTL 3.98e-01 0.0809 0.0956 0.274 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 4.93e-01 0.0716 0.104 0.271 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0439 0.0747 0.271 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0609 0.0991 0.271 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 1.58e-01 0.137 0.0965 0.271 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0889 0.112 0.271 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.75e-01 0.124 0.091 0.271 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 7.42e-01 0.032 0.097 0.271 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 5.24e-02 -0.207 0.106 0.271 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 5.60e-01 -0.047 0.0805 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 5.93e-01 -0.031 0.0578 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00596 0.0666 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 2.85e-01 0.104 0.0967 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 6.58e-01 0.0383 0.0865 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 8.11e-01 0.0174 0.0728 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 2.16e-01 0.0942 0.0759 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0869 0.101 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 6.46e-02 0.171 0.092 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 7.86e-01 0.0173 0.0634 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0062 0.0784 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 9.15e-01 0.0106 0.0993 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 2.13e-01 -0.117 0.0936 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0113 0.0817 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 7.60e-03 0.214 0.0795 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 8.60e-01 0.0192 0.109 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 8.02e-01 0.0302 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 4.08e-01 0.095 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00123 0.107 0.264 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 2.75e-01 -0.125 0.114 0.264 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0307 0.118 0.264 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 9.01e-01 0.0111 0.0891 0.264 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 6.02e-01 0.0536 0.103 0.264 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 9.13e-01 0.0119 0.109 0.269 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 6.19e-01 0.0365 0.0732 0.269 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.36e-01 0.0555 0.0895 0.269 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 2.20e-01 0.121 0.0984 0.269 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 1.85e-01 -0.135 0.102 0.269 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.87e-01 0.123 0.0927 0.269 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 4.87e-02 0.178 0.0896 0.269 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0728 0.111 0.269 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 6.06e-01 0.0509 0.0986 0.267 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0805 0.0586 0.267 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00412 0.0901 0.267 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 1.04e-01 0.154 0.0941 0.267 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0749 0.0712 0.267 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 9.64e-02 -0.143 0.0854 0.267 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 2.52e-03 0.218 0.0713 0.267 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 8.78e-01 0.0162 0.105 0.267 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 5.35e-01 -0.071 0.114 0.28 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 1.95e-01 0.115 0.0884 0.28 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 2.18e-01 -0.119 0.0964 0.28 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0425 0.0884 0.28 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.30e-01 0.0192 0.0896 0.28 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 9.31e-01 0.00852 0.098 0.28 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.45e-02 0.242 0.114 0.28 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 1.10e-01 -0.142 0.0882 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.77e-01 0.106 0.0977 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00381 0.0678 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00984 0.0894 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0853 0.087 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 3.69e-03 -0.26 0.0886 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 1.48e-01 0.0905 0.0623 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 1.59e-01 0.146 0.103 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 5.34e-01 0.0548 0.0879 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 7.71e-01 0.0298 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.88e-01 0.0974 0.0913 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0415 0.0634 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 6.41e-01 0.0436 0.0932 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0958 0.0854 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0465 0.0729 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00434 0.0512 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -333035 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0474 0.107 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.54e-01 0.0722 0.0777 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -312399 sc-eQTL 3.31e-01 -0.089 0.0913 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 4.14e-01 0.0606 0.0741 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0379 0.0553 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 7.41e-01 -0.022 0.0666 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 4.52e-01 0.0732 0.0972 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 8.89e-01 0.0112 0.0801 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 8.06e-01 0.0175 0.0712 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 6.81e-02 0.142 0.0774 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0637 0.104 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 5.07e-01 0.0664 0.0999 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0387 0.0534 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 5.32e-01 0.0534 0.0853 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 266392 sc-eQTL 2.50e-02 0.212 0.0938 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0619 0.059 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0975 0.0863 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 1.75e-02 0.176 0.0736 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 266415 sc-eQTL 7.59e-01 0.0322 0.105 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 185454 sc-eQTL 2.14e-01 0.116 0.093 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 555432 sc-eQTL 7.11e-01 -0.03 0.081 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 851544 sc-eQTL 5.71e-02 0.13 0.0677 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -176117 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0322 0.0796 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -29298 sc-eQTL 6.02e-01 0.0406 0.0778 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -69782 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0628 0.05 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -415685 sc-eQTL 3.08e-01 0.074 0.0724 0.276 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 266392 eQTL 0.0128 0.0655 0.0263 0.0 0.0 0.264
ENSG00000135597 REPS1 -29298 eQTL 6.17e-18 -0.153 0.0174 0.0 0.0 0.264

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -29298 1.67e-05 2.56e-05 3.02e-06 1.22e-05 3.06e-06 7.88e-06 2.37e-05 3.34e-06 1.87e-05 8.86e-06 2.45e-05 9.35e-06 3.35e-05 8.5e-06 5.16e-06 1.02e-05 9.2e-06 1.49e-05 5.04e-06 4.27e-06 8.04e-06 1.84e-05 1.84e-05 4.98e-06 3.08e-05 5.31e-06 8.03e-06 7.85e-06 1.9e-05 1.61e-05 1.28e-05 1.11e-06 1.45e-06 4.09e-06 7.96e-06 3.83e-06 1.7e-06 2.64e-06 2.78e-06 2.1e-06 9.34e-07 2.52e-05 2.39e-06 2.62e-07 1.13e-06 2.67e-06 2.71e-06 8.5e-07 8.61e-07