logo

Genes within 1Mb (chr6:138955964:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 5.78e-01 0.0492 0.0882 0.229 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0153 0.0674 0.229 B L1
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 3.66e-01 0.0608 0.0671 0.229 B L1
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.30e-01 -0.103 0.0855 0.229 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 4.30e-02 -0.153 0.0751 0.229 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 4.54e-02 -0.0888 0.0441 0.229 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0611 0.109 0.229 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 3.64e-01 0.0624 0.0686 0.229 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0245 0.0765 0.229 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 1.45e-01 0.143 0.0976 0.229 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.56e-01 0.0293 0.0658 0.229 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 9.63e-01 0.00287 0.0621 0.229 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.93e-01 -0.086 0.0816 0.229 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 9.38e-01 0.00499 0.0643 0.229 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 3.86e-02 -0.0972 0.0467 0.229 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 6.15e-01 0.0405 0.0805 0.229 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 1.50e-01 0.114 0.079 0.229 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 1.95e-01 0.138 0.106 0.229 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0346 0.0696 0.229 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00805 0.0709 0.229 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 9.42e-01 0.00555 0.0761 0.229 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00342 0.0716 0.229 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0627 0.0405 0.229 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 3.74e-01 0.0688 0.0772 0.229 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 5.15e-01 0.0613 0.0939 0.229 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 7.66e-01 0.0325 0.109 0.225 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.94e-01 -0.02 0.0765 0.225 DC L1
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 9.20e-01 0.00904 0.0897 0.225 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 3.55e-01 0.0922 0.0996 0.225 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 5.07e-01 0.0586 0.0882 0.225 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 3.58e-01 0.0795 0.0863 0.225 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 9.59e-01 0.00525 0.103 0.225 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0998 0.104 0.225 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 6.71e-01 0.0333 0.0782 0.229 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 8.54e-01 -0.00997 0.0541 0.229 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0775 0.0711 0.229 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 4.75e-01 0.0731 0.102 0.229 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0346 0.0598 0.229 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0975 0.0776 0.229 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 9.23e-03 0.213 0.0811 0.229 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 1.15e-01 -0.167 0.106 0.229 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 7.92e-02 0.167 0.0944 0.23 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.31e-01 0.0288 0.0837 0.23 NK L1
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 3.22e-02 0.152 0.0703 0.23 NK L1
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 6.67e-01 0.0354 0.0821 0.23 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.34e-01 0.0266 0.0782 0.23 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0697 0.0569 0.23 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.47e-01 0.11 0.0756 0.23 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0234 0.113 0.229 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 3.64e-01 -0.066 0.0726 0.229 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 3.86e-01 0.0779 0.0896 0.229 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 4.12e-01 -0.067 0.0814 0.229 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0678 0.0876 0.229 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0283 0.0574 0.229 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 2.16e-01 0.0832 0.067 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 6.12e-01 0.0651 0.128 0.235 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 2.14e-01 0.14 0.112 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 2.37e-01 -0.069 0.0582 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 3.89e-01 -0.105 0.122 0.235 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.49e-01 -0.041 0.128 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.61e-01 0.13 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0564 0.0992 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0778 0.125 0.235 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 3.98e-01 -0.106 0.125 0.235 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 2.42e-01 0.128 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0064 0.0756 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 2.57e-01 0.109 0.0959 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 4.46e-01 -0.072 0.0944 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 4.93e-02 -0.2 0.101 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 8.57e-01 0.0156 0.0868 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 8.52e-02 0.183 0.106 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 8.13e-01 0.0232 0.0978 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 9.16e-01 0.0111 0.106 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 3.20e-01 0.112 0.113 0.231 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 9.28e-01 0.00766 0.0851 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 4.28e-01 -0.084 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0252 0.0978 0.231 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 2.20e-01 -0.13 0.106 0.231 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0557 0.0837 0.231 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 9.99e-01 0.000164 0.107 0.231 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.27e-01 0.15 0.0977 0.231 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 7.59e-01 0.037 0.121 0.231 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0584 0.105 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.80e-01 0.0206 0.0738 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 4.28e-01 0.0794 0.1 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 6.32e-02 -0.17 0.0909 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.59e-01 0.026 0.0847 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 6.49e-01 -0.027 0.0593 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0258 0.111 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 2.70e-01 0.0891 0.0805 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0505 0.106 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 9.81e-02 0.172 0.103 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.41e-01 0.0235 0.0711 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0781 0.0852 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0198 0.0978 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0391 0.0933 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0525 0.0686 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 1.43e-01 -0.159 0.108 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 3.97e-01 0.0941 0.111 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 1.28e-01 -0.155 0.101 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0361 0.108 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 5.13e-01 0.0612 0.0933 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0103 0.114 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0029 0.109 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 6.83e-01 0.0434 0.106 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 8.80e-01 0.0146 0.0966 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 5.99e-01 0.0511 0.097 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 6.64e-01 0.0436 0.1 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 1.03e-01 0.169 0.103 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.25e-01 0.0317 0.0647 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 1.57e-01 -0.121 0.0851 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0851 0.0805 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.10e-01 0.0267 0.0716 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0734 0.0479 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 5.68e-01 0.0468 0.0818 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 1.92e-01 0.108 0.0824 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 2.17e-01 0.125 0.101 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 8.89e-01 0.0106 0.0752 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0209 0.0944 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0723 0.0807 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0655 0.0765 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0797 0.0587 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 4.33e-01 0.0688 0.0876 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 3.58e-01 0.0872 0.0945 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0473 0.114 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.98e-01 0.0301 0.0776 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0435 0.0903 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 1.78e-01 -0.119 0.0883 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 2.25e-01 0.117 0.0963 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.30e-02 -0.17 0.0679 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 9.20e-01 0.00905 0.0904 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00872 0.0946 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 2.57e-01 0.133 0.118 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0166 0.0842 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0525 0.105 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 3.37e-01 0.0824 0.0856 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0645 0.0918 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.23e-01 -0.114 0.0739 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 3.24e-01 0.0854 0.0864 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0991 0.104 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.111 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0526 0.0709 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0985 0.085 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0245 0.0857 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 4.77e-01 0.0612 0.0858 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0466 0.045 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.91e-01 0.119 0.0907 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 8.52e-01 0.0195 0.104 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 3.41e-01 0.119 0.125 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.44e-01 0.0407 0.088 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 1.33e-01 0.174 0.116 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0893 0.0915 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 2.83e-01 -0.102 0.095 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.25e-03 -0.303 0.0924 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0205 0.0976 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00704 0.103 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 3.93e-01 0.098 0.115 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 3.40e-01 0.0997 0.104 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00888 0.119 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 4.02e-01 0.09 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 6.28e-01 0.0542 0.112 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.13e-01 -0.107 0.0859 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 9.11e-02 0.158 0.093 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0251 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0731 0.121 0.229 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 9.47e-01 0.00555 0.0842 0.229 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 4.15e-01 0.0907 0.111 0.229 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 7.88e-01 0.0249 0.0922 0.229 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0785 0.0992 0.229 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 5.04e-01 0.0488 0.0729 0.229 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 7.97e-01 0.0221 0.086 0.229 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 5.65e-01 0.0653 0.113 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.69e-01 0.0284 0.0964 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 9.13e-01 0.0112 0.103 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 7.87e-01 0.0278 0.103 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0384 0.0957 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.66e-02 -0.195 0.0872 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.48e-01 0.137 0.0941 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 2.16e-01 0.128 0.103 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.02e-01 0.0352 0.0916 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 4.05e-03 0.234 0.0805 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00781 0.0888 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.12e-01 0.0311 0.0841 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0591 0.0568 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 8.79e-02 0.129 0.0755 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 4.14e-01 -0.097 0.118 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 2.16e-01 0.125 0.101 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 1.85e-01 0.119 0.0894 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.08e-02 0.255 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 9.66e-01 0.00474 0.109 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.54e-01 -0.128 0.0896 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 8.70e-02 0.164 0.0954 0.228 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 2.13e-02 0.245 0.105 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0482 0.0919 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 5.77e-01 0.0479 0.0856 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0253 0.0919 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0361 0.0949 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.14e-01 -0.076 0.0609 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 6.66e-01 0.0345 0.0798 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 2.28e-01 -0.171 0.141 0.237 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 3.08e-01 0.129 0.126 0.237 PB L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 1.55e-01 0.137 0.0954 0.237 PB L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.82e-01 -0.167 0.154 0.237 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 3.27e-02 -0.291 0.135 0.237 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0152 0.0963 0.237 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 3.02e-01 0.145 0.14 0.237 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.28e-01 -0.161 0.105 0.237 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 3.50e-01 -0.133 0.141 0.237 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0809 0.117 0.226 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0768 0.093 0.226 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 7.33e-01 0.0294 0.0861 0.226 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 1.90e-01 -0.121 0.0917 0.226 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0964 0.108 0.226 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0855 0.0697 0.226 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 3.63e-02 0.174 0.0824 0.226 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 3.60e-01 0.1 0.109 0.229 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 9.35e-01 0.00608 0.0747 0.229 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0984 0.117 0.229 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 8.64e-01 0.0156 0.0908 0.229 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.19e-01 0.0339 0.094 0.229 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0938 0.0798 0.229 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 4.95e-01 0.0611 0.0893 0.229 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -283689 sc-eQTL 1.59e-01 0.144 0.102 0.229 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 7.49e-01 0.0359 0.112 0.224 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0699 0.0803 0.224 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0283 0.107 0.224 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 8.52e-02 0.179 0.104 0.224 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0927 0.12 0.224 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 3.44e-01 0.0932 0.0982 0.224 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0209 0.104 0.224 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 2.16e-01 -0.143 0.115 0.224 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0938 0.0861 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0306 0.062 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0835 0.0711 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 5.53e-01 0.0617 0.104 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 9.63e-01 0.00427 0.0928 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0314 0.078 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 3.15e-01 0.0819 0.0814 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 2.84e-01 -0.117 0.109 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 1.31e-01 0.15 0.0992 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 4.44e-01 0.0523 0.0682 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0765 0.0842 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 5.19e-01 -0.069 0.107 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 1.05e-01 -0.163 0.1 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0545 0.0878 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 6.29e-03 0.236 0.0855 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0697 0.117 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 4.79e-01 0.0919 0.129 0.221 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 5.01e-01 0.0832 0.123 0.221 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 9.49e-01 0.00732 0.115 0.221 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 9.81e-01 0.003 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0227 0.0958 0.221 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 4.03e-01 0.0924 0.11 0.221 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 8.08e-01 0.0286 0.118 0.222 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 2.72e-01 0.0869 0.0788 0.222 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 4.14e-01 0.079 0.0966 0.222 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 3.93e-01 0.0912 0.106 0.222 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 3.46e-01 -0.104 0.11 0.222 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 7.85e-01 0.0275 0.1 0.222 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 9.84e-02 0.161 0.0969 0.222 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0721 0.119 0.222 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 4.14e-01 0.0875 0.107 0.222 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0972 0.0635 0.222 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 7.53e-01 0.0308 0.0979 0.222 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 2.46e-01 0.119 0.103 0.222 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0851 0.0773 0.222 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 4.77e-03 -0.261 0.0916 0.222 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 8.87e-03 0.206 0.0779 0.222 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0515 0.114 0.222 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00171 0.124 0.234 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 4.35e-01 0.0753 0.0963 0.234 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0768 0.105 0.234 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0461 0.096 0.234 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 8.13e-01 -0.023 0.0973 0.234 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 6.16e-01 0.0534 0.106 0.234 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.67e-01 0.172 0.124 0.234 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 2.93e-01 -0.101 0.0962 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 1.01e-01 0.172 0.104 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.49e-01 0.0233 0.0727 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 8.82e-01 0.0142 0.0958 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 2.78e-01 -0.101 0.0931 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 1.66e-02 -0.231 0.0955 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 6.64e-01 0.0292 0.0671 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 2.79e-01 0.12 0.111 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 9.05e-01 0.0112 0.0942 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0277 0.11 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 5.22e-01 0.0625 0.0975 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.59e-01 0.0208 0.0677 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 7.63e-01 0.0299 0.0994 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 6.84e-02 -0.166 0.0906 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0458 0.0778 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0394 0.0545 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -336034 sc-eQTL 1.97e-01 -0.147 0.114 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 2.48e-01 0.0959 0.0828 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -315398 sc-eQTL 1.79e-01 -0.131 0.0971 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 9.11e-01 0.00887 0.0795 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0204 0.0593 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 1.52e-01 -0.102 0.071 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 9.14e-01 0.0113 0.104 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0309 0.0858 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0304 0.0763 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.16e-01 0.131 0.0831 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 2.35e-01 -0.133 0.112 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 5.44e-01 0.0657 0.108 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0335 0.0577 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 3.16e-01 0.0926 0.0921 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 263393 sc-eQTL 2.67e-01 0.114 0.102 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0329 0.0639 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 4.16e-02 -0.19 0.0926 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 4.83e-02 0.159 0.0799 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 263416 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0174 0.114 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 sc-eQTL 9.88e-02 0.163 0.0985 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 552433 sc-eQTL 6.93e-01 0.034 0.086 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 848545 sc-eQTL 2.26e-02 0.165 0.0717 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -179116 sc-eQTL 8.80e-01 0.0128 0.0846 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -32297 sc-eQTL 3.63e-01 0.0751 0.0825 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -72781 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0816 0.053 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -418684 sc-eQTL 1.44e-01 0.112 0.0767 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 182455 eQTL 0.0183 0.0421 0.0178 0.0 0.0 0.233
ENSG00000135597 REPS1 -32297 eQTL 1.36e-19 -0.167 0.0181 0.0 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -32297 1.09e-05 1.3e-05 2.38e-06 7.29e-06 2.36e-06 5.16e-06 1.22e-05 2.08e-06 1.07e-05 6.13e-06 1.54e-05 6.49e-06 1.85e-05 4.21e-06 3.87e-06 6.75e-06 5.99e-06 9.67e-06 2.97e-06 3.13e-06 6.52e-06 1.16e-05 1.03e-05 3.37e-06 1.93e-05 4.33e-06 6.35e-06 4.97e-06 1.22e-05 1.06e-05 7.81e-06 9.77e-07 1.2e-06 3.49e-06 5.44e-06 2.74e-06 1.83e-06 2.03e-06 2.06e-06 1.15e-06 9.78e-07 1.48e-05 1.6e-06 1.54e-07 8.01e-07 1.78e-06 1.75e-06 7.75e-07 4.52e-07