logo

Genes within 1Mb (chr6:138951953:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 8.38e-01 0.0279 0.136 0.077 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 2.10e-01 0.13 0.103 0.077 B L1
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 2.06e-01 -0.131 0.103 0.077 B L1
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0297 0.132 0.077 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0551 0.117 0.077 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 3.13e-01 0.0693 0.0685 0.077 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00083 0.168 0.077 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0828 0.106 0.077 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 9.26e-01 -0.011 0.118 0.077 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 5.34e-01 0.093 0.149 0.077 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0174 0.1 0.077 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0558 0.0946 0.077 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0919 0.125 0.077 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 6.22e-01 0.0484 0.098 0.077 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0915 0.0717 0.077 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.20e-01 0.0281 0.123 0.077 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0762 0.121 0.077 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 7.69e-01 0.0488 0.166 0.077 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 9.51e-01 0.00676 0.109 0.077 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 3.31e-01 0.108 0.111 0.077 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00594 0.119 0.077 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 2.84e-01 -0.12 0.112 0.077 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 9.49e-01 0.00408 0.0638 0.077 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0658 0.121 0.077 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 3.66e-01 0.133 0.147 0.077 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0688 0.163 0.079 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 3.60e-01 0.105 0.114 0.079 DC L1
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 2.13e-01 -0.167 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 5.57e-02 -0.285 0.148 0.079 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 4.29e-01 -0.105 0.132 0.079 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 2.60e-01 -0.146 0.129 0.079 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0805 0.154 0.079 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 7.72e-02 0.276 0.155 0.079 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 4.20e-01 0.0965 0.119 0.077 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0887 0.0825 0.077 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0542 0.109 0.077 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 6.42e-02 0.288 0.155 0.077 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 3.43e-01 0.0868 0.0913 0.077 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.119 0.077 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0971 0.126 0.077 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 2.60e-01 0.183 0.162 0.077 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 1.17e-01 0.232 0.147 0.077 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 1.01e-01 0.213 0.13 0.077 NK L1
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 1.55e-01 -0.157 0.11 0.077 NK L1
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 5.02e-01 -0.086 0.128 0.077 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 6.63e-01 0.0531 0.122 0.077 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 9.48e-02 -0.148 0.0884 0.077 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0187 0.118 0.077 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 9.91e-02 0.283 0.171 0.077 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 5.12e-01 0.0728 0.111 0.077 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 1.31e-01 0.207 0.136 0.077 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 5.98e-01 0.0658 0.125 0.077 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 3.21e-01 0.133 0.134 0.077 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.65e-01 -0.122 0.0873 0.077 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0151 0.103 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 4.42e-01 -0.156 0.202 0.077 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 8.06e-03 0.465 0.174 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0899 0.0918 0.077 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 2.41e-01 -0.226 0.192 0.077 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 8.57e-01 0.0364 0.202 0.077 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 2.10e-01 0.228 0.182 0.077 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 2.28e-01 -0.188 0.156 0.077 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0881 0.196 0.077 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 9.44e-01 0.0139 0.196 0.077 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 7.94e-01 0.0439 0.168 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 8.70e-01 0.0191 0.116 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 4.95e-01 -0.101 0.148 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0581 0.145 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0572 0.157 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 3.62e-01 -0.122 0.133 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 3.49e-01 0.153 0.163 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.15e-01 0.0354 0.151 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 5.87e-01 0.0885 0.163 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0379 0.17 0.078 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 7.10e-01 0.0476 0.128 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 3.46e-01 0.15 0.159 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 4.20e-02 -0.298 0.145 0.078 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 7.98e-01 0.0409 0.159 0.078 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.58e-01 0.177 0.125 0.078 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 4.76e-01 0.115 0.161 0.078 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 5.77e-01 0.0824 0.148 0.078 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 4.64e-01 -0.133 0.181 0.078 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0869 0.161 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 8.81e-01 0.017 0.113 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 4.62e-01 -0.113 0.154 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0905 0.141 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 3.37e-01 -0.125 0.13 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0157 0.091 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 7.12e-02 -0.307 0.169 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.03e-01 0.0309 0.124 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 1.82e-01 0.217 0.162 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 9.90e-01 0.00199 0.159 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 9.62e-02 0.18 0.108 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 2.70e-03 -0.387 0.127 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 6.64e-01 0.0649 0.149 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 7.61e-01 0.0434 0.142 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 5.30e-01 0.0658 0.105 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0266 0.166 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 3.48e-01 -0.159 0.169 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 3.71e-01 -0.139 0.155 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0748 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 3.37e-01 0.136 0.141 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 2.77e-01 -0.188 0.172 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 1.26e-01 -0.252 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 3.95e-01 -0.137 0.16 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 3.63e-01 0.133 0.146 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0241 0.147 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0425 0.152 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 7.43e-01 0.0515 0.157 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 6.57e-01 0.0436 0.0981 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0339 0.13 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 2.28e-01 -0.147 0.122 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 7.93e-01 0.0284 0.108 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.68e-01 -0.101 0.0727 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.41e-01 0.0249 0.124 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 5.03e-01 -0.084 0.125 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 3.17e-01 0.154 0.154 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 3.15e-01 -0.115 0.114 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 3.09e-01 0.146 0.143 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 8.03e-01 0.0307 0.123 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 7.26e-01 -0.041 0.117 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 2.33e-01 -0.107 0.0895 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.77e-01 0.0208 0.134 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0226 0.144 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 9.05e-01 0.0207 0.173 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0859 0.118 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 2.20e-01 -0.168 0.137 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 1.63e-01 0.188 0.134 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 2.40e-01 0.173 0.146 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0562 0.105 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 9.60e-01 0.00683 0.138 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 3.87e-01 0.125 0.144 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 1.39e-01 0.265 0.179 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 6.34e-01 0.0612 0.128 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 4.50e-01 0.121 0.16 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 9.54e-01 0.00754 0.131 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00422 0.14 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.81e-01 -0.151 0.113 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0356 0.132 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 3.22e-01 0.157 0.158 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0206 0.171 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 8.43e-01 0.0217 0.109 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 1.45e-01 0.191 0.13 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 8.04e-01 0.0327 0.132 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 2.00e-01 -0.169 0.132 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 4.26e-01 0.0552 0.0692 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0391 0.14 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00473 0.16 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 1.85e-02 -0.443 0.187 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 2.18e-01 -0.164 0.133 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 3.63e-01 -0.16 0.175 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 2.60e-01 -0.156 0.138 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00936 0.144 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 8.27e-01 0.0314 0.143 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.83e-01 0.0217 0.147 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 2.37e-01 0.184 0.155 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 7.92e-01 0.0468 0.178 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0446 0.161 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0973 0.184 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0425 0.166 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0247 0.173 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 9.82e-01 0.00297 0.133 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 6.74e-02 -0.264 0.144 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 6.16e-01 0.0827 0.165 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 2.29e-01 0.228 0.189 0.076 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 6.88e-01 0.0528 0.131 0.076 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 3.37e-01 0.167 0.173 0.076 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 4.12e-01 -0.118 0.144 0.076 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 7.94e-02 0.271 0.154 0.076 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.54e-01 -0.162 0.113 0.076 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.63e-01 0.0232 0.134 0.076 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 5.23e-01 0.113 0.177 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 3.58e-01 0.139 0.15 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 7.73e-01 0.0466 0.161 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 1.45e-01 -0.234 0.16 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 6.62e-01 0.0655 0.15 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 2.12e-02 0.316 0.136 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0188 0.148 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 1.62e-01 0.226 0.161 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 1.13e-01 0.227 0.143 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 1.54e-01 -0.183 0.128 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 3.28e-01 -0.136 0.139 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0863 0.132 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0201 0.0893 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 9.07e-01 0.0139 0.119 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 4.75e-01 0.132 0.184 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 9.11e-01 0.0176 0.157 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 4.55e-01 -0.105 0.14 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 5.04e-01 -0.115 0.172 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 1.79e-01 -0.229 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 6.73e-01 0.0591 0.14 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 3.56e-01 -0.138 0.149 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 2.67e-01 0.184 0.166 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 3.67e-02 0.298 0.142 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 7.62e-02 -0.236 0.132 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 7.31e-01 0.0492 0.143 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 3.90e-02 0.304 0.146 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.02e-02 -0.243 0.0936 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 7.54e-01 0.039 0.124 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 5.88e-01 0.11 0.202 0.07 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0471 0.18 0.07 PB L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 7.53e-01 0.0431 0.137 0.07 PB L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 1.41e-01 0.323 0.218 0.07 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 9.83e-01 0.00428 0.196 0.07 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 6.88e-01 -0.055 0.137 0.07 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 9.02e-01 0.0247 0.2 0.07 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 5.48e-02 -0.287 0.148 0.07 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 1.96e-01 -0.261 0.2 0.07 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 3.30e-01 0.177 0.182 0.076 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 2.91e-01 -0.153 0.145 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 5.40e-01 0.0823 0.134 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0264 0.143 0.076 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0148 0.169 0.076 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000319 0.109 0.076 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 1.85e-01 -0.172 0.129 0.076 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 7.27e-01 0.0589 0.169 0.077 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0746 0.115 0.077 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 1.07e-01 -0.292 0.18 0.077 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 6.72e-01 0.0595 0.14 0.077 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 2.68e-01 -0.161 0.145 0.077 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 2.49e-02 -0.276 0.122 0.077 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 3.88e-01 -0.119 0.138 0.077 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -287700 sc-eQTL 9.40e-01 0.012 0.158 0.077 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 9.25e-01 0.0155 0.164 0.08 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 1.09e-01 0.187 0.116 0.08 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 4.75e-01 -0.111 0.155 0.08 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 3.10e-02 -0.327 0.15 0.08 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 4.12e-01 -0.144 0.175 0.08 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0862 0.143 0.08 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 3.87e-01 -0.132 0.152 0.08 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 1.07e-01 0.27 0.167 0.08 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 1.33e-01 0.198 0.131 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0258 0.0946 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0155 0.109 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 2.80e-01 0.171 0.158 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 4.43e-01 0.109 0.141 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0974 0.119 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0184 0.124 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 3.20e-01 0.165 0.166 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 4.49e-01 -0.115 0.152 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0623 0.104 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 2.85e-01 -0.137 0.128 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 1.21e-02 0.406 0.16 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 6.06e-01 0.0793 0.154 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 4.42e-01 -0.103 0.134 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 2.61e-01 -0.149 0.132 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 7.17e-01 0.0647 0.178 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 4.71e-01 -0.15 0.207 0.082 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0407 0.197 0.082 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 3.51e-01 -0.171 0.183 0.082 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 5.68e-02 0.373 0.194 0.082 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 3.83e-01 0.178 0.203 0.082 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 8.63e-01 0.0265 0.153 0.082 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 3.09e-01 -0.18 0.176 0.082 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 6.32e-01 0.0844 0.176 0.078 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 3.57e-01 -0.109 0.118 0.078 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 4.88e-01 -0.1 0.144 0.078 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 4.83e-01 0.112 0.159 0.078 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 4.55e-01 0.123 0.164 0.078 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 4.47e-01 -0.114 0.15 0.078 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 1.00e-01 -0.239 0.145 0.078 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 4.32e-01 0.14 0.178 0.078 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 8.40e-01 0.0323 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 8.18e-01 0.022 0.095 0.081 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 5.05e-01 0.0971 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 8.02e-01 0.0384 0.153 0.081 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0205 0.115 0.081 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0837 0.139 0.081 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00665 0.118 0.081 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0684 0.17 0.081 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 4.25e-01 0.148 0.185 0.088 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 5.60e-02 0.274 0.142 0.088 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 4.59e-01 -0.116 0.156 0.088 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 1.73e-01 -0.195 0.142 0.088 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0852 0.145 0.088 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.88e-01 -0.208 0.158 0.088 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 2.80e-01 -0.201 0.186 0.088 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 2.88e-01 0.153 0.143 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00549 0.161 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 4.96e-01 0.0762 0.112 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 7.60e-01 0.0451 0.147 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 2.00e-01 -0.184 0.143 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 5.62e-01 0.0864 0.149 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 7.59e-01 0.0317 0.103 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 4.72e-01 0.123 0.171 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 7.00e-01 0.0558 0.145 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0723 0.169 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 7.13e-01 -0.055 0.149 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 5.01e-01 0.0697 0.103 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 1.47e-01 -0.22 0.151 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0469 0.139 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 3.12e-01 -0.12 0.119 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 9.71e-01 0.00309 0.0834 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -340045 sc-eQTL 3.11e-01 -0.177 0.174 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0106 0.127 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -319409 sc-eQTL 4.56e-01 0.111 0.149 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 6.14e-01 0.061 0.121 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0454 0.0898 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0505 0.108 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 1.37e-02 0.387 0.156 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 4.94e-01 0.089 0.13 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 3.72e-01 -0.103 0.115 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0592 0.127 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 2.52e-01 0.195 0.169 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 4.17e-01 0.131 0.161 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0509 0.0861 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0375 0.138 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 259382 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00588 0.153 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 8.07e-01 0.0233 0.0953 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0311 0.14 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0892 0.12 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 259405 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0262 0.169 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 178444 sc-eQTL 8.87e-02 0.262 0.153 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 548422 sc-eQTL 7.62e-02 0.237 0.133 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 844534 sc-eQTL 1.47e-01 -0.164 0.112 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -183127 sc-eQTL 6.71e-01 -0.056 0.132 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -36308 sc-eQTL 7.06e-01 0.0487 0.129 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -76792 sc-eQTL 1.38e-01 -0.123 0.0826 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -422695 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0153 0.12 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146386 ABRACL -76792 eQTL 0.0378 -0.106 0.0512 0.0 0.0 0.0545

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 844534 2.8e-07 1.34e-07 5.14e-08 1.89e-07 9.25e-08 9.48e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.52e-07 9e-08 1.59e-07 7.13e-08 6.25e-08 7.5e-08 4.09e-08 1.4e-07 5.75e-08 4.21e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.55e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.2e-07 1.02e-07 1.06e-07 2.93e-08 4.02e-08 8e-08 5.99e-08 3.05e-08 5.59e-08 9.26e-08 6.86e-08 4.47e-08 5.45e-08 1.52e-07 5.22e-08 1.49e-08 4.7e-08 1.86e-08 1.18e-07 1.88e-09 4.88e-08
ENSG00000112406 \N -183127 4.41e-06 4.18e-06 7.43e-07 1.97e-06 8.57e-07 1.09e-06 2.48e-06 8.98e-07 3.14e-06 1.73e-06 3.41e-06 2.13e-06 5.88e-06 1.25e-06 9.97e-07 2.42e-06 1.75e-06 2.46e-06 1.56e-06 1.05e-06 2.51e-06 4.14e-06 3.25e-06 1.4e-06 4.5e-06 1.21e-06 1.77e-06 1.51e-06 3.82e-06 2.5e-06 1.96e-06 5.76e-07 7.1e-07 1.3e-06 1.79e-06 8.71e-07 9.08e-07 4.68e-07 1.26e-06 3.65e-07 1.96e-07 5.32e-06 3.99e-07 1.99e-07 3.44e-07 3.62e-07 6.63e-07 2.4e-07 1.77e-07