Genes within 1Mb (chr6:138939554:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.81e-01 -0.127 0.0944 0.154 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 1.49e-01 0.104 0.072 0.154 B L1
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0262 0.0722 0.154 B L1
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.04e-03 0.243 0.0907 0.154 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 3.97e-01 0.0691 0.0814 0.154 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.26e-01 -0.0732 0.0476 0.154 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0528 0.117 0.154 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0245 0.0739 0.154 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 1.29e-01 0.124 0.0817 0.154 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.95e-02 -0.245 0.104 0.154 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 4.22e-01 0.057 0.0708 0.154 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 4.96e-01 0.0455 0.0668 0.154 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 4.00e-01 0.0742 0.0879 0.154 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 8.88e-01 0.0098 0.0692 0.154 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.52e-01 0.0726 0.0506 0.154 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 8.48e-01 0.0167 0.0867 0.154 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00833 0.0855 0.154 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.115 0.154 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 2.96e-01 0.0786 0.0751 0.154 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0982 0.0764 0.154 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 4.51e-01 0.062 0.0822 0.154 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 9.20e-01 0.00782 0.0774 0.154 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.51e-02 0.106 0.0434 0.154 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 6.88e-01 0.0336 0.0836 0.154 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0534 0.102 0.154 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.37e-01 -0.169 0.113 0.158 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 9.97e-01 0.000273 0.0797 0.158 DC L1
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.75e-01 0.0147 0.0934 0.158 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 7.17e-01 0.0378 0.104 0.158 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0463 0.0919 0.158 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0858 0.0898 0.158 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 7.09e-01 -0.04 0.107 0.158 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 7.19e-01 0.0392 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 4.88e-02 -0.162 0.0819 0.154 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 5.12e-02 0.111 0.0567 0.154 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 7.70e-01 0.0221 0.0754 0.154 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 4.02e-02 -0.221 0.107 0.154 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0217 0.0632 0.154 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.10e-01 0.103 0.082 0.154 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0688 0.087 0.154 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 4.96e-01 0.0766 0.112 0.154 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 2.91e-01 -0.109 0.103 0.155 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 7.96e-01 0.0236 0.091 0.155 NK L1
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00501 0.0773 0.155 NK L1
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 4.63e-01 0.0656 0.0892 0.155 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0266 0.085 0.155 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.33e-03 0.181 0.0608 0.155 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0756 0.0824 0.155 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0803 0.121 0.154 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 4.91e-01 0.0541 0.0784 0.154 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0505 0.0967 0.154 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 1.41e-02 0.215 0.0867 0.154 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 1.96e-01 -0.122 0.0942 0.154 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.50e-01 0.0891 0.0616 0.154 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.34e-01 0.00604 0.0725 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 9.83e-01 0.00301 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00808 0.124 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0202 0.0643 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 1.69e-01 0.185 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 9.59e-01 0.0072 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.97e-01 -0.165 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 4.37e-01 0.0849 0.109 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 3.04e-01 -0.141 0.137 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 5.53e-02 0.262 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0714 0.118 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 5.11e-01 0.0536 0.0814 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0246 0.104 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 4.19e-01 0.0823 0.102 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 1.99e-01 0.141 0.11 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.71e-01 0.0838 0.0934 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0522 0.115 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.53e-01 0.00626 0.105 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 8.70e-01 0.0187 0.114 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.12e-01 -0.192 0.12 0.153 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0906 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 6.02e-01 0.0594 0.114 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 4.19e-01 0.0847 0.105 0.153 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0688 0.113 0.153 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.0895 0.153 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 4.21e-01 0.0923 0.114 0.153 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.96e-01 0.000515 0.105 0.153 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0221 0.129 0.153 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 3.01e-01 -0.117 0.112 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 3.17e-01 0.0792 0.0789 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 3.56e-01 -0.099 0.107 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.12e-03 0.258 0.0965 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 3.50e-01 0.0848 0.0906 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0686 0.0634 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.119 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 8.83e-01 0.0127 0.0865 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 6.51e-02 0.209 0.113 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 8.77e-02 -0.188 0.109 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 7.99e-02 0.132 0.0748 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 3.99e-01 0.0764 0.0904 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 3.29e-02 0.22 0.103 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 5.48e-01 0.0595 0.0989 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0654 0.0727 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 9.31e-01 0.01 0.115 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.32e-01 -0.01 0.118 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 3.52e-01 0.1 0.108 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.23e-01 -0.181 0.117 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 4.26e-01 0.081 0.102 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 2.41e-01 0.145 0.124 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.23e-01 0.0266 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0726 0.115 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0528 0.105 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 5.03e-01 0.0709 0.106 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0989 0.109 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 3.65e-03 -0.32 0.109 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 8.37e-01 0.0143 0.0693 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 1.70e-01 0.125 0.0911 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 1.92e-01 0.113 0.086 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 5.72e-01 0.0433 0.0765 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 5.66e-01 0.0296 0.0515 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.26e-01 0.00819 0.0875 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0273 0.0885 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 8.59e-02 -0.186 0.108 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 5.17e-01 0.0525 0.0808 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 8.72e-01 0.0163 0.101 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 6.83e-01 0.0355 0.0869 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 8.51e-01 0.0155 0.0824 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 9.97e-02 0.104 0.063 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 4.91e-01 0.065 0.0941 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 8.67e-01 0.0171 0.102 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.125 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 5.22e-01 0.0547 0.0853 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 7.55e-01 -0.031 0.0992 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 6.99e-01 0.0377 0.0974 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0951 0.106 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.50e-01 0.109 0.0754 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 4.85e-01 0.0695 0.0993 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0451 0.104 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.13e-01 -0.201 0.127 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 8.41e-02 0.157 0.0903 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 8.74e-02 -0.193 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0183 0.0927 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0633 0.0992 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.44e-03 0.253 0.0784 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.63e-01 0.00429 0.0935 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 1.04e-01 -0.182 0.111 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0539 0.12 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 4.42e-01 0.0588 0.0763 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 1.34e-01 -0.137 0.0914 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 6.71e-01 0.0392 0.0923 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0727 0.0924 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 7.52e-01 0.0154 0.0485 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0269 0.0981 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0124 0.112 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0155 0.136 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 4.22e-01 0.0767 0.0954 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0859 0.126 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 3.65e-01 0.0902 0.0993 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 5.63e-02 0.197 0.102 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 8.85e-01 0.0149 0.103 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00787 0.106 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 7.04e-01 0.0425 0.112 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.57e-01 -0.178 0.126 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 9.40e-01 0.00864 0.115 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 5.69e-02 -0.248 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 2.47e-01 -0.137 0.118 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 1.75e-01 -0.167 0.122 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.52e-02 0.199 0.0937 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 5.09e-01 0.068 0.103 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 1.56e-01 -0.166 0.117 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.99e-01 -0.169 0.131 0.154 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0787 0.0912 0.154 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 9.38e-02 -0.202 0.12 0.154 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 2.14e-02 0.229 0.0989 0.154 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 1.82e-02 -0.253 0.106 0.154 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 5.33e-01 0.0495 0.0792 0.154 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 7.19e-01 0.0337 0.0933 0.154 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 6.42e-01 0.055 0.118 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0472 0.101 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00569 0.108 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.24e-01 -0.024 0.107 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0872 0.0999 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0281 0.0922 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 4.87e-01 0.0688 0.0988 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0705 0.112 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 7.02e-01 0.0383 0.0998 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0315 0.0894 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0963 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0414 0.0916 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.20e-02 0.141 0.0613 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 2.09e-01 -0.104 0.0824 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0676 0.13 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 9.59e-01 0.00563 0.111 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 4.53e-02 0.196 0.0973 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 6.35e-01 0.0577 0.121 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 1.79e-01 -0.161 0.119 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 4.36e-01 0.0768 0.0984 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 2.84e-01 -0.113 0.105 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 2.99e-01 -0.119 0.115 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 7.30e-01 0.0342 0.099 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0678 0.0921 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 2.27e-01 0.119 0.0986 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 3.68e-01 0.092 0.102 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.49e-02 0.147 0.065 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0573 0.0858 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.80e-01 0.188 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 3.69e-01 0.113 0.125 0.144 PB L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0473 0.0952 0.144 PB L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 3.25e-02 0.325 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 1.66e-01 -0.188 0.135 0.144 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0948 0.144 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0668 0.139 0.144 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 7.68e-01 0.0309 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0746 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00712 0.123 0.154 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 6.05e-01 0.0507 0.0979 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 2.49e-01 0.104 0.0902 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 4.14e-03 0.275 0.0948 0.154 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 9.38e-03 0.294 0.112 0.154 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.32e-01 0.0878 0.0732 0.154 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 3.06e-01 0.0897 0.0873 0.154 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 2.79e-01 -0.126 0.116 0.154 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 1.23e-01 0.122 0.0791 0.154 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0316 0.125 0.154 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.33e-01 0.0204 0.0967 0.154 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0998 0.154 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 9.91e-01 -0.001 0.0853 0.154 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 7.32e-01 0.0326 0.0951 0.154 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -300099 sc-eQTL 6.26e-01 0.0531 0.109 0.154 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 2.30e-02 -0.256 0.112 0.156 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 6.09e-01 0.0416 0.0811 0.156 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 6.98e-01 0.0418 0.108 0.156 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0218 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0191 0.121 0.156 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0618 0.0992 0.156 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0681 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 3.61e-01 0.106 0.116 0.156 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0856 0.0897 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 2.59e-01 0.0728 0.0644 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0169 0.0743 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0504 0.108 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 7.92e-01 0.0255 0.0966 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.26e-01 0.0798 0.0811 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0447 0.0849 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 6.01e-01 0.0593 0.113 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0512 0.104 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 7.51e-03 0.188 0.0698 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 3.54e-01 0.0813 0.0875 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 4.27e-02 -0.224 0.11 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0214 0.105 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 7.35e-01 0.031 0.0914 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 4.48e-01 0.0687 0.0904 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0777 0.122 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 5.97e-02 0.264 0.139 0.161 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 6.19e-02 0.25 0.133 0.161 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 5.61e-01 0.0728 0.125 0.161 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0471 0.134 0.161 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 1.65e-01 0.192 0.138 0.161 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0303 0.104 0.161 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 1.18e-01 -0.188 0.119 0.161 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 6.89e-03 -0.321 0.117 0.158 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 1.57e-01 0.114 0.0799 0.158 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0529 0.0981 0.158 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 2.05e-01 -0.137 0.108 0.158 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 6.60e-01 0.0449 0.102 0.158 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 5.92e-01 0.0531 0.099 0.158 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 7.61e-01 0.037 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 7.20e-01 0.0242 0.0674 0.156 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0442 0.103 0.156 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0403 0.109 0.156 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 7.53e-02 -0.145 0.0812 0.156 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.95e-03 0.282 0.0966 0.156 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 2.37e-01 -0.099 0.0834 0.156 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 1.56e-01 0.171 0.12 0.156 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 3.60e-01 -0.12 0.131 0.147 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 2.02e-01 -0.13 0.101 0.147 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 5.23e-01 0.0709 0.111 0.147 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 2.50e-01 0.117 0.101 0.147 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0637 0.103 0.147 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0256 0.112 0.147 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 8.17e-01 0.0306 0.132 0.147 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0338 0.102 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0864 0.112 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 5.05e-01 0.0517 0.0775 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 4.99e-01 0.0692 0.102 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 3.36e-01 0.096 0.0994 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 6.49e-01 0.0471 0.103 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0663 0.0715 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 7.12e-01 0.0438 0.119 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00693 0.101 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 1.70e-01 0.161 0.116 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 7.90e-02 -0.184 0.104 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 2.11e-01 0.091 0.0726 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0375 0.107 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 1.35e-03 0.312 0.0959 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 7.74e-02 0.148 0.0832 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0775 0.0585 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -352444 sc-eQTL 2.63e-01 -0.138 0.123 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00319 0.0894 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 sc-eQTL 7.70e-02 0.185 0.104 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0978 0.0827 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 6.13e-02 0.115 0.0613 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 8.17e-01 0.0173 0.0744 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 1.97e-01 -0.14 0.108 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00771 0.0895 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 4.12e-01 0.0653 0.0795 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00999 0.0872 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.117 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 1.42e-03 -0.357 0.11 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 4.91e-01 0.0416 0.0603 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0459 0.0965 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 246983 sc-eQTL 5.88e-02 -0.202 0.106 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0516 0.0667 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 2.54e-02 0.218 0.0967 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0207 0.0843 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 247006 sc-eQTL 1.29e-01 0.18 0.118 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.108 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 536023 sc-eQTL 8.86e-01 0.0135 0.0938 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 832135 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0159 0.0791 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -195526 sc-eQTL 1.89e-01 0.121 0.0919 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -48707 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0268 0.0901 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -89191 sc-eQTL 7.65e-04 0.193 0.0566 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -435094 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0852 0.0839 0.155 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 eQTL 6.56e-07 -0.101 0.0201 0.0 0.0 0.17
ENSG00000112406 HECA -195526 eQTL 0.0022 0.0371 0.0121 0.0 0.0 0.17
ENSG00000135597 REPS1 -48707 eQTL 0.00585 0.0592 0.0214 0.0 0.0 0.17
ENSG00000146386 ABRACL -89191 eQTL 2.08e-08 0.165 0.0291 0.0 0.0 0.17
ENSG00000226571 AL592429.2 -331808 eQTL 2.32e-02 0.0968 0.0426 0.0 0.0 0.17


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 166045 3.06e-06 3.08e-06 5.11e-07 1.97e-06 6.85e-07 7.5e-07 2.29e-06 8.31e-07 2.29e-06 1.2e-06 2.78e-06 1.48e-06 4.26e-06 1.42e-06 9.25e-07 1.73e-06 1.59e-06 2.13e-06 1.48e-06 1.3e-06 1.39e-06 3.15e-06 2.67e-06 1.44e-06 3.97e-06 1.19e-06 1.49e-06 1.84e-06 2.83e-06 2.5e-06 2.08e-06 3.82e-07 6.63e-07 1.36e-06 1.54e-06 9.5e-07 8.57e-07 3.93e-07 1.35e-06 3.46e-07 2.4e-07 4.11e-06 6.14e-07 1.6e-07 3.62e-07 3.73e-07 8.09e-07 2.15e-07 1.76e-07
ENSG00000112406 HECA -195526 2.11e-06 2.58e-06 3.31e-07 1.7e-06 4.65e-07 7.98e-07 1.38e-06 6.11e-07 1.72e-06 8.15e-07 2.1e-06 1.45e-06 3.53e-06 9.92e-07 5.38e-07 1.19e-06 9.71e-07 1.99e-06 7.85e-07 1.15e-06 9.18e-07 2.51e-06 2e-06 9.95e-07 2.87e-06 1.3e-06 1.22e-06 1.44e-06 1.8e-06 1.8e-06 1.29e-06 2.37e-07 6.43e-07 1.23e-06 9.21e-07 9.66e-07 8.3e-07 4.1e-07 9.49e-07 3.55e-07 2.14e-07 3.03e-06 3.75e-07 1.9e-07 2.97e-07 3.26e-07 4.97e-07 2.22e-07 1.89e-07
ENSG00000146386 ABRACL -89191 4.99e-06 5.79e-06 6.54e-07 3.36e-06 1.46e-06 1.55e-06 7.57e-06 1.22e-06 4.56e-06 2.8e-06 7.5e-06 3.12e-06 9.94e-06 2.02e-06 9.99e-07 3.98e-06 2.73e-06 3.71e-06 1.65e-06 1.71e-06 2.72e-06 5.63e-06 4.79e-06 1.91e-06 8.88e-06 2.08e-06 2.42e-06 1.73e-06 5.89e-06 6.66e-06 2.86e-06 4.59e-07 8.41e-07 2.39e-06 1.98e-06 1.63e-06 1.11e-06 5.07e-07 1.12e-06 7.43e-07 7.78e-07 7.91e-06 5.96e-07 1.66e-07 8.28e-07 1.07e-06 1.1e-06 7.43e-07 5.81e-07