Genes within 1Mb (chr6:138936877:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.81e-01 -0.127 0.0944 0.154 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 1.49e-01 0.104 0.072 0.154 B L1
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0262 0.0722 0.154 B L1
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.04e-03 0.243 0.0907 0.154 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 3.97e-01 0.0691 0.0814 0.154 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.26e-01 -0.0732 0.0476 0.154 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0528 0.117 0.154 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0245 0.0739 0.154 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 1.29e-01 0.124 0.0817 0.154 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.95e-02 -0.245 0.104 0.154 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 4.22e-01 0.057 0.0708 0.154 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 4.96e-01 0.0455 0.0668 0.154 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 4.00e-01 0.0742 0.0879 0.154 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 8.88e-01 0.0098 0.0692 0.154 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.52e-01 0.0726 0.0506 0.154 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 8.48e-01 0.0167 0.0867 0.154 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00833 0.0855 0.154 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.115 0.154 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 2.96e-01 0.0786 0.0751 0.154 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0982 0.0764 0.154 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 4.51e-01 0.062 0.0822 0.154 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 9.20e-01 0.00782 0.0774 0.154 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.51e-02 0.106 0.0434 0.154 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 6.88e-01 0.0336 0.0836 0.154 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0534 0.102 0.154 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.37e-01 -0.169 0.113 0.158 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 9.97e-01 0.000273 0.0797 0.158 DC L1
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.75e-01 0.0147 0.0934 0.158 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 7.17e-01 0.0378 0.104 0.158 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0463 0.0919 0.158 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0858 0.0898 0.158 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 7.09e-01 -0.04 0.107 0.158 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 7.19e-01 0.0392 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 4.88e-02 -0.162 0.0819 0.154 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 5.12e-02 0.111 0.0567 0.154 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 7.70e-01 0.0221 0.0754 0.154 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 4.02e-02 -0.221 0.107 0.154 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0217 0.0632 0.154 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.10e-01 0.103 0.082 0.154 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0688 0.087 0.154 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 4.96e-01 0.0766 0.112 0.154 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 2.91e-01 -0.109 0.103 0.155 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 7.96e-01 0.0236 0.091 0.155 NK L1
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00501 0.0773 0.155 NK L1
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 4.63e-01 0.0656 0.0892 0.155 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0266 0.085 0.155 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.33e-03 0.181 0.0608 0.155 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0756 0.0824 0.155 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0803 0.121 0.154 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 4.91e-01 0.0541 0.0784 0.154 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0505 0.0967 0.154 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 1.41e-02 0.215 0.0867 0.154 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 1.96e-01 -0.122 0.0942 0.154 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.50e-01 0.0891 0.0616 0.154 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.34e-01 0.00604 0.0725 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 9.83e-01 0.00301 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00808 0.124 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0202 0.0643 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 1.69e-01 0.185 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 9.59e-01 0.0072 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.97e-01 -0.165 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 4.37e-01 0.0849 0.109 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 3.04e-01 -0.141 0.137 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 5.53e-02 0.262 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0714 0.118 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 5.11e-01 0.0536 0.0814 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0246 0.104 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 4.19e-01 0.0823 0.102 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 1.99e-01 0.141 0.11 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.71e-01 0.0838 0.0934 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0522 0.115 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.53e-01 0.00626 0.105 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 8.70e-01 0.0187 0.114 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.12e-01 -0.192 0.12 0.153 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0906 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 6.02e-01 0.0594 0.114 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 4.19e-01 0.0847 0.105 0.153 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0688 0.113 0.153 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.0895 0.153 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 4.21e-01 0.0923 0.114 0.153 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.96e-01 0.000515 0.105 0.153 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0221 0.129 0.153 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 3.01e-01 -0.117 0.112 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 3.17e-01 0.0792 0.0789 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 3.56e-01 -0.099 0.107 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.12e-03 0.258 0.0965 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 3.50e-01 0.0848 0.0906 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0686 0.0634 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.119 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 8.83e-01 0.0127 0.0865 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 6.51e-02 0.209 0.113 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 8.77e-02 -0.188 0.109 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 7.99e-02 0.132 0.0748 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 3.99e-01 0.0764 0.0904 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 3.29e-02 0.22 0.103 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 5.48e-01 0.0595 0.0989 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0654 0.0727 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 9.31e-01 0.01 0.115 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.32e-01 -0.01 0.118 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 3.52e-01 0.1 0.108 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.23e-01 -0.181 0.117 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 4.26e-01 0.081 0.102 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 2.41e-01 0.145 0.124 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.23e-01 0.0266 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0726 0.115 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0528 0.105 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 5.03e-01 0.0709 0.106 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0989 0.109 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 3.65e-03 -0.32 0.109 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 8.37e-01 0.0143 0.0693 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 1.70e-01 0.125 0.0911 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 1.92e-01 0.113 0.086 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 5.72e-01 0.0433 0.0765 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 5.66e-01 0.0296 0.0515 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.26e-01 0.00819 0.0875 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0273 0.0885 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 8.59e-02 -0.186 0.108 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 5.17e-01 0.0525 0.0808 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 8.72e-01 0.0163 0.101 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 6.83e-01 0.0355 0.0869 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 8.51e-01 0.0155 0.0824 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 9.97e-02 0.104 0.063 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 4.91e-01 0.065 0.0941 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 8.67e-01 0.0171 0.102 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.125 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 5.22e-01 0.0547 0.0853 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 7.55e-01 -0.031 0.0992 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 6.99e-01 0.0377 0.0974 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0951 0.106 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.50e-01 0.109 0.0754 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 4.85e-01 0.0695 0.0993 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0451 0.104 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.13e-01 -0.201 0.127 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 8.41e-02 0.157 0.0903 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 8.74e-02 -0.193 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0183 0.0927 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0633 0.0992 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.44e-03 0.253 0.0784 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.63e-01 0.00429 0.0935 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 1.04e-01 -0.182 0.111 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0539 0.12 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 4.42e-01 0.0588 0.0763 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 1.34e-01 -0.137 0.0914 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 6.71e-01 0.0392 0.0923 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0727 0.0924 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 7.52e-01 0.0154 0.0485 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0269 0.0981 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0124 0.112 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0155 0.136 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 4.22e-01 0.0767 0.0954 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0859 0.126 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 3.65e-01 0.0902 0.0993 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 5.63e-02 0.197 0.102 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 8.85e-01 0.0149 0.103 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00787 0.106 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 7.04e-01 0.0425 0.112 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.57e-01 -0.178 0.126 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 9.40e-01 0.00864 0.115 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 5.69e-02 -0.248 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 2.47e-01 -0.137 0.118 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 1.75e-01 -0.167 0.122 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.52e-02 0.199 0.0937 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 5.09e-01 0.068 0.103 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 1.56e-01 -0.166 0.117 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.99e-01 -0.169 0.131 0.154 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0787 0.0912 0.154 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 9.38e-02 -0.202 0.12 0.154 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 2.14e-02 0.229 0.0989 0.154 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 1.82e-02 -0.253 0.106 0.154 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 5.33e-01 0.0495 0.0792 0.154 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 7.19e-01 0.0337 0.0933 0.154 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 6.42e-01 0.055 0.118 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0472 0.101 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00569 0.108 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.24e-01 -0.024 0.107 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0872 0.0999 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0281 0.0922 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 4.87e-01 0.0688 0.0988 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0705 0.112 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 7.02e-01 0.0383 0.0998 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0315 0.0894 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0963 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0414 0.0916 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.20e-02 0.141 0.0613 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 2.09e-01 -0.104 0.0824 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0676 0.13 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 9.59e-01 0.00563 0.111 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 4.53e-02 0.196 0.0973 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 6.35e-01 0.0577 0.121 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 1.79e-01 -0.161 0.119 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 4.36e-01 0.0768 0.0984 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 2.84e-01 -0.113 0.105 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 2.99e-01 -0.119 0.115 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 7.30e-01 0.0342 0.099 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0678 0.0921 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 2.27e-01 0.119 0.0986 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 3.68e-01 0.092 0.102 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.49e-02 0.147 0.065 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0573 0.0858 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.80e-01 0.188 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 3.69e-01 0.113 0.125 0.144 PB L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0473 0.0952 0.144 PB L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 3.25e-02 0.325 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 1.66e-01 -0.188 0.135 0.144 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0948 0.144 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0668 0.139 0.144 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 7.68e-01 0.0309 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0746 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00712 0.123 0.154 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 6.05e-01 0.0507 0.0979 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 2.49e-01 0.104 0.0902 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 4.14e-03 0.275 0.0948 0.154 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 9.38e-03 0.294 0.112 0.154 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.32e-01 0.0878 0.0732 0.154 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 3.06e-01 0.0897 0.0873 0.154 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 2.79e-01 -0.126 0.116 0.154 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 1.23e-01 0.122 0.0791 0.154 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0316 0.125 0.154 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.33e-01 0.0204 0.0967 0.154 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0998 0.154 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 9.91e-01 -0.001 0.0853 0.154 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 7.32e-01 0.0326 0.0951 0.154 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -302776 sc-eQTL 6.26e-01 0.0531 0.109 0.154 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 2.30e-02 -0.256 0.112 0.156 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 6.09e-01 0.0416 0.0811 0.156 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 6.98e-01 0.0418 0.108 0.156 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0218 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0191 0.121 0.156 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0618 0.0992 0.156 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0681 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 3.61e-01 0.106 0.116 0.156 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0856 0.0897 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 2.59e-01 0.0728 0.0644 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0169 0.0743 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0504 0.108 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 7.92e-01 0.0255 0.0966 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.26e-01 0.0798 0.0811 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0447 0.0849 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 6.01e-01 0.0593 0.113 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0512 0.104 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 7.51e-03 0.188 0.0698 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 3.54e-01 0.0813 0.0875 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 4.27e-02 -0.224 0.11 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0214 0.105 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 7.35e-01 0.031 0.0914 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 4.48e-01 0.0687 0.0904 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0777 0.122 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 5.97e-02 0.264 0.139 0.161 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 6.19e-02 0.25 0.133 0.161 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 5.61e-01 0.0728 0.125 0.161 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0471 0.134 0.161 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 1.65e-01 0.192 0.138 0.161 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0303 0.104 0.161 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 1.18e-01 -0.188 0.119 0.161 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 6.89e-03 -0.321 0.117 0.158 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 1.57e-01 0.114 0.0799 0.158 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0529 0.0981 0.158 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 2.05e-01 -0.137 0.108 0.158 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 6.60e-01 0.0449 0.102 0.158 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 5.92e-01 0.0531 0.099 0.158 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 7.61e-01 0.037 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 7.20e-01 0.0242 0.0674 0.156 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0442 0.103 0.156 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0403 0.109 0.156 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 7.53e-02 -0.145 0.0812 0.156 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.95e-03 0.282 0.0966 0.156 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 2.37e-01 -0.099 0.0834 0.156 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 1.56e-01 0.171 0.12 0.156 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 3.60e-01 -0.12 0.131 0.147 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 2.02e-01 -0.13 0.101 0.147 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 5.23e-01 0.0709 0.111 0.147 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 2.50e-01 0.117 0.101 0.147 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0637 0.103 0.147 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0256 0.112 0.147 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 8.17e-01 0.0306 0.132 0.147 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0338 0.102 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0864 0.112 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 5.05e-01 0.0517 0.0775 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 4.99e-01 0.0692 0.102 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 3.36e-01 0.096 0.0994 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 6.49e-01 0.0471 0.103 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0663 0.0715 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 7.12e-01 0.0438 0.119 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00693 0.101 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 1.70e-01 0.161 0.116 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 7.90e-02 -0.184 0.104 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 2.11e-01 0.091 0.0726 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0375 0.107 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 1.35e-03 0.312 0.0959 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 7.74e-02 0.148 0.0832 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0775 0.0585 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -355121 sc-eQTL 2.63e-01 -0.138 0.123 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00319 0.0894 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 sc-eQTL 7.70e-02 0.185 0.104 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0978 0.0827 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 6.13e-02 0.115 0.0613 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 8.17e-01 0.0173 0.0744 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 1.97e-01 -0.14 0.108 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00771 0.0895 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 4.12e-01 0.0653 0.0795 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00999 0.0872 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.117 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 1.42e-03 -0.357 0.11 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 4.91e-01 0.0416 0.0603 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0459 0.0965 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 244306 sc-eQTL 5.88e-02 -0.202 0.106 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0516 0.0667 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 2.54e-02 0.218 0.0967 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0207 0.0843 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 244329 sc-eQTL 1.29e-01 0.18 0.118 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.108 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 533346 sc-eQTL 8.86e-01 0.0135 0.0938 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 829458 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0159 0.0791 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198203 sc-eQTL 1.89e-01 0.121 0.0919 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -51384 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0268 0.0901 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -91868 sc-eQTL 7.65e-04 0.193 0.0566 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -437771 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0852 0.0839 0.155 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 eQTL 6.58e-07 -0.101 0.0201 0.0 0.0 0.17
ENSG00000112406 HECA -198203 eQTL 0.00221 0.0371 0.0121 0.0 0.0 0.17
ENSG00000135597 REPS1 -51384 eQTL 0.00592 0.0592 0.0214 0.0 0.0 0.17
ENSG00000146386 ABRACL -91868 eQTL 2.08e-08 0.165 0.0291 0.0 0.0 0.17
ENSG00000226571 AL592429.2 -334485 eQTL 2.31e-02 0.0969 0.0426 0.0 0.0 0.17


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 163368 3.64e-06 3.14e-06 5.33e-07 2e-06 7.94e-07 7.6e-07 2.45e-06 9.1e-07 2.44e-06 1.37e-06 2.98e-06 1.71e-06 5.39e-06 1.41e-06 9.62e-07 2e-06 1.54e-06 2.12e-06 1.56e-06 1.2e-06 1.53e-06 3.36e-06 3.25e-06 1.6e-06 4.32e-06 1.21e-06 1.55e-06 1.77e-06 3.2e-06 2.81e-06 1.92e-06 4.34e-07 6.46e-07 1.45e-06 1.63e-06 9.19e-07 9.25e-07 4.21e-07 1.27e-06 3.46e-07 2.38e-07 4.12e-06 6.52e-07 1.87e-07 3.34e-07 3.42e-07 8.68e-07 2.32e-07 1.76e-07
ENSG00000112406 HECA -198203 2.78e-06 2.58e-06 3.08e-07 1.58e-06 4.8e-07 7.89e-07 1.55e-06 6.11e-07 1.82e-06 8.55e-07 2.12e-06 1.31e-06 3.49e-06 1.11e-06 5.48e-07 1.54e-06 9.67e-07 1.99e-06 7.93e-07 1.13e-06 9.86e-07 2.8e-06 2.15e-06 1.03e-06 3.42e-06 1.36e-06 1.21e-06 1.51e-06 1.92e-06 1.84e-06 1.45e-06 2.7e-07 5.29e-07 1.22e-06 9.14e-07 9.71e-07 7.72e-07 3.93e-07 9.49e-07 3.53e-07 2.14e-07 3.29e-06 4.16e-07 1.99e-07 2.97e-07 3.21e-07 5.48e-07 2.2e-07 2.1e-07
ENSG00000146386 ABRACL -91868 5.53e-06 5.38e-06 6.54e-07 3.52e-06 1.61e-06 1.54e-06 7.57e-06 1.29e-06 4.67e-06 3.06e-06 7.5e-06 3.12e-06 9.82e-06 2.13e-06 1.02e-06 4.31e-06 2.51e-06 3.74e-06 1.66e-06 1.68e-06 2.77e-06 6.08e-06 4.66e-06 2.01e-06 8.96e-06 2.29e-06 2.79e-06 1.73e-06 5.81e-06 6.66e-06 2.91e-06 5.23e-07 7.77e-07 2.53e-06 1.95e-06 1.68e-06 1.19e-06 5.44e-07 9.34e-07 7.21e-07 7.88e-07 8.42e-06 6.91e-07 1.61e-07 7.75e-07 1.07e-06 1.03e-06 7.43e-07 5.83e-07