logo

Genes within 1Mb (chr6:138936223:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 6.90e-01 0.0362 0.0906 0.19 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0351 0.0692 0.19 B L1
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 9.38e-01 0.0054 0.0691 0.19 B L1
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 5.23e-02 -0.171 0.0874 0.19 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 2.15e-02 -0.178 0.077 0.19 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.39e-02 -0.103 0.0452 0.19 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.112 0.19 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 5.69e-01 0.0402 0.0706 0.19 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0403 0.0785 0.19 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 6.57e-01 0.0446 0.1 0.19 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00292 0.0674 0.19 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 8.41e-01 0.0128 0.0635 0.19 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.56e-01 -0.119 0.0833 0.19 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 3.05e-01 0.0675 0.0656 0.19 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 7.06e-02 -0.087 0.0479 0.19 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 7.10e-01 0.0307 0.0824 0.19 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00115 0.0812 0.19 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.19 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0395 0.0716 0.19 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00691 0.073 0.19 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0754 0.0782 0.19 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 3.26e-01 0.0723 0.0735 0.19 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0578 0.0418 0.19 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 3.68e-01 0.0717 0.0795 0.19 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0476 0.0967 0.19 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 7.01e-01 -0.043 0.112 0.187 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0735 0.0784 0.187 DC L1
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0798 0.0918 0.187 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 9.34e-01 0.00851 0.102 0.187 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 4.19e-01 0.0733 0.0904 0.187 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.0883 0.187 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0242 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 6.22e-02 -0.199 0.106 0.187 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 8.91e-01 0.011 0.0805 0.19 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0438 0.0556 0.19 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.28e-01 -0.112 0.073 0.19 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.105 0.19 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0487 0.0615 0.19 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 9.58e-01 0.00426 0.0802 0.19 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 4.43e-02 0.17 0.084 0.19 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 2.01e-01 -0.14 0.109 0.19 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 7.02e-02 0.178 0.0977 0.191 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0172 0.0868 0.191 NK L1
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 8.06e-02 0.128 0.0731 0.191 NK L1
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 4.88e-01 -0.059 0.085 0.191 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 5.13e-01 -0.053 0.081 0.191 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0176 0.0591 0.191 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.05e-01 0.0996 0.0784 0.191 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0508 0.116 0.19 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0646 0.0751 0.19 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 5.05e-01 0.062 0.0928 0.19 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0626 0.0843 0.19 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 5.67e-01 -0.052 0.0907 0.19 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0257 0.0594 0.19 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.34e-01 0.0828 0.0693 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 7.38e-01 0.044 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 8.00e-02 -0.104 0.0593 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 8.70e-02 -0.214 0.124 0.194 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00123 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 9.54e-01 0.00684 0.119 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 3.70e-01 -0.114 0.128 0.194 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 3.71e-01 -0.114 0.127 0.194 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 1.75e-01 0.152 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0596 0.0777 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 6.72e-01 0.042 0.099 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.87e-01 -0.128 0.0969 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 9.17e-03 -0.271 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 7.88e-01 0.024 0.0893 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 4.87e-01 0.0759 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.115 0.192 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 4.39e-01 0.0672 0.0867 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 5.24e-01 -0.069 0.108 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0663 0.0997 0.192 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 5.81e-02 -0.204 0.107 0.192 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0888 0.0853 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0936 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 3.90e-01 0.0863 0.1 0.192 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 7.30e-01 0.0426 0.123 0.192 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 6.64e-01 -0.047 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00203 0.0761 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0302 0.103 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 2.15e-02 -0.216 0.0932 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 6.57e-01 0.0388 0.0873 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0468 0.061 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0055 0.114 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 4.53e-01 0.0625 0.0831 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0855 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 3.00e-01 0.11 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0468 0.0728 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0415 0.0875 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0775 0.1 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00717 0.0957 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0819 0.0702 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0807 0.111 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 9.77e-01 0.00332 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00384 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.0968 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 1.84e-01 0.157 0.118 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0699 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 9.63e-01 0.00515 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00879 0.1 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 4.14e-01 0.0825 0.101 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 8.49e-01 0.0199 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 7.73e-01 0.0308 0.106 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 9.52e-01 0.00396 0.0664 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0847 0.0874 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.96e-01 -0.107 0.0824 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 3.06e-01 0.0751 0.0732 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0632 0.0492 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 5.56e-01 0.0494 0.0838 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0222 0.0848 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 2.79e-01 0.111 0.103 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0267 0.0765 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0957 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.99e-01 -0.106 0.0819 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0461 0.0779 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0691 0.0598 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 5.27e-01 0.0564 0.0891 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 7.56e-01 0.03 0.0963 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0709 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 7.41e-01 0.0264 0.0796 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00517 0.0925 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 9.28e-02 -0.152 0.0903 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0987 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0703 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0061 0.0927 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 5.96e-01 0.0515 0.0969 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 2.11e-01 0.151 0.12 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0204 0.0862 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0755 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0466 0.0878 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0796 0.094 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0718 0.076 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 5.44e-01 0.0539 0.0886 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0371 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0545 0.073 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0982 0.0876 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0753 0.0881 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 1.62e-01 0.124 0.088 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0388 0.0463 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0935 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 3.29e-01 -0.105 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 3.22e-01 0.128 0.129 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 6.47e-01 0.0415 0.0906 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 2.77e-01 0.13 0.119 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0864 0.0942 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 9.10e-01 -0.011 0.0981 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 4.30e-03 -0.277 0.0957 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 6.19e-01 -0.05 0.1 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0554 0.106 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 1.06e-01 0.191 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 3.25e-01 0.106 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0503 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 8.25e-01 0.0246 0.111 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 6.37e-01 0.0547 0.116 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.23e-02 -0.203 0.088 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 6.78e-01 0.0403 0.0968 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 3.35e-01 -0.106 0.11 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 2.16e-01 -0.154 0.124 0.19 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 9.44e-01 0.00602 0.0861 0.19 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 2.07e-01 0.144 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 7.14e-01 0.0346 0.0943 0.19 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0712 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 5.37e-01 0.0462 0.0746 0.19 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0256 0.0879 0.19 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0244 0.118 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 8.30e-01 0.0216 0.101 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 7.64e-01 0.0324 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0396 0.107 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0617 0.0999 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 3.23e-03 -0.269 0.0902 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0986 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 1.77e-01 0.144 0.107 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0316 0.095 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 2.63e-02 0.188 0.0842 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 8.21e-02 -0.16 0.0914 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 9.21e-01 0.00864 0.0873 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0203 0.0591 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 1.16e-01 0.124 0.0784 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 9.04e-01 0.0147 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 6.19e-01 0.0517 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0919 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.99e-01 0.146 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0547 0.113 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0556 0.0925 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 1.99e-01 0.127 0.0985 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 4.83e-02 0.219 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0752 0.0957 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 3.64e-01 0.0811 0.0891 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0956 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 6.86e-01 -0.04 0.0989 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0165 0.0637 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 5.72e-01 0.047 0.0831 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0717 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0342 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0951 0.196 PB L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0124 0.154 0.196 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 2.38e-01 -0.161 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 4.25e-01 0.0764 0.0954 0.196 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 3.83e-01 0.122 0.139 0.196 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 1.72e-01 -0.143 0.104 0.196 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0986 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 2.36e-01 -0.142 0.12 0.189 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 2.60e-01 -0.108 0.0956 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0759 0.0885 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 4.16e-01 -0.077 0.0946 0.189 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 6.97e-01 0.0281 0.072 0.189 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 1.46e-01 0.125 0.0853 0.189 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 9.46e-01 0.0076 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0181 0.0766 0.19 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0501 0.12 0.19 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 7.45e-01 0.0303 0.0931 0.19 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 4.70e-01 0.0696 0.0963 0.19 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 8.74e-01 0.013 0.0821 0.19 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 4.30e-01 0.0723 0.0915 0.19 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -303430 sc-eQTL 2.22e-01 0.128 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0283 0.113 0.19 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 1.27e-01 -0.124 0.0806 0.19 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0972 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 5.84e-01 0.0577 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0395 0.121 0.19 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 1.62e-01 0.139 0.0987 0.19 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 7.88e-01 0.0283 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 8.78e-02 -0.198 0.115 0.19 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0687 0.0876 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0494 0.0629 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0947 0.0722 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 7.54e-02 0.187 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 7.67e-02 0.167 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 5.04e-01 0.0531 0.0792 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.94e-01 0.087 0.0827 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0904 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 4.59e-01 0.0756 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 9.29e-01 0.00621 0.0698 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0859 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0434 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 9.78e-03 -0.265 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 6.13e-01 0.0456 0.0899 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 1.14e-01 0.14 0.0885 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0785 0.12 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 1.07e-01 0.219 0.135 0.182 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 1.35e-01 0.193 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 8.29e-01 0.0261 0.12 0.182 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0414 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 8.67e-01 0.0224 0.134 0.182 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0408 0.1 0.182 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 6.42e-01 0.0539 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 6.83e-01 0.0487 0.119 0.189 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 3.07e-01 0.082 0.0799 0.189 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 1.92e-01 0.128 0.0976 0.189 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 5.19e-01 0.0697 0.108 0.189 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 4.29e-01 0.0805 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 1.23e-01 0.152 0.0983 0.189 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0559 0.121 0.189 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 4.75e-01 0.0785 0.11 0.186 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0772 0.0652 0.186 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.1 0.186 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 9.80e-01 0.00261 0.105 0.186 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0938 0.0792 0.186 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 6.59e-02 -0.175 0.0949 0.186 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.44e-02 0.182 0.0802 0.186 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 3.91e-01 -0.1 0.117 0.186 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00674 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 8.11e-01 0.0229 0.0957 0.201 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0678 0.104 0.201 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0694 0.0951 0.201 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 8.37e-01 0.0199 0.0965 0.201 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 1.35e-01 0.157 0.105 0.201 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 1.00e-01 0.203 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 1.78e-01 -0.129 0.0952 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 2.85e-01 0.115 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 7.60e-01 0.0228 0.0748 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0324 0.0985 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 5.06e-02 -0.187 0.0952 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 8.01e-04 -0.33 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0348 0.069 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 9.79e-01 0.00298 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00565 0.113 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 4.67e-01 0.0734 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00875 0.0699 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0472 0.103 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 2.22e-02 -0.215 0.0931 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0194 0.0803 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0595 0.0562 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -355775 sc-eQTL 3.60e-01 -0.108 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 5.44e-01 0.052 0.0856 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -335139 sc-eQTL 6.29e-02 -0.187 0.0999 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0196 0.0815 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0513 0.0606 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 8.02e-02 -0.128 0.0726 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 2.59e-01 0.121 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 8.96e-01 0.0115 0.0879 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 4.32e-01 0.0615 0.0781 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.05e-01 0.108 0.0853 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0934 0.114 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 6.37e-01 0.0525 0.111 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0319 0.0592 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 6.26e-01 0.0462 0.0947 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 243652 sc-eQTL 5.64e-01 0.0608 0.105 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0569 0.0655 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0957 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 5.16e-02 0.16 0.082 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 243675 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0408 0.116 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 sc-eQTL 4.84e-02 0.203 0.102 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 532692 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0282 0.0896 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 828804 sc-eQTL 3.08e-02 0.163 0.0748 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -198857 sc-eQTL 2.19e-01 -0.108 0.0878 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -52038 sc-eQTL 8.67e-01 0.0145 0.0861 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -92522 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0361 0.0555 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -438425 sc-eQTL 2.47e-01 0.093 0.0801 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 162714 eQTL 0.049 0.038 0.0193 0.0 0.0 0.185
ENSG00000112378 PERP 828804 eQTL 0.04 -0.0666 0.0324 0.00103 0.0 0.185
ENSG00000135597 REPS1 -52038 eQTL 1.62e-24 -0.203 0.0193 0.0548 0.0578 0.185
ENSG00000146386 ABRACL -92522 eQTL 0.015 0.0682 0.028 0.0 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -52038 7.68e-06 1.08e-05 6.82e-07 4.37e-06 1.73e-06 3.28e-06 9.55e-06 1.18e-06 5.83e-06 3.06e-06 9.35e-06 4.77e-06 1.15e-05 3.86e-06 1.66e-06 3.99e-06 3.76e-06 3.8e-06 2.2e-06 1.92e-06 2.69e-06 7.5e-06 6.46e-06 1.93e-06 1.18e-05 2.11e-06 3.05e-06 1.75e-06 7.12e-06 7.78e-06 4.32e-06 5.42e-07 7.36e-07 2.02e-06 2.47e-06 1.13e-06 9.76e-07 5.58e-07 9.61e-07 7.43e-07 3.06e-07 9.72e-06 6.7e-07 1.55e-07 6.1e-07 1.07e-06 1.08e-06 4.4e-07 3.24e-07
ENSG00000146386 ABRACL -92522 5.1e-06 7.73e-06 6.05e-07 3.29e-06 1.31e-06 1.66e-06 5.25e-06 1.01e-06 5.16e-06 1.99e-06 5.73e-06 3.36e-06 7.72e-06 1.7e-06 1.35e-06 2.42e-06 1.97e-06 3.55e-06 1.45e-06 1.02e-06 1.95e-06 4.87e-06 4.59e-06 1.83e-06 7.94e-06 1.32e-06 2.41e-06 1.57e-06 4.45e-06 4.71e-06 2.81e-06 4.15e-07 7.35e-07 1.75e-06 2.19e-06 8.67e-07 9.07e-07 4.93e-07 1.23e-06 4.29e-07 1.67e-07 6.25e-06 3.64e-07 1.62e-07 3.63e-07 3.94e-07 8.69e-07 2.32e-07 1.79e-07