logo

Genes within 1Mb (chr6:138919247:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 5.80e-01 0.0488 0.0879 0.233 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0368 0.0671 0.233 B L1
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 3.92e-01 0.0574 0.0669 0.233 B L1
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 1.73e-01 -0.117 0.0852 0.233 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 1.76e-02 -0.178 0.0746 0.233 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 4.98e-02 -0.0868 0.044 0.233 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0764 0.109 0.233 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 3.38e-01 0.0656 0.0684 0.233 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0166 0.0762 0.233 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 1.86e-01 0.129 0.0971 0.233 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.50e-01 0.00414 0.0654 0.233 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0143 0.0617 0.233 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0889 0.0811 0.233 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000531 0.0639 0.233 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 5.26e-02 -0.0905 0.0465 0.233 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 5.11e-01 0.0526 0.0799 0.233 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 1.77e-01 0.106 0.0786 0.233 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 2.61e-01 0.119 0.106 0.233 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0537 0.0692 0.233 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00802 0.0706 0.233 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0069 0.0758 0.233 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00287 0.0713 0.233 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0581 0.0404 0.233 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 3.21e-01 0.0764 0.0769 0.233 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 7.18e-01 0.0339 0.0936 0.233 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 6.92e-01 0.0429 0.108 0.23 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0374 0.0762 0.23 DC L1
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0026 0.0893 0.23 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 2.02e-01 0.127 0.099 0.23 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 5.07e-01 0.0584 0.0878 0.23 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.68e-01 0.0953 0.0858 0.23 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 9.67e-01 0.00418 0.102 0.23 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 3.34e-01 -0.1 0.104 0.23 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 6.95e-01 0.0306 0.0779 0.233 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0164 0.0539 0.233 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0764 0.0709 0.233 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 4.87e-01 0.0709 0.102 0.233 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0356 0.0596 0.233 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0916 0.0773 0.233 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 5.53e-03 0.226 0.0806 0.233 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 8.43e-02 -0.182 0.105 0.233 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 8.85e-02 0.161 0.094 0.234 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.53e-01 0.00497 0.0834 0.234 NK L1
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 5.51e-02 0.135 0.0702 0.234 NK L1
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 7.98e-01 0.021 0.0818 0.234 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 7.64e-01 0.0234 0.0779 0.234 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0608 0.0567 0.234 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.67e-01 0.104 0.0753 0.234 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0127 0.112 0.233 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 2.35e-01 -0.086 0.0722 0.233 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 4.14e-01 0.073 0.0892 0.233 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0557 0.0811 0.233 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0531 0.0872 0.233 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0259 0.0571 0.233 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.99e-01 0.086 0.0667 0.233 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 7.64e-01 0.0383 0.127 0.24 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 3.73e-01 0.0994 0.111 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0697 0.0577 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0802 0.121 0.24 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0304 0.127 0.24 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.71e-01 0.126 0.114 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0706 0.0982 0.24 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0573 0.124 0.24 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0992 0.123 0.24 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 2.63e-01 0.122 0.108 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0292 0.0752 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 1.43e-01 0.14 0.0953 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 2.76e-01 -0.103 0.0939 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.60e-02 -0.212 0.1 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 7.80e-01 0.0242 0.0864 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 8.06e-02 0.185 0.105 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 7.07e-01 0.0367 0.0974 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 7.29e-01 0.0366 0.105 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 3.37e-01 0.108 0.112 0.235 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.99e-01 7.03e-05 0.0847 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 3.39e-01 -0.101 0.105 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0388 0.0973 0.235 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 1.37e-01 -0.157 0.105 0.235 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0499 0.0834 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0322 0.106 0.235 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.16e-01 0.154 0.0973 0.235 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 7.34e-01 0.0409 0.12 0.235 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0337 0.105 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.80e-01 0.00184 0.0735 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 3.72e-01 0.0891 0.0995 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 5.35e-02 -0.176 0.0904 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 9.97e-01 0.000347 0.0844 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0263 0.059 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0309 0.111 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 2.56e-01 0.0914 0.0802 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0565 0.105 0.233 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 8.05e-02 0.181 0.103 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00372 0.0708 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0837 0.0849 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0364 0.0974 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0457 0.093 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0633 0.0683 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 1.67e-01 -0.15 0.108 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 4.30e-01 0.0873 0.11 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 1.14e-01 -0.16 0.101 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0279 0.108 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 4.98e-01 0.0631 0.093 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0303 0.113 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00668 0.109 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 8.42e-01 0.0211 0.106 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 9.08e-01 0.0112 0.0963 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 7.09e-01 0.0361 0.0967 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 6.46e-01 0.0458 0.0997 0.227 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 1.79e-01 0.139 0.103 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.16e-01 0.00678 0.0644 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 1.41e-01 -0.125 0.0846 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0887 0.08 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 8.18e-01 0.0164 0.0712 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0713 0.0477 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 4.93e-01 0.0558 0.0813 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 1.86e-01 0.109 0.0819 0.233 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 2.14e-01 0.125 0.1 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0142 0.0747 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0351 0.0937 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0826 0.0801 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0779 0.076 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0711 0.0584 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 3.88e-01 0.0751 0.0869 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 4.43e-01 0.0722 0.094 0.233 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0159 0.113 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 7.53e-01 0.0244 0.0773 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0232 0.0899 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 1.91e-01 -0.115 0.0879 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 1.99e-01 0.124 0.0958 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.46e-02 -0.167 0.0676 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 8.12e-01 0.0215 0.09 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 9.55e-01 0.00529 0.0942 0.233 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 2.64e-01 0.131 0.117 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0396 0.0837 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0663 0.104 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 4.63e-01 0.0627 0.0853 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0793 0.0913 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 9.09e-02 -0.125 0.0735 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 3.06e-01 0.0881 0.0859 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 2.77e-01 -0.112 0.103 0.233 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00182 0.111 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0686 0.0705 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0835 0.0847 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0399 0.0853 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 4.74e-01 0.0613 0.0854 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0414 0.0448 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.56e-01 0.129 0.0903 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 9.97e-01 0.000411 0.104 0.233 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 2.58e-01 0.141 0.125 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 8.80e-01 0.0133 0.0878 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 1.48e-01 0.167 0.115 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0755 0.0912 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 2.82e-01 -0.102 0.0947 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.59e-03 -0.295 0.0922 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0147 0.0973 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 8.38e-01 -0.021 0.103 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 3.06e-01 0.117 0.114 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 3.90e-01 0.0895 0.104 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0155 0.119 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 4.25e-01 0.0855 0.107 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 7.62e-01 0.0338 0.111 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.92e-01 -0.112 0.0855 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.10e-01 0.149 0.0927 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00717 0.106 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0728 0.121 0.234 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0191 0.0838 0.234 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 4.10e-01 0.0914 0.111 0.234 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 7.76e-01 0.0262 0.0918 0.234 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0626 0.0988 0.234 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 4.70e-01 0.0526 0.0726 0.234 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 7.92e-01 0.0226 0.0856 0.234 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 6.35e-01 0.0537 0.113 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.96e-01 0.000517 0.0962 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 8.90e-01 0.0142 0.103 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 8.04e-01 0.0254 0.102 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0396 0.0955 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.89e-02 -0.205 0.0868 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 2.25e-01 0.115 0.0941 0.231 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 1.82e-01 0.137 0.102 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 8.88e-01 0.0129 0.0913 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 7.92e-03 0.216 0.0805 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0194 0.0885 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 5.81e-01 0.0464 0.0838 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0484 0.0567 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.05e-01 0.123 0.0752 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 4.36e-01 -0.092 0.118 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 4.28e-01 0.0798 0.1 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 2.44e-01 0.104 0.0891 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 3.50e-02 0.232 0.109 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00695 0.109 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.10e-01 -0.112 0.0892 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 6.89e-02 0.174 0.0949 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 3.01e-02 0.23 0.105 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0658 0.0915 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 5.84e-01 0.0468 0.0853 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0369 0.0915 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0594 0.0944 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0784 0.0607 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 6.35e-01 0.0378 0.0795 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 1.37e-01 -0.209 0.14 0.241 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 2.98e-01 0.131 0.125 0.241 PB L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 1.14e-01 0.15 0.0945 0.241 PB L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 3.75e-01 -0.136 0.153 0.241 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 4.77e-02 -0.269 0.134 0.241 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 8.51e-01 0.018 0.0956 0.241 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 3.38e-01 0.134 0.139 0.241 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.77e-01 -0.142 0.104 0.241 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 4.10e-01 -0.116 0.141 0.241 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0943 0.116 0.23 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0872 0.0926 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00441 0.0858 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 1.63e-01 -0.128 0.0912 0.23 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.05e-01 -0.111 0.108 0.23 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0665 0.0695 0.23 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 2.90e-02 0.18 0.082 0.23 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 4.82e-01 0.0766 0.109 0.233 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0172 0.0743 0.233 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 2.58e-01 -0.132 0.117 0.233 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 7.92e-01 0.0238 0.0904 0.233 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 5.42e-01 0.0571 0.0935 0.233 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0976 0.0794 0.233 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 4.52e-01 0.0669 0.0888 0.233 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -320406 sc-eQTL 1.16e-01 0.16 0.101 0.233 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 6.27e-01 0.0544 0.112 0.229 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0908 0.0799 0.229 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0457 0.106 0.229 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 3.46e-02 0.219 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.84e-01 -0.104 0.12 0.229 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 2.31e-01 0.117 0.0976 0.229 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0154 0.104 0.229 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 2.36e-01 -0.136 0.114 0.229 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0831 0.0857 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0374 0.0617 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0782 0.0708 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 5.92e-01 0.0555 0.103 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 6.97e-01 0.0359 0.0923 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0237 0.0776 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 2.63e-01 0.0908 0.081 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 2.16e-01 -0.134 0.108 0.233 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 2.51e-01 0.114 0.0989 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 5.34e-01 0.0422 0.0678 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0789 0.0836 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0605 0.106 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 7.77e-02 -0.177 0.0998 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0569 0.0873 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 7.44e-03 0.23 0.0851 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0981 0.116 0.233 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 3.07e-01 0.132 0.129 0.227 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 5.66e-01 0.0707 0.123 0.227 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 8.67e-01 0.0192 0.114 0.227 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 2.52e-01 -0.14 0.122 0.227 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00621 0.127 0.227 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0174 0.0954 0.227 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 4.13e-01 0.0902 0.11 0.227 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 7.75e-01 0.0335 0.117 0.227 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 2.66e-01 0.0874 0.0784 0.227 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 5.29e-01 0.0607 0.0961 0.227 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 4.86e-01 0.074 0.106 0.227 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.21e-01 -0.109 0.109 0.227 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 7.50e-01 0.0319 0.0999 0.227 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 5.52e-02 0.186 0.0962 0.227 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0798 0.119 0.227 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 4.01e-01 0.0898 0.107 0.226 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.50e-02 -0.106 0.0633 0.226 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 7.91e-01 0.0259 0.0977 0.226 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 2.26e-01 0.124 0.102 0.226 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 1.76e-01 -0.105 0.077 0.226 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 5.91e-03 -0.254 0.0915 0.226 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 4.59e-03 0.222 0.0775 0.226 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0345 0.114 0.226 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0155 0.123 0.24 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 5.25e-01 0.0609 0.0954 0.24 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0899 0.104 0.24 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0611 0.095 0.24 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 9.52e-01 0.00586 0.0963 0.24 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 6.40e-01 0.0493 0.105 0.24 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.36e-01 0.184 0.123 0.24 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0947 0.0952 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 1.35e-01 0.156 0.104 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.51e-01 0.00447 0.0723 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 9.09e-01 0.0109 0.0953 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 1.90e-01 -0.122 0.0925 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 6.29e-03 -0.261 0.0946 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 6.01e-01 0.0349 0.0667 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 3.79e-01 0.0973 0.11 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 8.04e-01 0.0233 0.0937 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0108 0.109 0.233 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 3.92e-01 0.0833 0.0971 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.91e-01 0.000777 0.0674 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 7.35e-01 0.0336 0.099 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 5.21e-02 -0.176 0.0901 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0677 0.0774 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0416 0.0543 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -372751 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.113 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 2.54e-01 0.0943 0.0824 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -352115 sc-eQTL 1.58e-01 -0.137 0.0967 0.233 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 9.53e-01 0.00464 0.0791 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0298 0.0589 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 1.57e-01 -0.1 0.0706 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 9.37e-01 0.00826 0.104 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00991 0.0854 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0261 0.0759 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.05e-01 0.134 0.0826 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 1.49e-01 -0.16 0.111 0.233 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 5.30e-01 0.0678 0.108 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0389 0.0576 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 3.40e-01 0.088 0.0919 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 226676 sc-eQTL 2.81e-01 0.11 0.102 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0512 0.0637 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 5.16e-02 -0.181 0.0925 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 2.22e-02 0.183 0.0794 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 226699 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00913 0.113 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 sc-eQTL 1.02e-01 0.161 0.0982 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 515716 sc-eQTL 9.02e-01 0.0106 0.0857 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 811828 sc-eQTL 3.90e-02 0.149 0.0715 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -215833 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00395 0.0843 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -69014 sc-eQTL 3.96e-01 0.0699 0.0822 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -109498 sc-eQTL 1.75e-01 -0.072 0.0529 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -455401 sc-eQTL 1.52e-01 0.11 0.0764 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 145738 eQTL 0.0314 0.0384 0.0178 0.0 0.0 0.235
ENSG00000135597 REPS1 -69014 eQTL 1e-19 -0.168 0.0181 0.0 0.0 0.235

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -69014 7.8e-06 1.04e-05 1.68e-06 6.7e-06 2.32e-06 4.28e-06 1.15e-05 2.08e-06 1e-05 5.58e-06 1.24e-05 5.89e-06 1.68e-05 3.6e-06 3.4e-06 6.93e-06 4.74e-06 7.88e-06 2.98e-06 3.16e-06 6.27e-06 1.02e-05 9.05e-06 3.4e-06 1.75e-05 4.4e-06 6.97e-06 4.92e-06 1.22e-05 9.08e-06 5.9e-06 1.01e-06 1.27e-06 3.54e-06 4.81e-06 2.85e-06 1.78e-06 1.93e-06 2.08e-06 1.18e-06 1.29e-06 1.33e-05 1.43e-06 1.96e-07 9.48e-07 2.04e-06 1.91e-06 7.99e-07 5.8e-07