logo

Genes within 1Mb (chr6:138917061:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0946 0.152 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 1.40e-01 0.107 0.0721 0.152 B L1
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0273 0.0723 0.152 B L1
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 5.50e-03 0.254 0.0907 0.152 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 3.74e-01 0.0725 0.0814 0.152 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0645 0.0477 0.152 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0437 0.117 0.152 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0154 0.074 0.152 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 1.17e-01 0.129 0.0818 0.152 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 2.92e-02 -0.23 0.105 0.152 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 3.98e-01 0.06 0.0709 0.152 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.79e-01 0.0474 0.0669 0.152 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 3.36e-01 0.0848 0.088 0.152 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 9.06e-01 0.0082 0.0693 0.152 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 1.89e-01 0.0668 0.0507 0.152 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 8.19e-01 0.0199 0.0868 0.152 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0101 0.0856 0.152 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0837 0.115 0.152 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 2.96e-01 0.0789 0.0754 0.152 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 1.84e-01 -0.102 0.0766 0.152 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 3.56e-01 0.0763 0.0824 0.152 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 9.67e-01 0.00321 0.0777 0.152 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 1.43e-02 0.108 0.0436 0.152 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 6.55e-01 0.0376 0.0839 0.152 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0498 0.102 0.152 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.80e-01 -0.152 0.113 0.155 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 9.89e-01 0.00115 0.08 0.155 DC L1
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 9.46e-01 0.0063 0.0937 0.155 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 8.01e-01 0.0264 0.104 0.155 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0454 0.0922 0.155 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0981 0.0901 0.155 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0294 0.107 0.155 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 6.12e-01 0.0553 0.109 0.155 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 6.77e-02 -0.151 0.0822 0.152 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 5.71e-02 0.109 0.0569 0.152 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 5.84e-01 0.0415 0.0756 0.152 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 6.71e-02 -0.198 0.107 0.152 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0232 0.0634 0.152 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.08e-01 0.104 0.0822 0.152 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0585 0.0872 0.152 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 3.61e-01 0.103 0.112 0.152 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 3.05e-01 -0.106 0.103 0.152 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 7.36e-01 0.0309 0.0913 0.152 NK L1
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0067 0.0775 0.152 NK L1
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 4.21e-01 0.0722 0.0895 0.152 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0217 0.0853 0.152 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 5.20e-03 0.173 0.0611 0.152 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0634 0.0827 0.152 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0658 0.122 0.152 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 4.25e-01 0.0629 0.0786 0.152 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0391 0.0971 0.152 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 1.31e-02 0.217 0.0869 0.152 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 2.68e-01 -0.105 0.0946 0.152 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 1.67e-01 0.0858 0.0618 0.152 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 8.20e-01 0.0166 0.0727 0.152 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 8.34e-01 0.0299 0.142 0.143 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0365 0.124 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0165 0.0646 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 2.35e-01 0.161 0.135 0.143 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 9.74e-01 0.0046 0.142 0.143 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.23e-01 -0.156 0.128 0.143 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 4.02e-01 0.0921 0.11 0.143 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 3.17e-01 -0.138 0.138 0.143 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 6.24e-02 0.256 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0527 0.118 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 4.53e-01 0.0614 0.0816 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 7.73e-01 -0.03 0.104 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 3.64e-01 0.0928 0.102 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 1.87e-01 0.145 0.11 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 3.33e-01 0.0908 0.0936 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0458 0.115 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.14e-01 0.0115 0.106 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 9.15e-01 0.0122 0.115 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.18e-01 -0.189 0.121 0.151 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 9.20e-02 0.154 0.0907 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.77e-01 0.081 0.114 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 3.71e-01 0.0939 0.105 0.151 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0632 0.114 0.151 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0912 0.0897 0.151 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 4.27e-01 0.0912 0.115 0.151 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.51e-01 0.0065 0.106 0.151 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0212 0.129 0.151 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0966 0.113 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 3.15e-01 0.0796 0.0791 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 3.30e-01 -0.105 0.107 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 5.34e-03 0.272 0.0965 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 3.20e-01 0.0904 0.0908 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0537 0.0635 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0922 0.119 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.32e-01 0.00736 0.0867 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 7.12e-02 0.205 0.113 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 7.75e-02 -0.194 0.109 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 6.58e-02 0.138 0.0748 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 3.69e-01 0.0814 0.0905 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 2.74e-02 0.228 0.103 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 6.43e-01 0.046 0.099 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0734 0.0727 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00243 0.115 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 8.28e-01 0.0257 0.118 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 2.94e-01 0.113 0.108 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.42e-01 -0.173 0.118 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 4.94e-01 0.07 0.102 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 2.12e-01 0.155 0.124 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 7.19e-01 0.043 0.119 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0735 0.116 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0631 0.105 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 3.90e-01 0.0913 0.106 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0884 0.109 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 4.42e-03 -0.314 0.109 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 8.15e-01 0.0163 0.0694 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 1.40e-01 0.135 0.0912 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 1.55e-01 0.123 0.0861 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 6.17e-01 0.0384 0.0767 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 6.27e-01 0.0251 0.0516 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.00e-01 0.011 0.0877 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0292 0.0887 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.41e-01 -0.16 0.108 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 4.58e-01 0.0602 0.081 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 7.25e-01 0.0358 0.102 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 6.11e-01 0.0444 0.0871 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 7.20e-01 0.0296 0.0826 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 1.28e-01 0.0966 0.0632 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 4.69e-01 0.0685 0.0944 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 9.95e-01 0.000642 0.102 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 9.55e-01 0.00711 0.126 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 5.02e-01 0.0575 0.0856 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 7.26e-01 -0.035 0.0996 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 6.83e-01 0.04 0.0978 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0844 0.106 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 1.56e-01 0.108 0.0756 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 4.05e-01 0.0831 0.0996 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0406 0.104 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.37e-01 -0.19 0.127 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 8.35e-02 0.158 0.0906 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 8.69e-02 -0.194 0.113 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00797 0.093 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0633 0.0995 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.71e-03 0.239 0.0788 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 8.89e-01 0.0131 0.0938 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 1.14e-01 -0.177 0.112 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0312 0.12 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 4.61e-01 0.0565 0.0766 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 1.29e-01 -0.14 0.0917 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 5.73e-01 0.0522 0.0925 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 4.01e-01 -0.078 0.0927 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 5.88e-01 0.0264 0.0487 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0259 0.0984 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0103 0.113 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00192 0.136 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 3.80e-01 0.0842 0.0957 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0954 0.126 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 2.94e-01 0.105 0.0995 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 8.14e-02 0.18 0.103 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 7.19e-01 0.0372 0.103 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0111 0.106 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 6.23e-01 0.0552 0.112 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.93e-01 -0.165 0.126 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 9.03e-01 0.014 0.115 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.75e-02 -0.259 0.13 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 2.30e-01 -0.142 0.118 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 1.83e-01 -0.164 0.123 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 3.90e-02 0.196 0.0941 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 4.68e-01 0.0751 0.103 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 1.29e-01 -0.178 0.117 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 2.59e-01 -0.149 0.132 0.152 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0811 0.0915 0.152 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 1.00e-01 -0.199 0.12 0.152 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 2.18e-02 0.229 0.0992 0.152 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 2.77e-02 -0.237 0.107 0.152 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 6.15e-01 0.04 0.0795 0.152 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 6.43e-01 0.0434 0.0936 0.152 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 6.61e-01 0.0521 0.119 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0462 0.101 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00622 0.108 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0245 0.108 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0712 0.1 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0339 0.0925 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 4.48e-01 0.0753 0.0991 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0645 0.113 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 7.15e-01 0.0366 0.1 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0363 0.0897 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 1.60e-01 0.136 0.0965 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0386 0.0919 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.36e-02 0.14 0.0615 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0954 0.0828 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0572 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 9.37e-01 0.00885 0.111 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.14e-02 0.201 0.0977 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 5.86e-01 0.0664 0.122 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 1.68e-01 -0.166 0.12 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 4.95e-01 0.0675 0.0989 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 3.16e-01 -0.106 0.105 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 2.74e-01 -0.126 0.115 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 6.53e-01 0.0447 0.0993 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0675 0.0924 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 2.00e-01 0.127 0.0989 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 3.22e-01 0.102 0.102 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 4.50e-02 0.132 0.0654 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0415 0.0862 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.80e-01 0.188 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 3.69e-01 0.113 0.125 0.144 PB L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0473 0.0952 0.144 PB L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 3.25e-02 0.325 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 1.66e-01 -0.188 0.135 0.144 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0948 0.144 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0668 0.139 0.144 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 7.68e-01 0.0309 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0746 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00172 0.123 0.152 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 5.26e-01 0.0624 0.0982 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 1.83e-01 0.121 0.0904 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 2.58e-03 0.29 0.095 0.152 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 1.27e-02 0.283 0.113 0.152 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.40e-01 0.0867 0.0735 0.152 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 3.18e-01 0.0876 0.0876 0.152 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 3.06e-01 -0.119 0.116 0.152 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 1.14e-01 0.126 0.0792 0.152 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 9.36e-01 -0.01 0.125 0.152 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 6.72e-01 0.0411 0.0968 0.152 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 2.39e-01 -0.118 0.0999 0.152 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00792 0.0854 0.152 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 7.61e-01 0.029 0.0953 0.152 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -322592 sc-eQTL 5.12e-01 0.0715 0.109 0.152 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 2.43e-02 -0.254 0.112 0.154 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 5.19e-01 0.0525 0.0813 0.154 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 6.60e-01 0.0475 0.108 0.154 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0391 0.106 0.154 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0188 0.122 0.154 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0672 0.0994 0.154 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0693 0.105 0.154 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 2.97e-01 0.122 0.116 0.154 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0664 0.0901 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 2.87e-01 0.069 0.0646 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00106 0.0745 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0305 0.109 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 7.38e-01 0.0324 0.0969 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 3.26e-01 0.0801 0.0813 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0344 0.0852 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 5.49e-01 0.0681 0.114 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0451 0.104 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 5.81e-03 0.195 0.0698 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 3.25e-01 0.0865 0.0876 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 6.11e-02 -0.208 0.11 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 7.98e-01 -0.027 0.105 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 8.58e-01 0.0164 0.0916 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 4.48e-01 0.0689 0.0905 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0487 0.122 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 5.28e-02 0.274 0.14 0.158 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 3.95e-02 0.277 0.133 0.158 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.60e-01 0.0931 0.126 0.158 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0382 0.135 0.158 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 1.19e-01 0.217 0.138 0.158 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0272 0.105 0.158 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 1.89e-01 -0.159 0.12 0.158 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 4.84e-03 -0.335 0.118 0.156 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 1.76e-01 0.109 0.0802 0.156 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0348 0.0985 0.156 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.108 0.156 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 3.15e-01 0.113 0.112 0.156 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 6.28e-01 0.0496 0.102 0.156 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 5.57e-01 0.0585 0.0993 0.156 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 6.60e-01 0.0536 0.122 0.156 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.71e-01 -0.155 0.113 0.154 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 7.35e-01 0.0229 0.0676 0.154 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0324 0.104 0.154 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0389 0.109 0.154 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 7.05e-02 -0.148 0.0814 0.154 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 4.18e-03 0.281 0.0968 0.154 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 2.00e-01 -0.107 0.0836 0.154 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 1.26e-01 0.185 0.12 0.154 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0852 0.132 0.144 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 1.64e-01 -0.142 0.102 0.144 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 6.85e-01 0.0454 0.112 0.144 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 2.16e-01 0.126 0.101 0.144 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0642 0.103 0.144 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0417 0.113 0.144 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 6.70e-01 0.0566 0.133 0.144 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0308 0.102 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0706 0.112 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 4.44e-01 0.0596 0.0776 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 4.17e-01 0.0832 0.102 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 3.03e-01 0.103 0.0996 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 5.96e-01 0.055 0.103 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0543 0.0716 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 6.74e-01 0.05 0.119 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000431 0.101 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 1.83e-01 0.156 0.117 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.03e-01 -0.171 0.105 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 2.06e-01 0.0923 0.0727 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0439 0.107 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 8.84e-04 0.323 0.0958 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 7.84e-02 0.147 0.0833 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0685 0.0586 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -374937 sc-eQTL 3.04e-01 -0.127 0.123 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00188 0.0895 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 sc-eQTL 7.31e-02 0.188 0.104 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0812 0.083 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 6.87e-02 0.113 0.0616 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 6.82e-01 0.0306 0.0746 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 2.86e-01 -0.116 0.109 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00468 0.0898 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 4.26e-01 0.0635 0.0797 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00161 0.0874 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 7.36e-01 0.0396 0.117 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 1.07e-03 -0.367 0.11 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 5.15e-01 0.0394 0.0605 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0291 0.0967 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 224490 sc-eQTL 6.72e-02 -0.196 0.107 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0596 0.0669 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 2.42e-02 0.22 0.0969 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0239 0.0845 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 224513 sc-eQTL 8.89e-02 0.202 0.118 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 sc-eQTL 3.45e-01 -0.103 0.108 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 513530 sc-eQTL 8.23e-01 0.0211 0.0942 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 809642 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0162 0.0794 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -218019 sc-eQTL 1.59e-01 0.13 0.0922 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -71200 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0263 0.0905 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -111684 sc-eQTL 1.19e-03 0.187 0.0569 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -457587 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0731 0.0842 0.153 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 eQTL 6.71e-07 -0.1 0.0201 0.0 0.0 0.17
ENSG00000112406 HECA -218019 eQTL 0.00237 0.0368 0.0121 0.0 0.0 0.17
ENSG00000135597 REPS1 -71200 eQTL 0.00531 0.0599 0.0214 0.0 0.0 0.17
ENSG00000146386 ABRACL -111684 eQTL 2.16e-08 0.164 0.0291 0.0 0.0 0.17
ENSG00000226571 AL592429.2 -354301 eQTL 2.26e-02 0.0971 0.0425 0.0 0.0 0.17

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 143552 1.93e-06 2.61e-06 2.18e-07 1.7e-06 4.92e-07 7.71e-07 1.31e-06 3.78e-07 1.77e-06 7.31e-07 1.88e-06 1.39e-06 3.44e-06 8.7e-07 3.18e-07 9.79e-07 1.05e-06 1.33e-06 5.46e-07 7.22e-07 6.34e-07 1.94e-06 1.82e-06 8.95e-07 2.68e-06 9.13e-07 1e-06 1.05e-06 1.68e-06 1.66e-06 9.07e-07 2.43e-07 3.58e-07 1.12e-06 9.17e-07 6.76e-07 8.45e-07 3.21e-07 7.04e-07 3.34e-07 2.88e-07 2.94e-06 3.32e-07 1.31e-07 3.17e-07 3.24e-07 2.69e-07 1.71e-07 1.83e-07
ENSG00000112406 HECA -218019 1.29e-06 9.52e-07 2.72e-07 1e-06 2.1e-07 4.76e-07 1.2e-06 3.34e-07 1.13e-06 3.87e-07 1.36e-06 5.97e-07 2e-06 2.54e-07 4.16e-07 5.81e-07 8.26e-07 5.63e-07 4.54e-07 6.07e-07 3.24e-07 1.17e-06 8.52e-07 5.4e-07 1.94e-06 2.98e-07 6.21e-07 6.23e-07 1.05e-06 1.23e-06 5.48e-07 4.94e-08 1.78e-07 6.19e-07 4.22e-07 4.09e-07 5.31e-07 1.36e-07 3.2e-07 3.12e-07 3.01e-07 1.47e-06 6.81e-08 1.29e-08 2.03e-07 7.57e-08 1.9e-07 8.97e-08 5.55e-08
ENSG00000146386 ABRACL -111684 3.25e-06 3.66e-06 3.2e-07 1.95e-06 6.04e-07 7.43e-07 2.49e-06 6.85e-07 2.27e-06 1.13e-06 2.98e-06 1.68e-06 5.3e-06 1.41e-06 8.88e-07 1.64e-06 1.56e-06 2.19e-06 1.33e-06 1.51e-06 1.15e-06 3.2e-06 3.01e-06 1.24e-06 4.11e-06 1.27e-06 1.36e-06 1.78e-06 2.83e-06 2.88e-06 2.04e-06 3.21e-07 5.66e-07 1.45e-06 1.61e-06 9.85e-07 8.91e-07 4.21e-07 1.28e-06 3.28e-07 2.1e-07 4.12e-06 4.41e-07 1.99e-07 3.68e-07 3.27e-07 5.48e-07 2.18e-07 2.44e-07