logo

Genes within 1Mb (chr6:138909548:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 6.90e-01 0.0362 0.0906 0.19 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0351 0.0692 0.19 B L1
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 9.38e-01 0.0054 0.0691 0.19 B L1
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 5.23e-02 -0.171 0.0874 0.19 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 2.15e-02 -0.178 0.077 0.19 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.39e-02 -0.103 0.0452 0.19 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.112 0.19 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 5.69e-01 0.0402 0.0706 0.19 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0403 0.0785 0.19 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 6.57e-01 0.0446 0.1 0.19 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00292 0.0674 0.19 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 8.41e-01 0.0128 0.0635 0.19 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.56e-01 -0.119 0.0833 0.19 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 3.05e-01 0.0675 0.0656 0.19 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 7.06e-02 -0.087 0.0479 0.19 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 7.10e-01 0.0307 0.0824 0.19 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00115 0.0812 0.19 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.19 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0395 0.0716 0.19 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00691 0.073 0.19 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0754 0.0782 0.19 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 3.26e-01 0.0723 0.0735 0.19 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0578 0.0418 0.19 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 3.68e-01 0.0717 0.0795 0.19 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0476 0.0967 0.19 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 7.01e-01 -0.043 0.112 0.187 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0735 0.0784 0.187 DC L1
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0798 0.0918 0.187 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 9.34e-01 0.00851 0.102 0.187 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 4.19e-01 0.0733 0.0904 0.187 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.0883 0.187 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0242 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 6.22e-02 -0.199 0.106 0.187 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 8.91e-01 0.011 0.0805 0.19 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0438 0.0556 0.19 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.28e-01 -0.112 0.073 0.19 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.105 0.19 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0487 0.0615 0.19 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 9.58e-01 0.00426 0.0802 0.19 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 4.43e-02 0.17 0.084 0.19 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 2.01e-01 -0.14 0.109 0.19 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 7.02e-02 0.178 0.0977 0.191 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0172 0.0868 0.191 NK L1
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 8.06e-02 0.128 0.0731 0.191 NK L1
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 4.88e-01 -0.059 0.085 0.191 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 5.13e-01 -0.053 0.081 0.191 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0176 0.0591 0.191 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.05e-01 0.0996 0.0784 0.191 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0508 0.116 0.19 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0646 0.0751 0.19 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 5.05e-01 0.062 0.0928 0.19 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0626 0.0843 0.19 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 5.67e-01 -0.052 0.0907 0.19 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0257 0.0594 0.19 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.34e-01 0.0828 0.0693 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 7.38e-01 0.044 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 8.00e-02 -0.104 0.0593 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 8.70e-02 -0.214 0.124 0.194 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00123 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 9.54e-01 0.00684 0.119 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 3.70e-01 -0.114 0.128 0.194 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 3.71e-01 -0.114 0.127 0.194 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 1.75e-01 0.152 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0596 0.0777 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 6.72e-01 0.042 0.099 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.87e-01 -0.128 0.0969 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 9.17e-03 -0.271 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 7.88e-01 0.024 0.0893 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 4.87e-01 0.0759 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.115 0.192 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 4.39e-01 0.0672 0.0867 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 5.24e-01 -0.069 0.108 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0663 0.0997 0.192 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 5.81e-02 -0.204 0.107 0.192 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0888 0.0853 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0936 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 3.90e-01 0.0863 0.1 0.192 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 7.30e-01 0.0426 0.123 0.192 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 6.64e-01 -0.047 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00203 0.0761 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0302 0.103 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 2.15e-02 -0.216 0.0932 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 6.57e-01 0.0388 0.0873 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0468 0.061 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0055 0.114 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 4.53e-01 0.0625 0.0831 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0855 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 3.00e-01 0.11 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0468 0.0728 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0415 0.0875 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0775 0.1 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00717 0.0957 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0819 0.0702 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0807 0.111 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 9.77e-01 0.00332 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00384 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.0968 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 1.84e-01 0.157 0.118 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0699 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 9.63e-01 0.00515 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00879 0.1 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 4.14e-01 0.0825 0.101 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 8.49e-01 0.0199 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 7.73e-01 0.0308 0.106 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 9.52e-01 0.00396 0.0664 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0847 0.0874 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.96e-01 -0.107 0.0824 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 3.06e-01 0.0751 0.0732 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0632 0.0492 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 5.56e-01 0.0494 0.0838 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0222 0.0848 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 2.79e-01 0.111 0.103 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0267 0.0765 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0957 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.99e-01 -0.106 0.0819 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0461 0.0779 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0691 0.0598 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 5.27e-01 0.0564 0.0891 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 7.56e-01 0.03 0.0963 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0709 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 7.41e-01 0.0264 0.0796 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00517 0.0925 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 9.28e-02 -0.152 0.0903 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0987 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0703 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0061 0.0927 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 5.96e-01 0.0515 0.0969 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 2.11e-01 0.151 0.12 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0204 0.0862 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0755 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0466 0.0878 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0796 0.094 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0718 0.076 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 5.44e-01 0.0539 0.0886 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0371 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0545 0.073 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0982 0.0876 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0753 0.0881 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 1.62e-01 0.124 0.088 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0388 0.0463 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0935 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 3.29e-01 -0.105 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 3.22e-01 0.128 0.129 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 6.47e-01 0.0415 0.0906 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 2.77e-01 0.13 0.119 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0864 0.0942 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 9.10e-01 -0.011 0.0981 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 4.30e-03 -0.277 0.0957 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 6.19e-01 -0.05 0.1 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0554 0.106 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 1.06e-01 0.191 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 3.25e-01 0.106 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0503 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 8.25e-01 0.0246 0.111 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 6.37e-01 0.0547 0.116 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.23e-02 -0.203 0.088 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 6.78e-01 0.0403 0.0968 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 3.35e-01 -0.106 0.11 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 2.16e-01 -0.154 0.124 0.19 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 9.44e-01 0.00602 0.0861 0.19 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 2.07e-01 0.144 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 7.14e-01 0.0346 0.0943 0.19 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0712 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 5.37e-01 0.0462 0.0746 0.19 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0256 0.0879 0.19 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0244 0.118 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 8.30e-01 0.0216 0.101 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 7.64e-01 0.0324 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0396 0.107 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0617 0.0999 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 3.23e-03 -0.269 0.0902 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0986 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 1.77e-01 0.144 0.107 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0316 0.095 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 2.63e-02 0.188 0.0842 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 8.21e-02 -0.16 0.0914 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 9.21e-01 0.00864 0.0873 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0203 0.0591 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 1.16e-01 0.124 0.0784 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 9.04e-01 0.0147 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 6.19e-01 0.0517 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0919 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.99e-01 0.146 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0547 0.113 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0556 0.0925 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 1.99e-01 0.127 0.0985 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 4.83e-02 0.219 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0752 0.0957 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 3.64e-01 0.0811 0.0891 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0956 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 6.86e-01 -0.04 0.0989 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0165 0.0637 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 5.72e-01 0.047 0.0831 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0717 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0342 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0951 0.196 PB L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0124 0.154 0.196 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 2.38e-01 -0.161 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 4.25e-01 0.0764 0.0954 0.196 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 3.83e-01 0.122 0.139 0.196 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 1.72e-01 -0.143 0.104 0.196 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0986 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 2.36e-01 -0.142 0.12 0.189 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 2.60e-01 -0.108 0.0956 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0759 0.0885 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 4.16e-01 -0.077 0.0946 0.189 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 6.97e-01 0.0281 0.072 0.189 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 1.46e-01 0.125 0.0853 0.189 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 9.46e-01 0.0076 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0181 0.0766 0.19 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0501 0.12 0.19 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 7.45e-01 0.0303 0.0931 0.19 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 4.70e-01 0.0696 0.0963 0.19 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 8.74e-01 0.013 0.0821 0.19 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 4.30e-01 0.0723 0.0915 0.19 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -330105 sc-eQTL 2.22e-01 0.128 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0283 0.113 0.19 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 1.27e-01 -0.124 0.0806 0.19 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0972 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 5.84e-01 0.0577 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0395 0.121 0.19 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 1.62e-01 0.139 0.0987 0.19 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 7.88e-01 0.0283 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 8.78e-02 -0.198 0.115 0.19 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0687 0.0876 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0494 0.0629 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0947 0.0722 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 7.54e-02 0.187 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 7.67e-02 0.167 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 5.04e-01 0.0531 0.0792 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.94e-01 0.087 0.0827 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0904 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 4.59e-01 0.0756 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 9.29e-01 0.00621 0.0698 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0859 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0434 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 9.78e-03 -0.265 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 6.13e-01 0.0456 0.0899 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 1.14e-01 0.14 0.0885 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0785 0.12 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 1.07e-01 0.219 0.135 0.182 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 1.35e-01 0.193 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 8.29e-01 0.0261 0.12 0.182 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0414 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 8.67e-01 0.0224 0.134 0.182 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0408 0.1 0.182 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 6.42e-01 0.0539 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 6.83e-01 0.0487 0.119 0.189 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 3.07e-01 0.082 0.0799 0.189 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 1.92e-01 0.128 0.0976 0.189 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 5.19e-01 0.0697 0.108 0.189 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 4.29e-01 0.0805 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 1.23e-01 0.152 0.0983 0.189 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0559 0.121 0.189 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 4.75e-01 0.0785 0.11 0.186 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0772 0.0652 0.186 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.1 0.186 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 9.80e-01 0.00261 0.105 0.186 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0938 0.0792 0.186 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 6.59e-02 -0.175 0.0949 0.186 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.44e-02 0.182 0.0802 0.186 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 3.91e-01 -0.1 0.117 0.186 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00674 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 8.11e-01 0.0229 0.0957 0.201 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0678 0.104 0.201 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0694 0.0951 0.201 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 8.37e-01 0.0199 0.0965 0.201 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 1.35e-01 0.157 0.105 0.201 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 1.00e-01 0.203 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 1.78e-01 -0.129 0.0952 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 2.85e-01 0.115 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 7.60e-01 0.0228 0.0748 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0324 0.0985 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 5.06e-02 -0.187 0.0952 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 8.01e-04 -0.33 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0348 0.069 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 9.79e-01 0.00298 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00565 0.113 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 4.67e-01 0.0734 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00875 0.0699 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0472 0.103 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 2.22e-02 -0.215 0.0931 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0194 0.0803 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0595 0.0562 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -382450 sc-eQTL 3.60e-01 -0.108 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 5.44e-01 0.052 0.0856 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -361814 sc-eQTL 6.29e-02 -0.187 0.0999 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0196 0.0815 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0513 0.0606 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 8.02e-02 -0.128 0.0726 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 2.59e-01 0.121 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 8.96e-01 0.0115 0.0879 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 4.32e-01 0.0615 0.0781 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.05e-01 0.108 0.0853 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0934 0.114 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 6.37e-01 0.0525 0.111 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0319 0.0592 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 6.26e-01 0.0462 0.0947 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 216977 sc-eQTL 5.64e-01 0.0608 0.105 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0569 0.0655 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0957 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 5.16e-02 0.16 0.082 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 217000 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0408 0.116 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 136039 sc-eQTL 4.84e-02 0.203 0.102 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 506017 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0282 0.0896 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 802129 sc-eQTL 3.08e-02 0.163 0.0748 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -225532 sc-eQTL 2.19e-01 -0.108 0.0878 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -78713 sc-eQTL 8.67e-01 0.0145 0.0861 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -119197 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0361 0.0555 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -465100 sc-eQTL 2.47e-01 0.093 0.0801 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112378 PERP 802129 eQTL 0.0399 -0.0669 0.0325 0.00104 0.0 0.185
ENSG00000135597 REPS1 -78713 eQTL 1.66e-24 -0.204 0.0194 0.0523 0.0562 0.185
ENSG00000146386 ABRACL -119197 eQTL 0.0151 0.0684 0.0281 0.0 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -78713 6.66e-06 8.57e-06 1.36e-06 4e-06 2.13e-06 3.43e-06 9.67e-06 1.69e-06 6.17e-06 4.42e-06 9.04e-06 4.49e-06 1.14e-05 3.66e-06 1.69e-06 5.49e-06 3.68e-06 4.58e-06 2.34e-06 2.66e-06 4.18e-06 7.64e-06 6.24e-06 2.87e-06 1.06e-05 2.93e-06 4.22e-06 2.84e-06 7.08e-06 7.74e-06 4.17e-06 7.72e-07 1.12e-06 2.89e-06 3.3e-06 2.04e-06 1.63e-06 1.6e-06 1.62e-06 1.02e-06 1.02e-06 8.29e-06 1.26e-06 1.75e-07 7.18e-07 1.3e-06 9.95e-07 6.9e-07 4.78e-07
ENSG00000146386 ABRACL -119197 4.54e-06 5.05e-06 6.48e-07 3.05e-06 1.66e-06 1.56e-06 5.13e-06 1.11e-06 5e-06 2.88e-06 5.75e-06 3.28e-06 7.51e-06 1.97e-06 1.23e-06 3.69e-06 1.97e-06 3.82e-06 1.5e-06 1.34e-06 2.71e-06 4.81e-06 4.56e-06 1.71e-06 7.14e-06 1.94e-06 2.31e-06 1.62e-06 4.46e-06 4.42e-06 2.77e-06 4.34e-07 7.21e-07 1.9e-06 2e-06 1.13e-06 9.95e-07 4.36e-07 8.77e-07 5.93e-07 7.1e-07 5.69e-06 5.26e-07 1.63e-07 8.03e-07 1.18e-06 1.13e-06 6.58e-07 4.83e-07