logo

Genes within 1Mb (chr6:138908360:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 5.40e-01 0.0494 0.0806 0.278 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0999 0.0612 0.278 B L1
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 4.20e-01 0.0496 0.0614 0.278 B L1
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0408 0.0784 0.278 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 6.73e-03 -0.186 0.0681 0.278 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0596 0.0405 0.278 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0293 0.0998 0.278 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 3.58e-01 0.0578 0.0627 0.278 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 6.96e-01 0.0273 0.0699 0.278 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 3.22e-01 0.0886 0.0892 0.278 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0725 0.0598 0.278 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0541 0.0564 0.278 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0767 0.0744 0.278 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0146 0.0586 0.278 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0518 0.0428 0.278 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.72e-01 0.0528 0.0733 0.278 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 4.44e-01 0.0554 0.0723 0.278 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 8.09e-02 0.169 0.0966 0.278 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.76e-02 -0.126 0.0631 0.278 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0349 0.0648 0.278 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0238 0.0696 0.278 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0219 0.0655 0.278 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0435 0.0372 0.278 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 3.51e-01 0.066 0.0707 0.278 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00776 0.086 0.278 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 9.65e-01 0.00432 0.0978 0.275 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0256 0.0687 0.275 DC L1
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0163 0.0806 0.275 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 3.07e-01 0.0915 0.0894 0.275 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 3.03e-01 0.0817 0.0791 0.275 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 2.43e-01 0.0907 0.0774 0.275 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 5.24e-01 0.0588 0.0921 0.275 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 9.47e-02 -0.156 0.0931 0.275 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 2.74e-01 0.0776 0.0708 0.278 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 5.15e-01 -0.032 0.0491 0.278 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0168 0.0648 0.278 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 1.07e-01 0.149 0.0922 0.278 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0287 0.0543 0.278 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0225 0.0707 0.278 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.27e-03 0.212 0.0734 0.278 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0899 0.0963 0.278 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 3.89e-01 0.0751 0.0871 0.279 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0632 0.0768 0.279 NK L1
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 1.52e-01 0.0933 0.0649 0.279 NK L1
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00468 0.0754 0.279 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000132 0.0718 0.279 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0379 0.0524 0.279 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 2.76e-01 0.0759 0.0695 0.279 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0685 0.102 0.278 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 9.94e-02 -0.109 0.0656 0.278 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0151 0.0814 0.278 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00848 0.074 0.278 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 5.67e-01 0.0456 0.0795 0.278 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 6.82e-01 0.0214 0.0521 0.278 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.96e-01 0.0788 0.0607 0.278 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 5.42e-01 0.0714 0.117 0.283 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 6.68e-01 0.0441 0.103 0.283 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0483 0.0531 0.283 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0519 0.111 0.283 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00547 0.117 0.283 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 5.73e-01 0.0596 0.106 0.283 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0678 0.0903 0.283 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 8.76e-01 0.0177 0.114 0.283 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 8.98e-01 0.0146 0.114 0.283 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 2.30e-01 0.119 0.0994 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0626 0.0689 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 1.78e-01 0.118 0.0875 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0757 0.0862 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 1.85e-02 -0.218 0.0919 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 4.93e-01 0.0544 0.0792 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 1.56e-01 0.138 0.0967 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 3.88e-01 0.0771 0.0892 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 3.27e-01 0.0949 0.0966 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00152 0.103 0.28 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0175 0.0773 0.28 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 1.76e-01 -0.13 0.096 0.28 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0324 0.0888 0.28 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 4.55e-02 -0.192 0.0954 0.28 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 4.34e-01 0.0596 0.0761 0.28 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00577 0.0972 0.28 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.60e-01 0.125 0.0889 0.28 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 4.53e-01 0.0824 0.109 0.28 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 8.31e-01 0.0205 0.096 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0596 0.0674 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 4.99e-01 0.0619 0.0914 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0976 0.0834 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 9.01e-01 0.00963 0.0774 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00742 0.0542 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 6.59e-01 0.0449 0.101 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 3.98e-01 0.0624 0.0737 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 9.39e-01 0.00747 0.0968 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 5.52e-02 0.181 0.0938 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0509 0.0646 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 7.68e-01 -0.023 0.0777 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 7.47e-01 0.0288 0.089 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0741 0.0848 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0415 0.0625 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0977 0.0988 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.00e-01 0.085 0.101 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 1.91e-01 -0.121 0.0924 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 2.52e-01 -0.112 0.097 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0155 0.0841 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0282 0.102 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0534 0.0982 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 8.21e-01 0.0216 0.0954 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0293 0.0869 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 6.67e-01 0.0377 0.0873 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 9.80e-01 0.00229 0.0901 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 3.66e-01 0.0855 0.0943 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0684 0.0587 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 1.58e-01 -0.11 0.0774 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0744 0.0733 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0167 0.0651 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 6.82e-01 -0.018 0.0438 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.60e-01 0.055 0.0744 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 2.20e-01 0.0923 0.075 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 1.70e-01 0.126 0.0916 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0563 0.0684 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 8.25e-01 -0.019 0.0859 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 1.78e-01 -0.099 0.0733 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00714 0.0698 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0733 0.0534 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 3.45e-01 0.0753 0.0796 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 7.89e-01 0.0231 0.0862 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 6.80e-01 0.043 0.104 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0321 0.0709 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0164 0.0825 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0765 0.0808 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 3.80e-01 0.0775 0.0881 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 6.97e-02 -0.114 0.0624 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 8.09e-01 0.02 0.0826 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 9.05e-01 0.0103 0.0864 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 1.47e-01 0.155 0.107 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 7.76e-02 -0.135 0.0761 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0656 0.0956 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 6.27e-01 0.038 0.0781 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0503 0.0836 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0893 0.0674 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 3.78e-01 0.0696 0.0787 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 9.68e-02 -0.157 0.0939 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 9.31e-01 0.00872 0.101 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 7.76e-02 -0.114 0.064 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0981 0.0772 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0162 0.0779 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 5.71e-01 0.0442 0.078 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0113 0.041 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.41e-01 0.122 0.0824 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 8.70e-01 0.0155 0.0948 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 1.96e-01 0.147 0.113 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0448 0.0798 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 1.77e-01 0.142 0.105 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 1.29e-01 -0.126 0.0826 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0608 0.0862 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 8.71e-04 -0.283 0.0836 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 9.58e-01 0.00471 0.0884 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0407 0.0933 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 4.31e-02 0.211 0.104 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 1.00e+00 -5.18e-05 0.0951 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0735 0.108 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 7.21e-01 -0.035 0.0979 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 5.84e-01 0.0559 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0909 0.0783 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.39e-01 0.126 0.0849 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 4.45e-01 0.0743 0.097 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0974 0.11 0.279 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0522 0.0765 0.279 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0285 0.101 0.279 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 4.20e-01 0.0677 0.0838 0.279 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0171 0.0904 0.279 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 4.27e-01 0.0528 0.0664 0.279 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 5.56e-01 0.0461 0.0782 0.279 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0923 0.103 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0488 0.0879 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0212 0.0941 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.97e-01 0.0793 0.0935 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00691 0.0873 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 9.99e-02 -0.132 0.0799 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.11e-01 0.137 0.0858 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 2.10e-01 0.119 0.0946 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0397 0.0842 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 4.92e-03 0.211 0.0741 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0519 0.0816 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 4.76e-01 0.0552 0.0773 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0458 0.0523 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 2.15e-01 0.0866 0.0696 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0795 0.109 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 9.43e-01 0.00668 0.0926 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 4.04e-01 0.0686 0.0821 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 8.86e-02 0.173 0.101 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0431 0.1 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0777 0.0823 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.51e-01 0.126 0.0876 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0975 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 1.60e-01 -0.118 0.0839 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 6.72e-01 0.0333 0.0785 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0434 0.0842 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 2.38e-01 -0.103 0.0867 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0273 0.056 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 6.53e-01 0.033 0.0731 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 2.02e-01 -0.162 0.127 0.281 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 8.39e-01 0.0231 0.113 0.281 PB L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 5.40e-01 0.0529 0.0862 0.281 PB L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0944 0.138 0.281 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 3.10e-02 -0.264 0.121 0.281 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 6.22e-01 0.0426 0.0862 0.281 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0164 0.126 0.281 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 2.13e-01 -0.118 0.0942 0.281 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 2.65e-01 -0.142 0.127 0.281 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0996 0.105 0.276 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0961 0.0833 0.276 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0188 0.0772 0.276 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0697 0.0824 0.276 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0345 0.0972 0.276 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0172 0.0627 0.276 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 7.65e-03 0.198 0.0734 0.276 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 4.49e-01 0.0755 0.0995 0.278 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 8.77e-02 -0.116 0.0676 0.278 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 1.77e-02 -0.253 0.106 0.278 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 7.82e-01 0.023 0.0828 0.278 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 4.78e-01 0.0609 0.0856 0.278 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 5.29e-01 -0.046 0.0729 0.278 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.89e-01 0.0564 0.0814 0.278 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -331293 sc-eQTL 4.29e-01 0.0737 0.093 0.278 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 5.20e-01 0.0651 0.101 0.276 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0548 0.0724 0.276 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0643 0.0961 0.276 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 1.91e-01 0.123 0.0937 0.276 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0882 0.108 0.276 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 1.34e-01 0.133 0.0881 0.276 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 6.81e-01 0.0387 0.094 0.276 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 5.66e-02 -0.197 0.103 0.276 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0369 0.0785 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0433 0.0563 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00487 0.0649 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 2.19e-01 0.116 0.0941 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 5.97e-01 0.0446 0.0843 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 6.69e-01 0.0304 0.0709 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.48e-01 0.107 0.0738 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 3.79e-01 -0.087 0.0987 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 9.63e-02 0.15 0.0898 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 9.63e-01 0.00289 0.0618 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0142 0.0764 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 9.92e-01 0.000954 0.0968 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 2.15e-01 -0.114 0.0913 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 9.65e-01 0.00345 0.0796 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 9.16e-03 0.204 0.0776 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 9.51e-01 0.00649 0.106 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 6.74e-01 0.0491 0.116 0.27 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 4.51e-01 0.0837 0.111 0.27 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00394 0.103 0.27 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.11 0.27 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0163 0.114 0.27 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 8.47e-01 0.0166 0.086 0.27 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 5.19e-01 0.064 0.0991 0.27 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 7.78e-01 0.0299 0.106 0.273 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 7.25e-01 0.0251 0.0712 0.273 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 5.24e-01 0.0556 0.087 0.273 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 2.06e-01 0.121 0.0957 0.273 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 2.14e-01 -0.123 0.0989 0.273 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 1.77e-01 0.122 0.0901 0.273 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.78e-02 0.173 0.0871 0.273 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0727 0.108 0.273 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 4.91e-01 0.0663 0.0961 0.271 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0851 0.0571 0.271 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 9.53e-01 0.00522 0.088 0.271 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 1.09e-01 0.148 0.0919 0.271 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0832 0.0694 0.271 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0835 0.271 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.41e-03 0.225 0.0694 0.271 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 9.78e-01 0.00289 0.103 0.271 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0893 0.11 0.285 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 3.61e-01 0.0784 0.0857 0.285 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0929 0.0932 0.285 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0454 0.0854 0.285 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 7.42e-01 0.0286 0.0866 0.285 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 9.14e-01 0.0102 0.0946 0.285 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.11e-02 0.226 0.11 0.285 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 1.48e-01 -0.124 0.0853 0.285 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 3.16e-01 0.0957 0.0953 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0259 0.0661 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0197 0.0871 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0761 0.0848 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 1.64e-03 -0.274 0.0861 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 1.45e-01 0.0889 0.0607 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 2.30e-01 0.121 0.101 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 4.75e-01 0.0613 0.0857 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 5.16e-01 0.0649 0.0996 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 1.89e-01 0.117 0.0889 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0574 0.0618 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 6.37e-01 0.043 0.0909 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0848 0.0833 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0469 0.0711 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0153 0.0499 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -383638 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0541 0.104 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 3.64e-01 0.069 0.0758 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -363002 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0826 0.0891 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 4.12e-01 0.0594 0.0722 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0494 0.0538 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0229 0.0649 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 4.24e-01 0.0758 0.0947 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 8.20e-01 0.0178 0.078 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 6.53e-01 0.0312 0.0694 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 5.28e-02 0.147 0.0753 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0695 0.102 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 4.12e-01 0.0801 0.0974 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0449 0.052 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 4.77e-01 0.0593 0.0832 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 215789 sc-eQTL 2.55e-02 0.206 0.0916 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0673 0.0575 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0835 0.0842 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 1.14e-02 0.183 0.0716 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 215812 sc-eQTL 8.29e-01 0.0222 0.102 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 134851 sc-eQTL 2.82e-01 0.0978 0.0906 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 504829 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0493 0.0788 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 800941 sc-eQTL 7.97e-02 0.116 0.066 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -226720 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0349 0.0775 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -79901 sc-eQTL 6.59e-01 0.0334 0.0757 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -120385 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0498 0.0488 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -466288 sc-eQTL 2.77e-01 0.0768 0.0704 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 215789 eQTL 0.0186 0.0621 0.0263 0.0 0.0 0.266
ENSG00000135597 REPS1 -79901 eQTL 7.26e-18 -0.154 0.0175 0.0 0.0 0.266

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -79901 5.2e-06 5.93e-06 6.2e-07 3.4e-06 1.54e-06 1.59e-06 7.61e-06 1.25e-06 4.49e-06 3.09e-06 7.55e-06 2.88e-06 9.55e-06 2.17e-06 9.51e-07 3.78e-06 2.72e-06 3.99e-06 1.56e-06 1.61e-06 2.72e-06 5.62e-06 4.69e-06 1.97e-06 9.01e-06 2.11e-06 2.72e-06 1.73e-06 5.61e-06 6.17e-06 2.89e-06 4.43e-07 7.75e-07 2.3e-06 1.97e-06 1.33e-06 1.04e-06 5.43e-07 1.08e-06 6.99e-07 7.88e-07 7.99e-06 6.47e-07 1.52e-07 7.49e-07 9.94e-07 1.06e-06 6.85e-07 5.44e-07