logo

Genes within 1Mb (chr6:138899575:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 5.40e-01 0.0494 0.0806 0.278 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0999 0.0612 0.278 B L1
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 4.20e-01 0.0496 0.0614 0.278 B L1
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0408 0.0784 0.278 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 6.73e-03 -0.186 0.0681 0.278 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0596 0.0405 0.278 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0293 0.0998 0.278 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 3.58e-01 0.0578 0.0627 0.278 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 6.96e-01 0.0273 0.0699 0.278 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 3.22e-01 0.0886 0.0892 0.278 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0725 0.0598 0.278 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0541 0.0564 0.278 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0767 0.0744 0.278 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0146 0.0586 0.278 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0518 0.0428 0.278 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.72e-01 0.0528 0.0733 0.278 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 4.44e-01 0.0554 0.0723 0.278 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 8.09e-02 0.169 0.0966 0.278 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.76e-02 -0.126 0.0631 0.278 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0349 0.0648 0.278 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0238 0.0696 0.278 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0219 0.0655 0.278 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0435 0.0372 0.278 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 3.51e-01 0.066 0.0707 0.278 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00776 0.086 0.278 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 9.65e-01 0.00432 0.0978 0.275 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0256 0.0687 0.275 DC L1
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0163 0.0806 0.275 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 3.07e-01 0.0915 0.0894 0.275 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 3.03e-01 0.0817 0.0791 0.275 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 2.43e-01 0.0907 0.0774 0.275 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 5.24e-01 0.0588 0.0921 0.275 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 9.47e-02 -0.156 0.0931 0.275 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 2.74e-01 0.0776 0.0708 0.278 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 5.15e-01 -0.032 0.0491 0.278 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0168 0.0648 0.278 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 1.07e-01 0.149 0.0922 0.278 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0287 0.0543 0.278 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0225 0.0707 0.278 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.27e-03 0.212 0.0734 0.278 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0899 0.0963 0.278 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 3.89e-01 0.0751 0.0871 0.279 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0632 0.0768 0.279 NK L1
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 1.52e-01 0.0933 0.0649 0.279 NK L1
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00468 0.0754 0.279 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000132 0.0718 0.279 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0379 0.0524 0.279 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 2.76e-01 0.0759 0.0695 0.279 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0685 0.102 0.278 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 9.94e-02 -0.109 0.0656 0.278 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0151 0.0814 0.278 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00848 0.074 0.278 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 5.67e-01 0.0456 0.0795 0.278 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 6.82e-01 0.0214 0.0521 0.278 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.96e-01 0.0788 0.0607 0.278 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 5.42e-01 0.0714 0.117 0.283 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 6.68e-01 0.0441 0.103 0.283 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0483 0.0531 0.283 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0519 0.111 0.283 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00547 0.117 0.283 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 5.73e-01 0.0596 0.106 0.283 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0678 0.0903 0.283 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 8.76e-01 0.0177 0.114 0.283 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 8.98e-01 0.0146 0.114 0.283 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 2.30e-01 0.119 0.0994 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0626 0.0689 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 1.78e-01 0.118 0.0875 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0757 0.0862 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 1.85e-02 -0.218 0.0919 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 4.93e-01 0.0544 0.0792 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 1.56e-01 0.138 0.0967 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 3.88e-01 0.0771 0.0892 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 3.27e-01 0.0949 0.0966 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00152 0.103 0.28 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0175 0.0773 0.28 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 1.76e-01 -0.13 0.096 0.28 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0324 0.0888 0.28 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 4.55e-02 -0.192 0.0954 0.28 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 4.34e-01 0.0596 0.0761 0.28 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00577 0.0972 0.28 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.60e-01 0.125 0.0889 0.28 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 4.53e-01 0.0824 0.109 0.28 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 8.31e-01 0.0205 0.096 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0596 0.0674 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 4.99e-01 0.0619 0.0914 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0976 0.0834 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 9.01e-01 0.00963 0.0774 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00742 0.0542 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 6.59e-01 0.0449 0.101 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 3.98e-01 0.0624 0.0737 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 9.39e-01 0.00747 0.0968 0.278 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 5.52e-02 0.181 0.0938 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0509 0.0646 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 7.68e-01 -0.023 0.0777 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 7.47e-01 0.0288 0.089 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0741 0.0848 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0415 0.0625 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0977 0.0988 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.00e-01 0.085 0.101 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 1.91e-01 -0.121 0.0924 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 2.52e-01 -0.112 0.097 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0155 0.0841 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0282 0.102 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0534 0.0982 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 8.21e-01 0.0216 0.0954 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0293 0.0869 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 6.67e-01 0.0377 0.0873 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 9.80e-01 0.00229 0.0901 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 3.66e-01 0.0855 0.0943 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0684 0.0587 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 1.58e-01 -0.11 0.0774 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0744 0.0733 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0167 0.0651 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 6.82e-01 -0.018 0.0438 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.60e-01 0.055 0.0744 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 2.20e-01 0.0923 0.075 0.278 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 1.70e-01 0.126 0.0916 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0563 0.0684 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 8.25e-01 -0.019 0.0859 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 1.78e-01 -0.099 0.0733 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00714 0.0698 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0733 0.0534 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 3.45e-01 0.0753 0.0796 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 7.89e-01 0.0231 0.0862 0.278 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 6.80e-01 0.043 0.104 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0321 0.0709 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0164 0.0825 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0765 0.0808 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 3.80e-01 0.0775 0.0881 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 6.97e-02 -0.114 0.0624 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 8.09e-01 0.02 0.0826 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 9.05e-01 0.0103 0.0864 0.278 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 1.47e-01 0.155 0.107 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 7.76e-02 -0.135 0.0761 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0656 0.0956 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 6.27e-01 0.038 0.0781 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0503 0.0836 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0893 0.0674 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 3.78e-01 0.0696 0.0787 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 9.68e-02 -0.157 0.0939 0.278 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 9.31e-01 0.00872 0.101 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 7.76e-02 -0.114 0.064 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0981 0.0772 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0162 0.0779 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 5.71e-01 0.0442 0.078 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0113 0.041 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.41e-01 0.122 0.0824 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 8.70e-01 0.0155 0.0948 0.278 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 1.96e-01 0.147 0.113 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0448 0.0798 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 1.77e-01 0.142 0.105 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 1.29e-01 -0.126 0.0826 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0608 0.0862 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 8.71e-04 -0.283 0.0836 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 9.58e-01 0.00471 0.0884 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0407 0.0933 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 4.31e-02 0.211 0.104 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 1.00e+00 -5.18e-05 0.0951 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0735 0.108 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 7.21e-01 -0.035 0.0979 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 5.84e-01 0.0559 0.102 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0909 0.0783 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.39e-01 0.126 0.0849 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 4.45e-01 0.0743 0.097 0.283 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0974 0.11 0.279 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0522 0.0765 0.279 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0285 0.101 0.279 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 4.20e-01 0.0677 0.0838 0.279 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0171 0.0904 0.279 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 4.27e-01 0.0528 0.0664 0.279 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 5.56e-01 0.0461 0.0782 0.279 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0923 0.103 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0488 0.0879 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0212 0.0941 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.97e-01 0.0793 0.0935 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00691 0.0873 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 9.99e-02 -0.132 0.0799 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.11e-01 0.137 0.0858 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 2.10e-01 0.119 0.0946 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0397 0.0842 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 4.92e-03 0.211 0.0741 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0519 0.0816 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 4.76e-01 0.0552 0.0773 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0458 0.0523 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 2.15e-01 0.0866 0.0696 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0795 0.109 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 9.43e-01 0.00668 0.0926 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 4.04e-01 0.0686 0.0821 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 8.86e-02 0.173 0.101 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0431 0.1 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0777 0.0823 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.51e-01 0.126 0.0876 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0975 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 1.60e-01 -0.118 0.0839 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 6.72e-01 0.0333 0.0785 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0434 0.0842 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 2.38e-01 -0.103 0.0867 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0273 0.056 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 6.53e-01 0.033 0.0731 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 2.02e-01 -0.162 0.127 0.281 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 8.39e-01 0.0231 0.113 0.281 PB L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 5.40e-01 0.0529 0.0862 0.281 PB L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0944 0.138 0.281 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 3.10e-02 -0.264 0.121 0.281 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 6.22e-01 0.0426 0.0862 0.281 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0164 0.126 0.281 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 2.13e-01 -0.118 0.0942 0.281 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 2.65e-01 -0.142 0.127 0.281 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0996 0.105 0.276 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0961 0.0833 0.276 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0188 0.0772 0.276 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0697 0.0824 0.276 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0345 0.0972 0.276 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0172 0.0627 0.276 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 7.65e-03 0.198 0.0734 0.276 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 4.49e-01 0.0755 0.0995 0.278 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 8.77e-02 -0.116 0.0676 0.278 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 1.77e-02 -0.253 0.106 0.278 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 7.82e-01 0.023 0.0828 0.278 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 4.78e-01 0.0609 0.0856 0.278 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 5.29e-01 -0.046 0.0729 0.278 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.89e-01 0.0564 0.0814 0.278 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -340078 sc-eQTL 4.29e-01 0.0737 0.093 0.278 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 5.20e-01 0.0651 0.101 0.276 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0548 0.0724 0.276 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0643 0.0961 0.276 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 1.91e-01 0.123 0.0937 0.276 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0882 0.108 0.276 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 1.34e-01 0.133 0.0881 0.276 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 6.81e-01 0.0387 0.094 0.276 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 5.66e-02 -0.197 0.103 0.276 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0369 0.0785 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0433 0.0563 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00487 0.0649 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 2.19e-01 0.116 0.0941 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 5.97e-01 0.0446 0.0843 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 6.69e-01 0.0304 0.0709 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.48e-01 0.107 0.0738 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 3.79e-01 -0.087 0.0987 0.278 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 9.63e-02 0.15 0.0898 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 9.63e-01 0.00289 0.0618 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0142 0.0764 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 9.92e-01 0.000954 0.0968 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 2.15e-01 -0.114 0.0913 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 9.65e-01 0.00345 0.0796 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 9.16e-03 0.204 0.0776 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 9.51e-01 0.00649 0.106 0.278 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 6.74e-01 0.0491 0.116 0.27 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 4.51e-01 0.0837 0.111 0.27 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00394 0.103 0.27 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.11 0.27 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0163 0.114 0.27 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 8.47e-01 0.0166 0.086 0.27 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 5.19e-01 0.064 0.0991 0.27 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 7.78e-01 0.0299 0.106 0.273 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 7.25e-01 0.0251 0.0712 0.273 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 5.24e-01 0.0556 0.087 0.273 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 2.06e-01 0.121 0.0957 0.273 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 2.14e-01 -0.123 0.0989 0.273 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 1.77e-01 0.122 0.0901 0.273 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.78e-02 0.173 0.0871 0.273 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0727 0.108 0.273 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 4.91e-01 0.0663 0.0961 0.271 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0851 0.0571 0.271 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 9.53e-01 0.00522 0.088 0.271 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 1.09e-01 0.148 0.0919 0.271 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0832 0.0694 0.271 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0835 0.271 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.41e-03 0.225 0.0694 0.271 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 9.78e-01 0.00289 0.103 0.271 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0893 0.11 0.285 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 3.61e-01 0.0784 0.0857 0.285 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0929 0.0932 0.285 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0454 0.0854 0.285 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 7.42e-01 0.0286 0.0866 0.285 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 9.14e-01 0.0102 0.0946 0.285 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.11e-02 0.226 0.11 0.285 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 1.48e-01 -0.124 0.0853 0.285 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 3.16e-01 0.0957 0.0953 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0259 0.0661 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0197 0.0871 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0761 0.0848 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 1.64e-03 -0.274 0.0861 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 1.45e-01 0.0889 0.0607 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 2.30e-01 0.121 0.101 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 4.75e-01 0.0613 0.0857 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 5.16e-01 0.0649 0.0996 0.278 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 1.89e-01 0.117 0.0889 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0574 0.0618 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 6.37e-01 0.043 0.0909 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0848 0.0833 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0469 0.0711 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0153 0.0499 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -392423 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0541 0.104 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 3.64e-01 0.069 0.0758 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -371787 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0826 0.0891 0.278 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 4.12e-01 0.0594 0.0722 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0494 0.0538 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0229 0.0649 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 4.24e-01 0.0758 0.0947 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 8.20e-01 0.0178 0.078 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 6.53e-01 0.0312 0.0694 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 5.28e-02 0.147 0.0753 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0695 0.102 0.278 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 4.12e-01 0.0801 0.0974 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0449 0.052 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 4.77e-01 0.0593 0.0832 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 207004 sc-eQTL 2.55e-02 0.206 0.0916 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0673 0.0575 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0835 0.0842 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 1.14e-02 0.183 0.0716 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 207027 sc-eQTL 8.29e-01 0.0222 0.102 0.278 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 126066 sc-eQTL 2.82e-01 0.0978 0.0906 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 496044 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0493 0.0788 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 792156 sc-eQTL 7.97e-02 0.116 0.066 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -235505 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0349 0.0775 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -88686 sc-eQTL 6.59e-01 0.0334 0.0757 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -129170 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0498 0.0488 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -475073 sc-eQTL 2.77e-01 0.0768 0.0704 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 207004 eQTL 0.0208 0.0611 0.0264 0.0 0.0 0.265
ENSG00000135597 REPS1 -88686 eQTL 8.29e-18 -0.154 0.0175 0.0 0.0 0.265

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -88686 6.54e-06 9.5e-06 1.33e-06 5.99e-06 2.32e-06 3.65e-06 1.04e-05 2.16e-06 9.63e-06 5.39e-06 1.05e-05 5.15e-06 1.38e-05 3.92e-06 3.26e-06 6.98e-06 3.7e-06 7.14e-06 2.89e-06 3.12e-06 6.18e-06 9.08e-06 7.55e-06 3.25e-06 1.5e-05 4.73e-06 6.66e-06 4.92e-06 1.1e-05 7.83e-06 4.81e-06 9.76e-07 1.29e-06 3.5e-06 4.54e-06 2.8e-06 1.78e-06 1.95e-06 2.08e-06 1.6e-06 1.7e-06 1.17e-05 1.09e-06 2.8e-07 8.64e-07 1.75e-06 1.79e-06 6.85e-07 9.39e-07