logo

Genes within 1Mb (chr6:138897977:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 6.32e-01 0.0415 0.0866 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0386 0.0661 0.235 B L1
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 3.71e-01 0.0591 0.0659 0.235 B L1
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.15e-01 -0.104 0.0839 0.235 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 1.49e-02 -0.18 0.0734 0.235 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 5.16e-02 -0.0848 0.0433 0.235 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0779 0.107 0.235 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 3.14e-01 0.0679 0.0673 0.235 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 9.36e-01 0.00605 0.0751 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 1.81e-01 0.128 0.0956 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.64e-01 0.00295 0.0644 0.235 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 8.44e-01 -0.012 0.0607 0.235 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0896 0.0798 0.235 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00492 0.0629 0.235 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 6.18e-02 -0.086 0.0458 0.235 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 6.46e-01 0.0363 0.0788 0.235 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 2.22e-01 0.0948 0.0774 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0498 0.0681 0.235 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00525 0.0695 0.235 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 8.72e-01 -0.012 0.0746 0.235 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0159 0.0701 0.235 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0522 0.0398 0.235 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 3.62e-01 0.0692 0.0757 0.235 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 8.34e-01 0.0194 0.0921 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 8.36e-01 0.0221 0.107 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0448 0.0748 0.232 DC L1
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00416 0.0878 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 2.61e-01 0.11 0.0974 0.232 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 4.94e-01 0.0591 0.0863 0.232 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.69e-01 0.0935 0.0843 0.232 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000139 0.1 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 7.05e-01 0.0291 0.0767 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0194 0.053 0.235 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0778 0.0698 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 3.83e-01 0.0875 0.1 0.235 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0296 0.0586 0.235 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0863 0.0761 0.235 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 4.58e-03 0.227 0.0792 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 6.72e-02 -0.19 0.103 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 1.14e-01 0.147 0.0926 0.236 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.96e-01 0.000384 0.0821 0.236 NK L1
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 5.80e-02 0.132 0.0691 0.236 NK L1
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 8.02e-01 0.0202 0.0805 0.236 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 7.91e-01 0.0203 0.0767 0.236 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0545 0.0558 0.236 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.39e-01 0.11 0.074 0.236 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00702 0.11 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0833 0.0711 0.235 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 4.77e-01 0.0627 0.0879 0.235 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0567 0.0799 0.235 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0483 0.0859 0.235 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0258 0.0563 0.235 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.89e-01 0.0866 0.0656 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 7.34e-01 0.0425 0.125 0.242 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 2.88e-01 0.116 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 2.46e-01 -0.066 0.0567 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0961 0.119 0.242 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0615 0.125 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 3.44e-01 0.107 0.113 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0652 0.0966 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0359 0.122 0.242 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0926 0.121 0.242 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.79e-01 0.116 0.107 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0328 0.074 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 1.05e-01 0.152 0.0937 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0868 0.0925 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.15e-02 -0.214 0.0988 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 7.91e-01 0.0225 0.0851 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 7.65e-02 0.184 0.103 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 7.37e-01 0.0323 0.0959 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 5.93e-01 0.0555 0.104 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 3.62e-01 0.101 0.111 0.237 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0033 0.0834 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 2.98e-01 -0.108 0.104 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0323 0.0958 0.237 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 8.94e-02 -0.176 0.103 0.237 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 5.84e-01 -0.045 0.0821 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0503 0.105 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.25e-01 0.148 0.0958 0.237 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 5.14e-01 0.0772 0.118 0.237 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0254 0.103 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.46e-01 0.0049 0.0724 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 4.08e-01 0.0812 0.098 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 5.90e-02 -0.169 0.0891 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 8.66e-01 0.014 0.0831 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0271 0.0581 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0351 0.109 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 2.26e-01 0.0958 0.0789 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0593 0.104 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 1.08e-01 0.163 0.101 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00745 0.0696 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0881 0.0835 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0222 0.0958 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0402 0.0914 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0634 0.0672 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 2.03e-01 -0.136 0.106 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 4.63e-01 0.0799 0.109 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 1.16e-01 -0.157 0.0993 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000962 0.106 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 4.88e-01 0.0636 0.0915 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0167 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 9.64e-01 0.00472 0.104 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 9.49e-01 0.0061 0.0947 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 7.51e-01 0.0302 0.0951 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 7.79e-01 0.0276 0.0981 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 1.68e-01 0.14 0.101 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.02e-01 0.00781 0.0634 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0832 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0882 0.0787 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 8.83e-01 0.0103 0.0701 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0703 0.0469 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 6.37e-01 0.0379 0.0801 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 2.23e-01 0.0987 0.0807 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.38e-01 0.117 0.0986 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0141 0.0736 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 7.38e-01 -0.031 0.0923 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0844 0.0789 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0682 0.0749 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.25e-01 -0.07 0.0575 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 4.35e-01 0.067 0.0857 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 4.65e-01 0.0678 0.0926 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0163 0.112 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 7.66e-01 0.0227 0.0761 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 8.22e-01 -0.02 0.0885 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.18e-01 -0.107 0.0866 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 2.46e-01 0.11 0.0944 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 1.82e-02 -0.159 0.0666 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 8.04e-01 0.0221 0.0886 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000968 0.0927 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.97e-01 0.12 0.115 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 7.34e-01 -0.028 0.0824 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0685 0.103 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 5.20e-01 0.0541 0.0839 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0915 0.0897 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 1.58e-01 -0.103 0.0724 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 2.83e-01 0.091 0.0845 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 2.54e-01 -0.116 0.101 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0022 0.109 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0635 0.0694 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0907 0.0834 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0443 0.0839 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 5.48e-01 0.0506 0.0841 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0385 0.0441 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.94e-01 0.116 0.0889 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00968 0.102 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.57e-01 0.139 0.122 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 8.79e-01 0.0132 0.0863 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 1.12e-01 0.181 0.113 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 3.85e-01 -0.078 0.0896 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.093 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 1.59e-03 -0.29 0.0907 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00863 0.0956 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0369 0.101 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.56e-01 0.128 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 3.80e-01 0.0898 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00306 0.116 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 4.34e-01 0.0824 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 8.25e-01 0.0242 0.109 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.084 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.23e-01 0.141 0.0911 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 9.75e-01 0.00324 0.104 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0756 0.119 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0139 0.0825 0.236 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 5.15e-01 0.0712 0.109 0.236 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 7.11e-01 0.0336 0.0904 0.236 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0642 0.0973 0.236 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 5.44e-01 0.0435 0.0716 0.236 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 7.84e-01 0.0232 0.0843 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 7.95e-01 0.0289 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000198 0.0945 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 8.62e-01 0.0177 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 7.49e-01 0.0323 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0293 0.0938 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 1.49e-02 -0.209 0.0852 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.92e-01 0.121 0.0924 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.44e-01 0.118 0.101 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.34e-01 0.00747 0.0898 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 8.42e-03 0.211 0.0792 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 8.18e-01 -0.02 0.087 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 6.66e-01 0.0357 0.0825 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0447 0.0558 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 9.38e-02 0.125 0.074 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0756 0.116 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 4.51e-01 0.0745 0.0987 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 3.10e-01 0.0893 0.0877 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 3.67e-02 0.226 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0113 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.48e-01 -0.102 0.0878 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 6.10e-02 0.176 0.0933 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 3.18e-02 0.223 0.103 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0622 0.09 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 5.68e-01 0.048 0.0839 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0299 0.09 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0487 0.0929 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0692 0.0597 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 5.46e-01 0.0472 0.0781 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 1.02e-01 -0.224 0.136 0.244 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 2.47e-01 0.141 0.121 0.244 PB L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 1.35e-01 0.139 0.0921 0.244 PB L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 4.30e-01 -0.118 0.149 0.244 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.21e-02 -0.282 0.13 0.244 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 6.93e-01 0.0368 0.0929 0.244 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 4.41e-01 0.105 0.135 0.244 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.94e-01 -0.133 0.101 0.244 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 3.23e-01 -0.135 0.137 0.244 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0965 0.114 0.233 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0864 0.0911 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 9.57e-01 0.00452 0.0844 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 1.81e-01 -0.12 0.0898 0.233 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.34e-01 -0.103 0.106 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 3.73e-01 -0.061 0.0684 0.233 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 2.72e-02 0.179 0.0807 0.233 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 5.53e-01 0.0637 0.107 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0216 0.0732 0.235 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 2.37e-01 -0.136 0.115 0.235 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 7.88e-01 0.0239 0.089 0.235 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 6.93e-01 0.0364 0.0921 0.235 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0824 0.0783 0.235 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 4.55e-01 0.0655 0.0875 0.235 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -341676 sc-eQTL 1.25e-01 0.154 0.0996 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 6.60e-01 0.0481 0.109 0.232 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0887 0.0782 0.232 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0511 0.104 0.232 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 6.13e-02 0.19 0.101 0.232 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.117 0.232 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.26e-01 0.116 0.0956 0.232 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0282 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 1.76e-01 -0.152 0.112 0.232 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0905 0.0843 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0432 0.0607 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0775 0.0696 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 3.95e-01 0.0866 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 6.45e-01 0.0419 0.0908 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0173 0.0764 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 2.00e-01 0.102 0.0796 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 2.06e-01 -0.135 0.106 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0973 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 5.72e-01 0.0377 0.0667 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0854 0.0823 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0571 0.104 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 9.15e-02 -0.167 0.0982 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0492 0.0859 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 8.99e-03 0.221 0.0838 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 3.34e-01 -0.111 0.114 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 2.54e-01 0.144 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 5.17e-01 0.0781 0.12 0.23 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 8.69e-01 0.0185 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.32e-01 -0.143 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 9.81e-01 0.00301 0.124 0.23 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00952 0.0934 0.23 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 3.61e-01 0.0983 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 7.08e-01 0.0431 0.115 0.229 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 2.74e-01 0.0845 0.077 0.229 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 5.22e-01 0.0605 0.0944 0.229 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 4.37e-01 0.081 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.87e-01 -0.093 0.107 0.229 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 7.33e-01 0.0335 0.0981 0.229 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 6.31e-02 0.177 0.0945 0.229 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0684 0.117 0.229 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 3.38e-01 0.101 0.105 0.229 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 1.02e-01 -0.102 0.0623 0.229 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 7.79e-01 0.027 0.0961 0.229 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 2.60e-01 0.114 0.101 0.229 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 1.57e-01 -0.108 0.0758 0.229 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 6.05e-03 -0.25 0.09 0.229 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 4.18e-03 0.221 0.0763 0.229 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0594 0.112 0.229 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0357 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 6.71e-01 0.0398 0.0934 0.243 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0794 0.102 0.243 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0609 0.0929 0.243 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 8.72e-01 0.0152 0.0942 0.243 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 6.71e-01 0.0439 0.103 0.243 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.38e-01 0.179 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0963 0.0932 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 1.59e-01 0.145 0.102 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00103 0.0712 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 9.09e-01 0.0107 0.0938 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 2.50e-01 -0.105 0.0912 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 3.64e-03 -0.273 0.0929 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 5.76e-01 0.0368 0.0656 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 4.15e-01 0.0887 0.109 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 8.31e-01 0.0198 0.0923 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 8.58e-01 0.0192 0.107 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 4.22e-01 0.077 0.0956 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.98e-01 0.000198 0.0664 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 7.97e-01 0.0251 0.0975 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 6.80e-02 -0.163 0.0888 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0558 0.0763 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0422 0.0535 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -394021 sc-eQTL 2.16e-01 -0.139 0.112 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 2.45e-01 0.0947 0.0812 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -373385 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0952 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00139 0.0779 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0326 0.058 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0695 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 7.59e-01 0.0314 0.102 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000666 0.084 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0204 0.0747 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 8.93e-02 0.139 0.0813 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 1.28e-01 -0.167 0.109 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 4.71e-01 0.0766 0.106 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0373 0.0566 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 3.42e-01 0.0861 0.0904 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 205406 sc-eQTL 2.86e-01 0.108 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0518 0.0627 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 5.32e-02 -0.177 0.091 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 2.18e-02 0.181 0.0781 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 205429 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0223 0.111 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 sc-eQTL 1.24e-01 0.149 0.0966 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 494446 sc-eQTL 9.47e-01 0.00556 0.0843 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 790558 sc-eQTL 4.29e-02 0.143 0.0704 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -237103 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00414 0.0829 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -90284 sc-eQTL 4.31e-01 0.0638 0.0809 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -130768 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0652 0.0521 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -476671 sc-eQTL 1.28e-01 0.115 0.0751 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 124468 eQTL 0.0237 0.0406 0.0179 0.0 0.0 0.235
ENSG00000135597 REPS1 -90284 eQTL 1.15e-19 -0.169 0.0182 0.0 0.0 0.235

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -90284 4.67e-05 4.36e-05 1.15e-05 2.13e-05 1.11e-05 2.28e-05 5.71e-05 1.51e-05 6.04e-05 3.28e-05 7.27e-05 3.05e-05 8.11e-05 1.8e-05 1.25e-05 3.97e-05 2.77e-05 4.44e-05 1.81e-05 1.48e-05 3.05e-05 6.25e-05 4.38e-05 1.35e-05 6.61e-05 2.14e-05 3.48e-05 2.77e-05 5.49e-05 2.5e-05 3.63e-05 4.51e-06 7.14e-06 1.26e-05 1.76e-05 9.21e-06 6.03e-06 6.9e-06 8.64e-06 5.87e-06 2.57e-06 4.41e-05 5.45e-06 1.87e-06 6.57e-06 9.15e-06 9.21e-06 5.03e-06 4.74e-06