logo

Genes within 1Mb (chr6:138895289:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 6.90e-01 0.0362 0.0906 0.19 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0351 0.0692 0.19 B L1
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 9.38e-01 0.0054 0.0691 0.19 B L1
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 5.23e-02 -0.171 0.0874 0.19 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 2.15e-02 -0.178 0.077 0.19 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.39e-02 -0.103 0.0452 0.19 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.112 0.19 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 5.69e-01 0.0402 0.0706 0.19 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0403 0.0785 0.19 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 6.57e-01 0.0446 0.1 0.19 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00292 0.0674 0.19 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 8.41e-01 0.0128 0.0635 0.19 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.56e-01 -0.119 0.0833 0.19 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 3.05e-01 0.0675 0.0656 0.19 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 7.06e-02 -0.087 0.0479 0.19 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 7.10e-01 0.0307 0.0824 0.19 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00115 0.0812 0.19 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.19 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0395 0.0716 0.19 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00691 0.073 0.19 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0754 0.0782 0.19 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 3.26e-01 0.0723 0.0735 0.19 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0578 0.0418 0.19 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 3.68e-01 0.0717 0.0795 0.19 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0476 0.0967 0.19 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 7.01e-01 -0.043 0.112 0.187 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0735 0.0784 0.187 DC L1
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0798 0.0918 0.187 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 9.34e-01 0.00851 0.102 0.187 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 4.19e-01 0.0733 0.0904 0.187 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.0883 0.187 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0242 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 6.22e-02 -0.199 0.106 0.187 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 8.91e-01 0.011 0.0805 0.19 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0438 0.0556 0.19 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.28e-01 -0.112 0.073 0.19 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.105 0.19 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0487 0.0615 0.19 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 9.58e-01 0.00426 0.0802 0.19 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 4.43e-02 0.17 0.084 0.19 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 2.01e-01 -0.14 0.109 0.19 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 7.02e-02 0.178 0.0977 0.191 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0172 0.0868 0.191 NK L1
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 8.06e-02 0.128 0.0731 0.191 NK L1
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 4.88e-01 -0.059 0.085 0.191 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 5.13e-01 -0.053 0.081 0.191 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0176 0.0591 0.191 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.05e-01 0.0996 0.0784 0.191 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0508 0.116 0.19 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0646 0.0751 0.19 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 5.05e-01 0.062 0.0928 0.19 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0626 0.0843 0.19 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 5.67e-01 -0.052 0.0907 0.19 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0257 0.0594 0.19 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.34e-01 0.0828 0.0693 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 7.38e-01 0.044 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 8.00e-02 -0.104 0.0593 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 8.70e-02 -0.214 0.124 0.194 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00123 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 9.54e-01 0.00684 0.119 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 3.70e-01 -0.114 0.128 0.194 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 3.71e-01 -0.114 0.127 0.194 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 1.75e-01 0.152 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0596 0.0777 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 6.72e-01 0.042 0.099 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.87e-01 -0.128 0.0969 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 9.17e-03 -0.271 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 7.88e-01 0.024 0.0893 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 4.87e-01 0.0759 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.115 0.192 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 4.39e-01 0.0672 0.0867 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 5.24e-01 -0.069 0.108 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0663 0.0997 0.192 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 5.81e-02 -0.204 0.107 0.192 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0888 0.0853 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0936 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 3.90e-01 0.0863 0.1 0.192 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 7.30e-01 0.0426 0.123 0.192 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 6.64e-01 -0.047 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00203 0.0761 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0302 0.103 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 2.15e-02 -0.216 0.0932 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 6.57e-01 0.0388 0.0873 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0468 0.061 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0055 0.114 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 4.53e-01 0.0625 0.0831 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0855 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 3.00e-01 0.11 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0468 0.0728 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0415 0.0875 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0775 0.1 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00717 0.0957 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0819 0.0702 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0807 0.111 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 9.77e-01 0.00332 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00384 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.0968 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 1.84e-01 0.157 0.118 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0699 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 9.63e-01 0.00515 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00879 0.1 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 4.14e-01 0.0825 0.101 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 8.49e-01 0.0199 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 7.73e-01 0.0308 0.106 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 9.52e-01 0.00396 0.0664 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0847 0.0874 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.96e-01 -0.107 0.0824 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 3.06e-01 0.0751 0.0732 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0632 0.0492 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 5.56e-01 0.0494 0.0838 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0222 0.0848 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 2.79e-01 0.111 0.103 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0267 0.0765 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0957 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.99e-01 -0.106 0.0819 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0461 0.0779 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0691 0.0598 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 5.27e-01 0.0564 0.0891 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 7.56e-01 0.03 0.0963 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0709 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 7.41e-01 0.0264 0.0796 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00517 0.0925 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 9.28e-02 -0.152 0.0903 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0987 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0703 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0061 0.0927 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 5.96e-01 0.0515 0.0969 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 2.11e-01 0.151 0.12 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0204 0.0862 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0755 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0466 0.0878 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0796 0.094 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0718 0.076 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 5.44e-01 0.0539 0.0886 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0371 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0545 0.073 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0982 0.0876 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0753 0.0881 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 1.62e-01 0.124 0.088 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0388 0.0463 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0935 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 3.29e-01 -0.105 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 3.22e-01 0.128 0.129 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 6.47e-01 0.0415 0.0906 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 2.77e-01 0.13 0.119 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0864 0.0942 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 9.10e-01 -0.011 0.0981 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 4.30e-03 -0.277 0.0957 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 6.19e-01 -0.05 0.1 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0554 0.106 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 1.06e-01 0.191 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 3.25e-01 0.106 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0503 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 8.25e-01 0.0246 0.111 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 6.37e-01 0.0547 0.116 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.23e-02 -0.203 0.088 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 6.78e-01 0.0403 0.0968 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 3.35e-01 -0.106 0.11 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 2.16e-01 -0.154 0.124 0.19 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 9.44e-01 0.00602 0.0861 0.19 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 2.07e-01 0.144 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 7.14e-01 0.0346 0.0943 0.19 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0712 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 5.37e-01 0.0462 0.0746 0.19 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0256 0.0879 0.19 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0244 0.118 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 8.30e-01 0.0216 0.101 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 7.64e-01 0.0324 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0396 0.107 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0617 0.0999 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 3.23e-03 -0.269 0.0902 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0986 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 1.77e-01 0.144 0.107 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0316 0.095 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 2.63e-02 0.188 0.0842 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 8.21e-02 -0.16 0.0914 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 9.21e-01 0.00864 0.0873 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0203 0.0591 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 1.16e-01 0.124 0.0784 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 9.04e-01 0.0147 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 6.19e-01 0.0517 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0919 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.99e-01 0.146 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0547 0.113 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0556 0.0925 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 1.99e-01 0.127 0.0985 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 4.83e-02 0.219 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0752 0.0957 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 3.64e-01 0.0811 0.0891 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0956 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 6.86e-01 -0.04 0.0989 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0165 0.0637 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 5.72e-01 0.047 0.0831 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0717 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0342 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0951 0.196 PB L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0124 0.154 0.196 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 2.38e-01 -0.161 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 4.25e-01 0.0764 0.0954 0.196 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 3.83e-01 0.122 0.139 0.196 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 1.72e-01 -0.143 0.104 0.196 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0986 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 2.36e-01 -0.142 0.12 0.189 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 2.60e-01 -0.108 0.0956 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0759 0.0885 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 4.16e-01 -0.077 0.0946 0.189 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 6.97e-01 0.0281 0.072 0.189 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 1.46e-01 0.125 0.0853 0.189 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 9.46e-01 0.0076 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0181 0.0766 0.19 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0501 0.12 0.19 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 7.45e-01 0.0303 0.0931 0.19 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 4.70e-01 0.0696 0.0963 0.19 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 8.74e-01 0.013 0.0821 0.19 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 4.30e-01 0.0723 0.0915 0.19 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344364 sc-eQTL 2.22e-01 0.128 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0283 0.113 0.19 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 1.27e-01 -0.124 0.0806 0.19 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0972 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 5.84e-01 0.0577 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0395 0.121 0.19 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 1.62e-01 0.139 0.0987 0.19 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 7.88e-01 0.0283 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 8.78e-02 -0.198 0.115 0.19 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0687 0.0876 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0494 0.0629 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0947 0.0722 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 7.54e-02 0.187 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 7.67e-02 0.167 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 5.04e-01 0.0531 0.0792 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.94e-01 0.087 0.0827 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0904 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 4.59e-01 0.0756 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 9.29e-01 0.00621 0.0698 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0859 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0434 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 9.78e-03 -0.265 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 6.13e-01 0.0456 0.0899 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 1.14e-01 0.14 0.0885 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0785 0.12 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 1.07e-01 0.219 0.135 0.182 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 1.35e-01 0.193 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 8.29e-01 0.0261 0.12 0.182 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0414 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 8.67e-01 0.0224 0.134 0.182 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0408 0.1 0.182 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 6.42e-01 0.0539 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 6.83e-01 0.0487 0.119 0.189 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 3.07e-01 0.082 0.0799 0.189 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 1.92e-01 0.128 0.0976 0.189 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 5.19e-01 0.0697 0.108 0.189 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 4.29e-01 0.0805 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 1.23e-01 0.152 0.0983 0.189 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0559 0.121 0.189 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 4.75e-01 0.0785 0.11 0.186 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0772 0.0652 0.186 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.1 0.186 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 9.80e-01 0.00261 0.105 0.186 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0938 0.0792 0.186 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 6.59e-02 -0.175 0.0949 0.186 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.44e-02 0.182 0.0802 0.186 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 3.91e-01 -0.1 0.117 0.186 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00674 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 8.11e-01 0.0229 0.0957 0.201 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0678 0.104 0.201 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0694 0.0951 0.201 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 8.37e-01 0.0199 0.0965 0.201 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 1.35e-01 0.157 0.105 0.201 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 1.00e-01 0.203 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 1.78e-01 -0.129 0.0952 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 2.85e-01 0.115 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 7.60e-01 0.0228 0.0748 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0324 0.0985 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 5.06e-02 -0.187 0.0952 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 8.01e-04 -0.33 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0348 0.069 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 9.79e-01 0.00298 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00565 0.113 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 4.67e-01 0.0734 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00875 0.0699 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0472 0.103 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 2.22e-02 -0.215 0.0931 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0194 0.0803 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0595 0.0562 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -396709 sc-eQTL 3.60e-01 -0.108 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 5.44e-01 0.052 0.0856 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -376073 sc-eQTL 6.29e-02 -0.187 0.0999 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0196 0.0815 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0513 0.0606 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 8.02e-02 -0.128 0.0726 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 2.59e-01 0.121 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 8.96e-01 0.0115 0.0879 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 4.32e-01 0.0615 0.0781 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.05e-01 0.108 0.0853 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0934 0.114 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 6.37e-01 0.0525 0.111 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0319 0.0592 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 6.26e-01 0.0462 0.0947 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 202718 sc-eQTL 5.64e-01 0.0608 0.105 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0569 0.0655 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0957 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 5.16e-02 0.16 0.082 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 202741 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0408 0.116 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 sc-eQTL 4.84e-02 0.203 0.102 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491758 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0282 0.0896 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787870 sc-eQTL 3.08e-02 0.163 0.0748 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -239791 sc-eQTL 2.19e-01 -0.108 0.0878 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -92972 sc-eQTL 8.67e-01 0.0145 0.0861 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133456 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0361 0.0555 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479359 sc-eQTL 2.47e-01 0.093 0.0801 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 121780 eQTL 0.0494 0.0381 0.0194 0.0 0.0 0.185
ENSG00000112378 PERP 787870 eQTL 0.0394 -0.0671 0.0325 0.00104 0.0 0.185
ENSG00000135597 REPS1 -92972 eQTL 1.94e-24 -0.204 0.0194 0.0443 0.0482 0.185
ENSG00000146386 ABRACL -133456 eQTL 0.0157 0.0681 0.0281 0.0 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -92972 7.05e-06 9.5e-06 1.25e-06 4.51e-06 2.38e-06 3.41e-06 9.57e-06 2.12e-06 8.41e-06 4.89e-06 1.04e-05 4.99e-06 1.22e-05 3.89e-06 2.62e-06 6.36e-06 3.8e-06 6.49e-06 2.66e-06 2.73e-06 5.1e-06 8.24e-06 6.94e-06 3.27e-06 1.29e-05 4.41e-06 5.26e-06 4.05e-06 9.36e-06 7.78e-06 4.46e-06 1.06e-06 1.17e-06 3.35e-06 3.99e-06 2.69e-06 1.85e-06 2e-06 2.13e-06 1.18e-06 1.55e-06 9.84e-06 1.29e-06 2.66e-07 7.68e-07 1.74e-06 1.5e-06 6.92e-07 6.07e-07
ENSG00000146386 ABRACL -133456 4.78e-06 5.26e-06 7.05e-07 3.5e-06 2.03e-06 1.56e-06 7e-06 1.43e-06 4.62e-06 3.1e-06 6.86e-06 3.03e-06 8.85e-06 1.79e-06 1.21e-06 4.71e-06 2.01e-06 3.74e-06 1.75e-06 2.07e-06 3.16e-06 6.37e-06 4.74e-06 1.93e-06 9.13e-06 2.43e-06 3.63e-06 2.3e-06 6.07e-06 4.98e-06 2.58e-06 5.86e-07 8.15e-07 2.53e-06 2.1e-06 1.73e-06 1.39e-06 5.24e-07 1.41e-06 1.03e-06 9.49e-07 6.85e-06 5.62e-07 1.44e-07 7.18e-07 8.66e-07 1.07e-06 6.12e-07 4.02e-07