logo

Genes within 1Mb (chr6:138894850:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 6.32e-01 0.0415 0.0866 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0386 0.0661 0.235 B L1
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 3.71e-01 0.0591 0.0659 0.235 B L1
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.15e-01 -0.104 0.0839 0.235 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 1.49e-02 -0.18 0.0734 0.235 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 5.16e-02 -0.0848 0.0433 0.235 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0779 0.107 0.235 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 3.14e-01 0.0679 0.0673 0.235 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 9.36e-01 0.00605 0.0751 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 1.81e-01 0.128 0.0956 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.64e-01 0.00295 0.0644 0.235 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 8.44e-01 -0.012 0.0607 0.235 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0896 0.0798 0.235 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00492 0.0629 0.235 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 6.18e-02 -0.086 0.0458 0.235 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 6.46e-01 0.0363 0.0788 0.235 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 2.22e-01 0.0948 0.0774 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0498 0.0681 0.235 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00525 0.0695 0.235 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 8.72e-01 -0.012 0.0746 0.235 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0159 0.0701 0.235 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0522 0.0398 0.235 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 3.62e-01 0.0692 0.0757 0.235 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 8.34e-01 0.0194 0.0921 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 8.36e-01 0.0221 0.107 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0448 0.0748 0.232 DC L1
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00416 0.0878 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 2.61e-01 0.11 0.0974 0.232 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 4.94e-01 0.0591 0.0863 0.232 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.69e-01 0.0935 0.0843 0.232 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000139 0.1 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 7.05e-01 0.0291 0.0767 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0194 0.053 0.235 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0778 0.0698 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 3.83e-01 0.0875 0.1 0.235 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0296 0.0586 0.235 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0863 0.0761 0.235 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 4.58e-03 0.227 0.0792 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 6.72e-02 -0.19 0.103 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 1.14e-01 0.147 0.0926 0.236 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.96e-01 0.000384 0.0821 0.236 NK L1
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 5.80e-02 0.132 0.0691 0.236 NK L1
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 8.02e-01 0.0202 0.0805 0.236 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 7.91e-01 0.0203 0.0767 0.236 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0545 0.0558 0.236 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.39e-01 0.11 0.074 0.236 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00702 0.11 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0833 0.0711 0.235 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 4.77e-01 0.0627 0.0879 0.235 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0567 0.0799 0.235 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0483 0.0859 0.235 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0258 0.0563 0.235 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.89e-01 0.0866 0.0656 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 7.34e-01 0.0425 0.125 0.242 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 2.88e-01 0.116 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 2.46e-01 -0.066 0.0567 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0961 0.119 0.242 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0615 0.125 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 3.44e-01 0.107 0.113 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0652 0.0966 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0359 0.122 0.242 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0926 0.121 0.242 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.79e-01 0.116 0.107 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0328 0.074 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 1.05e-01 0.152 0.0937 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0868 0.0925 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.15e-02 -0.214 0.0988 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 7.91e-01 0.0225 0.0851 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 7.65e-02 0.184 0.103 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 7.37e-01 0.0323 0.0959 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 5.93e-01 0.0555 0.104 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 3.62e-01 0.101 0.111 0.237 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0033 0.0834 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 2.98e-01 -0.108 0.104 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0323 0.0958 0.237 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 8.94e-02 -0.176 0.103 0.237 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 5.84e-01 -0.045 0.0821 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0503 0.105 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.25e-01 0.148 0.0958 0.237 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 5.14e-01 0.0772 0.118 0.237 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0254 0.103 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.46e-01 0.0049 0.0724 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 4.08e-01 0.0812 0.098 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 5.90e-02 -0.169 0.0891 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 8.66e-01 0.014 0.0831 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0271 0.0581 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0351 0.109 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 2.26e-01 0.0958 0.0789 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0593 0.104 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 1.08e-01 0.163 0.101 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00745 0.0696 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0881 0.0835 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0222 0.0958 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0402 0.0914 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0634 0.0672 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 2.03e-01 -0.136 0.106 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 4.63e-01 0.0799 0.109 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 1.16e-01 -0.157 0.0993 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000962 0.106 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 4.88e-01 0.0636 0.0915 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0167 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 9.64e-01 0.00472 0.104 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 9.49e-01 0.0061 0.0947 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 7.51e-01 0.0302 0.0951 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 7.79e-01 0.0276 0.0981 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 1.68e-01 0.14 0.101 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.02e-01 0.00781 0.0634 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0832 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0882 0.0787 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 8.83e-01 0.0103 0.0701 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0703 0.0469 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 6.37e-01 0.0379 0.0801 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 2.23e-01 0.0987 0.0807 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.38e-01 0.117 0.0986 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0141 0.0736 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 7.38e-01 -0.031 0.0923 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0844 0.0789 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0682 0.0749 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.25e-01 -0.07 0.0575 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 4.35e-01 0.067 0.0857 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 4.65e-01 0.0678 0.0926 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0163 0.112 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 7.66e-01 0.0227 0.0761 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 8.22e-01 -0.02 0.0885 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.18e-01 -0.107 0.0866 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 2.46e-01 0.11 0.0944 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 1.82e-02 -0.159 0.0666 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 8.04e-01 0.0221 0.0886 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000968 0.0927 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.97e-01 0.12 0.115 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 7.34e-01 -0.028 0.0824 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0685 0.103 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 5.20e-01 0.0541 0.0839 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0915 0.0897 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 1.58e-01 -0.103 0.0724 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 2.83e-01 0.091 0.0845 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 2.54e-01 -0.116 0.101 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0022 0.109 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0635 0.0694 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0907 0.0834 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0443 0.0839 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 5.48e-01 0.0506 0.0841 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0385 0.0441 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.94e-01 0.116 0.0889 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00968 0.102 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.57e-01 0.139 0.122 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 8.79e-01 0.0132 0.0863 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 1.12e-01 0.181 0.113 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 3.85e-01 -0.078 0.0896 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.093 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 1.59e-03 -0.29 0.0907 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00863 0.0956 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0369 0.101 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.56e-01 0.128 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 3.80e-01 0.0898 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00306 0.116 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 4.34e-01 0.0824 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 8.25e-01 0.0242 0.109 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.084 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.23e-01 0.141 0.0911 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 9.75e-01 0.00324 0.104 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0756 0.119 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0139 0.0825 0.236 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 5.15e-01 0.0712 0.109 0.236 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 7.11e-01 0.0336 0.0904 0.236 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0642 0.0973 0.236 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 5.44e-01 0.0435 0.0716 0.236 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 7.84e-01 0.0232 0.0843 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 7.95e-01 0.0289 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000198 0.0945 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 8.62e-01 0.0177 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 7.49e-01 0.0323 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0293 0.0938 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 1.49e-02 -0.209 0.0852 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.92e-01 0.121 0.0924 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.44e-01 0.118 0.101 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.34e-01 0.00747 0.0898 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 8.42e-03 0.211 0.0792 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 8.18e-01 -0.02 0.087 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 6.66e-01 0.0357 0.0825 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0447 0.0558 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 9.38e-02 0.125 0.074 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0756 0.116 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 4.51e-01 0.0745 0.0987 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 3.10e-01 0.0893 0.0877 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 3.67e-02 0.226 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0113 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.48e-01 -0.102 0.0878 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 6.10e-02 0.176 0.0933 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 3.18e-02 0.223 0.103 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0622 0.09 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 5.68e-01 0.048 0.0839 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0299 0.09 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0487 0.0929 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0692 0.0597 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 5.46e-01 0.0472 0.0781 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 1.02e-01 -0.224 0.136 0.244 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 2.47e-01 0.141 0.121 0.244 PB L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 1.35e-01 0.139 0.0921 0.244 PB L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 4.30e-01 -0.118 0.149 0.244 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.21e-02 -0.282 0.13 0.244 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 6.93e-01 0.0368 0.0929 0.244 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 4.41e-01 0.105 0.135 0.244 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.94e-01 -0.133 0.101 0.244 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 3.23e-01 -0.135 0.137 0.244 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0965 0.114 0.233 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0864 0.0911 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 9.57e-01 0.00452 0.0844 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 1.81e-01 -0.12 0.0898 0.233 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.34e-01 -0.103 0.106 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 3.73e-01 -0.061 0.0684 0.233 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 2.72e-02 0.179 0.0807 0.233 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 5.53e-01 0.0637 0.107 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0216 0.0732 0.235 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 2.37e-01 -0.136 0.115 0.235 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 7.88e-01 0.0239 0.089 0.235 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 6.93e-01 0.0364 0.0921 0.235 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0824 0.0783 0.235 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 4.55e-01 0.0655 0.0875 0.235 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -344803 sc-eQTL 1.25e-01 0.154 0.0996 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 6.60e-01 0.0481 0.109 0.232 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0887 0.0782 0.232 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0511 0.104 0.232 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 6.13e-02 0.19 0.101 0.232 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.117 0.232 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.26e-01 0.116 0.0956 0.232 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0282 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 1.76e-01 -0.152 0.112 0.232 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0905 0.0843 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0432 0.0607 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0775 0.0696 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 3.95e-01 0.0866 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 6.45e-01 0.0419 0.0908 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0173 0.0764 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 2.00e-01 0.102 0.0796 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 2.06e-01 -0.135 0.106 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0973 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 5.72e-01 0.0377 0.0667 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0854 0.0823 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0571 0.104 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 9.15e-02 -0.167 0.0982 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0492 0.0859 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 8.99e-03 0.221 0.0838 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 3.34e-01 -0.111 0.114 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 2.54e-01 0.144 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 5.17e-01 0.0781 0.12 0.23 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 8.69e-01 0.0185 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.32e-01 -0.143 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 9.81e-01 0.00301 0.124 0.23 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00952 0.0934 0.23 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 3.61e-01 0.0983 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 7.08e-01 0.0431 0.115 0.229 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 2.74e-01 0.0845 0.077 0.229 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 5.22e-01 0.0605 0.0944 0.229 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 4.37e-01 0.081 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.87e-01 -0.093 0.107 0.229 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 7.33e-01 0.0335 0.0981 0.229 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 6.31e-02 0.177 0.0945 0.229 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0684 0.117 0.229 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 3.38e-01 0.101 0.105 0.229 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 1.02e-01 -0.102 0.0623 0.229 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 7.79e-01 0.027 0.0961 0.229 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 2.60e-01 0.114 0.101 0.229 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 1.57e-01 -0.108 0.0758 0.229 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 6.05e-03 -0.25 0.09 0.229 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 4.18e-03 0.221 0.0763 0.229 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0594 0.112 0.229 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0357 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 6.71e-01 0.0398 0.0934 0.243 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0794 0.102 0.243 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0609 0.0929 0.243 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 8.72e-01 0.0152 0.0942 0.243 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 6.71e-01 0.0439 0.103 0.243 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.38e-01 0.179 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0963 0.0932 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 1.59e-01 0.145 0.102 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00103 0.0712 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 9.09e-01 0.0107 0.0938 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 2.50e-01 -0.105 0.0912 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 3.64e-03 -0.273 0.0929 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 5.76e-01 0.0368 0.0656 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 4.15e-01 0.0887 0.109 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 8.31e-01 0.0198 0.0923 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 8.58e-01 0.0192 0.107 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 4.22e-01 0.077 0.0956 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.98e-01 0.000198 0.0664 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 7.97e-01 0.0251 0.0975 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 6.80e-02 -0.163 0.0888 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0558 0.0763 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0422 0.0535 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -397148 sc-eQTL 2.16e-01 -0.139 0.112 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 2.45e-01 0.0947 0.0812 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -376512 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0952 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00139 0.0779 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0326 0.058 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0695 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 7.59e-01 0.0314 0.102 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000666 0.084 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0204 0.0747 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 8.93e-02 0.139 0.0813 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 1.28e-01 -0.167 0.109 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 4.71e-01 0.0766 0.106 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0373 0.0566 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 3.42e-01 0.0861 0.0904 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 202279 sc-eQTL 2.86e-01 0.108 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0518 0.0627 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 5.32e-02 -0.177 0.091 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 2.18e-02 0.181 0.0781 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 202302 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0223 0.111 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 sc-eQTL 1.24e-01 0.149 0.0966 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 491319 sc-eQTL 9.47e-01 0.00556 0.0843 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787431 sc-eQTL 4.29e-02 0.143 0.0704 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240230 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00414 0.0829 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93411 sc-eQTL 4.31e-01 0.0638 0.0809 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -133895 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0652 0.0521 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -479798 sc-eQTL 1.28e-01 0.115 0.0751 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 121341 eQTL 0.0237 0.0406 0.0179 0.0 0.0 0.235
ENSG00000135597 REPS1 -93411 eQTL 1.24e-19 -0.169 0.0182 0.0 0.0 0.235

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -93411 6.92e-06 9.28e-06 9.65e-07 4.31e-06 1.82e-06 3.4e-06 9.6e-06 1.93e-06 6.53e-06 4.28e-06 1.01e-05 4.77e-06 1.13e-05 3.56e-06 1.83e-06 5.07e-06 3.71e-06 4e-06 2.25e-06 2.56e-06 3.52e-06 7.66e-06 5.83e-06 2.15e-06 1.02e-05 2.79e-06 4.49e-06 2.81e-06 7.04e-06 6.64e-06 4.33e-06 7.36e-07 9.28e-07 2.69e-06 3.09e-06 1.63e-06 1.26e-06 1.6e-06 1.36e-06 8.9e-07 9.55e-07 8.1e-06 1.23e-06 1.54e-07 6.87e-07 1.36e-06 1.09e-06 6.88e-07 5.43e-07