logo

Genes within 1Mb (chr6:138894492:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 6.32e-01 0.0415 0.0866 0.235 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0386 0.0661 0.235 B L1
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 3.71e-01 0.0591 0.0659 0.235 B L1
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.15e-01 -0.104 0.0839 0.235 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 1.49e-02 -0.18 0.0734 0.235 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 5.16e-02 -0.0848 0.0433 0.235 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0779 0.107 0.235 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 3.14e-01 0.0679 0.0673 0.235 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 9.36e-01 0.00605 0.0751 0.235 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 1.81e-01 0.128 0.0956 0.235 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.64e-01 0.00295 0.0644 0.235 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 8.44e-01 -0.012 0.0607 0.235 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0896 0.0798 0.235 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00492 0.0629 0.235 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 6.18e-02 -0.086 0.0458 0.235 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 6.46e-01 0.0363 0.0788 0.235 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 2.22e-01 0.0948 0.0774 0.235 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.58e-01 0.118 0.104 0.235 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0498 0.0681 0.235 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00525 0.0695 0.235 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 8.72e-01 -0.012 0.0746 0.235 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0159 0.0701 0.235 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0522 0.0398 0.235 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 3.62e-01 0.0692 0.0757 0.235 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 8.34e-01 0.0194 0.0921 0.235 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 8.36e-01 0.0221 0.107 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0448 0.0748 0.232 DC L1
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00416 0.0878 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 2.61e-01 0.11 0.0974 0.232 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 4.94e-01 0.0591 0.0863 0.232 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.69e-01 0.0935 0.0843 0.232 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000139 0.1 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 2.60e-01 -0.115 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 7.05e-01 0.0291 0.0767 0.235 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0194 0.053 0.235 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0778 0.0698 0.235 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 3.83e-01 0.0875 0.1 0.235 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0296 0.0586 0.235 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0863 0.0761 0.235 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 4.58e-03 0.227 0.0792 0.235 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 6.72e-02 -0.19 0.103 0.235 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 1.14e-01 0.147 0.0926 0.236 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.96e-01 0.000384 0.0821 0.236 NK L1
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 5.80e-02 0.132 0.0691 0.236 NK L1
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 8.02e-01 0.0202 0.0805 0.236 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 7.91e-01 0.0203 0.0767 0.236 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0545 0.0558 0.236 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.39e-01 0.11 0.074 0.236 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00702 0.11 0.235 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0833 0.0711 0.235 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 4.77e-01 0.0627 0.0879 0.235 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0567 0.0799 0.235 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0483 0.0859 0.235 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0258 0.0563 0.235 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.89e-01 0.0866 0.0656 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 7.34e-01 0.0425 0.125 0.242 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 2.88e-01 0.116 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 2.46e-01 -0.066 0.0567 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0961 0.119 0.242 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0615 0.125 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 3.44e-01 0.107 0.113 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0652 0.0966 0.242 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0359 0.122 0.242 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0926 0.121 0.242 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.79e-01 0.116 0.107 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0328 0.074 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 1.05e-01 0.152 0.0937 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0868 0.0925 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.15e-02 -0.214 0.0988 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 7.91e-01 0.0225 0.0851 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 7.65e-02 0.184 0.103 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 7.37e-01 0.0323 0.0959 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 5.93e-01 0.0555 0.104 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 3.62e-01 0.101 0.111 0.237 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0033 0.0834 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 2.98e-01 -0.108 0.104 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0323 0.0958 0.237 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 8.94e-02 -0.176 0.103 0.237 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 5.84e-01 -0.045 0.0821 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0503 0.105 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.25e-01 0.148 0.0958 0.237 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 5.14e-01 0.0772 0.118 0.237 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0254 0.103 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.46e-01 0.0049 0.0724 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 4.08e-01 0.0812 0.098 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 5.90e-02 -0.169 0.0891 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 8.66e-01 0.014 0.0831 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0271 0.0581 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0351 0.109 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 2.26e-01 0.0958 0.0789 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0593 0.104 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 1.08e-01 0.163 0.101 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00745 0.0696 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0881 0.0835 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0222 0.0958 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0402 0.0914 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0634 0.0672 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 2.03e-01 -0.136 0.106 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 4.63e-01 0.0799 0.109 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 1.16e-01 -0.157 0.0993 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000962 0.106 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 4.88e-01 0.0636 0.0915 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0122 0.112 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0167 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 9.64e-01 0.00472 0.104 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 9.49e-01 0.0061 0.0947 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 7.51e-01 0.0302 0.0951 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 7.79e-01 0.0276 0.0981 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 1.68e-01 0.14 0.101 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.02e-01 0.00781 0.0634 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 1.30e-01 -0.127 0.0832 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0882 0.0787 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 8.83e-01 0.0103 0.0701 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0703 0.0469 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 6.37e-01 0.0379 0.0801 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 2.23e-01 0.0987 0.0807 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.38e-01 0.117 0.0986 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0141 0.0736 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 7.38e-01 -0.031 0.0923 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0844 0.0789 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0682 0.0749 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.25e-01 -0.07 0.0575 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 4.35e-01 0.067 0.0857 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 4.65e-01 0.0678 0.0926 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0163 0.112 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 7.66e-01 0.0227 0.0761 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 8.22e-01 -0.02 0.0885 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.18e-01 -0.107 0.0866 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 2.46e-01 0.11 0.0944 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 1.82e-02 -0.159 0.0666 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 8.04e-01 0.0221 0.0886 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000968 0.0927 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.97e-01 0.12 0.115 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 7.34e-01 -0.028 0.0824 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0685 0.103 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 5.20e-01 0.0541 0.0839 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0915 0.0897 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 1.58e-01 -0.103 0.0724 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 2.83e-01 0.091 0.0845 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 2.54e-01 -0.116 0.101 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0022 0.109 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0635 0.0694 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0907 0.0834 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0443 0.0839 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 5.48e-01 0.0506 0.0841 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0385 0.0441 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.94e-01 0.116 0.0889 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00968 0.102 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.57e-01 0.139 0.122 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 8.79e-01 0.0132 0.0863 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 1.12e-01 0.181 0.113 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 3.85e-01 -0.078 0.0896 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.093 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 1.59e-03 -0.29 0.0907 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00863 0.0956 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0369 0.101 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.56e-01 0.128 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 3.80e-01 0.0898 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00306 0.116 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 4.34e-01 0.0824 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 8.25e-01 0.0242 0.109 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.084 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.23e-01 0.141 0.0911 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 9.75e-01 0.00324 0.104 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0756 0.119 0.236 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0139 0.0825 0.236 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 5.15e-01 0.0712 0.109 0.236 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 7.11e-01 0.0336 0.0904 0.236 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0642 0.0973 0.236 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 5.44e-01 0.0435 0.0716 0.236 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 7.84e-01 0.0232 0.0843 0.236 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 7.95e-01 0.0289 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000198 0.0945 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 8.62e-01 0.0177 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 7.49e-01 0.0323 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0293 0.0938 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 1.49e-02 -0.209 0.0852 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.92e-01 0.121 0.0924 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.44e-01 0.118 0.101 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.34e-01 0.00747 0.0898 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 8.42e-03 0.211 0.0792 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 8.18e-01 -0.02 0.087 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 6.66e-01 0.0357 0.0825 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0447 0.0558 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 9.38e-02 0.125 0.074 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0756 0.116 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 4.51e-01 0.0745 0.0987 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 3.10e-01 0.0893 0.0877 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 3.67e-02 0.226 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0113 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.48e-01 -0.102 0.0878 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 6.10e-02 0.176 0.0933 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 3.18e-02 0.223 0.103 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0622 0.09 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 5.68e-01 0.048 0.0839 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0299 0.09 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0487 0.0929 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0692 0.0597 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 5.46e-01 0.0472 0.0781 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 1.02e-01 -0.224 0.136 0.244 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 2.47e-01 0.141 0.121 0.244 PB L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 1.35e-01 0.139 0.0921 0.244 PB L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 4.30e-01 -0.118 0.149 0.244 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.21e-02 -0.282 0.13 0.244 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 6.93e-01 0.0368 0.0929 0.244 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 4.41e-01 0.105 0.135 0.244 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.94e-01 -0.133 0.101 0.244 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 3.23e-01 -0.135 0.137 0.244 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0965 0.114 0.233 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0864 0.0911 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 9.57e-01 0.00452 0.0844 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 1.81e-01 -0.12 0.0898 0.233 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.34e-01 -0.103 0.106 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 3.73e-01 -0.061 0.0684 0.233 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 2.72e-02 0.179 0.0807 0.233 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 5.53e-01 0.0637 0.107 0.235 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0216 0.0732 0.235 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 2.37e-01 -0.136 0.115 0.235 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 7.88e-01 0.0239 0.089 0.235 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 6.93e-01 0.0364 0.0921 0.235 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0824 0.0783 0.235 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 4.55e-01 0.0655 0.0875 0.235 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345161 sc-eQTL 1.25e-01 0.154 0.0996 0.235 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 6.60e-01 0.0481 0.109 0.232 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0887 0.0782 0.232 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0511 0.104 0.232 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 6.13e-02 0.19 0.101 0.232 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.117 0.232 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.26e-01 0.116 0.0956 0.232 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0282 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 1.76e-01 -0.152 0.112 0.232 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0905 0.0843 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0432 0.0607 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0775 0.0696 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 3.95e-01 0.0866 0.102 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 6.45e-01 0.0419 0.0908 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0173 0.0764 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 2.00e-01 0.102 0.0796 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 2.06e-01 -0.135 0.106 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0973 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 5.72e-01 0.0377 0.0667 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0854 0.0823 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0571 0.104 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 9.15e-02 -0.167 0.0982 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0492 0.0859 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 8.99e-03 0.221 0.0838 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 3.34e-01 -0.111 0.114 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 2.54e-01 0.144 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 5.17e-01 0.0781 0.12 0.23 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 8.69e-01 0.0185 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.32e-01 -0.143 0.119 0.23 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 9.81e-01 0.00301 0.124 0.23 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00952 0.0934 0.23 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 3.61e-01 0.0983 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 7.08e-01 0.0431 0.115 0.229 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 2.74e-01 0.0845 0.077 0.229 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 5.22e-01 0.0605 0.0944 0.229 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 4.37e-01 0.081 0.104 0.229 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.87e-01 -0.093 0.107 0.229 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 7.33e-01 0.0335 0.0981 0.229 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 6.31e-02 0.177 0.0945 0.229 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0684 0.117 0.229 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 3.38e-01 0.101 0.105 0.229 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 1.02e-01 -0.102 0.0623 0.229 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 7.79e-01 0.027 0.0961 0.229 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 2.60e-01 0.114 0.101 0.229 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 1.57e-01 -0.108 0.0758 0.229 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 6.05e-03 -0.25 0.09 0.229 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 4.18e-03 0.221 0.0763 0.229 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0594 0.112 0.229 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0357 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 6.71e-01 0.0398 0.0934 0.243 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0794 0.102 0.243 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0609 0.0929 0.243 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 8.72e-01 0.0152 0.0942 0.243 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 6.71e-01 0.0439 0.103 0.243 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.38e-01 0.179 0.12 0.243 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0963 0.0932 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 1.59e-01 0.145 0.102 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00103 0.0712 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 9.09e-01 0.0107 0.0938 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 2.50e-01 -0.105 0.0912 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 3.64e-03 -0.273 0.0929 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 5.76e-01 0.0368 0.0656 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 4.15e-01 0.0887 0.109 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 8.31e-01 0.0198 0.0923 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 8.58e-01 0.0192 0.107 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 4.22e-01 0.077 0.0956 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.98e-01 0.000198 0.0664 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 7.97e-01 0.0251 0.0975 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 6.80e-02 -0.163 0.0888 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0558 0.0763 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0422 0.0535 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -397506 sc-eQTL 2.16e-01 -0.139 0.112 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 2.45e-01 0.0947 0.0812 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -376870 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0952 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00139 0.0779 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0326 0.058 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 1.48e-01 -0.101 0.0695 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 7.59e-01 0.0314 0.102 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000666 0.084 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0204 0.0747 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 8.93e-02 0.139 0.0813 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 1.28e-01 -0.167 0.109 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 4.71e-01 0.0766 0.106 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0373 0.0566 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 3.42e-01 0.0861 0.0904 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 201921 sc-eQTL 2.86e-01 0.108 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0518 0.0627 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 5.32e-02 -0.177 0.091 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 2.18e-02 0.181 0.0781 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 201944 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0223 0.111 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 sc-eQTL 1.24e-01 0.149 0.0966 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490961 sc-eQTL 9.47e-01 0.00556 0.0843 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 787073 sc-eQTL 4.29e-02 0.143 0.0704 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -240588 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00414 0.0829 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -93769 sc-eQTL 4.31e-01 0.0638 0.0809 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134253 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0652 0.0521 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480156 sc-eQTL 1.28e-01 0.115 0.0751 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 120983 eQTL 0.0237 0.0406 0.0179 0.0 0.0 0.235
ENSG00000135597 REPS1 -93769 eQTL 1.24e-19 -0.169 0.0182 0.0 0.0 0.235

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -93769 7.6e-06 9.76e-06 1.33e-06 5.5e-06 2.32e-06 3.82e-06 1.03e-05 2.08e-06 1e-05 5.3e-06 1.24e-05 5.63e-06 1.45e-05 3.81e-06 3.15e-06 6.74e-06 4.17e-06 6.71e-06 2.72e-06 2.81e-06 5.97e-06 9.54e-06 7.49e-06 3.25e-06 1.5e-05 4.62e-06 6.24e-06 4.83e-06 1.03e-05 7.9e-06 5.43e-06 1.05e-06 1.1e-06 3.26e-06 4.62e-06 2.63e-06 1.76e-06 1.95e-06 2.16e-06 9.86e-07 1.05e-06 1.21e-05 1.32e-06 2.52e-07 8.18e-07 1.75e-06 1.76e-06 6.92e-07 4.51e-07