Genes within 1Mb (chr6:138893755:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 6.90e-01 0.0362 0.0906 0.19 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0351 0.0692 0.19 B L1
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 9.38e-01 0.0054 0.0691 0.19 B L1
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 5.23e-02 -0.171 0.0874 0.19 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 2.15e-02 -0.178 0.077 0.19 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.39e-02 -0.103 0.0452 0.19 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.112 0.19 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 5.69e-01 0.0402 0.0706 0.19 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0403 0.0785 0.19 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 6.57e-01 0.0446 0.1 0.19 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00292 0.0674 0.19 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 8.41e-01 0.0128 0.0635 0.19 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.56e-01 -0.119 0.0833 0.19 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 3.05e-01 0.0675 0.0656 0.19 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 7.06e-02 -0.087 0.0479 0.19 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 7.10e-01 0.0307 0.0824 0.19 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00115 0.0812 0.19 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 2.35e-01 0.13 0.109 0.19 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0395 0.0716 0.19 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00691 0.073 0.19 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0754 0.0782 0.19 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 3.26e-01 0.0723 0.0735 0.19 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0578 0.0418 0.19 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 3.68e-01 0.0717 0.0795 0.19 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0476 0.0967 0.19 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 7.01e-01 -0.043 0.112 0.187 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0735 0.0784 0.187 DC L1
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0798 0.0918 0.187 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 9.34e-01 0.00851 0.102 0.187 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 4.19e-01 0.0733 0.0904 0.187 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.0883 0.187 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0242 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 6.22e-02 -0.199 0.106 0.187 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 8.91e-01 0.011 0.0805 0.19 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0438 0.0556 0.19 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.28e-01 -0.112 0.073 0.19 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.105 0.19 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0487 0.0615 0.19 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 9.58e-01 0.00426 0.0802 0.19 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 4.43e-02 0.17 0.084 0.19 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 2.01e-01 -0.14 0.109 0.19 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 7.02e-02 0.178 0.0977 0.191 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0172 0.0868 0.191 NK L1
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 8.06e-02 0.128 0.0731 0.191 NK L1
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 4.88e-01 -0.059 0.085 0.191 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 5.13e-01 -0.053 0.081 0.191 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0176 0.0591 0.191 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.05e-01 0.0996 0.0784 0.191 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0508 0.116 0.19 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0646 0.0751 0.19 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 5.05e-01 0.062 0.0928 0.19 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0626 0.0843 0.19 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 5.67e-01 -0.052 0.0907 0.19 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0257 0.0594 0.19 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.34e-01 0.0828 0.0693 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 7.38e-01 0.044 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 8.00e-02 -0.104 0.0593 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 8.70e-02 -0.214 0.124 0.194 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00123 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 9.54e-01 0.00684 0.119 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 3.70e-01 -0.114 0.128 0.194 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 3.71e-01 -0.114 0.127 0.194 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 1.75e-01 0.152 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0596 0.0777 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 6.72e-01 0.042 0.099 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.87e-01 -0.128 0.0969 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 9.17e-03 -0.271 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 7.88e-01 0.024 0.0893 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00106 0.101 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 4.87e-01 0.0759 0.109 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.115 0.192 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 4.39e-01 0.0672 0.0867 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 5.24e-01 -0.069 0.108 0.192 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0663 0.0997 0.192 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 5.81e-02 -0.204 0.107 0.192 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0888 0.0853 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0936 0.109 0.192 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 3.90e-01 0.0863 0.1 0.192 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 7.30e-01 0.0426 0.123 0.192 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 6.64e-01 -0.047 0.108 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00203 0.0761 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0302 0.103 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 2.15e-02 -0.216 0.0932 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 6.57e-01 0.0388 0.0873 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0468 0.061 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0055 0.114 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 4.53e-01 0.0625 0.0831 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0855 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 3.00e-01 0.11 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0468 0.0728 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0415 0.0875 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0775 0.1 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00717 0.0957 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0819 0.0702 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0807 0.111 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 9.77e-01 0.00332 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 1.33e-01 -0.157 0.104 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00384 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.0968 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 1.84e-01 0.157 0.118 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0699 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 9.63e-01 0.00515 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00879 0.1 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 4.14e-01 0.0825 0.101 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 8.49e-01 0.0199 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 7.73e-01 0.0308 0.106 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 9.52e-01 0.00396 0.0664 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0847 0.0874 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.96e-01 -0.107 0.0824 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 3.06e-01 0.0751 0.0732 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0632 0.0492 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 5.56e-01 0.0494 0.0838 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0222 0.0848 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 2.79e-01 0.111 0.103 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0267 0.0765 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0957 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.99e-01 -0.106 0.0819 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0461 0.0779 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0691 0.0598 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 5.27e-01 0.0564 0.0891 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 7.56e-01 0.03 0.0963 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0709 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 7.41e-01 0.0264 0.0796 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00517 0.0925 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 9.28e-02 -0.152 0.0903 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 2.88e-01 0.105 0.0987 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0703 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0061 0.0927 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 5.96e-01 0.0515 0.0969 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 2.11e-01 0.151 0.12 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0204 0.0862 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0755 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0466 0.0878 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0796 0.094 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0718 0.076 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 5.44e-01 0.0539 0.0886 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0371 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0545 0.073 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0982 0.0876 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0753 0.0881 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 1.62e-01 0.124 0.088 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0388 0.0463 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0935 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 3.29e-01 -0.105 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 3.22e-01 0.128 0.129 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 6.47e-01 0.0415 0.0906 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 2.77e-01 0.13 0.119 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0864 0.0942 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 9.10e-01 -0.011 0.0981 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 4.30e-03 -0.277 0.0957 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 6.19e-01 -0.05 0.1 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0554 0.106 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 1.06e-01 0.191 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 3.25e-01 0.106 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0503 0.123 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 8.25e-01 0.0246 0.111 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 6.37e-01 0.0547 0.116 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.23e-02 -0.203 0.088 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 6.78e-01 0.0403 0.0968 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 3.35e-01 -0.106 0.11 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 2.16e-01 -0.154 0.124 0.19 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 9.44e-01 0.00602 0.0861 0.19 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 2.07e-01 0.144 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 7.14e-01 0.0346 0.0943 0.19 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0712 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 5.37e-01 0.0462 0.0746 0.19 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0256 0.0879 0.19 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0244 0.118 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 8.30e-01 0.0216 0.101 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 7.64e-01 0.0324 0.108 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0396 0.107 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0617 0.0999 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 3.23e-03 -0.269 0.0902 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.84e-01 0.106 0.0986 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 1.77e-01 0.144 0.107 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0316 0.095 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 2.63e-02 0.188 0.0842 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 8.21e-02 -0.16 0.0914 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 9.21e-01 0.00864 0.0873 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0203 0.0591 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 1.16e-01 0.124 0.0784 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 9.04e-01 0.0147 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 6.19e-01 0.0517 0.104 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0919 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.99e-01 0.146 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0547 0.113 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0556 0.0925 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 1.99e-01 0.127 0.0985 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 4.83e-02 0.219 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0752 0.0957 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 3.64e-01 0.0811 0.0891 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0956 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 6.86e-01 -0.04 0.0989 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0165 0.0637 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 5.72e-01 0.047 0.0831 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0717 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0342 0.126 0.196 PB L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0951 0.196 PB L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0124 0.154 0.196 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 2.38e-01 -0.161 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 4.25e-01 0.0764 0.0954 0.196 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 3.83e-01 0.122 0.139 0.196 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 1.72e-01 -0.143 0.104 0.196 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0986 0.141 0.196 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 2.36e-01 -0.142 0.12 0.189 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 2.60e-01 -0.108 0.0956 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0759 0.0885 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 4.16e-01 -0.077 0.0946 0.189 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 1.24e-01 -0.171 0.111 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 6.97e-01 0.0281 0.072 0.189 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 1.46e-01 0.125 0.0853 0.189 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 9.46e-01 0.0076 0.112 0.19 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0181 0.0766 0.19 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0501 0.12 0.19 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 7.45e-01 0.0303 0.0931 0.19 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 4.70e-01 0.0696 0.0963 0.19 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 8.74e-01 0.013 0.0821 0.19 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 4.30e-01 0.0723 0.0915 0.19 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -345898 sc-eQTL 2.22e-01 0.128 0.104 0.19 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0283 0.113 0.19 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 1.27e-01 -0.124 0.0806 0.19 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0972 0.107 0.19 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 5.84e-01 0.0577 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0395 0.121 0.19 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 1.62e-01 0.139 0.0987 0.19 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 7.88e-01 0.0283 0.105 0.19 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 8.78e-02 -0.198 0.115 0.19 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0687 0.0876 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0494 0.0629 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0947 0.0722 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 7.54e-02 0.187 0.105 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 7.67e-02 0.167 0.0936 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 5.04e-01 0.0531 0.0792 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.94e-01 0.087 0.0827 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0904 0.11 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 4.59e-01 0.0756 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 9.29e-01 0.00621 0.0698 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0859 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0434 0.109 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 9.78e-03 -0.265 0.102 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 6.13e-01 0.0456 0.0899 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 1.14e-01 0.14 0.0885 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0785 0.12 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 1.07e-01 0.219 0.135 0.182 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 1.35e-01 0.193 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 8.29e-01 0.0261 0.12 0.182 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0414 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 8.67e-01 0.0224 0.134 0.182 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0408 0.1 0.182 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 6.42e-01 0.0539 0.116 0.182 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 6.83e-01 0.0487 0.119 0.189 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 3.07e-01 0.082 0.0799 0.189 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 1.92e-01 0.128 0.0976 0.189 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 5.19e-01 0.0697 0.108 0.189 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 4.29e-01 0.0805 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 1.23e-01 0.152 0.0983 0.189 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0559 0.121 0.189 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 4.75e-01 0.0785 0.11 0.186 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0772 0.0652 0.186 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.1 0.186 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 9.80e-01 0.00261 0.105 0.186 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0938 0.0792 0.186 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 6.59e-02 -0.175 0.0949 0.186 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.44e-02 0.182 0.0802 0.186 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 3.91e-01 -0.1 0.117 0.186 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00674 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 8.11e-01 0.0229 0.0957 0.201 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0678 0.104 0.201 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0694 0.0951 0.201 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 8.37e-01 0.0199 0.0965 0.201 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 1.35e-01 0.157 0.105 0.201 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 1.00e-01 0.203 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 1.78e-01 -0.129 0.0952 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 2.85e-01 0.115 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 7.60e-01 0.0228 0.0748 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0324 0.0985 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 5.06e-02 -0.187 0.0952 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 8.01e-04 -0.33 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0348 0.069 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 9.79e-01 0.00298 0.114 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0112 0.097 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00565 0.113 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 4.67e-01 0.0734 0.101 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00875 0.0699 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0472 0.103 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 2.22e-02 -0.215 0.0931 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0194 0.0803 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0595 0.0562 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -398243 sc-eQTL 3.60e-01 -0.108 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 5.44e-01 0.052 0.0856 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -377607 sc-eQTL 6.29e-02 -0.187 0.0999 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0196 0.0815 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0513 0.0606 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 8.02e-02 -0.128 0.0726 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 2.59e-01 0.121 0.107 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 8.96e-01 0.0115 0.0879 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 4.32e-01 0.0615 0.0781 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.05e-01 0.108 0.0853 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0934 0.114 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 6.37e-01 0.0525 0.111 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0319 0.0592 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 6.26e-01 0.0462 0.0947 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 201184 sc-eQTL 5.64e-01 0.0608 0.105 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0569 0.0655 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 2.21e-01 -0.118 0.0957 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 5.16e-02 0.16 0.082 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 201207 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0408 0.116 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 sc-eQTL 4.84e-02 0.203 0.102 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 490224 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0282 0.0896 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 786336 sc-eQTL 3.08e-02 0.163 0.0748 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241325 sc-eQTL 2.19e-01 -0.108 0.0878 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -94506 sc-eQTL 8.67e-01 0.0145 0.0861 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -134990 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0361 0.0555 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -480893 sc-eQTL 2.47e-01 0.093 0.0801 0.192 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 120246 eQTL 0.0494 0.0381 0.0194 0.0 0.0 0.185
ENSG00000112378 PERP 786336 eQTL 0.0391 -0.0672 0.0325 0.00105 0.0 0.185
ENSG00000135597 REPS1 -94506 eQTL 1.94e-24 -0.204 0.0194 0.0442 0.048 0.185
ENSG00000146386 ABRACL -134990 eQTL 0.0158 0.068 0.0281 0.0 0.0 0.185


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -94506 5.58e-06 6.3e-06 7.62e-07 3.6e-06 1.87e-06 1.55e-06 8.67e-06 1.36e-06 4.79e-06 3.34e-06 8.01e-06 2.93e-06 1.02e-05 2.32e-06 1.37e-06 4.67e-06 2.73e-06 3.75e-06 2.11e-06 2.11e-06 3.25e-06 6.81e-06 4.97e-06 2.01e-06 9.22e-06 2.38e-06 3.62e-06 2.3e-06 6.66e-06 6.51e-06 3.39e-06 5.85e-07 9.16e-07 2.78e-06 2.14e-06 1.84e-06 1.4e-06 9.82e-07 1.26e-06 8.7e-07 9.98e-07 8.06e-06 6.6e-07 1.5e-07 6.9e-07 1.02e-06 9.67e-07 6.73e-07 4.78e-07
ENSG00000146386 ABRACL -134990 4.36e-06 4.74e-06 9.13e-07 2.65e-06 1.61e-06 1.33e-06 4.29e-06 1.04e-06 4.96e-06 2.44e-06 4.9e-06 3.5e-06 7.38e-06 2.38e-06 1.33e-06 3.69e-06 2.06e-06 3.26e-06 1.48e-06 1.12e-06 3.02e-06 4.73e-06 3.78e-06 1.48e-06 5.85e-06 1.95e-06 2.49e-06 1.81e-06 4.53e-06 4.12e-06 2.68e-06 5.4e-07 5.2e-07 1.47e-06 2.09e-06 1.04e-06 1.09e-06 4.58e-07 8.13e-07 5.02e-07 8.13e-07 5.33e-06 3.99e-07 1.59e-07 5.92e-07 1.02e-06 9.76e-07 4.42e-07 4.98e-07