Genes within 1Mb (chr6:138893225:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 7.01e-01 0.0463 0.12 0.088 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 7.95e-02 -0.161 0.0912 0.088 B L1
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 2.71e-01 0.101 0.0915 0.088 B L1
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 7.23e-02 0.21 0.116 0.088 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 3.28e-01 -0.101 0.103 0.088 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.24e-01 0.0486 0.0607 0.088 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 4.26e-01 0.119 0.149 0.088 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 5.38e-01 0.0578 0.0937 0.088 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 2.06e-01 0.132 0.104 0.088 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.68e-01 0.122 0.135 0.088 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 7.58e-02 -0.161 0.0901 0.088 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 8.50e-02 -0.147 0.085 0.088 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 7.26e-01 0.0396 0.113 0.088 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 7.74e-02 -0.156 0.088 0.088 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.44e-01 0.0395 0.065 0.088 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 5.58e-01 0.0651 0.111 0.088 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 2.39e-01 0.129 0.109 0.088 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.06e-01 0.148 0.144 0.088 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.65e-02 -0.209 0.0937 0.088 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0653 0.0965 0.088 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.45e-01 0.0791 0.103 0.088 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 7.16e-02 -0.175 0.0967 0.088 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 9.32e-01 0.00477 0.0555 0.088 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 8.44e-01 0.0208 0.105 0.088 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 6.06e-01 0.0661 0.128 0.088 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 5.65e-01 0.0852 0.148 0.088 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 4.99e-01 0.0704 0.104 0.088 DC L1
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.00e-01 0.103 0.122 0.088 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 1.51e-01 0.194 0.135 0.088 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 6.28e-01 0.0582 0.12 0.088 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 9.75e-01 0.00363 0.117 0.088 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 2.04e-01 0.177 0.139 0.088 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0084 0.142 0.088 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.48e-01 0.153 0.105 0.088 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 9.51e-01 0.00451 0.073 0.088 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 1.07e-01 0.155 0.0957 0.088 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 5.95e-01 0.0734 0.138 0.088 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 8.03e-01 0.0202 0.0807 0.088 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.88e-01 -0.057 0.105 0.088 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 1.13e-01 0.176 0.111 0.088 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 7.73e-01 0.0414 0.143 0.088 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 2.71e-01 -0.143 0.13 0.088 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 3.36e-01 -0.11 0.114 0.088 NK L1
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0166 0.0972 0.088 NK L1
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.11e-01 0.0925 0.112 0.088 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 3.89e-01 0.0921 0.107 0.088 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0534 0.078 0.088 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00497 0.104 0.088 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0652 0.152 0.088 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 1.84e-01 -0.13 0.0978 0.088 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 2.51e-01 -0.139 0.121 0.088 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.25e-01 0.0879 0.11 0.088 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 1.09e-01 0.189 0.118 0.088 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 2.40e-01 0.0911 0.0773 0.088 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 7.12e-01 0.0335 0.0907 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 6.39e-01 0.0827 0.176 0.089 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 4.73e-01 -0.111 0.154 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 3.29e-01 0.0782 0.08 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 1.12e-01 0.266 0.167 0.089 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0102 0.176 0.089 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.40e-01 0.123 0.159 0.089 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 6.02e-01 0.0711 0.136 0.089 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 1.50e-01 0.246 0.17 0.089 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 1.63e-01 0.238 0.17 0.089 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00114 0.148 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0345 0.102 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 1.50e-01 0.188 0.13 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 6.62e-01 0.0561 0.128 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0092 0.138 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.07e-01 0.0781 0.118 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 4.96e-01 0.0983 0.144 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 1.95e-01 0.172 0.132 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 5.90e-01 0.0774 0.144 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 8.62e-01 0.0263 0.151 0.088 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 1.79e-01 -0.152 0.113 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 2.49e-01 -0.163 0.141 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 7.39e-01 0.0434 0.13 0.088 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0643 0.141 0.088 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 1.18e-02 0.279 0.11 0.088 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 3.02e-01 0.147 0.142 0.088 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 3.50e-01 0.122 0.131 0.088 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 5.16e-01 0.104 0.161 0.088 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.77e-01 0.125 0.141 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.04e-01 -0.126 0.0992 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 1.67e-01 0.186 0.134 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 2.03e-01 0.157 0.123 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0454 0.114 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.23e-01 0.064 0.0798 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 4.75e-01 0.107 0.149 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 7.90e-01 0.029 0.109 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 2.55e-01 0.163 0.142 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.45e-01 0.203 0.138 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0301 0.0952 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 8.54e-01 0.0211 0.114 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 1.37e-01 0.195 0.13 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 2.36e-01 -0.148 0.125 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.87e-01 0.05 0.092 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0736 0.146 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 2.30e-01 0.178 0.148 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 9.72e-01 0.00474 0.137 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.04e-01 -0.229 0.14 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 6.19e-02 -0.227 0.121 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 3.78e-02 -0.308 0.147 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00222 0.143 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 7.87e-01 0.0375 0.139 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0479 0.126 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0508 0.127 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0266 0.131 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.30e-01 0.138 0.142 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 6.71e-02 -0.162 0.0879 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 4.07e-01 -0.097 0.117 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 8.42e-01 0.0221 0.11 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 7.88e-02 -0.172 0.0972 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 2.75e-01 0.0719 0.0657 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 7.46e-01 0.0363 0.112 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 2.77e-02 0.248 0.112 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 5.45e-01 0.0843 0.139 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0798 0.103 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 2.49e-01 0.15 0.129 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 7.66e-01 -0.033 0.111 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 5.19e-01 0.0679 0.105 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0409 0.081 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 5.69e-01 0.0688 0.12 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0021 0.13 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.52e-01 0.223 0.155 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.62e-01 -0.119 0.106 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0275 0.124 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.10e-01 0.1 0.121 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0134 0.132 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0729 0.0942 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 6.52e-01 0.0559 0.124 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0688 0.129 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 6.20e-01 0.0786 0.158 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.14e-02 -0.259 0.112 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0129 0.141 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 1.57e-01 0.163 0.115 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 8.24e-01 0.0275 0.124 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0709 0.0998 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 6.14e-01 0.0587 0.116 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 3.20e-01 -0.139 0.139 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 5.77e-01 0.0841 0.151 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 9.90e-02 -0.159 0.0958 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0482 0.116 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.15e-01 0.0949 0.116 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 3.19e-01 -0.116 0.116 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.91e-01 0.0422 0.0612 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 4.85e-01 0.0865 0.124 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 1.25e-01 0.217 0.141 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 5.44e-01 0.0999 0.164 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 1.62e-01 -0.162 0.115 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 5.69e-01 0.087 0.153 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 3.04e-01 -0.124 0.12 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 3.81e-01 -0.11 0.125 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 2.49e-01 -0.144 0.124 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 4.77e-01 0.0912 0.128 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 9.72e-01 0.00479 0.135 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.92e-01 0.129 0.15 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.11e-01 -0.171 0.137 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0715 0.156 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.26e-01 -0.112 0.141 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 8.50e-01 0.0279 0.147 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 2.23e-01 0.138 0.113 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 1.09e-01 0.197 0.122 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 1.94e-02 0.325 0.138 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 7.45e-01 0.0535 0.164 0.089 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.68e-01 -0.126 0.114 0.089 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 3.58e-02 -0.316 0.149 0.089 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.75e-01 0.0893 0.125 0.089 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 5.18e-01 0.0872 0.135 0.089 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 7.17e-01 0.036 0.099 0.089 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 2.06e-01 0.147 0.116 0.089 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 2.97e-01 -0.158 0.151 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.77e-01 -0.14 0.128 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0982 0.137 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 8.66e-02 0.234 0.136 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 5.02e-01 0.0859 0.128 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 1.85e-01 0.156 0.117 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 3.39e-01 0.121 0.126 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 9.32e-01 0.0119 0.139 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 7.96e-01 -0.032 0.124 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 2.24e-01 0.135 0.111 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 1.84e-01 0.159 0.12 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 3.58e-01 0.105 0.114 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0645 0.0769 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0233 0.103 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.93e-01 -0.219 0.168 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0825 0.143 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0799 0.127 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 3.90e-01 0.135 0.157 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 9.96e-01 0.000695 0.155 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0805 0.128 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 6.51e-01 0.0618 0.136 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.94e-01 -0.122 0.143 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.97e-01 -0.129 0.123 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 5.84e-01 -0.063 0.115 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 5.51e-01 0.0736 0.123 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 2.28e-01 -0.153 0.127 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0312 0.082 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00726 0.107 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 2.71e-01 -0.188 0.17 0.085 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 5.46e-01 0.0921 0.152 0.085 PB L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0691 0.116 0.085 PB L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.14e-01 -0.153 0.186 0.085 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 1.46e-01 -0.24 0.164 0.085 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0354 0.116 0.085 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 2.16e-01 -0.209 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0025 0.128 0.085 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 5.15e-01 -0.112 0.171 0.085 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 9.03e-01 0.0196 0.16 0.087 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0331 0.128 0.087 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 4.43e-01 0.0906 0.118 0.087 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0264 0.126 0.087 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 1.33e-01 0.223 0.148 0.087 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0899 0.0956 0.087 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 3.39e-02 0.241 0.113 0.087 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 2.87e-01 0.162 0.152 0.088 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.20e-02 -0.237 0.103 0.088 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 2.19e-03 -0.496 0.16 0.088 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00231 0.126 0.088 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 9.17e-01 0.0136 0.131 0.088 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 2.39e-01 -0.131 0.111 0.088 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00179 0.124 0.088 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -346428 sc-eQTL 6.53e-01 -0.064 0.142 0.088 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.91e-01 0.199 0.152 0.085 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 3.63e-01 0.0994 0.109 0.085 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 8.35e-01 0.0302 0.145 0.085 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 2.19e-01 0.174 0.141 0.085 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 4.31e-01 -0.129 0.163 0.085 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 7.08e-01 0.0501 0.134 0.085 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 7.97e-01 0.0364 0.142 0.085 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 5.70e-01 -0.089 0.156 0.085 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 7.26e-01 0.0419 0.12 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00877 0.086 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 9.50e-02 0.165 0.0982 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0786 0.144 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 1.08e-01 -0.206 0.128 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0281 0.108 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 4.40e-01 0.0873 0.113 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0341 0.151 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.23e-01 0.213 0.138 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00466 0.0948 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 1.25e-01 0.179 0.116 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 5.80e-01 0.0821 0.148 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 1.13e-01 0.222 0.14 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0758 0.122 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 6.73e-02 0.22 0.12 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 3.25e-01 0.16 0.162 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.51e-01 -0.25 0.173 0.088 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 4.35e-01 -0.13 0.166 0.088 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0519 0.154 0.088 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 2.16e-01 -0.205 0.165 0.088 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0735 0.171 0.088 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.18e-01 0.105 0.129 0.088 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 7.12e-01 0.055 0.149 0.088 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 9.02e-01 -0.02 0.162 0.084 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0924 0.109 0.084 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 4.27e-01 -0.106 0.133 0.084 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 2.92e-01 0.154 0.146 0.084 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0945 0.151 0.084 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 3.24e-01 0.136 0.138 0.084 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 3.58e-01 0.123 0.134 0.084 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0665 0.164 0.084 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 9.26e-01 0.0136 0.146 0.086 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0589 0.0869 0.086 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00625 0.133 0.086 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 1.62e-02 0.335 0.138 0.086 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0253 0.106 0.086 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 8.84e-01 0.0186 0.127 0.086 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 7.02e-02 0.195 0.107 0.086 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 2.37e-01 0.184 0.155 0.086 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 2.45e-01 -0.196 0.168 0.085 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.85e-01 0.14 0.131 0.085 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0897 0.143 0.085 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 8.51e-01 0.0246 0.131 0.085 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 8.25e-01 0.0294 0.132 0.085 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.91e-02 -0.272 0.143 0.085 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 3.91e-01 0.146 0.17 0.085 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0476 0.131 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 9.32e-01 0.0122 0.142 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0972 0.0983 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 9.23e-01 0.0125 0.13 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 2.17e-01 0.156 0.126 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0364 0.131 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 4.27e-03 0.258 0.0892 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 7.88e-02 0.264 0.149 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 2.23e-01 0.156 0.127 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 3.01e-01 0.154 0.148 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.22e-01 0.131 0.132 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 2.26e-01 -0.111 0.0915 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 1.92e-01 0.176 0.134 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 1.37e-01 0.184 0.123 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0696 0.105 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 3.50e-01 0.0692 0.0739 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -398773 sc-eQTL 6.64e-01 0.0674 0.155 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 5.83e-01 0.0619 0.112 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -378137 sc-eQTL 2.87e-01 0.141 0.132 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 1.16e-01 0.173 0.109 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0206 0.0819 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 6.86e-02 0.179 0.0978 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0445 0.144 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 8.65e-01 0.0201 0.118 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0398 0.105 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 2.21e-01 0.141 0.115 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 9.51e-01 0.00946 0.155 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 5.43e-01 0.0894 0.147 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0457 0.0783 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 6.71e-01 0.0532 0.125 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 200654 sc-eQTL 9.37e-03 0.36 0.137 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0527 0.0867 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 8.95e-01 0.0168 0.127 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 2.24e-01 0.133 0.109 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 200677 sc-eQTL 4.30e-01 0.122 0.154 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 119716 sc-eQTL 3.33e-01 -0.13 0.134 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 489694 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0601 0.116 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 785806 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0208 0.0983 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -241855 sc-eQTL 3.53e-01 0.107 0.114 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -95036 sc-eQTL 6.65e-01 0.0486 0.112 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -135520 sc-eQTL 5.07e-01 -0.048 0.0722 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -481423 sc-eQTL 9.19e-01 0.0106 0.104 0.088 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 \N 785806 2.76e-07 1.36e-07 6.86e-08 2.15e-07 9.82e-08 1e-07 1.6e-07 5.48e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.63e-07 1.05e-07 1.71e-07 8.15e-08 5.43e-08 7.74e-08 4.24e-08 1.64e-07 7.11e-08 4.89e-08 1.18e-07 1.25e-07 1.5e-07 3.42e-08 1.63e-07 1.14e-07 1.18e-07 1.04e-07 1.16e-07 1.06e-07 1.02e-07 4.58e-08 3.43e-08 8.89e-08 4.92e-08 6.85e-08 5.96e-08 8.72e-08 6.41e-08 3.75e-08 4.35e-08 1.36e-07 3.55e-08 1.08e-08 9.95e-08 1.92e-08 1.21e-07 0.0 4.82e-08
ENSG00000135540 \N 200654 2.04e-06 2.59e-06 3.6e-07 1.7e-06 4.65e-07 6.48e-07 1.31e-06 3.83e-07 1.65e-06 7.3e-07 1.96e-06 1.29e-06 3.42e-06 1.43e-06 4.97e-07 1.19e-06 1.04e-06 1.7e-06 1.15e-06 5.88e-07 6.7e-07 1.88e-06 1.78e-06 9.4e-07 2.62e-06 8.03e-07 1.19e-06 1.07e-06 1.68e-06 1.86e-06 9.44e-07 2.35e-07 3.61e-07 6.13e-07 9.1e-07 9.86e-07 7.77e-07 3.82e-07 9.94e-07 2.03e-07 2.97e-07 2.76e-06 5.26e-07 1.96e-07 4.19e-07 3.05e-07 2.46e-07 2.32e-07 1.55e-07
ENSG00000146386 \N -135520 4.35e-06 4.65e-06 8.92e-07 2.52e-06 8.63e-07 8.1e-07 2.92e-06 1e-06 3.65e-06 1.94e-06 4.33e-06 3.41e-06 6.55e-06 2.11e-06 9.71e-07 2.69e-06 1.79e-06 2.78e-06 1.45e-06 1.24e-06 1.96e-06 3.41e-06 3.47e-06 1.83e-06 4.81e-06 1.19e-06 2.35e-06 1.68e-06 3.82e-06 4.23e-06 2.01e-06 6.09e-07 5.88e-07 1.44e-06 1.95e-06 1.16e-06 9.08e-07 4.74e-07 9.49e-07 3.28e-07 3.53e-07 4.71e-06 1.35e-06 1.64e-07 7.84e-07 3.62e-07 8e-07 6.91e-07 4.54e-07
ENSG00000164440 \N -398773 1.01e-06 7.98e-07 3.02e-07 3.25e-07 9.61e-08 1.77e-07 6.02e-07 1.45e-07 5.88e-07 2.98e-07 9.73e-07 4.75e-07 1.02e-06 2.4e-07 3.72e-07 3.57e-07 5.34e-07 4.65e-07 4.7e-07 1.76e-07 2.26e-07 4.66e-07 4.08e-07 3.32e-07 9.71e-07 2.4e-07 4.25e-07 2.98e-07 4.13e-07 8.89e-07 3.49e-07 3.72e-08 5.47e-08 1.77e-07 3.34e-07 4.44e-07 3.14e-07 1.06e-07 7.56e-08 2.68e-08 4.83e-08 5.09e-07 3.7e-07 1.93e-08 3.07e-07 1.37e-08 7.25e-08 9.04e-08 5.18e-08