Genes within 1Mb (chr6:138875982:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 9.78e-01 0.00236 0.0866 0.192 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 8.40e-01 0.0134 0.0661 0.192 B L1
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0563 0.0659 0.192 B L1
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 1.04e-01 -0.137 0.0837 0.192 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 8.34e-02 -0.129 0.0739 0.192 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 1.12e-01 -0.0694 0.0435 0.192 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0321 0.107 0.192 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 7.50e-01 0.0216 0.0675 0.192 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0896 0.0748 0.192 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 3.36e-01 0.0925 0.0958 0.192 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 5.43e-01 0.0392 0.0644 0.192 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0529 0.0606 0.192 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0942 0.0798 0.192 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 9.71e-01 0.00228 0.0629 0.192 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0617 0.046 0.192 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 6.26e-01 0.0384 0.0788 0.192 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0267 0.0777 0.192 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 2.10e-01 0.131 0.104 0.192 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 9.70e-01 0.00259 0.0686 0.192 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0212 0.0699 0.192 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0852 0.0748 0.192 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 6.86e-01 0.0286 0.0705 0.192 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0309 0.0401 0.192 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 6.28e-01 0.037 0.0762 0.192 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 6.70e-01 0.0395 0.0926 0.192 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.08e-01 0.0256 0.105 0.187 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0612 0.0739 0.187 DC L1
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0309 0.0868 0.187 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0263 0.0966 0.187 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 3.02e-01 0.0882 0.0852 0.187 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 8.12e-02 0.146 0.083 0.187 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 2.98e-01 -0.103 0.099 0.187 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 1.24e-02 -0.251 0.0994 0.187 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000786 0.0766 0.192 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0253 0.053 0.192 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 1.46e-01 -0.101 0.0696 0.192 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 5.31e-01 0.0628 0.1 0.192 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0944 0.0583 0.192 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 7.20e-01 0.0274 0.0763 0.192 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 4.33e-01 0.0633 0.0806 0.192 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 6.18e-02 -0.194 0.103 0.192 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.38e-03 0.245 0.0919 0.193 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0118 0.0824 0.193 NK L1
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 2.29e-01 0.084 0.0697 0.193 NK L1
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0695 0.0806 0.193 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00338 0.0769 0.193 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.69e-01 -0.024 0.0561 0.193 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 5.90e-01 0.0403 0.0746 0.193 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.80e-01 0.0169 0.111 0.192 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 9.39e-01 0.00548 0.072 0.192 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 4.54e-01 0.0666 0.0887 0.192 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0638 0.0806 0.192 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0296 0.0868 0.192 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0344 0.0568 0.192 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 3.50e-01 0.0622 0.0664 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 9.50e-01 0.00786 0.125 0.189 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 6.08e-01 0.0563 0.11 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0902 0.0565 0.189 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 8.61e-02 -0.204 0.118 0.189 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 6.79e-01 0.0517 0.125 0.189 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 8.03e-01 0.0282 0.113 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0341 0.0967 0.189 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0895 0.121 0.189 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 2.80e-01 -0.131 0.121 0.189 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 3.34e-01 0.104 0.108 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 9.18e-01 0.00772 0.0747 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0617 0.095 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0512 0.0934 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0455 0.101 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 7.47e-01 0.0277 0.0858 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 9.80e-01 0.00267 0.105 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 8.09e-01 0.0235 0.0967 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0361 0.105 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0172 0.11 0.194 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.20e-01 0.067 0.0829 0.194 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0505 0.103 0.194 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0149 0.0954 0.194 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 2.29e-01 -0.124 0.103 0.194 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0961 0.0815 0.194 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0792 0.104 0.194 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 4.65e-01 0.07 0.0958 0.194 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0266 0.118 0.194 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0491 0.103 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 7.49e-01 0.0232 0.0722 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 2.25e-01 -0.119 0.0975 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 6.33e-02 -0.166 0.0888 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0159 0.0828 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 9.92e-01 0.000602 0.0579 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 7.83e-01 0.0299 0.108 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0282 0.0789 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 1.61e-01 -0.145 0.103 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0105 0.102 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.98e-01 0.0471 0.0694 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0541 0.0834 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 2.14e-01 -0.119 0.0953 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 9.97e-01 0.000365 0.0913 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0403 0.0671 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 9.21e-01 0.0106 0.106 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 5.70e-01 0.0618 0.108 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0998 0.0994 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 9.19e-01 0.0109 0.107 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 3.27e-01 0.0904 0.0921 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 2.48e-01 0.13 0.112 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0676 0.108 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0321 0.105 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 1.52e-01 0.137 0.0949 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 2.43e-01 0.112 0.0956 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0964 0.0987 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.101 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 6.70e-01 0.0269 0.063 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0628 0.0831 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0661 0.0784 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 6.69e-01 0.0298 0.0696 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0407 0.0468 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 3.49e-01 0.0745 0.0795 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0457 0.0805 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 3.67e-01 0.0889 0.0983 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 6.65e-01 0.0317 0.0732 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 6.61e-03 -0.248 0.0903 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 9.58e-02 -0.131 0.0782 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 9.56e-01 0.0041 0.0747 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0257 0.0574 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00903 0.0854 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 7.31e-01 0.0317 0.0922 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0275 0.113 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.74e-01 0.0551 0.0767 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0338 0.0893 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 3.40e-02 -0.185 0.0868 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000107 0.0956 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 8.02e-02 -0.119 0.0677 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 8.25e-01 0.0198 0.0894 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 7.14e-01 0.0344 0.0936 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 1.61e-01 0.161 0.115 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 7.60e-01 0.0251 0.0822 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 7.87e-01 0.0278 0.103 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0473 0.0838 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00585 0.0898 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 8.69e-01 -0.012 0.0726 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0105 0.0845 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0732 0.101 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00374 0.109 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 9.64e-01 0.00313 0.0699 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0752 0.0838 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 5.22e-01 -0.054 0.0843 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 2.03e-01 0.108 0.0842 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0177 0.0444 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 2.23e-01 0.109 0.0894 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 5.74e-01 0.0578 0.103 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 1.86e-01 0.16 0.121 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 3.26e-01 0.0838 0.085 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 3.58e-01 -0.104 0.112 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0187 0.0887 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0826 0.092 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 9.34e-02 -0.154 0.0912 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0249 0.0944 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 8.64e-01 0.0171 0.0997 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 1.69e-01 0.155 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 1.88e-01 0.135 0.102 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 3.89e-01 -0.101 0.117 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0747 0.105 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 7.29e-01 0.038 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 1.27e-01 -0.129 0.0841 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 7.88e-01 0.0247 0.0919 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 1.27e-01 -0.159 0.104 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 3.49e-01 -0.112 0.119 0.193 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.51e-01 0.0626 0.0829 0.193 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 8.57e-02 0.188 0.109 0.193 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0035 0.0909 0.193 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0724 0.0978 0.193 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 5.63e-01 0.0417 0.0719 0.193 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00662 0.0847 0.193 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 2.89e-01 0.119 0.112 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 7.61e-01 0.0292 0.0959 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 6.69e-01 0.0439 0.103 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0424 0.102 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0134 0.0953 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 2.25e-03 -0.265 0.0858 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0197 0.0941 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 5.41e-02 0.195 0.101 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00268 0.0904 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 3.14e-01 0.0815 0.0808 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 6.63e-02 -0.16 0.0869 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 9.02e-01 0.0102 0.083 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0233 0.0562 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 3.99e-01 0.0632 0.0748 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0436 0.115 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 6.35e-01 0.0467 0.0983 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 2.59e-01 0.0987 0.0872 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 2.15e-01 0.134 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 5.26e-01 0.0677 0.106 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0581 0.0876 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 1.29e-01 0.142 0.0931 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 4.22e-02 0.212 0.104 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0765 0.09 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 5.33e-01 0.0525 0.0839 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 2.14e-01 -0.112 0.0898 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 8.42e-01 0.0185 0.093 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.47e-01 0.0274 0.0599 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 9.46e-01 0.00529 0.0783 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0997 0.136 0.196 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 5.46e-01 0.0732 0.121 0.196 PB L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 1.95e-01 0.119 0.0916 0.196 PB L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 2.52e-01 -0.17 0.147 0.196 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 4.19e-01 -0.107 0.131 0.196 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 9.35e-02 0.154 0.0911 0.196 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 2.36e-01 0.159 0.134 0.196 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 4.81e-02 -0.199 0.0997 0.196 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 2.99e-01 -0.141 0.135 0.196 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 3.80e-01 -0.101 0.115 0.191 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0474 0.092 0.191 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 4.23e-02 -0.172 0.0843 0.191 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0199 0.091 0.191 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0608 0.107 0.191 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0163 0.0691 0.191 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 5.25e-01 0.0524 0.0823 0.191 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.88e-01 0.0151 0.107 0.192 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.11e-01 0.0603 0.0731 0.192 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 9.21e-01 0.0115 0.115 0.192 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 7.53e-01 0.0281 0.0891 0.192 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0487 0.0922 0.192 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.71e-01 0.0334 0.0785 0.192 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 6.16e-01 0.044 0.0876 0.192 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00252 0.1 0.192 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.18e-01 0.025 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.97e-02 -0.152 0.077 0.185 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 2.44e-01 -0.12 0.103 0.185 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00898 0.101 0.185 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 4.09e-01 0.0961 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 1.48e-01 0.138 0.0946 0.185 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 5.84e-01 0.0552 0.101 0.185 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 4.25e-02 -0.225 0.11 0.185 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0659 0.0832 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0144 0.0598 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0558 0.0687 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 3.05e-01 0.103 0.1 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 6.02e-01 0.0467 0.0895 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.59e-01 0.0333 0.0753 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 8.08e-01 0.0192 0.0787 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 7.58e-02 -0.186 0.104 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 6.43e-01 0.0449 0.0966 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 5.87e-01 -0.036 0.0661 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 1.62e-02 -0.195 0.0806 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 2.71e-01 -0.114 0.103 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 1.29e-01 -0.148 0.0974 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 4.24e-01 0.0681 0.085 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 4.78e-01 0.0599 0.0842 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 2.96e-01 -0.119 0.113 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 7.18e-02 0.237 0.131 0.182 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 2.75e-01 0.137 0.125 0.182 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 5.16e-01 -0.076 0.117 0.182 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0523 0.125 0.182 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 4.15e-01 -0.106 0.129 0.182 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0889 0.0973 0.182 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00335 0.113 0.182 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 9.47e-02 0.19 0.113 0.189 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 1.67e-01 0.106 0.0762 0.189 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 4.01e-01 0.0787 0.0935 0.189 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 3.86e-01 0.0896 0.103 0.189 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 3.29e-02 -0.227 0.106 0.189 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0159 0.0973 0.189 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 2.08e-01 0.119 0.0941 0.189 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 3.06e-01 -0.118 0.116 0.189 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 3.30e-01 0.102 0.104 0.19 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0162 0.0624 0.19 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 5.85e-01 0.0523 0.0955 0.19 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0833 0.1 0.19 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0289 0.0757 0.19 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0839 0.0911 0.19 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 3.82e-01 0.0677 0.0773 0.19 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0623 0.112 0.19 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 7.86e-01 0.0347 0.128 0.192 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 5.27e-01 -0.063 0.0994 0.192 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0289 0.108 0.192 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 1.41e-01 -0.145 0.0984 0.192 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0182 0.1 0.192 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 1.09e-01 0.175 0.109 0.192 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 9.84e-01 0.00263 0.129 0.192 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 1.63e-01 -0.139 0.0989 0.192 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 6.09e-01 0.0529 0.103 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 4.02e-01 0.06 0.0714 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0578 0.0942 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0938 0.0917 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 1.35e-01 -0.142 0.0948 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0507 0.0659 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0845 0.109 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 6.49e-01 0.0423 0.0927 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0729 0.108 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 8.64e-01 0.0164 0.0956 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 7.53e-01 0.0209 0.0663 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 2.05e-01 -0.123 0.097 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 6.01e-02 -0.168 0.0886 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0403 0.0762 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 7.80e-01 -0.015 0.0535 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -416016 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0115 0.112 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0229 0.0813 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -395380 sc-eQTL 5.56e-02 -0.182 0.0947 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0439 0.0771 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0356 0.0575 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 6.22e-02 -0.129 0.0687 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 9.35e-01 0.00822 0.101 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0375 0.0832 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 3.77e-01 0.0654 0.0739 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 7.53e-01 0.0255 0.0811 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 9.30e-02 -0.182 0.108 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 2.11e-01 0.132 0.105 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 7.15e-01 0.0206 0.0564 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 6.45e-01 0.0417 0.0902 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 183411 sc-eQTL 5.71e-01 0.0569 0.1 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0907 0.0621 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0856 0.0912 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 5.61e-01 0.0458 0.0787 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 183434 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0478 0.111 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 sc-eQTL 1.55e-02 0.236 0.0967 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 472451 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0141 0.0851 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 768563 sc-eQTL 7.59e-02 0.127 0.0712 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -259098 sc-eQTL 1.91e-01 -0.109 0.0833 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -112279 sc-eQTL 6.19e-01 0.0407 0.0817 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -152763 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0252 0.0527 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -498666 sc-eQTL 5.29e-01 0.0481 0.0762 0.192 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 102473 eQTL 0.00552 0.0511 0.0184 0.0 0.0 0.213
ENSG00000135597 REPS1 -112279 eQTL 2.19e-14 -0.147 0.019 0.0 0.0 0.213
ENSG00000146386 ABRACL -152763 eQTL 0.005 0.0753 0.0268 0.0 0.0 0.213
ENSG00000231329 AL031772.1 -363671 eQTL 0.0152 0.0509 0.0209 0.00114 0.0 0.213


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -112279 4.62e-06 4.82e-06 8.56e-07 2.84e-06 1.51e-06 1.57e-06 4.36e-06 9.79e-07 5.08e-06 2.44e-06 5.33e-06 3.52e-06 7.36e-06 2.33e-06 1.43e-06 3.71e-06 1.83e-06 3.55e-06 1.45e-06 1.15e-06 3.1e-06 4.95e-06 4.64e-06 1.43e-06 6.37e-06 1.87e-06 2.49e-06 1.83e-06 4.44e-06 4.18e-06 2.79e-06 5.09e-07 6.31e-07 1.71e-06 2.15e-06 8.84e-07 9.28e-07 4.08e-07 9.24e-07 4.28e-07 4.59e-07 5.59e-06 3.65e-07 1.8e-07 4.86e-07 7.43e-07 9.47e-07 4.11e-07 3.41e-07
ENSG00000146386 ABRACL -152763 3.21e-06 3.22e-06 5.1e-07 1.91e-06 6.85e-07 7.86e-07 2.45e-06 8.45e-07 2.44e-06 1.44e-06 3e-06 1.71e-06 4.69e-06 1.41e-06 8.99e-07 2.1e-06 1.57e-06 2.13e-06 1.48e-06 1.25e-06 1.56e-06 3.43e-06 3.32e-06 1.4e-06 4.03e-06 1.22e-06 1.44e-06 1.7e-06 3.09e-06 2.55e-06 2e-06 3.82e-07 5.97e-07 1.28e-06 1.56e-06 9.34e-07 9.41e-07 4.2e-07 1.23e-06 4.35e-07 2.1e-07 3.92e-06 5.78e-07 1.89e-07 3.69e-07 3.58e-07 8.5e-07 1.99e-07 1.68e-07