Genes within 1Mb (chr12:93530733:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0148 0.0534 0.28 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 2.27e-01 0.0641 0.0528 0.28 B L1
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.14e-01 0.0524 0.0801 0.28 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 4.41e-02 -0.134 0.0663 0.28 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 6.64e-01 -0.026 0.0596 0.28 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 6.46e-02 0.0969 0.0522 0.28 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 3.21e-01 0.0589 0.0592 0.28 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.84e-02 -0.179 0.0812 0.28 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 6.79e-01 0.0339 0.0817 0.28 B L1
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 6.08e-01 0.0284 0.0554 0.28 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0102 0.0536 0.28 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.65e-01 0.051 0.0562 0.28 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 6.48e-01 0.0421 0.0922 0.28 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 2.93e-01 0.062 0.0588 0.28 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0087 0.0532 0.28 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0144 0.0494 0.28 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.49e-04 -0.31 0.0833 0.28 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0583 0.0615 0.28 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0182 0.0707 0.28 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0662 0.0727 0.28 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 4.29e-02 0.173 0.0849 0.28 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 1.38e-01 0.101 0.0677 0.28 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 4.92e-01 0.035 0.0508 0.28 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 5.32e-01 0.0396 0.0632 0.28 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 8.10e-02 -0.157 0.0895 0.28 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0293 0.0822 0.279 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 1.13e-01 0.141 0.0882 0.279 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 1.05e-01 0.162 0.0996 0.279 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 4.79e-01 -0.056 0.079 0.279 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0272 0.0824 0.279 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0801 0.083 0.279 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0954 0.0954 0.279 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 8.78e-01 0.0076 0.0494 0.28 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 2.32e-01 0.0675 0.0562 0.28 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 1.33e-01 0.156 0.103 0.28 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 2.21e-01 -0.102 0.0831 0.28 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 2.11e-01 0.0895 0.0714 0.28 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0631 0.0536 0.28 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 5.92e-04 -0.245 0.0703 0.28 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 2.09e-01 0.0864 0.0686 0.279 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 3.89e-02 -0.132 0.0637 0.279 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 7.44e-01 -0.022 0.0672 0.279 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.94e-01 0.0515 0.0964 0.279 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 1.27e-01 -0.116 0.076 0.279 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 6.73e-01 0.0264 0.0624 0.279 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 8.20e-02 0.107 0.0613 0.279 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 3.98e-02 -0.181 0.0874 0.279 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 sc-eQTL 4.47e-03 -0.284 0.0987 0.279 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 7.55e-01 0.0274 0.0877 0.28 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0354 0.0813 0.28 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 8.28e-01 0.0166 0.0763 0.28 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 9.51e-01 0.00567 0.0923 0.28 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0609 0.0857 0.28 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 5.40e-02 0.127 0.0653 0.28 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0217 0.0611 0.28 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0616 0.0721 0.28 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 2.29e-01 0.124 0.102 0.281 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0532 0.0866 0.281 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.101 0.281 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 7.82e-01 0.0298 0.108 0.281 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0426 0.0905 0.281 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 6.96e-03 -0.3 0.11 0.281 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 3.95e-01 0.0808 0.0947 0.281 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 5.30e-01 0.0684 0.109 0.281 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0203 0.106 0.281 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 5.41e-01 0.0506 0.0826 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 8.73e-02 0.14 0.0814 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 3.92e-01 0.0834 0.0972 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 1.55e-01 -0.129 0.0904 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.00e-01 0.0102 0.0812 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 1.14e-01 0.13 0.0822 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 1.65e-01 0.127 0.0912 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 1.02e-01 -0.165 0.1 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 5.96e-01 0.0527 0.0993 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 1.54e-01 0.118 0.0827 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 6.36e-01 0.0371 0.0782 0.28 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 1.02e-01 -0.167 0.102 0.28 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 1.34e-01 0.137 0.0907 0.28 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 5.01e-01 0.0493 0.0732 0.28 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 5.84e-01 0.0359 0.0655 0.28 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0113 0.0835 0.28 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.01e-01 -0.124 0.097 0.28 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 9.36e-01 0.0078 0.0973 0.28 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0718 0.0791 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 9.78e-02 0.136 0.0817 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 7.11e-01 0.0383 0.103 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 9.69e-02 -0.141 0.0844 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0657 0.0738 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 1.30e-01 0.12 0.0791 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 1.89e-01 0.115 0.0875 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.23e-01 -0.112 0.0915 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 2.64e-01 0.109 0.097 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 8.43e-01 0.0186 0.0939 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 9.43e-01 0.00625 0.0867 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 2.84e-01 0.105 0.0974 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 8.23e-03 -0.24 0.09 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0164 0.0807 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 6.97e-02 0.143 0.0784 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 3.76e-01 0.0608 0.0685 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 6.50e-03 -0.277 0.101 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0581 0.0982 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 4.13e-01 0.0779 0.095 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0423 0.0958 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 1.69e-01 0.125 0.0909 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00939 0.0927 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 8.31e-02 -0.161 0.0926 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.82e-01 0.00201 0.0908 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 5.87e-01 0.0504 0.0926 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0408 0.103 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 9.51e-01 0.0036 0.0583 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 8.34e-01 0.0115 0.0551 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0623 0.0621 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 4.74e-01 0.068 0.0949 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 1.32e-01 0.101 0.067 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 3.73e-01 0.0498 0.0558 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00076 0.0536 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 3.80e-04 -0.315 0.0874 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 7.85e-01 0.0218 0.0799 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 1.37e-01 -0.0925 0.0619 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 1.59e-01 0.104 0.0736 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.22e-01 0.0639 0.0997 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00228 0.0788 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 5.49e-01 0.0375 0.0625 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0237 0.0601 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 7.57e-04 -0.305 0.0894 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0197 0.0918 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0229 0.0678 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.69e-03 0.234 0.0797 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0345 0.1 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 7.40e-02 -0.163 0.0906 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.16e-02 -0.133 0.0784 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 8.30e-01 0.0174 0.0811 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0587 0.089 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0367 0.0827 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 7.26e-01 0.0282 0.0804 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0673 0.0814 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 1.37e-01 0.147 0.0986 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 2.07e-01 0.113 0.0895 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0106 0.0734 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0061 0.0852 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0615 0.0976 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 1.08e-01 -0.122 0.0753 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0665 0.0745 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 6.25e-01 0.0409 0.0835 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 9.07e-02 0.163 0.096 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 8.03e-02 0.14 0.0799 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 2.11e-01 0.0836 0.0666 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 1.97e-01 0.0941 0.0726 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 7.73e-02 -0.164 0.0924 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 9.68e-01 0.00398 0.1 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0645 0.0858 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.65e-02 -0.201 0.0955 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0197 0.102 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 7.72e-01 0.0288 0.0991 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 6.42e-01 0.0377 0.081 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0119 0.0965 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 1.17e-01 -0.154 0.0982 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 5.60e-01 0.0586 0.1 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 1.41e-01 -0.137 0.0928 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0622 0.0981 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 3.37e-01 0.0999 0.104 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 2.76e-01 0.11 0.101 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.89e-01 0.00129 0.0958 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0847 0.0913 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.64e-01 -0.106 0.0945 0.274 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 5.24e-01 0.0617 0.0966 0.279 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 8.47e-01 -0.017 0.088 0.279 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 5.02e-01 0.0544 0.0809 0.279 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 4.10e-02 0.21 0.102 0.279 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0413 0.0927 0.279 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 7.79e-02 0.131 0.0742 0.279 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00759 0.0917 0.279 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 6.52e-01 0.0423 0.0936 0.279 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 3.41e-02 0.198 0.093 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0668 0.0877 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 9.96e-01 0.000376 0.0855 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.38e-02 -0.2 0.103 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 1.06e-01 -0.14 0.086 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 4.36e-01 0.0721 0.0925 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 1.62e-01 0.137 0.0979 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 8.28e-02 -0.169 0.0972 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0227 0.0913 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 4.34e-01 0.0638 0.0814 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 3.42e-02 -0.152 0.0714 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0103 0.0785 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00875 0.102 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0192 0.0907 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00558 0.0725 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 8.67e-01 0.0117 0.0696 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0288 0.0964 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 sc-eQTL 3.67e-02 -0.206 0.0981 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00475 0.094 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 5.61e-01 -0.054 0.0927 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0153 0.0848 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 9.00e-01 0.0131 0.104 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00863 0.0973 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 7.42e-02 0.155 0.0861 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 2.08e-01 0.122 0.0969 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0419 0.108 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0671 0.0876 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 1.13e-01 0.133 0.0835 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00668 0.0801 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0791 0.0811 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0265 0.0907 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 6.03e-02 -0.175 0.0925 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0336 0.0713 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 8.96e-02 0.139 0.0815 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 4.26e-02 -0.192 0.0942 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 sc-eQTL 5.92e-02 -0.179 0.0943 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0615 0.12 0.278 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 7.17e-01 0.0408 0.112 0.278 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0982 0.103 0.278 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0387 0.117 0.278 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 8.66e-01 0.0164 0.0969 0.278 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 3.54e-01 0.0791 0.085 0.278 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 5.51e-03 0.329 0.116 0.278 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 5.64e-01 0.0677 0.117 0.278 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0676 0.114 0.278 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0503 0.0988 0.28 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0856 0.0905 0.28 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0316 0.0964 0.28 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 1.16e-01 -0.148 0.0937 0.28 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0479 0.0955 0.28 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 1.62e-02 0.183 0.0753 0.28 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0229 0.0704 0.28 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 1.56e-01 0.12 0.0842 0.28 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 5.38e-01 0.0529 0.0859 0.28 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0435 0.0846 0.28 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0216 0.0893 0.28 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0127 0.103 0.28 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0515 0.0955 0.28 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0213 0.073 0.28 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 5.69e-01 -0.045 0.0788 0.28 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 7.46e-03 -0.263 0.0975 0.28 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 3.55e-02 -0.185 0.0873 0.283 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.16e-01 0.0911 0.0906 0.283 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.40e-02 0.193 0.0994 0.283 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0431 0.0851 0.283 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0666 0.102 0.283 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0141 0.0888 0.283 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000269 0.102 0.283 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 5.59e-01 0.0333 0.0569 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 1.20e-01 0.104 0.0666 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0292 0.0996 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 2.46e-01 -0.106 0.091 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00704 0.073 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0113 0.0572 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.22e-02 -0.18 0.0783 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 9.79e-01 0.00195 0.0736 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0251 0.0703 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 8.88e-02 0.183 0.107 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 5.80e-01 -0.055 0.0994 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 4.34e-02 0.17 0.0838 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0552 0.0735 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 5.61e-04 -0.288 0.0821 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 7.87e-01 0.0329 0.122 0.279 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 1.99e-01 0.145 0.112 0.279 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 6.63e-02 -0.216 0.117 0.279 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0888 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 4.05e-01 0.096 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 3.20e-01 -0.109 0.11 0.279 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0687 0.12 0.279 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0477 0.117 0.279 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0743 0.0874 0.278 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 1.65e-01 -0.118 0.0848 0.278 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.28e-01 -0.062 0.098 0.278 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0124 0.103 0.278 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 5.82e-01 0.0493 0.0893 0.278 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 1.06e-01 -0.137 0.0845 0.278 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.27e-01 -0.111 0.0913 0.278 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 3.59e-01 0.0699 0.076 0.276 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 5.47e-01 0.0383 0.0634 0.276 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0159 0.0989 0.276 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 3.11e-01 0.101 0.099 0.276 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00051 0.0868 0.276 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 5.95e-01 0.0451 0.0846 0.276 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 3.34e-02 -0.186 0.0868 0.276 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 1.45e-01 0.158 0.108 0.274 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 1.56e-01 0.149 0.104 0.274 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.69e-02 0.201 0.105 0.274 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0649 0.113 0.274 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000982 0.0914 0.274 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0707 0.108 0.274 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 1.22e-01 -0.173 0.111 0.274 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 4.76e-01 0.0496 0.0696 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 9.85e-01 0.00117 0.0623 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.79e-01 0.0588 0.106 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 7.89e-01 0.0233 0.0869 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 9.14e-01 0.00679 0.0626 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 3.99e-01 0.0481 0.057 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 4.43e-01 0.0565 0.0735 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 1.18e-01 -0.145 0.0925 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 8.26e-01 0.0213 0.0969 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0613 0.0756 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 1.63e-01 0.103 0.0736 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 5.61e-01 0.057 0.098 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 1.25e-02 -0.191 0.076 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 5.77e-01 -0.04 0.0715 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 2.48e-02 0.164 0.0725 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 827890 sc-eQTL 2.87e-01 0.0955 0.0894 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.61e-02 -0.2 0.0893 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 531515 sc-eQTL 7.96e-01 0.024 0.0929 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 9.42e-01 0.00387 0.0529 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 3.98e-01 0.053 0.0626 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 3.92e-01 0.0866 0.101 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 8.15e-02 -0.148 0.0848 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 3.32e-01 0.0702 0.0722 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0587 0.0544 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.05e-03 -0.231 0.0739 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 8.90e-01 0.00964 0.0699 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00798 0.0585 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 7.20e-01 0.0379 0.106 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 2.12e-01 0.121 0.0968 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 7.29e-01 0.0274 0.079 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0718 0.079 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 2.60e-02 -0.185 0.0825 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 601402 sc-eQTL 2.05e-01 0.0892 0.0701 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -39081 sc-eQTL 8.93e-02 -0.11 0.0645 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -617844 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0355 0.0709 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -146642 sc-eQTL 7.01e-01 0.0386 0.1 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -929255 sc-eQTL 2.04e-01 -0.101 0.0795 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 152850 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0116 0.0636 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 88786 sc-eQTL 1.92e-01 0.0802 0.0613 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 63245 sc-eQTL 5.19e-02 -0.178 0.0911 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 sc-eQTL 2.15e-03 -0.307 0.0987 0.28 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 eQTL 0.000801 -0.103 0.0307 0.0 0.00845 0.301


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N 601402 2.67e-07 1.67e-07 4.91e-08 2.45e-07 9.24e-08 8.45e-08 1.73e-07 5.43e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.66e-07 1.05e-07 1.79e-07 8.13e-08 5.98e-08 7.74e-08 4.31e-08 1.4e-07 7.36e-08 4.92e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.87e-08 2.09e-07 1.22e-07 1.1e-07 9.92e-08 1.22e-07 1.07e-07 1.06e-07 4.23e-08 3.96e-08 8.72e-08 4.84e-08 3.2e-08 4.41e-08 9.36e-08 6.71e-08 5.96e-08 5.13e-08 1.59e-07 5.2e-08 1.27e-08 4.67e-08 1.89e-08 1.21e-07 1.88e-09 4.69e-08
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -41035 2.43e-05 2.85e-05 2.98e-06 1.29e-05 3.44e-06 9.68e-06 3.49e-05 3.71e-06 2.27e-05 9.53e-06 2.86e-05 1.04e-05 3.96e-05 9.68e-06 5.1e-06 1.09e-05 1.22e-05 1.75e-05 5.37e-06 4.8e-06 8.88e-06 2.26e-05 2.29e-05 5.76e-06 3.29e-05 5.39e-06 8.26e-06 8.88e-06 2.34e-05 1.81e-05 1.31e-05 1.52e-06 1.71e-06 4.56e-06 8.6e-06 3.93e-06 2.05e-06 2.43e-06 3.44e-06 2.18e-06 1.3e-06 3e-05 2.63e-06 2.81e-07 1.9e-06 2.63e-06 2.32e-06 1.26e-06 7.09e-07