logo

Genes within 1Mb (chr12:93517944:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 8.20e-01 0.0144 0.0632 0.169 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 2.16e-02 0.143 0.0619 0.169 B L1
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0158 0.0948 0.169 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 9.63e-02 -0.131 0.0785 0.169 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0775 0.0703 0.169 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 7.95e-01 0.0162 0.0622 0.169 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 8.82e-01 0.0104 0.0702 0.169 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 8.81e-01 0.0145 0.097 0.169 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 2.27e-01 0.117 0.0962 0.169 B L1
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0609 0.0655 0.169 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 9.98e-01 0.000192 0.0634 0.169 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 2.60e-01 0.0751 0.0664 0.169 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 4.22e-01 0.0877 0.109 0.169 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 6.40e-01 0.0326 0.0697 0.169 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0684 0.0628 0.169 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0266 0.0585 0.169 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0938 0.101 0.169 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0851 0.0732 0.169 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 2.34e-01 -0.1 0.084 0.169 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0722 0.0867 0.169 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00526 0.102 0.169 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.80e-01 0.0572 0.081 0.169 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.98e-01 -0.063 0.0604 0.169 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.41e-01 0.0151 0.0754 0.169 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 6.26e-01 0.0524 0.107 0.169 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 7.91e-01 0.0255 0.096 0.171 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 6.88e-01 0.0417 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0878 0.117 0.171 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00407 0.0924 0.171 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0164 0.0963 0.171 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0137 0.0972 0.171 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0251 0.112 0.171 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 1.90e-01 0.0763 0.058 0.169 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 4.05e-01 0.0554 0.0664 0.169 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 3.62e-01 0.112 0.122 0.169 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 1.56e-01 -0.139 0.0978 0.169 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.70e-01 0.0931 0.0841 0.169 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0652 0.0631 0.169 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0662 0.0851 0.169 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 1.50e-01 0.117 0.0807 0.17 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0721 0.0756 0.17 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 9.56e-01 0.00437 0.0792 0.17 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 5.13e-01 0.0744 0.114 0.17 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 5.78e-01 -0.05 0.0899 0.17 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 4.07e-01 -0.061 0.0734 0.17 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 1.54e-01 0.104 0.0724 0.17 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 1.18e-01 0.162 0.103 0.17 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -53824 sc-eQTL 1.86e-01 -0.157 0.118 0.17 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 5.46e-01 0.0633 0.105 0.169 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 2.80e-01 -0.105 0.0967 0.169 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 9.81e-01 0.00212 0.091 0.169 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 9.93e-01 0.00101 0.11 0.169 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 7.17e-01 0.0371 0.102 0.169 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0366 0.0786 0.169 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0217 0.0729 0.169 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 8.51e-01 0.0162 0.0862 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.44e-01 0.144 0.123 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 3.03e-01 0.107 0.104 0.166 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 6.03e-01 0.0636 0.122 0.166 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 9.27e-01 0.0119 0.13 0.166 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.46e-01 -0.126 0.108 0.166 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0985 0.135 0.166 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 4.45e-01 0.0872 0.114 0.166 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 3.76e-01 0.116 0.131 0.166 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 2.17e-01 -0.157 0.126 0.166 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 6.26e-01 0.0475 0.0972 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 2.57e-01 0.109 0.0961 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 9.45e-01 0.00798 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 2.02e-01 -0.136 0.106 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 6.33e-01 0.0457 0.0954 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0255 0.0972 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 2.24e-01 0.131 0.107 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 9.26e-01 -0.011 0.118 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 4.75e-01 0.0836 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 7.56e-01 0.0307 0.0989 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 2.41e-01 0.109 0.0927 0.17 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 2.54e-01 -0.139 0.121 0.17 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 6.51e-01 0.0492 0.108 0.17 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 6.95e-01 0.0343 0.0872 0.17 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.63e-01 0.0573 0.0779 0.17 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0682 0.0992 0.17 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 7.55e-01 0.0361 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 6.13e-01 0.0587 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 8.47e-02 -0.163 0.0941 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 2.79e-01 0.106 0.0981 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 7.10e-01 -0.046 0.123 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0734 0.101 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 6.67e-02 -0.162 0.0877 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 5.57e-01 0.0558 0.095 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.105 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 3.99e-01 0.0925 0.11 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 6.69e-01 0.0498 0.116 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 4.73e-01 0.0797 0.111 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0443 0.102 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 1.71e-01 0.158 0.115 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 1.64e-01 -0.15 0.108 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0217 0.0955 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 3.16e-01 0.0937 0.0932 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 9.24e-01 0.00775 0.0811 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 1.40e-01 -0.179 0.121 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0178 0.116 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 6.35e-01 0.0538 0.113 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 9.88e-01 0.00166 0.114 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 7.15e-02 0.195 0.108 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0362 0.11 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0589 0.111 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0773 0.108 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0912 0.11 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 4.70e-01 0.0891 0.123 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0561 0.0686 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0184 0.0649 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0328 0.0733 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 2.12e-01 0.14 0.112 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.76e-01 0.0566 0.0793 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 9.33e-01 0.00554 0.0658 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 9.58e-01 0.00332 0.0632 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 3.29e-01 -0.104 0.106 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0911 0.0948 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0251 0.074 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 1.23e-01 0.135 0.0874 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00246 0.119 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0782 0.0935 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0692 0.0742 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0367 0.0715 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 1.78e-01 -0.147 0.109 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.17e-01 -0.136 0.109 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 4.83e-01 0.057 0.0811 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 2.97e-01 0.101 0.097 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 9.37e-01 0.00949 0.12 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0807 0.109 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 4.45e-02 -0.189 0.0935 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0243 0.097 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0608 0.107 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 4.05e-01 0.0819 0.0982 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 3.47e-01 0.0898 0.0953 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 7.56e-01 0.0301 0.0969 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 7.70e-01 0.0345 0.118 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 2.85e-01 0.114 0.106 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0798 0.0871 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0563 0.101 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 3.88e-01 0.1 0.116 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 3.05e-02 -0.196 0.0898 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 2.37e-01 -0.106 0.0891 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 7.48e-01 0.0322 0.1 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 8.66e-01 0.0196 0.116 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 1.67e-01 0.133 0.0961 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 6.75e-01 0.0336 0.0801 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 3.94e-01 0.0745 0.0873 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 9.57e-01 0.00598 0.112 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0555 0.119 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 3.52e-02 -0.214 0.101 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 1.25e-01 -0.176 0.114 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 3.52e-01 -0.113 0.121 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.91e-01 0.0811 0.118 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 6.11e-01 0.0491 0.0963 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0834 0.115 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0217 0.118 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 5.34e-01 0.076 0.122 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 3.42e-01 -0.108 0.113 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 3.91e-01 -0.103 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 5.31e-01 0.0794 0.126 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 6.93e-01 0.0487 0.123 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.75e-02 -0.256 0.115 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.24e-01 0.0247 0.111 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0112 0.115 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 7.92e-01 0.0306 0.116 0.169 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 3.34e-01 -0.102 0.105 0.169 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 8.87e-01 0.0138 0.0972 0.169 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 4.58e-01 0.0918 0.123 0.169 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 5.73e-01 0.0627 0.111 0.169 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0336 0.0897 0.169 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 5.62e-01 0.0638 0.11 0.169 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 2.66e-01 0.125 0.112 0.169 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 1.43e-01 0.162 0.11 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 7.72e-01 0.0299 0.103 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 8.27e-01 0.022 0.1 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 4.32e-01 -0.096 0.122 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 2.44e-01 -0.119 0.101 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00825 0.109 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.67e-01 0.0842 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0886 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -53824 sc-eQTL 8.31e-01 0.0229 0.107 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 4.02e-01 0.0811 0.0965 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0718 0.0854 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0156 0.093 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 6.22e-01 0.0598 0.121 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.62e-01 0.0792 0.107 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.95e-01 -0.09 0.0857 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 6.78e-01 0.0343 0.0825 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 6.40e-02 0.211 0.113 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -53824 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00646 0.118 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 6.74e-01 0.0467 0.111 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0176 0.11 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 9.44e-01 0.00709 0.1 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 6.20e-01 0.0609 0.123 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0952 0.115 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 3.69e-01 0.0921 0.102 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 7.84e-01 0.0316 0.115 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.128 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -53824 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0229 0.104 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 4.60e-02 0.198 0.0988 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 9.98e-01 0.000245 0.0951 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0528 0.0964 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0404 0.108 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 2.19e-01 -0.136 0.11 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 9.02e-02 -0.143 0.0841 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 2.02e-01 0.124 0.0971 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 1.19e-01 0.176 0.112 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -53824 sc-eQTL 2.67e-02 -0.249 0.112 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.13e-01 -0.192 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0609 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 8.83e-01 0.0195 0.133 0.156 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 2.91e-01 0.158 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.45e-01 -0.144 0.123 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.32e-01 0.0233 0.109 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 3.57e-02 0.321 0.151 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 6.15e-01 0.0756 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 6.48e-01 0.0666 0.146 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 5.02e-01 0.0809 0.12 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 1.40e-01 -0.163 0.11 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 9.64e-01 0.00535 0.118 0.17 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 3.44e-01 -0.109 0.115 0.17 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0574 0.116 0.17 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 1.46e-01 0.135 0.0926 0.17 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0184 0.0858 0.17 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 4.36e-01 0.0803 0.103 0.17 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 8.49e-01 0.0194 0.102 0.169 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 9.95e-01 0.000685 0.1 0.169 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 7.79e-01 0.0297 0.106 0.169 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00228 0.122 0.169 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 5.78e-01 0.0631 0.113 0.169 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0532 0.0865 0.169 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.15e-01 0.0219 0.0934 0.169 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0375 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.31e-01 -0.122 0.101 0.173 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00806 0.105 0.173 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0202 0.116 0.173 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 1.47e-01 -0.142 0.0977 0.173 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0348 0.118 0.173 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0149 0.102 0.173 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0236 0.117 0.173 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 4.12e-02 0.136 0.0664 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 4.13e-01 0.0646 0.0788 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0295 0.117 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 3.33e-01 -0.104 0.107 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 5.27e-01 0.0544 0.0858 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0518 0.0672 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0116 0.0933 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 8.10e-01 -0.021 0.0869 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0171 0.083 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 4.65e-01 0.0929 0.127 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0544 0.117 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 3.03e-01 0.103 0.0997 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 7.57e-01 0.0269 0.0869 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 1.82e-01 -0.133 0.0993 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.77e-01 0.153 0.14 0.164 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 8.70e-01 0.0214 0.131 0.164 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 1.14e-02 -0.343 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 2.64e-01 -0.15 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 8.28e-01 0.0291 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 1.70e-01 -0.175 0.127 0.164 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0749 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 2.95e-01 0.142 0.136 0.164 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 6.53e-01 0.0474 0.105 0.171 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 9.64e-01 0.00467 0.103 0.171 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 2.77e-01 -0.128 0.118 0.171 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 3.97e-02 -0.253 0.122 0.171 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0154 0.108 0.171 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0791 0.102 0.171 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 9.80e-01 0.0027 0.11 0.171 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.02e-01 0.115 0.0898 0.167 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 2.58e-01 0.085 0.075 0.167 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 4.30e-01 0.0924 0.117 0.167 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 9.25e-01 0.011 0.118 0.167 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 9.12e-01 0.0114 0.103 0.167 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0654 0.1 0.167 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0698 0.104 0.167 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.38e-01 0.147 0.124 0.178 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 7.29e-01 0.0417 0.12 0.178 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 6.70e-01 0.0518 0.121 0.178 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.65e-01 0.0944 0.129 0.178 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0709 0.104 0.178 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 3.38e-01 0.119 0.123 0.178 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0396 0.128 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 4.50e-01 0.0616 0.0814 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 1.72e-01 0.0994 0.0725 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0695 0.124 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0591 0.102 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 9.27e-01 0.00677 0.0733 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 5.33e-01 0.0417 0.0667 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 7.11e-01 0.0319 0.0861 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 6.03e-01 0.0566 0.109 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 4.93e-01 0.0777 0.113 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0882 0.0897 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 1.97e-01 0.113 0.0875 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 7.77e-01 0.033 0.116 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 1.60e-01 -0.129 0.0912 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 1.70e-01 -0.117 0.0846 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 2.51e-01 0.1 0.0869 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 815101 sc-eQTL 5.84e-01 0.0584 0.106 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00981 0.107 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 518726 sc-eQTL 8.29e-01 0.0238 0.11 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 2.29e-01 0.0749 0.062 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 6.16e-01 0.037 0.0737 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 8.25e-01 0.0263 0.119 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 3.15e-01 -0.101 0.1 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 2.81e-01 0.0918 0.0849 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0529 0.064 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 6.12e-01 -0.045 0.0888 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 3.70e-01 0.074 0.0823 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 4.29e-01 0.0546 0.0689 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 5.35e-01 0.0775 0.125 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0848 0.114 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 7.74e-01 0.0268 0.0933 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 1.53e-01 -0.133 0.0929 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0331 0.0985 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 588613 sc-eQTL 1.27e-01 0.127 0.0827 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -51870 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0757 0.0766 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -630633 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0307 0.0839 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -159431 sc-eQTL 7.64e-01 0.0356 0.119 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -942044 sc-eQTL 6.34e-01 -0.045 0.0943 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 140061 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0968 0.075 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 75997 sc-eQTL 3.48e-01 0.0684 0.0726 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 50456 sc-eQTL 7.58e-02 0.192 0.108 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -53824 sc-eQTL 1.08e-01 -0.191 0.119 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 140061 eQTL 0.000108 -0.0889 0.0229 0.0 0.0 0.2
ENSG00000198015 MRPL42 50456 eQTL 7.76e-10 0.148 0.0238 0.0307 0.0 0.2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -53824 eQTL 0.0158 -0.0815 0.0337 0.0 0.0 0.2
ENSG00000278916 CEP83-DT -942059 eQTL 0.00338 -0.127 0.0432 0.00157 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 140061 4.18e-06 4.89e-06 7.1e-07 3.14e-06 1.75e-06 1.74e-06 4.29e-06 1.29e-06 5.18e-06 2.65e-06 5.69e-06 3.27e-06 7.06e-06 2.22e-06 1.29e-06 3.81e-06 1.96e-06 3.43e-06 1.44e-06 1.44e-06 2.71e-06 4.95e-06 4e-06 1.47e-06 6.44e-06 2.01e-06 2.24e-06 1.55e-06 4.58e-06 4.12e-06 2.75e-06 4.51e-07 7.38e-07 1.65e-06 1.98e-06 1.17e-06 1.06e-06 5.42e-07 8.5e-07 5.94e-07 8.2e-07 5.27e-06 4.01e-07 1.88e-07 7.82e-07 1.08e-06 1.15e-06 6.72e-07 5.83e-07
ENSG00000198015 MRPL42 50456 1.05e-05 1.26e-05 2.59e-06 7.89e-06 2.57e-06 5.83e-06 1.56e-05 3.25e-06 1.29e-05 6.72e-06 1.71e-05 6.86e-06 2.13e-05 4.48e-06 4.27e-06 8.06e-06 6.4e-06 1.11e-05 4.09e-06 4.22e-06 7e-06 1.21e-05 1.14e-05 4.56e-06 2.16e-05 5.11e-06 7.69e-06 6.08e-06 1.44e-05 1.15e-05 8.13e-06 9.55e-07 1.42e-06 4.05e-06 6.37e-06 3.35e-06 1.81e-06 2.64e-06 2.23e-06 2.02e-06 1.66e-06 1.45e-05 1.63e-06 4.31e-07 1.67e-06 2.6e-06 2.53e-06 1.17e-06 9.89e-07
ENSG00000258365 \N -764900 3.07e-07 1.51e-07 6.57e-08 2.31e-07 1.07e-07 7.75e-08 2.16e-07 5.89e-08 1.71e-07 1.03e-07 1.69e-07 1.31e-07 2.13e-07 8e-08 5.97e-08 9.01e-08 4.63e-08 1.91e-07 7.27e-08 6.58e-08 1.27e-07 1.65e-07 1.64e-07 4.07e-08 2.17e-07 1.51e-07 1.25e-07 1.28e-07 1.37e-07 1.24e-07 1.21e-07 5.08e-08 4.74e-08 9.08e-08 5.41e-08 3.43e-08 5.26e-08 5.36e-08 6.33e-08 8.61e-08 4.9e-08 1.5e-07 3.25e-08 1.76e-08 6.21e-08 9.86e-09 7.8e-08 0.0 4.61e-08