Genes within 1Mb (chr12:93487798:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 8.00e-01 0.0161 0.0634 0.167 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 2.00e-02 0.145 0.0621 0.167 B L1
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0242 0.0952 0.167 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 1.33e-01 -0.119 0.079 0.167 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.58e-01 -0.08 0.0706 0.167 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.47e-01 0.0121 0.0624 0.167 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 7.70e-01 0.0206 0.0704 0.167 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 9.03e-01 0.0119 0.0974 0.167 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 2.36e-01 0.115 0.0966 0.167 B L1
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0548 0.0657 0.167 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0025 0.0637 0.167 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 2.25e-01 0.0811 0.0666 0.167 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 5.33e-01 0.0683 0.109 0.167 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 7.54e-01 0.022 0.07 0.167 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0726 0.063 0.167 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0168 0.0587 0.167 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 3.52e-01 -0.095 0.102 0.167 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0758 0.0736 0.167 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0905 0.0845 0.167 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 3.77e-01 -0.077 0.0871 0.167 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 8.60e-01 0.0181 0.103 0.167 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 5.21e-01 0.0524 0.0814 0.167 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0651 0.0607 0.167 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 7.61e-01 0.0231 0.0758 0.167 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 7.05e-01 0.0409 0.108 0.167 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 8.02e-01 0.0242 0.0962 0.169 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.26e-01 0.0364 0.104 0.169 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0894 0.117 0.169 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0926 0.169 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0161 0.0965 0.169 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0164 0.0975 0.169 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0222 0.112 0.169 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 1.88e-01 0.0766 0.058 0.167 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 3.97e-01 0.0563 0.0664 0.167 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 4.73e-01 0.0879 0.122 0.167 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 1.64e-01 -0.137 0.0979 0.167 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 3.18e-01 0.0844 0.0842 0.167 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 4.39e-01 -0.049 0.0633 0.167 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0501 0.0852 0.167 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 8.28e-02 0.141 0.0807 0.167 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 3.78e-01 -0.067 0.0759 0.167 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0246 0.0793 0.167 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 7.66e-01 0.034 0.114 0.167 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0713 0.0901 0.167 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0433 0.0737 0.167 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 1.08e-01 0.117 0.0725 0.167 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 4.70e-02 0.206 0.103 0.167 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -83970 sc-eQTL 2.71e-01 -0.131 0.118 0.167 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 6.38e-01 0.0494 0.105 0.167 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0957 0.097 0.167 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 8.39e-01 0.0185 0.0912 0.167 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00642 0.11 0.167 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 6.58e-01 0.0455 0.103 0.167 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 7.90e-01 -0.021 0.0788 0.167 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0166 0.073 0.167 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 9.12e-01 0.00957 0.0864 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 1.93e-01 0.161 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 3.11e-01 0.106 0.104 0.163 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 5.27e-01 0.0776 0.123 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 8.68e-01 0.0216 0.13 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.46e-01 -0.127 0.109 0.163 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0826 0.135 0.163 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 4.30e-01 0.0905 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 3.61e-01 0.12 0.131 0.163 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 2.25e-01 -0.155 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 6.88e-01 0.0392 0.0975 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 3.04e-01 0.0994 0.0964 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00979 0.115 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 2.75e-01 -0.117 0.107 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 7.14e-01 0.0351 0.0957 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0211 0.0975 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 1.96e-01 0.14 0.108 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0204 0.119 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 3.50e-01 0.11 0.117 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 6.60e-01 0.0438 0.0992 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 2.94e-01 0.098 0.0932 0.168 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 2.63e-01 -0.137 0.122 0.168 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 6.25e-01 0.0532 0.109 0.168 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 6.46e-01 0.0402 0.0875 0.168 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 4.36e-01 0.0611 0.0782 0.168 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0611 0.0997 0.168 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 7.12e-01 0.0429 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 6.40e-01 0.0544 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 8.14e-02 -0.165 0.0944 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.0984 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0474 0.124 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0655 0.102 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 6.58e-02 -0.163 0.088 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 6.48e-01 0.0436 0.0953 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 2.93e-01 0.111 0.105 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 4.27e-01 0.0876 0.11 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 7.94e-01 0.0305 0.117 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 4.55e-01 0.0832 0.111 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 6.97e-01 -0.04 0.103 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 1.85e-01 0.153 0.115 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 2.17e-01 -0.134 0.108 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 7.86e-01 -0.026 0.0958 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 3.52e-01 0.0872 0.0935 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00587 0.0814 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 1.22e-01 -0.188 0.121 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0252 0.117 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 5.43e-01 0.0691 0.113 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000694 0.114 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 6.47e-02 0.201 0.108 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0555 0.11 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0489 0.111 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0752 0.108 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 3.66e-01 -0.1 0.11 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 3.68e-01 0.111 0.123 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 4.78e-01 -0.049 0.0689 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0222 0.0651 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0297 0.0736 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.112 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 5.27e-01 0.0504 0.0796 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 9.18e-01 0.00683 0.0661 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.88e-01 0.00898 0.0634 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 3.19e-01 -0.106 0.106 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0974 0.0952 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0212 0.0743 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 1.05e-01 0.143 0.0877 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 9.76e-01 0.00358 0.119 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0963 0.0939 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0884 0.0744 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0187 0.0718 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 1.53e-01 -0.156 0.109 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.58e-01 -0.125 0.11 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 4.50e-01 0.0616 0.0814 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 2.53e-01 0.112 0.0973 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 7.83e-01 0.0331 0.12 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 4.88e-01 -0.076 0.109 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 5.34e-02 -0.182 0.0939 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 7.58e-01 -0.03 0.0974 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0425 0.107 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 4.70e-01 0.0714 0.0987 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 3.60e-01 0.0878 0.0957 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.01e-01 0.0374 0.0973 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 6.88e-01 0.0476 0.118 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 2.27e-01 0.129 0.107 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0582 0.0875 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0408 0.102 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 3.68e-01 0.105 0.116 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 5.50e-02 -0.174 0.0903 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0961 0.0895 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 8.89e-01 0.0141 0.1 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 8.06e-01 0.0286 0.116 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 2.09e-01 0.122 0.0965 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 6.37e-01 0.0379 0.0804 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 4.00e-01 0.0738 0.0876 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 9.72e-01 0.004 0.112 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0537 0.119 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 2.95e-02 -0.222 0.101 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 1.11e-01 -0.183 0.114 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 3.63e-01 -0.111 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 4.77e-01 0.0842 0.118 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 6.52e-01 0.0437 0.0967 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.21e-01 -0.074 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 7.35e-01 -0.04 0.118 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 5.03e-01 0.0823 0.122 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0979 0.114 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0798 0.12 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 3.71e-01 0.114 0.127 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 8.03e-01 0.031 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 9.06e-03 -0.303 0.115 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 6.66e-01 0.0483 0.112 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0471 0.116 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 8.71e-01 0.019 0.116 0.167 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0865 0.106 0.167 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.38e-01 0.0326 0.0975 0.167 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 4.84e-01 0.0868 0.124 0.167 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 5.33e-01 0.0697 0.112 0.167 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0203 0.09 0.167 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 4.55e-01 0.0826 0.11 0.167 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 2.48e-01 0.13 0.112 0.167 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 1.43e-01 0.162 0.11 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 7.72e-01 0.0299 0.103 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 8.27e-01 0.022 0.1 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 4.32e-01 -0.096 0.122 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 2.44e-01 -0.119 0.101 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00825 0.109 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 4.67e-01 0.0842 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0886 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -83970 sc-eQTL 8.31e-01 0.0229 0.107 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.60e-01 0.109 0.0966 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0731 0.0856 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0223 0.0933 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 8.60e-01 0.0214 0.122 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 4.69e-01 0.0782 0.108 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0689 0.086 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.47e-01 0.0499 0.0827 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 3.47e-02 0.241 0.113 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -83970 sc-eQTL 9.90e-01 0.00149 0.118 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 6.74e-01 0.0467 0.111 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0176 0.11 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 9.44e-01 0.00709 0.1 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 6.20e-01 0.0609 0.123 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0952 0.115 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 3.69e-01 0.0921 0.102 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 7.84e-01 0.0316 0.115 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 4.19e-01 0.103 0.128 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -83970 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0229 0.104 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 3.46e-02 0.21 0.0988 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 8.74e-01 0.0151 0.0953 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0637 0.0965 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0594 0.108 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 1.44e-01 -0.162 0.11 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 1.22e-01 -0.131 0.0844 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 2.54e-01 0.111 0.0973 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 6.53e-02 0.208 0.112 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -83970 sc-eQTL 3.79e-02 -0.234 0.112 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 1.64e-01 -0.216 0.154 0.152 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0511 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0627 0.134 0.152 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 1.98e-01 0.194 0.15 0.152 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.70e-01 -0.138 0.125 0.152 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.85e-01 0.016 0.11 0.152 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 2.24e-02 0.352 0.152 0.152 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 5.46e-01 0.0917 0.151 0.152 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 4.59e-01 0.109 0.147 0.152 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 3.55e-01 0.112 0.121 0.167 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 1.23e-01 -0.17 0.11 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00143 0.118 0.167 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0796 0.115 0.167 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0339 0.117 0.167 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 1.47e-01 0.135 0.0929 0.167 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0123 0.0861 0.167 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 4.81e-01 0.0729 0.103 0.167 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 8.62e-01 0.0177 0.102 0.167 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 9.67e-01 0.00413 0.1 0.167 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.74e-01 0.0304 0.106 0.167 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0111 0.122 0.167 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 5.29e-01 0.0714 0.113 0.167 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0803 0.0864 0.167 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.91e-01 0.0129 0.0934 0.167 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00765 0.118 0.167 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.31e-01 -0.122 0.101 0.173 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00806 0.105 0.173 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0202 0.116 0.173 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 1.47e-01 -0.142 0.0977 0.173 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0348 0.118 0.173 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0149 0.102 0.173 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0236 0.117 0.173 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.66e-02 0.148 0.0663 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 3.32e-01 0.0765 0.0788 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0468 0.117 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 2.85e-01 -0.115 0.107 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 4.19e-01 0.0696 0.0858 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0375 0.0673 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 9.24e-01 0.00893 0.0934 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0364 0.0871 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0328 0.0832 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 5.07e-01 0.0846 0.127 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0387 0.118 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 4.21e-01 0.0807 0.1 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 6.69e-01 0.0373 0.0871 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 1.84e-01 -0.133 0.0996 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.77e-01 0.153 0.14 0.164 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 8.70e-01 0.0214 0.131 0.164 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 1.14e-02 -0.343 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 2.64e-01 -0.15 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 8.28e-01 0.0291 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 1.70e-01 -0.175 0.127 0.164 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0749 0.139 0.164 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 2.95e-01 0.142 0.136 0.164 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 8.10e-01 0.0254 0.106 0.169 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.91e-01 0.0272 0.103 0.169 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 2.32e-01 -0.141 0.118 0.169 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 5.17e-02 -0.24 0.123 0.169 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0415 0.108 0.169 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0678 0.102 0.169 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0133 0.11 0.169 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.02e-01 0.115 0.0898 0.167 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 2.58e-01 0.085 0.075 0.167 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 4.30e-01 0.0924 0.117 0.167 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 9.25e-01 0.011 0.118 0.167 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 9.12e-01 0.0114 0.103 0.167 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0654 0.1 0.167 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0698 0.104 0.167 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.38e-01 0.147 0.124 0.178 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 7.29e-01 0.0417 0.12 0.178 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 6.70e-01 0.0518 0.121 0.178 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 4.65e-01 0.0944 0.129 0.178 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0709 0.104 0.178 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 3.38e-01 0.119 0.123 0.178 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0396 0.128 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 3.99e-01 0.0689 0.0816 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 2.08e-01 0.0919 0.0728 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0734 0.124 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 6.59e-01 -0.045 0.102 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 9.32e-01 0.00626 0.0735 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 4.56e-01 0.05 0.0669 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 6.60e-01 0.038 0.0863 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 5.97e-01 0.0578 0.109 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 3.82e-01 0.0995 0.114 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0871 0.09 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 1.51e-01 0.126 0.0877 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 8.08e-01 0.0284 0.117 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 2.09e-01 -0.115 0.0915 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 1.65e-01 -0.118 0.0849 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 3.19e-01 0.0872 0.0873 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 784955 sc-eQTL 6.34e-01 0.0509 0.107 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0185 0.108 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 488580 sc-eQTL 9.21e-01 0.011 0.111 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 2.29e-01 0.075 0.0621 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 5.82e-01 0.0406 0.0738 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 9.09e-01 0.0136 0.119 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0995 0.1 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.98e-01 0.0888 0.0851 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0373 0.0642 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0326 0.089 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 3.84e-01 0.0718 0.0823 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 4.18e-01 0.056 0.0689 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 6.16e-01 0.0626 0.125 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0865 0.115 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 8.57e-01 0.0169 0.0933 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 2.01e-01 -0.119 0.093 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0351 0.0985 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 558467 sc-eQTL 6.84e-02 0.151 0.0827 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -82016 sc-eQTL 3.70e-01 -0.069 0.0768 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -660779 sc-eQTL 5.52e-01 -0.05 0.084 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -189577 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00382 0.119 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -972190 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0596 0.0945 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 109915 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0792 0.0752 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 45851 sc-eQTL 2.81e-01 0.0787 0.0727 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 20310 sc-eQTL 3.45e-02 0.229 0.108 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -83970 sc-eQTL 1.63e-01 -0.167 0.119 0.168 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 109915 eQTL 0.000129 -0.0874 0.0227 0.0 0.0 0.201
ENSG00000198015 MRPL42 20310 eQTL 2.88e-10 0.151 0.0237 0.0198 0.0 0.201
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -83970 eQTL 0.0171 -0.0801 0.0335 0.0 0.0 0.201
ENSG00000278916 CEP83-DT -972205 eQTL 0.0083 -0.114 0.043 0.00101 0.0 0.201


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina