logo

Genes within 1Mb (chr1:29538595:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 1.10e-02 0.156 0.0609 0.297 B L1
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0326 0.0737 0.297 B L1
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0189 0.0563 0.297 B L1
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 2.30e-01 0.0698 0.058 0.297 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0807 0.0854 0.297 B L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0213 0.0637 0.297 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 8.93e-01 0.00793 0.0591 0.297 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 3.59e-01 0.0533 0.058 0.297 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0612 0.0883 0.297 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 3.91e-01 0.0506 0.059 0.297 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0223 0.0822 0.297 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0543 0.0428 0.297 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0343 0.0463 0.297 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0915 0.0698 0.297 CD4T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 4.80e-01 0.0475 0.0671 0.297 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.83e-01 0.0134 0.0487 0.297 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 2.00e-01 0.0666 0.0518 0.297 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 6.63e-01 0.0383 0.0877 0.297 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 7.14e-01 0.0236 0.0642 0.297 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 8.75e-01 0.0136 0.086 0.297 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0361 0.0533 0.297 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 8.33e-02 -0.0904 0.0519 0.297 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0769 0.08 0.297 CD8T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0068 0.0685 0.297 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.81e-01 0.0162 0.058 0.297 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 6.39e-01 0.0296 0.0631 0.297 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 3.26e-01 0.0854 0.0867 0.291 DC L1
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0675 0.0959 0.291 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 9.90e-01 0.00102 0.0855 0.291 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 7.86e-02 -0.15 0.0848 0.291 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 4.22e-03 -0.261 0.09 0.291 DC L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0363 0.0906 0.291 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 5.70e-01 0.054 0.0949 0.291 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 8.26e-01 -0.015 0.0684 0.291 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0928 0.0596 0.297 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0272 0.0882 0.297 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 1.85e-01 0.0793 0.0596 0.297 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 3.12e-01 0.0683 0.0673 0.297 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0499 0.0746 0.297 Mono L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 8.06e-01 0.016 0.0651 0.297 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 5.43e-01 0.0406 0.0666 0.297 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0235 0.0661 0.297 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 6.13e-01 0.0345 0.068 0.296 NK L1
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 2.85e-01 0.0956 0.0893 0.296 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0284 0.0517 0.296 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0212 0.0609 0.296 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 2.45e-01 0.0945 0.0811 0.296 NK L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0536 0.0836 0.296 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00594 0.0602 0.296 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00338 0.0711 0.296 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 6.09e-02 0.121 0.0645 0.297 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00649 0.0771 0.297 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 4.43e-01 0.0538 0.07 0.297 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0168 0.0699 0.297 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 4.96e-02 0.172 0.087 0.297 Other_T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.49e-01 0.0315 0.0692 0.297 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0236 0.0671 0.297 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 2.70e-01 0.0765 0.0692 0.297 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 2.52e-02 0.243 0.108 0.298 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 1.41e-01 -0.144 0.0975 0.298 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 7.61e-02 -0.177 0.0994 0.298 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0803 0.0969 0.298 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 7.60e-01 0.0324 0.106 0.298 B_Activated L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0337 0.107 0.298 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 2.77e-01 -0.115 0.106 0.298 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 2.11e-01 -0.138 0.11 0.298 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0429 0.0848 0.298 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 5.95e-01 0.042 0.079 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 1.22e-01 -0.142 0.0917 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.09e-01 0.0533 0.0806 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 2.83e-01 0.0781 0.0726 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.30e-01 0.146 0.0963 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.09e-01 0.0469 0.0915 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 9.02e-01 0.00859 0.0697 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 3.21e-01 0.0801 0.0805 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 5.65e-01 0.0513 0.0889 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 8.90e-01 0.0114 0.0825 0.297 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0883 0.0929 0.297 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.74e-01 0.0487 0.0864 0.297 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 6.53e-01 0.0354 0.0787 0.297 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0146 0.0897 0.297 B_Memory L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 4.03e-01 0.0735 0.0878 0.297 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0545 0.0817 0.297 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0436 0.0888 0.297 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 6.49e-01 0.0392 0.086 0.297 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 4.92e-01 0.0486 0.0707 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0669 0.093 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.20e-01 0.0488 0.0758 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 3.57e-01 0.0612 0.0663 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0369 0.0861 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 2.14e-01 0.106 0.0852 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 8.12e-01 0.0153 0.0641 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 4.86e-02 0.155 0.078 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 2.79e-01 -0.1 0.0925 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 8.23e-04 0.264 0.0779 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 8.64e-02 0.16 0.0927 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.78e-01 -0.049 0.088 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00576 0.0819 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.97e-01 0.123 0.0954 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0941 0.0827 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0582 0.0923 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 9.96e-02 0.148 0.0895 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0246 0.0933 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00794 0.0922 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 3.22e-01 0.0926 0.0933 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 2.38e-01 -0.111 0.094 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0927 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0439 0.0986 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0581 0.0956 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 5.49e-01 0.0557 0.0928 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0346 0.0858 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0283 0.0775 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 1.25e-01 0.0929 0.0604 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 8.52e-01 0.0163 0.0873 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0386 0.0506 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0277 0.0462 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 9.48e-02 -0.128 0.0764 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 3.36e-01 0.0747 0.0775 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0223 0.0496 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 3.72e-01 0.0477 0.0532 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 8.24e-01 0.0206 0.0927 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 4.73e-01 0.051 0.0708 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 5.34e-01 0.0595 0.0954 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0315 0.0563 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 5.98e-01 0.0283 0.0536 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0304 0.0818 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 1.76e-01 0.113 0.0829 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0225 0.0594 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 8.45e-01 0.0137 0.0701 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 1.53e-01 0.138 0.0961 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 5.17e-01 0.0558 0.0859 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 6.12e-01 0.0481 0.0948 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0259 0.0771 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0435 0.0707 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0983 0.0908 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 7.76e-01 0.0267 0.0937 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 6.94e-02 -0.128 0.0701 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0201 0.0823 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 8.23e-01 0.0193 0.0863 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 5.45e-01 0.0466 0.0768 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0383 0.0906 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0484 0.0737 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0358 0.0689 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 2.25e-01 -0.104 0.0856 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 2.46e-01 0.0974 0.0837 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00134 0.0787 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 4.87e-01 0.0565 0.0811 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0283 0.0794 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 3.32e-01 0.0847 0.0872 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 7.41e-01 0.0214 0.0647 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 7.79e-02 -0.106 0.0596 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0239 0.0884 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.81e-01 0.0366 0.0887 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0467 0.0624 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00413 0.0646 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 8.98e-01 0.0124 0.0972 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 7.93e-01 0.0254 0.0965 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 1.52e-01 -0.121 0.0843 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 9.38e-01 0.00571 0.0729 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 3.84e-01 0.0861 0.0987 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 2.87e-01 0.108 0.101 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 2.65e-01 0.0942 0.0842 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 1.33e-01 -0.136 0.0899 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0101 0.0897 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0322 0.0947 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0889 0.0886 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0492 0.0945 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0376 0.0979 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 9.27e-01 0.00878 0.0957 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0817 0.084 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00366 0.0951 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 7.06e-02 0.157 0.0862 0.297 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 2.66e-01 -0.109 0.0973 0.297 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.14e-01 0.0534 0.0816 0.297 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 8.08e-02 0.143 0.0816 0.297 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 4.40e-01 0.0747 0.0967 0.297 MAIT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0135 0.0961 0.297 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 3.81e-01 0.0812 0.0925 0.297 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 1.87e-01 0.115 0.0872 0.297 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 2.60e-02 0.21 0.0935 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 8.66e-01 0.0159 0.0939 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 9.63e-01 0.00417 0.0885 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0569 0.0827 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 4.03e-01 0.0816 0.0974 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.97e-01 0.0373 0.0956 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.75e-01 0.0249 0.0871 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0345 0.0943 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0335 0.0694 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 5.81e-02 0.179 0.0937 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 3.52e-01 0.0606 0.0649 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0432 0.0658 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 6.34e-01 0.0437 0.0915 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0314 0.0909 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0339 0.0732 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 7.85e-02 0.142 0.0804 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00815 0.0932 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0933 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0365 0.096 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 2.99e-01 0.0913 0.0876 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.101 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0897 0.102 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0289 0.0932 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0787 0.0981 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 4.93e-01 0.0532 0.0775 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00767 0.096 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 1.03e-01 -0.12 0.0731 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0706 0.0741 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.58e-01 0.127 0.0897 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0451 0.0884 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 4.96e-01 0.0477 0.0699 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 1.93e-02 -0.198 0.0839 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 8.11e-01 0.0262 0.109 0.285 PB L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0589 0.0984 0.285 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0816 0.092 0.285 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0574 0.111 0.285 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0418 0.113 0.285 PB L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0554 0.107 0.285 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0406 0.114 0.285 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 4.38e-01 -0.073 0.0937 0.285 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 5.42e-02 0.206 0.106 0.285 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 2.00e-01 0.0988 0.0769 0.3 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 2.41e-01 0.0925 0.0786 0.3 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 9.37e-01 0.00682 0.0865 0.3 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00143 0.0804 0.3 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0953 0.3 Pro_T L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 2.12e-01 0.102 0.0813 0.3 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0409 0.084 0.3 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00979 0.0795 0.3 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 9.22e-01 0.00815 0.0832 0.297 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 2.30e-01 -0.12 0.0999 0.297 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 1.21e-01 -0.128 0.0821 0.297 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 1.04e-01 -0.113 0.0695 0.297 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 5.17e-01 0.06 0.0925 0.297 Treg L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0105 0.0962 0.297 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.40e-02 0.123 0.0684 0.297 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0711 0.0927 0.297 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 8.44e-01 0.0179 0.091 0.297 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 6.50e-01 0.0414 0.0911 0.29 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 7.09e-01 0.0383 0.102 0.29 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 6.63e-01 0.0411 0.0942 0.29 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 7.53e-02 -0.153 0.0855 0.29 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 2.17e-03 -0.309 0.0994 0.29 cDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0667 0.101 0.29 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 8.61e-01 0.0164 0.0935 0.29 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 7.39e-01 0.0292 0.0873 0.29 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 1.04e-01 -0.118 0.0726 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 3.93e-01 0.0772 0.0902 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 5.92e-01 0.0369 0.0688 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 3.35e-01 0.0637 0.0659 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 2.18e-01 -0.099 0.0801 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 4.92e-01 0.0486 0.0706 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 3.03e-01 0.0747 0.0723 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0234 0.0685 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 1.27e-01 -0.106 0.069 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0554 0.0915 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 2.42e-01 0.102 0.0867 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 6.68e-01 0.0361 0.0839 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 9.34e-01 0.00737 0.0884 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0421 0.0849 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 4.08e-01 0.071 0.0858 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0614 0.0932 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 5.45e-01 0.0736 0.121 0.3 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 8.68e-01 0.0202 0.121 0.3 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0172 0.115 0.3 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 5.70e-01 0.0603 0.106 0.3 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.30e-02 0.283 0.112 0.3 gdT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0366 0.109 0.3 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 1.52e-02 -0.258 0.105 0.3 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 4.03e-01 0.0994 0.119 0.3 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 9.79e-01 0.00223 0.0864 0.296 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0571 0.0916 0.296 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 2.74e-01 0.0898 0.0818 0.296 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 9.22e-01 0.00876 0.0893 0.296 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0764 0.0915 0.296 intMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 6.23e-03 0.251 0.0907 0.296 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 3.00e-01 0.0929 0.0895 0.296 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 2.39e-01 0.113 0.0956 0.296 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 1.77e-01 -0.121 0.089 0.296 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0198 0.0964 0.296 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 2.59e-01 -0.101 0.0888 0.296 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0964 0.296 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00627 0.099 0.296 ncMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 1.56e-01 0.131 0.0919 0.296 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0375 0.081 0.296 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0818 0.0913 0.296 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 6.12e-01 0.0553 0.109 0.277 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 4.80e-02 -0.221 0.111 0.277 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 3.58e-02 0.227 0.107 0.277 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0133 0.107 0.277 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 3.01e-01 -0.115 0.111 0.277 pDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0276 0.104 0.277 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 4.86e-01 0.0719 0.103 0.277 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0172 0.0851 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 6.53e-01 0.0332 0.0737 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 6.77e-02 -0.166 0.0903 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00413 0.0732 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 8.42e-01 0.013 0.0653 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 6.39e-01 0.0411 0.0874 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 4.08e-01 0.068 0.0819 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 9.44e-01 0.00448 0.0636 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 7.79e-01 0.0214 0.0763 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 5.62e-01 0.0528 0.0909 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 2.38e-03 0.2 0.0652 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 6.00e-01 0.0456 0.0868 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 8.02e-01 -0.018 0.0716 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 7.30e-01 0.022 0.0637 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 7.72e-01 -0.026 0.0897 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 7.98e-01 0.0197 0.077 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0507 0.0635 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 3.92e-02 0.154 0.0742 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 895367 sc-eQTL 2.46e-01 -0.108 0.0928 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 8.44e-02 -0.112 0.0645 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 7.87e-01 0.0234 0.0868 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 1.52e-01 0.0929 0.0646 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 3.10e-01 0.0654 0.0643 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0984 0.0733 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0144 0.0666 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 3.27e-01 0.0698 0.071 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0268 0.069 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 2.94e-01 -0.082 0.0779 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0287 0.089 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 2.77e-01 0.0854 0.0783 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0776 0.0901 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0252 0.0885 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 2.91e-02 0.199 0.0906 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 4.66e-01 0.0616 0.0843 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0156 0.0912 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 356695 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0299 0.0666 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 307653 sc-eQTL 1.98e-01 0.118 0.0914 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 895510 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0277 0.0536 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 651504 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00849 0.0625 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 869863 sc-eQTL 1.80e-01 0.114 0.0847 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 985510 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0757 0.0849 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 955463 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0244 0.0637 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 801974 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0128 0.0715 0.295 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116350 SRSF4 356695 eQTL 0.0047 0.0316 0.0112 0.0 0.0 0.284
ENSG00000116353 MECR 307653 eQTL 0.000771 0.0688 0.0204 0.00702 0.00638 0.284
ENSG00000188060 RAB42 946395 eQTL 4.39e-02 -0.0858 0.0425 0.00163 0.0 0.284
ENSG00000274978 RNU11 889995 eQTL 0.0327 -0.0746 0.0349 0.0 0.0 0.284
ENSG00000279443 AL513497.1 994135 eQTL 0.0781 0.0673 0.0382 0.00127 0.0 0.284

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116353 MECR 307653 1.2e-06 9e-07 3e-07 3.15e-07 1.79e-07 3.36e-07 7.96e-07 2.84e-07 9.89e-07 3.13e-07 1.1e-06 5.73e-07 1.43e-06 2.29e-07 4.26e-07 5.7e-07 7.43e-07 5.33e-07 3.98e-07 4.12e-07 2.83e-07 7.73e-07 6.11e-07 4.59e-07 1.59e-06 2.54e-07 5.76e-07 4.75e-07 7.61e-07 9.93e-07 4.61e-07 3.82e-08 1.37e-07 3.28e-07 3.29e-07 3.21e-07 2.96e-07 1.53e-07 1.24e-07 1.86e-08 1.92e-07 1.09e-06 6.53e-08 1.28e-08 1.73e-07 6.12e-08 1.85e-07 8.51e-08 8.83e-08