Genes within 1Mb (chr1:29535919:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 1.10e-02 0.156 0.0609 0.297 B L1
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0326 0.0737 0.297 B L1
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0189 0.0563 0.297 B L1
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 2.30e-01 0.0698 0.058 0.297 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0807 0.0854 0.297 B L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0213 0.0637 0.297 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 8.93e-01 0.00793 0.0591 0.297 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 3.59e-01 0.0533 0.058 0.297 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0612 0.0883 0.297 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 3.91e-01 0.0506 0.059 0.297 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0223 0.0822 0.297 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0543 0.0428 0.297 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0343 0.0463 0.297 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0915 0.0698 0.297 CD4T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 4.80e-01 0.0475 0.0671 0.297 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.83e-01 0.0134 0.0487 0.297 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 2.00e-01 0.0666 0.0518 0.297 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 6.63e-01 0.0383 0.0877 0.297 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 7.14e-01 0.0236 0.0642 0.297 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 8.75e-01 0.0136 0.086 0.297 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0361 0.0533 0.297 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 8.33e-02 -0.0904 0.0519 0.297 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0769 0.08 0.297 CD8T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0068 0.0685 0.297 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.81e-01 0.0162 0.058 0.297 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 6.39e-01 0.0296 0.0631 0.297 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 3.26e-01 0.0854 0.0867 0.291 DC L1
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0675 0.0959 0.291 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 9.90e-01 0.00102 0.0855 0.291 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 7.86e-02 -0.15 0.0848 0.291 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 4.22e-03 -0.261 0.09 0.291 DC L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0363 0.0906 0.291 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 5.70e-01 0.054 0.0949 0.291 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 8.26e-01 -0.015 0.0684 0.291 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0928 0.0596 0.297 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0272 0.0882 0.297 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 1.85e-01 0.0793 0.0596 0.297 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 3.12e-01 0.0683 0.0673 0.297 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0499 0.0746 0.297 Mono L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 8.06e-01 0.016 0.0651 0.297 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 5.43e-01 0.0406 0.0666 0.297 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0235 0.0661 0.297 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 6.13e-01 0.0345 0.068 0.296 NK L1
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 2.85e-01 0.0956 0.0893 0.296 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0284 0.0517 0.296 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0212 0.0609 0.296 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 2.45e-01 0.0945 0.0811 0.296 NK L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0536 0.0836 0.296 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00594 0.0602 0.296 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00338 0.0711 0.296 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 6.09e-02 0.121 0.0645 0.297 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00649 0.0771 0.297 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 4.43e-01 0.0538 0.07 0.297 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0168 0.0699 0.297 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 4.96e-02 0.172 0.087 0.297 Other_T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.49e-01 0.0315 0.0692 0.297 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0236 0.0671 0.297 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 2.70e-01 0.0765 0.0692 0.297 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 2.52e-02 0.243 0.108 0.298 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 1.41e-01 -0.144 0.0975 0.298 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 7.61e-02 -0.177 0.0994 0.298 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0803 0.0969 0.298 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 7.60e-01 0.0324 0.106 0.298 B_Activated L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0337 0.107 0.298 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 2.77e-01 -0.115 0.106 0.298 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 2.11e-01 -0.138 0.11 0.298 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0429 0.0848 0.298 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 5.95e-01 0.042 0.079 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 1.22e-01 -0.142 0.0917 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.09e-01 0.0533 0.0806 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 2.83e-01 0.0781 0.0726 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.30e-01 0.146 0.0963 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.09e-01 0.0469 0.0915 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 9.02e-01 0.00859 0.0697 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 3.21e-01 0.0801 0.0805 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 5.65e-01 0.0513 0.0889 0.298 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 8.90e-01 0.0114 0.0825 0.297 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0883 0.0929 0.297 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.74e-01 0.0487 0.0864 0.297 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 6.53e-01 0.0354 0.0787 0.297 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0146 0.0897 0.297 B_Memory L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 4.03e-01 0.0735 0.0878 0.297 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0545 0.0817 0.297 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0436 0.0888 0.297 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 6.49e-01 0.0392 0.086 0.297 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 4.92e-01 0.0486 0.0707 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0669 0.093 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.20e-01 0.0488 0.0758 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 3.57e-01 0.0612 0.0663 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0369 0.0861 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 2.14e-01 0.106 0.0852 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 8.12e-01 0.0153 0.0641 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 4.86e-02 0.155 0.078 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 2.79e-01 -0.1 0.0925 0.297 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 8.23e-04 0.264 0.0779 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 8.64e-02 0.16 0.0927 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.78e-01 -0.049 0.088 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00576 0.0819 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.97e-01 0.123 0.0954 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0941 0.0827 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0582 0.0923 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 9.96e-02 0.148 0.0895 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0246 0.0933 0.296 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00794 0.0922 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 3.22e-01 0.0926 0.0933 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 2.38e-01 -0.111 0.094 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0927 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0439 0.0986 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0581 0.0956 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 5.49e-01 0.0557 0.0928 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0346 0.0858 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0283 0.0775 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 1.25e-01 0.0929 0.0604 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 8.52e-01 0.0163 0.0873 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0386 0.0506 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0277 0.0462 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 9.48e-02 -0.128 0.0764 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 3.36e-01 0.0747 0.0775 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0223 0.0496 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 3.72e-01 0.0477 0.0532 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 8.24e-01 0.0206 0.0927 0.297 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 4.73e-01 0.051 0.0708 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 5.34e-01 0.0595 0.0954 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0315 0.0563 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 5.98e-01 0.0283 0.0536 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0304 0.0818 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 1.76e-01 0.113 0.0829 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0225 0.0594 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 8.45e-01 0.0137 0.0701 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 1.53e-01 0.138 0.0961 0.297 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 5.17e-01 0.0558 0.0859 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 6.12e-01 0.0481 0.0948 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0259 0.0771 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0435 0.0707 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0983 0.0908 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 7.76e-01 0.0267 0.0937 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 6.94e-02 -0.128 0.0701 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0201 0.0823 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 8.23e-01 0.0193 0.0863 0.297 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 5.45e-01 0.0466 0.0768 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0383 0.0906 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0484 0.0737 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0358 0.0689 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 2.25e-01 -0.104 0.0856 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 2.46e-01 0.0974 0.0837 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00134 0.0787 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 4.87e-01 0.0565 0.0811 0.297 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0283 0.0794 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 3.32e-01 0.0847 0.0872 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 7.41e-01 0.0214 0.0647 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 7.79e-02 -0.106 0.0596 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0239 0.0884 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.81e-01 0.0366 0.0887 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0467 0.0624 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00413 0.0646 0.297 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 8.98e-01 0.0124 0.0972 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 7.93e-01 0.0254 0.0965 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 1.52e-01 -0.121 0.0843 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 9.38e-01 0.00571 0.0729 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 3.84e-01 0.0861 0.0987 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 2.87e-01 0.108 0.101 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 2.65e-01 0.0942 0.0842 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 1.33e-01 -0.136 0.0899 0.299 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0101 0.0897 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0322 0.0947 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0889 0.0886 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0492 0.0945 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0376 0.0979 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 9.27e-01 0.00878 0.0957 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0817 0.084 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00366 0.0951 0.304 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 7.06e-02 0.157 0.0862 0.297 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 2.66e-01 -0.109 0.0973 0.297 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.14e-01 0.0534 0.0816 0.297 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 8.08e-02 0.143 0.0816 0.297 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 4.40e-01 0.0747 0.0967 0.297 MAIT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0135 0.0961 0.297 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 3.81e-01 0.0812 0.0925 0.297 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 1.87e-01 0.115 0.0872 0.297 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 2.60e-02 0.21 0.0935 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 8.66e-01 0.0159 0.0939 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 9.63e-01 0.00417 0.0885 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0569 0.0827 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 4.03e-01 0.0816 0.0974 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.97e-01 0.0373 0.0956 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.75e-01 0.0249 0.0871 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0345 0.0943 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0335 0.0694 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 5.81e-02 0.179 0.0937 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 3.52e-01 0.0606 0.0649 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0432 0.0658 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 6.34e-01 0.0437 0.0915 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0314 0.0909 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0339 0.0732 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 7.85e-02 0.142 0.0804 0.295 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00815 0.0932 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0933 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0365 0.096 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 2.99e-01 0.0913 0.0876 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.101 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0897 0.102 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0289 0.0932 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0787 0.0981 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 4.93e-01 0.0532 0.0775 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00767 0.096 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 1.03e-01 -0.12 0.0731 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0706 0.0741 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.58e-01 0.127 0.0897 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0451 0.0884 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 4.96e-01 0.0477 0.0699 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 1.93e-02 -0.198 0.0839 0.295 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 8.11e-01 0.0262 0.109 0.285 PB L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0589 0.0984 0.285 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0816 0.092 0.285 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0574 0.111 0.285 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0418 0.113 0.285 PB L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0554 0.107 0.285 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0406 0.114 0.285 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 4.38e-01 -0.073 0.0937 0.285 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 5.42e-02 0.206 0.106 0.285 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 2.00e-01 0.0988 0.0769 0.3 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 2.41e-01 0.0925 0.0786 0.3 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 9.37e-01 0.00682 0.0865 0.3 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00143 0.0804 0.3 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0209 0.0953 0.3 Pro_T L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 2.12e-01 0.102 0.0813 0.3 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0409 0.084 0.3 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00979 0.0795 0.3 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 9.22e-01 0.00815 0.0832 0.297 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 2.30e-01 -0.12 0.0999 0.297 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 1.21e-01 -0.128 0.0821 0.297 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 1.04e-01 -0.113 0.0695 0.297 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 5.17e-01 0.06 0.0925 0.297 Treg L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0105 0.0962 0.297 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.40e-02 0.123 0.0684 0.297 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0711 0.0927 0.297 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 8.44e-01 0.0179 0.091 0.297 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 6.50e-01 0.0414 0.0911 0.29 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 7.09e-01 0.0383 0.102 0.29 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 6.63e-01 0.0411 0.0942 0.29 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 7.53e-02 -0.153 0.0855 0.29 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 2.17e-03 -0.309 0.0994 0.29 cDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0667 0.101 0.29 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 8.61e-01 0.0164 0.0935 0.29 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 7.39e-01 0.0292 0.0873 0.29 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 1.04e-01 -0.118 0.0726 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 3.93e-01 0.0772 0.0902 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 5.92e-01 0.0369 0.0688 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 3.35e-01 0.0637 0.0659 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 2.18e-01 -0.099 0.0801 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 4.92e-01 0.0486 0.0706 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 3.03e-01 0.0747 0.0723 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0234 0.0685 0.297 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 1.27e-01 -0.106 0.069 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0554 0.0915 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 2.42e-01 0.102 0.0867 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 6.68e-01 0.0361 0.0839 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 9.34e-01 0.00737 0.0884 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0421 0.0849 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 4.08e-01 0.071 0.0858 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0614 0.0932 0.297 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 5.45e-01 0.0736 0.121 0.3 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 8.68e-01 0.0202 0.121 0.3 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0172 0.115 0.3 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 5.70e-01 0.0603 0.106 0.3 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.30e-02 0.283 0.112 0.3 gdT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0366 0.109 0.3 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 1.52e-02 -0.258 0.105 0.3 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 4.03e-01 0.0994 0.119 0.3 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 9.79e-01 0.00223 0.0864 0.296 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0571 0.0916 0.296 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 2.74e-01 0.0898 0.0818 0.296 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 9.22e-01 0.00876 0.0893 0.296 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0764 0.0915 0.296 intMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 6.23e-03 0.251 0.0907 0.296 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 3.00e-01 0.0929 0.0895 0.296 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 2.39e-01 0.113 0.0956 0.296 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 1.77e-01 -0.121 0.089 0.296 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0198 0.0964 0.296 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 2.59e-01 -0.101 0.0888 0.296 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 2.94e-01 -0.101 0.0964 0.296 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00627 0.099 0.296 ncMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 1.56e-01 0.131 0.0919 0.296 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0375 0.081 0.296 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0818 0.0913 0.296 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 6.12e-01 0.0553 0.109 0.277 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 4.80e-02 -0.221 0.111 0.277 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 3.58e-02 0.227 0.107 0.277 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0133 0.107 0.277 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 3.01e-01 -0.115 0.111 0.277 pDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0276 0.104 0.277 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 4.86e-01 0.0719 0.103 0.277 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0172 0.0851 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 6.53e-01 0.0332 0.0737 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 6.77e-02 -0.166 0.0903 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00413 0.0732 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 8.42e-01 0.013 0.0653 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 6.39e-01 0.0411 0.0874 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 4.08e-01 0.068 0.0819 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 9.44e-01 0.00448 0.0636 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 7.79e-01 0.0214 0.0763 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 5.62e-01 0.0528 0.0909 0.297 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 2.38e-03 0.2 0.0652 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 6.00e-01 0.0456 0.0868 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 8.02e-01 -0.018 0.0716 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 7.30e-01 0.022 0.0637 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 7.72e-01 -0.026 0.0897 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 7.98e-01 0.0197 0.077 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0507 0.0635 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 3.92e-02 0.154 0.0742 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 892691 sc-eQTL 2.46e-01 -0.108 0.0928 0.297 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 8.44e-02 -0.112 0.0645 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 7.87e-01 0.0234 0.0868 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 1.52e-01 0.0929 0.0646 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 3.10e-01 0.0654 0.0643 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0984 0.0733 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0144 0.0666 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 3.27e-01 0.0698 0.071 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0268 0.069 0.297 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 2.94e-01 -0.082 0.0779 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0287 0.089 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 2.77e-01 0.0854 0.0783 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0776 0.0901 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0252 0.0885 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 2.91e-02 0.199 0.0906 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 4.66e-01 0.0616 0.0843 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0156 0.0912 0.297 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 354019 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0299 0.0666 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 304977 sc-eQTL 1.98e-01 0.118 0.0914 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 892834 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0277 0.0536 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 648828 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00849 0.0625 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 867187 sc-eQTL 1.80e-01 0.114 0.0847 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 982834 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0757 0.0849 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 952787 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0244 0.0637 0.295 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 799298 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0128 0.0715 0.295 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116350 SRSF4 354019 eQTL 0.00521 0.0315 0.0112 0.0 0.0 0.284
ENSG00000116353 MECR 304977 eQTL 0.000886 0.0685 0.0205 0.00646 0.00566 0.284
ENSG00000188060 RAB42 943719 eQTL 4.35e-02 -0.0866 0.0428 0.00164 0.0 0.284
ENSG00000274978 RNU11 887319 eQTL 0.03 -0.0764 0.0352 0.0 0.0 0.284
ENSG00000279443 AL513497.1 991459 eQTL 0.0673 0.0704 0.0384 0.00137 0.0 0.284


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116353 MECR 304977 1.25e-06 9.25e-07 3.2e-07 5.17e-07 2.79e-07 4.63e-07 1.18e-06 3.38e-07 1.2e-06 3.99e-07 1.4e-06 5.98e-07 1.75e-06 2.67e-07 4.31e-07 7.78e-07 7.74e-07 5.45e-07 5.36e-07 6.68e-07 4.77e-07 1.17e-06 8.6e-07 6.06e-07 1.98e-06 3.75e-07 6.7e-07 7.25e-07 1.17e-06 1.21e-06 5.47e-07 1.56e-07 2.24e-07 5.42e-07 4.05e-07 4.32e-07 4.61e-07 1.69e-07 2.94e-07 9.18e-08 2.56e-07 1.54e-06 5.37e-08 6.41e-08 1.73e-07 9.94e-08 2.14e-07 8.93e-08 9.51e-08