logo

Genes within 1Mb (chr1:29532571:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 9.94e-03 0.162 0.0621 0.288 B L1
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00239 0.0752 0.288 B L1
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0117 0.0574 0.288 B L1
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 5.10e-01 0.0391 0.0593 0.288 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0895 0.0871 0.288 B L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 5.80e-01 -0.036 0.065 0.288 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0129 0.0602 0.288 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 3.47e-01 0.0558 0.0592 0.288 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0915 0.09 0.288 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 2.30e-01 0.0722 0.06 0.288 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0173 0.0839 0.288 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 2.63e-01 -0.049 0.0437 0.288 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 5.97e-01 -0.025 0.0472 0.288 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0972 0.0712 0.288 CD4T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 4.42e-01 0.0527 0.0684 0.288 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 9.31e-01 0.00428 0.0496 0.288 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 2.93e-01 0.0557 0.0529 0.288 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 6.77e-01 0.0373 0.0895 0.288 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 7.00e-01 0.0253 0.0656 0.288 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 8.36e-01 0.0182 0.0879 0.288 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0291 0.0545 0.288 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.41e-02 -0.107 0.0529 0.288 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0943 0.0817 0.288 CD8T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 8.22e-01 0.0158 0.07 0.288 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 9.77e-01 0.0017 0.0593 0.288 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 5.93e-01 0.0345 0.0644 0.288 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 5.47e-01 0.0538 0.0893 0.282 DC L1
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0656 0.0985 0.282 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 9.36e-01 0.00702 0.0878 0.282 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 1.15e-01 -0.138 0.0873 0.282 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.36e-03 -0.299 0.092 0.282 DC L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0488 0.0931 0.282 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 5.41e-01 0.0597 0.0975 0.282 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0272 0.0702 0.282 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0547 0.061 0.288 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0625 0.0899 0.288 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 2.13e-01 0.0759 0.0608 0.288 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 2.42e-01 0.0804 0.0686 0.288 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0513 0.0761 0.288 Mono L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00691 0.0664 0.288 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 7.32e-01 0.0233 0.0679 0.288 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 7.12e-01 -0.025 0.0674 0.288 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 5.53e-01 0.0414 0.0697 0.288 NK L1
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 1.49e-01 0.132 0.0914 0.288 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0365 0.053 0.288 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0585 0.0624 0.288 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 2.31e-01 0.0999 0.0832 0.288 NK L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0881 0.0856 0.288 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0185 0.0617 0.288 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 7.22e-01 -0.026 0.0729 0.288 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 1.71e-02 0.158 0.0656 0.288 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000334 0.0789 0.288 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 4.53e-01 0.0539 0.0717 0.288 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0475 0.0715 0.288 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.17e-01 0.141 0.0893 0.288 Other_T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 3.67e-01 0.0639 0.0707 0.288 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0161 0.0687 0.288 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 2.25e-01 0.0861 0.0708 0.288 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 8.63e-03 0.29 0.109 0.288 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 1.22e-01 -0.155 0.0995 0.288 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 3.05e-02 -0.22 0.101 0.288 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0803 0.0989 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 7.46e-01 0.035 0.108 0.288 B_Activated L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0782 0.109 0.288 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 1.24e-01 -0.166 0.108 0.288 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 1.10e-01 -0.18 0.112 0.288 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 8.48e-01 0.0166 0.0867 0.288 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 4.30e-01 0.0638 0.0806 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 1.62e-01 -0.132 0.0937 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 3.99e-01 0.0694 0.0822 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 6.83e-01 0.0304 0.0743 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 2.16e-01 0.122 0.0985 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.09e-01 0.0478 0.0934 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 7.55e-01 0.0222 0.0712 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 2.64e-01 0.0921 0.0822 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 7.67e-01 0.027 0.0908 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 9.46e-01 0.0057 0.0841 0.289 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 3.88e-01 -0.082 0.0948 0.289 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.44e-01 0.0535 0.0881 0.289 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 9.28e-01 0.0073 0.0803 0.289 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 9.64e-01 0.00411 0.0914 0.289 B_Memory L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 3.46e-01 0.0845 0.0895 0.289 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0662 0.0833 0.289 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 5.89e-01 -0.049 0.0905 0.289 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 7.55e-01 0.0274 0.0877 0.289 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 4.46e-01 0.0552 0.0723 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0631 0.0951 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.31e-01 0.0487 0.0775 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.37e-01 0.0529 0.0679 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0561 0.088 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 3.34e-01 0.0846 0.0873 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0117 0.0656 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 2.30e-02 0.182 0.0795 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 2.68e-01 -0.105 0.0947 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 8.87e-04 0.268 0.0795 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 1.01e-01 0.156 0.0946 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0359 0.0897 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0314 0.0835 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.59e-01 0.137 0.0972 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 1.87e-01 -0.112 0.0842 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0556 0.0941 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 2.37e-01 0.109 0.0916 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0494 0.0951 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0266 0.0949 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 6.54e-01 0.0433 0.0962 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 2.13e-01 -0.121 0.0967 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0883 0.0955 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0332 0.102 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0456 0.0984 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 3.08e-01 0.0975 0.0954 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0576 0.0883 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0543 0.0797 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 5.74e-02 0.117 0.0613 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 8.59e-01 0.0158 0.089 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0418 0.0516 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0182 0.0471 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 6.85e-02 -0.142 0.0778 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 5.18e-01 0.0513 0.0791 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0368 0.0505 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 5.83e-01 0.0299 0.0543 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 9.22e-01 0.0093 0.0945 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 3.19e-01 0.0722 0.0722 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 5.16e-01 0.0634 0.0974 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00878 0.0575 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 5.87e-01 0.0297 0.0547 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0229 0.0836 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 1.50e-01 0.122 0.0846 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0134 0.0607 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 8.25e-01 0.0159 0.0716 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 1.06e-01 0.159 0.098 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 6.15e-01 0.0443 0.088 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 4.19e-01 0.0784 0.0969 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0186 0.0789 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0629 0.0723 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 2.51e-01 -0.107 0.0928 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.04e-01 0.0497 0.0959 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 5.72e-02 -0.137 0.0716 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 5.69e-01 -0.048 0.0841 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 9.99e-01 9.57e-05 0.0883 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 7.18e-01 0.0284 0.0786 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0203 0.0926 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0442 0.0754 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0492 0.0704 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.77e-01 -0.118 0.0875 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 2.53e-01 0.0981 0.0856 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00597 0.0805 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 4.15e-01 0.0676 0.0829 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0344 0.0811 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 4.50e-01 0.0675 0.0891 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.25e-01 0.042 0.066 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 6.21e-02 -0.114 0.0608 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0396 0.0901 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 5.45e-01 0.0548 0.0904 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0527 0.0637 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 8.59e-01 0.0118 0.0659 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 8.99e-01 0.0126 0.0997 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 5.73e-01 0.0559 0.0989 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 1.58e-01 -0.123 0.0865 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0114 0.0748 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 3.75e-01 0.09 0.101 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 1.96e-01 0.134 0.103 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 2.89e-01 0.0919 0.0864 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 1.17e-01 -0.145 0.0922 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0124 0.0907 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0436 0.0956 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0694 0.0896 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0717 0.0954 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0661 0.0989 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 9.80e-01 0.00242 0.0967 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0818 0.0849 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 9.43e-01 0.00691 0.0961 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 2.53e-02 0.198 0.0877 0.288 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 2.51e-01 -0.114 0.0994 0.288 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.40e-01 0.0512 0.0833 0.288 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 1.73e-01 0.114 0.0836 0.288 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 8.37e-01 0.0203 0.0989 0.288 MAIT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 8.67e-01 0.0164 0.0982 0.288 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 3.00e-01 0.0982 0.0944 0.288 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 1.40e-01 0.132 0.089 0.288 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 3.95e-02 0.198 0.0956 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 6.79e-01 0.0398 0.0959 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 8.98e-01 0.0116 0.0903 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0953 0.0842 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 6.45e-01 0.046 0.0995 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.74e-01 0.0411 0.0976 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 7.14e-01 0.0326 0.0889 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0431 0.0963 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0362 0.0713 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 6.74e-02 0.177 0.0963 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 3.76e-01 0.0591 0.0667 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0561 0.0676 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 6.57e-01 0.0417 0.0939 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.15e-01 -0.047 0.0933 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 5.33e-01 -0.047 0.0751 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 2.28e-01 0.1 0.0829 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0105 0.0956 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0691 0.0959 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0335 0.0985 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 3.25e-01 0.0886 0.0899 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 2.45e-01 0.121 0.103 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 2.96e-01 -0.11 0.105 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0398 0.0956 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0613 0.101 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 3.41e-01 0.0758 0.0793 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 9.63e-01 0.00452 0.0985 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 4.71e-02 -0.149 0.0747 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0733 0.076 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.25e-01 0.142 0.0919 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0626 0.0906 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 4.84e-01 0.0503 0.0717 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 2.02e-02 -0.201 0.0861 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 7.31e-01 0.0398 0.116 0.27 PB L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0326 0.104 0.27 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 2.90e-01 -0.103 0.0971 0.27 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 5.12e-01 -0.077 0.117 0.27 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0397 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0804 0.113 0.27 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0474 0.12 0.27 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 3.12e-01 -0.1 0.0989 0.27 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 7.09e-02 0.205 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 1.92e-01 0.102 0.0783 0.291 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 2.04e-01 0.102 0.08 0.291 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0329 0.0881 0.291 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0137 0.0818 0.291 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0147 0.097 0.291 Pro_T L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 1.67e-01 0.115 0.0827 0.291 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0187 0.0856 0.291 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00807 0.0809 0.291 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 8.92e-01 0.0115 0.0851 0.288 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 2.66e-01 -0.114 0.102 0.288 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 1.91e-01 -0.11 0.084 0.288 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 9.44e-02 -0.119 0.0709 0.288 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 5.51e-01 0.0564 0.0945 0.288 Treg L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00075 0.0983 0.288 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 7.88e-02 0.123 0.0699 0.288 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0911 0.0947 0.288 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 9.19e-01 0.0095 0.093 0.288 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 5.93e-01 0.0501 0.0935 0.283 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 9.27e-01 0.00971 0.105 0.283 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 7.71e-01 0.0282 0.0967 0.283 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 9.15e-02 -0.149 0.0878 0.283 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 8.57e-04 -0.344 0.102 0.283 cDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0885 0.103 0.283 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0959 0.283 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 9.38e-01 0.00703 0.0896 0.283 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 3.49e-01 -0.07 0.0745 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 5.38e-01 0.0569 0.0922 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.77e-01 0.0393 0.0704 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 3.34e-01 0.0653 0.0674 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0843 0.082 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.82e-01 0.0296 0.0722 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 5.10e-01 0.0488 0.074 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0395 0.07 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0959 0.0704 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0795 0.0931 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 2.42e-01 0.104 0.0884 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.48e-01 0.065 0.0855 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0441 0.09 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0856 0.0864 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 3.34e-01 0.0845 0.0874 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0404 0.095 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 4.97e-01 0.0842 0.124 0.297 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 8.19e-01 0.0283 0.123 0.297 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 9.53e-01 0.00697 0.117 0.297 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 5.37e-01 0.0669 0.108 0.297 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.85e-02 0.273 0.115 0.297 gdT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0693 0.111 0.297 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 1.24e-02 -0.27 0.107 0.297 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 3.61e-01 0.111 0.121 0.297 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 6.55e-01 0.0393 0.0878 0.287 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 3.91e-01 -0.08 0.093 0.287 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.67e-01 0.0478 0.0833 0.287 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0207 0.0908 0.287 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0904 0.0929 0.287 intMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 6.71e-03 0.253 0.0923 0.287 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 3.90e-01 0.0785 0.091 0.287 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 3.06e-01 0.0997 0.0972 0.287 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 1.42e-01 -0.134 0.0909 0.29 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0405 0.0985 0.29 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 2.46e-01 -0.106 0.0907 0.29 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0769 0.0986 0.29 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 9.41e-01 0.0075 0.101 0.29 ncMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 8.72e-02 0.161 0.0936 0.29 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 6.29e-01 -0.04 0.0827 0.29 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0686 0.0933 0.29 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 7.10e-01 0.0415 0.112 0.268 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 7.76e-02 -0.202 0.114 0.268 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 7.95e-03 0.293 0.109 0.268 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0356 0.109 0.268 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 2.19e-01 -0.14 0.113 0.268 pDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00366 0.107 0.268 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 4.39e-01 0.0818 0.105 0.268 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0129 0.0871 0.268 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 5.71e-01 0.0427 0.0752 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 1.21e-01 -0.144 0.0924 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 9.92e-01 0.000741 0.0747 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0282 0.0666 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 6.45e-01 0.0412 0.0892 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 3.67e-01 0.0755 0.0836 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00202 0.0649 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 7.22e-01 0.0277 0.0779 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 6.91e-01 0.037 0.0928 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 2.64e-03 0.203 0.0667 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 5.41e-01 0.0544 0.0888 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0214 0.0732 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 9.53e-01 0.00388 0.0651 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0426 0.0917 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0015 0.0787 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 2.30e-01 -0.078 0.0648 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 3.89e-02 0.158 0.0759 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 889343 sc-eQTL 1.75e-01 -0.129 0.0948 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0684 0.0662 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00525 0.0887 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 1.37e-01 0.0986 0.066 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 2.18e-01 0.0812 0.0657 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.53e-01 -0.107 0.0748 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0478 0.068 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 4.35e-01 0.0569 0.0726 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0302 0.0705 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0634 0.0798 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0566 0.091 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 4.78e-01 0.057 0.0802 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0883 0.0921 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0206 0.0906 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 2.05e-02 0.216 0.0925 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 6.76e-01 0.0361 0.0863 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0253 0.0933 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350671 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0181 0.0683 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301629 sc-eQTL 1.48e-01 0.136 0.0936 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889486 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0349 0.0549 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 645480 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0357 0.0641 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863839 sc-eQTL 1.52e-01 0.125 0.0868 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979486 sc-eQTL 2.18e-01 -0.107 0.0869 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 949439 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0308 0.0653 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795950 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0371 0.0733 0.287 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116350 SRSF4 350671 eQTL 0.00425 0.0328 0.0114 0.0 0.0 0.276
ENSG00000116353 MECR 301629 eQTL 0.00299 0.0623 0.0209 0.00335 0.00202 0.276
ENSG00000188060 RAB42 940371 eQTL 6.60e-02 -0.0802 0.0436 0.00137 0.0 0.276
ENSG00000274978 RNU11 883971 eQTL 0.0314 -0.0771 0.0358 0.0 0.0 0.276
ENSG00000279443 AL513497.1 988111 eQTL 0.0476 0.0775 0.0391 0.00163 0.0 0.276

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116353 MECR 301629 1.4e-06 1.4e-06 2.54e-07 1.3e-06 4.2e-07 6.94e-07 1.52e-06 4.11e-07 1.59e-06 6.28e-07 2e-06 9.26e-07 2.54e-06 3.41e-07 4.92e-07 9.97e-07 1.04e-06 9.7e-07 5.65e-07 4.42e-07 7.96e-07 1.89e-06 1.03e-06 5.38e-07 2.35e-06 7.53e-07 1.01e-06 8.92e-07 1.65e-06 1.3e-06 8.51e-07 2.96e-07 3.19e-07 5.96e-07 5.34e-07 4.82e-07 7.26e-07 3.43e-07 5.05e-07 2.43e-07 2.83e-07 1.65e-06 3.37e-07 1.75e-07 2.88e-07 2.32e-07 2.66e-07 1.69e-07 2.04e-07