logo

Genes within 1Mb (chr1:29532090:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 9.94e-03 0.162 0.0621 0.288 B L1
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00239 0.0752 0.288 B L1
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0117 0.0574 0.288 B L1
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 5.10e-01 0.0391 0.0593 0.288 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0895 0.0871 0.288 B L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 5.80e-01 -0.036 0.065 0.288 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0129 0.0602 0.288 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 3.47e-01 0.0558 0.0592 0.288 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0915 0.09 0.288 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 2.30e-01 0.0722 0.06 0.288 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0173 0.0839 0.288 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 2.63e-01 -0.049 0.0437 0.288 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 5.97e-01 -0.025 0.0472 0.288 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0972 0.0712 0.288 CD4T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 4.42e-01 0.0527 0.0684 0.288 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 9.31e-01 0.00428 0.0496 0.288 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 2.93e-01 0.0557 0.0529 0.288 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 6.77e-01 0.0373 0.0895 0.288 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 7.00e-01 0.0253 0.0656 0.288 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 8.36e-01 0.0182 0.0879 0.288 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0291 0.0545 0.288 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.41e-02 -0.107 0.0529 0.288 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0943 0.0817 0.288 CD8T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 8.22e-01 0.0158 0.07 0.288 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 9.77e-01 0.0017 0.0593 0.288 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 5.93e-01 0.0345 0.0644 0.288 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 5.47e-01 0.0538 0.0893 0.282 DC L1
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0656 0.0985 0.282 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 9.36e-01 0.00702 0.0878 0.282 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 1.15e-01 -0.138 0.0873 0.282 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.36e-03 -0.299 0.092 0.282 DC L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0488 0.0931 0.282 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 5.41e-01 0.0597 0.0975 0.282 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0272 0.0702 0.282 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0547 0.061 0.288 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0625 0.0899 0.288 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 2.13e-01 0.0759 0.0608 0.288 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 2.42e-01 0.0804 0.0686 0.288 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0513 0.0761 0.288 Mono L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00691 0.0664 0.288 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 7.32e-01 0.0233 0.0679 0.288 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 7.12e-01 -0.025 0.0674 0.288 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 5.53e-01 0.0414 0.0697 0.288 NK L1
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 1.49e-01 0.132 0.0914 0.288 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0365 0.053 0.288 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0585 0.0624 0.288 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 2.31e-01 0.0999 0.0832 0.288 NK L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0881 0.0856 0.288 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0185 0.0617 0.288 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 7.22e-01 -0.026 0.0729 0.288 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 1.71e-02 0.158 0.0656 0.288 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000334 0.0789 0.288 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 4.53e-01 0.0539 0.0717 0.288 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0475 0.0715 0.288 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.17e-01 0.141 0.0893 0.288 Other_T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 3.67e-01 0.0639 0.0707 0.288 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0161 0.0687 0.288 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 2.25e-01 0.0861 0.0708 0.288 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 8.63e-03 0.29 0.109 0.288 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 1.22e-01 -0.155 0.0995 0.288 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 3.05e-02 -0.22 0.101 0.288 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0803 0.0989 0.288 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 7.46e-01 0.035 0.108 0.288 B_Activated L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0782 0.109 0.288 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 1.24e-01 -0.166 0.108 0.288 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 1.10e-01 -0.18 0.112 0.288 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 8.48e-01 0.0166 0.0867 0.288 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 4.30e-01 0.0638 0.0806 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 1.62e-01 -0.132 0.0937 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 3.99e-01 0.0694 0.0822 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 6.83e-01 0.0304 0.0743 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 2.16e-01 0.122 0.0985 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.09e-01 0.0478 0.0934 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 7.55e-01 0.0222 0.0712 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 2.64e-01 0.0921 0.0822 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 7.67e-01 0.027 0.0908 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 9.46e-01 0.0057 0.0841 0.289 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 3.88e-01 -0.082 0.0948 0.289 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.44e-01 0.0535 0.0881 0.289 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 9.28e-01 0.0073 0.0803 0.289 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 9.64e-01 0.00411 0.0914 0.289 B_Memory L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 3.46e-01 0.0845 0.0895 0.289 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0662 0.0833 0.289 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 5.89e-01 -0.049 0.0905 0.289 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 7.55e-01 0.0274 0.0877 0.289 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 4.46e-01 0.0552 0.0723 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0631 0.0951 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.31e-01 0.0487 0.0775 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.37e-01 0.0529 0.0679 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0561 0.088 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 3.34e-01 0.0846 0.0873 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0117 0.0656 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 2.30e-02 0.182 0.0795 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 2.68e-01 -0.105 0.0947 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 8.87e-04 0.268 0.0795 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 1.01e-01 0.156 0.0946 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0359 0.0897 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0314 0.0835 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.59e-01 0.137 0.0972 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 1.87e-01 -0.112 0.0842 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0556 0.0941 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 2.37e-01 0.109 0.0916 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0494 0.0951 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0266 0.0949 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 6.54e-01 0.0433 0.0962 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 2.13e-01 -0.121 0.0967 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0883 0.0955 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0332 0.102 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0456 0.0984 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 3.08e-01 0.0975 0.0954 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0576 0.0883 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0543 0.0797 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 5.74e-02 0.117 0.0613 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 8.59e-01 0.0158 0.089 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0418 0.0516 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0182 0.0471 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 6.85e-02 -0.142 0.0778 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 5.18e-01 0.0513 0.0791 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0368 0.0505 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 5.83e-01 0.0299 0.0543 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 9.22e-01 0.0093 0.0945 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 3.19e-01 0.0722 0.0722 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 5.16e-01 0.0634 0.0974 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00878 0.0575 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 5.87e-01 0.0297 0.0547 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0229 0.0836 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 1.50e-01 0.122 0.0846 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0134 0.0607 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 8.25e-01 0.0159 0.0716 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 1.06e-01 0.159 0.098 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 6.15e-01 0.0443 0.088 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 4.19e-01 0.0784 0.0969 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0186 0.0789 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0629 0.0723 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 2.51e-01 -0.107 0.0928 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.04e-01 0.0497 0.0959 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 5.72e-02 -0.137 0.0716 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 5.69e-01 -0.048 0.0841 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 9.99e-01 9.57e-05 0.0883 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 7.18e-01 0.0284 0.0786 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0203 0.0926 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0442 0.0754 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0492 0.0704 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.77e-01 -0.118 0.0875 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 2.53e-01 0.0981 0.0856 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00597 0.0805 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 4.15e-01 0.0676 0.0829 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0344 0.0811 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 4.50e-01 0.0675 0.0891 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.25e-01 0.042 0.066 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 6.21e-02 -0.114 0.0608 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0396 0.0901 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 5.45e-01 0.0548 0.0904 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0527 0.0637 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 8.59e-01 0.0118 0.0659 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 8.99e-01 0.0126 0.0997 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 5.73e-01 0.0559 0.0989 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 1.58e-01 -0.123 0.0865 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0114 0.0748 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 3.75e-01 0.09 0.101 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 1.96e-01 0.134 0.103 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 2.89e-01 0.0919 0.0864 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 1.17e-01 -0.145 0.0922 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0124 0.0907 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0436 0.0956 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0694 0.0896 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0717 0.0954 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0661 0.0989 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 9.80e-01 0.00242 0.0967 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0818 0.0849 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 9.43e-01 0.00691 0.0961 0.297 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 2.53e-02 0.198 0.0877 0.288 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 2.51e-01 -0.114 0.0994 0.288 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.40e-01 0.0512 0.0833 0.288 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 1.73e-01 0.114 0.0836 0.288 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 8.37e-01 0.0203 0.0989 0.288 MAIT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 8.67e-01 0.0164 0.0982 0.288 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 3.00e-01 0.0982 0.0944 0.288 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 1.40e-01 0.132 0.089 0.288 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 3.95e-02 0.198 0.0956 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 6.79e-01 0.0398 0.0959 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 8.98e-01 0.0116 0.0903 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0953 0.0842 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 6.45e-01 0.046 0.0995 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.74e-01 0.0411 0.0976 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 7.14e-01 0.0326 0.0889 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0431 0.0963 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0362 0.0713 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 6.74e-02 0.177 0.0963 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 3.76e-01 0.0591 0.0667 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0561 0.0676 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 6.57e-01 0.0417 0.0939 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.15e-01 -0.047 0.0933 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 5.33e-01 -0.047 0.0751 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 2.28e-01 0.1 0.0829 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0105 0.0956 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0691 0.0959 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0335 0.0985 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 3.25e-01 0.0886 0.0899 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 2.45e-01 0.121 0.103 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 2.96e-01 -0.11 0.105 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0398 0.0956 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0613 0.101 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 3.41e-01 0.0758 0.0793 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 9.63e-01 0.00452 0.0985 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 4.71e-02 -0.149 0.0747 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0733 0.076 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.25e-01 0.142 0.0919 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0626 0.0906 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 4.84e-01 0.0503 0.0717 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 2.02e-02 -0.201 0.0861 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 7.31e-01 0.0398 0.116 0.27 PB L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0326 0.104 0.27 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 2.90e-01 -0.103 0.0971 0.27 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 5.12e-01 -0.077 0.117 0.27 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0397 0.119 0.27 PB L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0804 0.113 0.27 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0474 0.12 0.27 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 3.12e-01 -0.1 0.0989 0.27 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 7.09e-02 0.205 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 1.92e-01 0.102 0.0783 0.291 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 2.04e-01 0.102 0.08 0.291 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0329 0.0881 0.291 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0137 0.0818 0.291 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0147 0.097 0.291 Pro_T L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 1.67e-01 0.115 0.0827 0.291 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0187 0.0856 0.291 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00807 0.0809 0.291 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 8.92e-01 0.0115 0.0851 0.288 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 2.66e-01 -0.114 0.102 0.288 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 1.91e-01 -0.11 0.084 0.288 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 9.44e-02 -0.119 0.0709 0.288 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 5.51e-01 0.0564 0.0945 0.288 Treg L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00075 0.0983 0.288 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 7.88e-02 0.123 0.0699 0.288 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0911 0.0947 0.288 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 9.19e-01 0.0095 0.093 0.288 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 5.93e-01 0.0501 0.0935 0.283 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 9.27e-01 0.00971 0.105 0.283 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 7.71e-01 0.0282 0.0967 0.283 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 9.15e-02 -0.149 0.0878 0.283 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 8.57e-04 -0.344 0.102 0.283 cDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0885 0.103 0.283 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0959 0.283 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 9.38e-01 0.00703 0.0896 0.283 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 3.49e-01 -0.07 0.0745 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 5.38e-01 0.0569 0.0922 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.77e-01 0.0393 0.0704 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 3.34e-01 0.0653 0.0674 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0843 0.082 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.82e-01 0.0296 0.0722 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 5.10e-01 0.0488 0.074 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0395 0.07 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0959 0.0704 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0795 0.0931 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 2.42e-01 0.104 0.0884 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.48e-01 0.065 0.0855 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0441 0.09 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0856 0.0864 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 3.34e-01 0.0845 0.0874 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0404 0.095 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 4.97e-01 0.0842 0.124 0.297 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 8.19e-01 0.0283 0.123 0.297 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 9.53e-01 0.00697 0.117 0.297 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 5.37e-01 0.0669 0.108 0.297 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.85e-02 0.273 0.115 0.297 gdT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0693 0.111 0.297 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 1.24e-02 -0.27 0.107 0.297 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 3.61e-01 0.111 0.121 0.297 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 6.55e-01 0.0393 0.0878 0.287 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 3.91e-01 -0.08 0.093 0.287 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.67e-01 0.0478 0.0833 0.287 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0207 0.0908 0.287 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0904 0.0929 0.287 intMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 6.71e-03 0.253 0.0923 0.287 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 3.90e-01 0.0785 0.091 0.287 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 3.06e-01 0.0997 0.0972 0.287 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 1.42e-01 -0.134 0.0909 0.29 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0405 0.0985 0.29 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 2.46e-01 -0.106 0.0907 0.29 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0769 0.0986 0.29 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 9.41e-01 0.0075 0.101 0.29 ncMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 8.72e-02 0.161 0.0936 0.29 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 6.29e-01 -0.04 0.0827 0.29 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0686 0.0933 0.29 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 7.10e-01 0.0415 0.112 0.268 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 7.76e-02 -0.202 0.114 0.268 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 7.95e-03 0.293 0.109 0.268 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0356 0.109 0.268 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 2.19e-01 -0.14 0.113 0.268 pDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00366 0.107 0.268 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 4.39e-01 0.0818 0.105 0.268 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0129 0.0871 0.268 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 5.71e-01 0.0427 0.0752 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 1.21e-01 -0.144 0.0924 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 9.92e-01 0.000741 0.0747 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0282 0.0666 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 6.45e-01 0.0412 0.0892 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 3.67e-01 0.0755 0.0836 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00202 0.0649 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 7.22e-01 0.0277 0.0779 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 6.91e-01 0.037 0.0928 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 2.64e-03 0.203 0.0667 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 5.41e-01 0.0544 0.0888 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0214 0.0732 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 9.53e-01 0.00388 0.0651 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0426 0.0917 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0015 0.0787 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 2.30e-01 -0.078 0.0648 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 3.89e-02 0.158 0.0759 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 888862 sc-eQTL 1.75e-01 -0.129 0.0948 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0684 0.0662 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00525 0.0887 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 1.37e-01 0.0986 0.066 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 2.18e-01 0.0812 0.0657 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.53e-01 -0.107 0.0748 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0478 0.068 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 4.35e-01 0.0569 0.0726 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0302 0.0705 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0634 0.0798 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0566 0.091 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 4.78e-01 0.057 0.0802 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0883 0.0921 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0206 0.0906 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 2.05e-02 0.216 0.0925 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 6.76e-01 0.0361 0.0863 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0253 0.0933 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 350190 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0181 0.0683 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 301148 sc-eQTL 1.48e-01 0.136 0.0936 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 889005 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0349 0.0549 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644999 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0357 0.0641 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 863358 sc-eQTL 1.52e-01 0.125 0.0868 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 979005 sc-eQTL 2.18e-01 -0.107 0.0869 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948958 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0308 0.0653 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 795469 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0371 0.0733 0.287 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116350 SRSF4 350190 eQTL 0.0043 0.0328 0.0114 0.0 0.0 0.276
ENSG00000116353 MECR 301148 eQTL 0.00302 0.0623 0.0209 0.00333 0.00201 0.276
ENSG00000188060 RAB42 939890 eQTL 6.56e-02 -0.0804 0.0436 0.00138 0.0 0.276
ENSG00000274978 RNU11 883490 eQTL 0.0316 -0.077 0.0358 0.0 0.0 0.276
ENSG00000279443 AL513497.1 987630 eQTL 0.0479 0.0775 0.0391 0.00162 0.0 0.276

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116353 MECR 301148 1.34e-06 9.34e-07 3.2e-07 4.4e-07 2.79e-07 4.39e-07 1.15e-06 3.37e-07 1.2e-06 3.71e-07 1.4e-06 5.98e-07 1.73e-06 2.65e-07 4.26e-07 7.41e-07 7.88e-07 5.47e-07 5.29e-07 6.25e-07 4.43e-07 1.2e-06 8.27e-07 6.02e-07 1.94e-06 3.87e-07 6.85e-07 6e-07 1.12e-06 1.11e-06 5.66e-07 1.53e-07 2.31e-07 5.64e-07 4.17e-07 4.47e-07 4.68e-07 1.24e-07 2.21e-07 9.18e-08 2.57e-07 1.43e-06 5.45e-08 3.39e-08 1.75e-07 8.9e-08 2.34e-07 7.81e-08 1.04e-07