logo

Genes within 1Mb (chr1:29531304:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 1.38e-02 0.151 0.061 0.299 B L1
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 6.74e-01 -0.031 0.0737 0.299 B L1
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0181 0.0563 0.299 B L1
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 2.10e-01 0.0729 0.058 0.299 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0733 0.0855 0.299 B L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0186 0.0637 0.299 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00415 0.0591 0.299 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 3.42e-01 0.0553 0.0581 0.299 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0617 0.0883 0.299 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 3.70e-01 0.0529 0.0589 0.299 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0271 0.0822 0.299 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0527 0.0428 0.299 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0312 0.0462 0.299 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0886 0.0698 0.299 CD4T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 5.59e-01 0.0393 0.067 0.299 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 7.97e-01 0.0125 0.0486 0.299 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 2.00e-01 0.0666 0.0518 0.299 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 6.80e-01 0.0363 0.0877 0.299 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 6.95e-01 0.0252 0.0642 0.299 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 8.14e-01 0.0203 0.0861 0.299 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0395 0.0534 0.299 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.79e-02 -0.0954 0.052 0.299 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0884 0.0801 0.299 CD8T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000733 0.0686 0.299 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 8.72e-01 0.00934 0.0581 0.299 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 5.64e-01 0.0364 0.0631 0.299 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 3.43e-01 0.0825 0.0868 0.293 DC L1
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0706 0.0959 0.293 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 9.34e-01 0.00705 0.0855 0.293 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.81e-02 -0.141 0.0849 0.293 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 3.73e-03 -0.264 0.09 0.293 DC L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0464 0.0906 0.293 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 6.35e-01 0.0451 0.0949 0.293 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0125 0.0684 0.293 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0851 0.0596 0.299 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0361 0.0881 0.299 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 1.64e-01 0.0831 0.0595 0.299 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 2.85e-01 0.0721 0.0672 0.299 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0493 0.0745 0.299 Mono L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 8.49e-01 0.0124 0.0651 0.299 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.94e-01 0.0455 0.0665 0.299 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0207 0.066 0.299 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 6.17e-01 0.0341 0.0681 0.298 NK L1
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 3.33e-01 0.0869 0.0895 0.298 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0294 0.0518 0.298 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0386 0.061 0.298 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.86e-01 0.108 0.0812 0.298 NK L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0692 0.0838 0.298 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00899 0.0603 0.298 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00137 0.0713 0.298 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 4.98e-02 0.127 0.0644 0.299 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0164 0.0771 0.299 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 3.31e-01 0.0682 0.07 0.299 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0234 0.0699 0.299 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 7.42e-02 0.156 0.0871 0.299 Other_T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 5.88e-01 0.0375 0.0692 0.299 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0263 0.0671 0.299 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 2.22e-01 0.0847 0.0692 0.299 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 3.61e-02 0.227 0.107 0.301 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 1.77e-01 -0.132 0.0973 0.301 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.86e-02 -0.188 0.099 0.301 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0808 0.0966 0.301 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 8.77e-01 0.0163 0.105 0.301 B_Activated L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0366 0.106 0.301 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 2.43e-01 -0.124 0.106 0.301 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 1.89e-01 -0.144 0.109 0.301 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0329 0.0846 0.301 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 5.54e-01 0.0468 0.079 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 1.18e-01 -0.144 0.0917 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.18e-01 0.0522 0.0806 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 3.24e-01 0.0718 0.0726 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.14e-01 0.153 0.0963 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 5.90e-01 0.0494 0.0915 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 9.38e-01 0.00539 0.0697 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 3.12e-01 0.0816 0.0805 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 5.42e-01 0.0543 0.0889 0.3 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 9.94e-01 0.000638 0.0825 0.3 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0913 0.0929 0.3 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 6.04e-01 0.045 0.0864 0.3 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 7.32e-01 0.027 0.0787 0.3 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00546 0.0897 0.3 B_Memory L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 4.12e-01 0.0722 0.0878 0.3 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0605 0.0817 0.3 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0453 0.0888 0.3 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 6.20e-01 0.0427 0.086 0.3 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 5.93e-01 0.0379 0.0708 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0664 0.0931 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.20e-01 0.0488 0.0758 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 2.46e-01 0.077 0.0663 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0403 0.0862 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 2.57e-01 0.097 0.0853 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 9.91e-01 0.000693 0.0642 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 3.93e-02 0.162 0.078 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 2.70e-01 -0.102 0.0926 0.299 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 9.04e-04 0.263 0.078 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 1.11e-01 0.149 0.0929 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0464 0.0881 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.97e-01 0.0003 0.082 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.70e-01 0.132 0.0955 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 3.23e-01 -0.082 0.0828 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0605 0.0924 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 1.09e-01 0.144 0.0897 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 6.85e-01 -0.038 0.0934 0.298 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0203 0.0923 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 4.13e-01 0.0767 0.0935 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 2.16e-01 -0.117 0.0941 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0982 0.0929 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0274 0.0987 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0468 0.0957 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 3.77e-01 0.0822 0.0928 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0458 0.0859 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0343 0.0776 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 1.03e-01 0.0986 0.0603 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 9.13e-01 0.00954 0.0872 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0372 0.0506 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0226 0.0462 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 8.86e-02 -0.131 0.0763 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 4.38e-01 0.0602 0.0775 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0253 0.0496 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 3.57e-01 0.0491 0.0532 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 7.89e-01 0.0248 0.0927 0.299 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 4.63e-01 0.052 0.0708 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 5.46e-01 0.0576 0.0953 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0331 0.0562 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.18e-01 0.0267 0.0535 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0372 0.0817 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 2.37e-01 0.0984 0.0829 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0179 0.0593 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 9.27e-01 0.00646 0.0701 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 1.69e-01 0.132 0.096 0.299 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 4.92e-01 0.0592 0.086 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 5.98e-01 0.0501 0.0948 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0141 0.0771 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0472 0.0708 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0767 0.0909 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 7.32e-01 0.0321 0.0938 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 6.86e-02 -0.128 0.0701 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0233 0.0823 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 9.04e-01 0.0105 0.0863 0.299 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 5.61e-01 0.0448 0.0769 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0372 0.0907 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0521 0.0738 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0356 0.069 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.88e-01 -0.113 0.0857 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 2.14e-01 0.104 0.0837 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00158 0.0788 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 4.43e-01 0.0623 0.0811 0.299 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0334 0.0794 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 4.15e-01 0.0713 0.0872 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 7.61e-01 0.0197 0.0647 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.45e-02 -0.111 0.0596 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0235 0.0883 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 6.85e-01 0.036 0.0886 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.62e-01 -0.046 0.0624 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 9.12e-01 0.00711 0.0646 0.299 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 9.96e-01 0.000452 0.0973 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 6.43e-01 0.0448 0.0965 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 1.61e-01 -0.119 0.0845 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.10e-01 0.00823 0.073 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 3.96e-01 0.0842 0.0988 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 2.43e-01 0.118 0.101 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 3.04e-01 0.0869 0.0844 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 1.41e-01 -0.133 0.0901 0.301 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00412 0.0898 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0204 0.0947 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0785 0.0887 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0447 0.0946 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0443 0.0979 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 9.12e-01 0.0106 0.0958 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0709 0.0841 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00341 0.0951 0.306 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 6.57e-02 0.16 0.0862 0.299 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 2.35e-01 -0.116 0.0972 0.299 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 4.05e-01 0.068 0.0815 0.299 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.95e-02 0.135 0.0816 0.299 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 5.20e-01 0.0623 0.0967 0.299 MAIT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00638 0.0961 0.299 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.26e-01 0.0737 0.0925 0.299 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 1.90e-01 0.115 0.0872 0.299 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 3.71e-02 0.196 0.0936 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 8.07e-01 0.0229 0.0939 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 9.58e-01 0.00467 0.0885 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0778 0.0825 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 3.87e-01 0.0844 0.0973 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 7.96e-01 0.0248 0.0956 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 8.06e-01 0.0214 0.087 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0262 0.0943 0.296 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0344 0.0696 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 8.78e-02 0.161 0.0941 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 4.01e-01 0.0547 0.0651 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0517 0.0659 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 6.44e-01 0.0424 0.0917 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0454 0.091 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0325 0.0734 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 9.14e-02 0.137 0.0806 0.297 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00815 0.0932 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0933 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0365 0.096 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 2.99e-01 0.0913 0.0876 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.101 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0897 0.102 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0289 0.0932 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0787 0.0981 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 3.98e-01 0.0658 0.0777 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0153 0.0964 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 1.12e-01 -0.117 0.0734 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0749 0.0743 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 9.79e-02 0.149 0.0899 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0451 0.0887 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.68e-01 0.051 0.0702 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 2.63e-02 -0.189 0.0843 0.297 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 8.11e-01 0.0262 0.109 0.285 PB L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0589 0.0984 0.285 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0816 0.092 0.285 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0574 0.111 0.285 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0418 0.113 0.285 PB L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0554 0.107 0.285 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0406 0.114 0.285 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 4.38e-01 -0.073 0.0937 0.285 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 5.42e-02 0.206 0.106 0.285 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 2.10e-01 0.0967 0.0769 0.302 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 2.54e-01 0.09 0.0786 0.302 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 9.42e-01 0.00632 0.0865 0.302 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00942 0.0803 0.302 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0316 0.0953 0.302 Pro_T L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 1.67e-01 0.113 0.0813 0.302 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 6.95e-01 -0.033 0.0841 0.302 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00716 0.0795 0.302 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 9.87e-01 0.00137 0.0832 0.299 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 2.70e-01 -0.111 0.0999 0.299 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 1.28e-01 -0.125 0.0821 0.299 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.35e-02 -0.117 0.0694 0.299 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 4.74e-01 0.0663 0.0924 0.299 Treg L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 9.87e-01 0.00156 0.0962 0.299 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 5.79e-02 0.13 0.0683 0.299 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0646 0.0927 0.299 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 9.31e-01 0.00785 0.091 0.299 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 6.91e-01 0.0363 0.0912 0.293 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 7.79e-01 0.0288 0.102 0.293 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.89e-01 0.0509 0.0942 0.293 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.57e-02 -0.143 0.0856 0.293 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.56e-03 -0.319 0.0993 0.293 cDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0734 0.101 0.293 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 9.43e-01 0.00674 0.0935 0.293 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 7.71e-01 0.0254 0.0873 0.293 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 1.18e-01 -0.114 0.0727 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 3.82e-01 0.0791 0.0902 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 5.37e-01 0.0426 0.0688 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 3.84e-01 0.0576 0.066 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0938 0.0802 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 4.98e-01 0.048 0.0706 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 2.74e-01 0.0794 0.0723 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0186 0.0686 0.299 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0973 0.0691 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0537 0.0915 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 2.34e-01 0.103 0.0867 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 5.79e-01 0.0466 0.0839 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 9.14e-01 0.00961 0.0884 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0523 0.0849 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.13e-01 0.0704 0.0858 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 5.42e-01 -0.057 0.0932 0.299 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 3.99e-01 0.103 0.122 0.303 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000615 0.122 0.303 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 9.49e-01 0.00735 0.116 0.303 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 6.05e-01 0.0553 0.107 0.303 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.83e-02 0.27 0.113 0.303 gdT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0705 0.11 0.303 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 2.25e-02 -0.244 0.106 0.303 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 3.10e-01 0.121 0.119 0.303 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000614 0.0864 0.298 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0669 0.0916 0.298 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 2.53e-01 0.0937 0.0818 0.298 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 8.64e-01 0.0153 0.0893 0.298 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0852 0.0915 0.298 intMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 6.00e-03 0.252 0.0907 0.298 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 3.52e-01 0.0836 0.0895 0.298 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 2.22e-01 0.117 0.0956 0.298 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 1.80e-01 -0.12 0.089 0.299 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0324 0.0964 0.299 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 2.45e-01 -0.103 0.0888 0.299 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 2.95e-01 -0.101 0.0963 0.299 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00833 0.0989 0.299 ncMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 1.50e-01 0.133 0.0918 0.299 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0265 0.081 0.299 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0853 0.0913 0.299 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 5.14e-01 0.0712 0.109 0.28 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 5.95e-02 -0.21 0.111 0.28 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 3.53e-02 0.228 0.107 0.28 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.48e-01 -0.007 0.107 0.28 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 3.59e-01 -0.102 0.111 0.28 pDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0347 0.104 0.28 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 5.21e-01 0.0663 0.103 0.28 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 9.99e-01 9.81e-05 0.085 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 6.74e-01 0.031 0.0737 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 6.79e-02 -0.166 0.0903 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00822 0.0732 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 9.19e-01 0.00661 0.0653 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 5.55e-01 0.0517 0.0874 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 3.88e-01 0.0708 0.0819 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 9.91e-01 0.000713 0.0636 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 7.54e-01 0.024 0.0763 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 5.12e-01 0.0597 0.0909 0.299 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 3.69e-03 0.192 0.0654 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 6.35e-01 0.0414 0.087 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0183 0.0717 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 5.65e-01 0.0368 0.0637 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0218 0.0898 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 7.81e-01 0.0215 0.0771 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0633 0.0635 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 3.59e-02 0.157 0.0743 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 888076 sc-eQTL 2.07e-01 -0.117 0.0929 0.299 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 1.12e-01 -0.103 0.0646 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 7.75e-01 0.0249 0.0868 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 1.26e-01 0.0992 0.0646 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 2.90e-01 0.0682 0.0644 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0942 0.0733 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0182 0.0666 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 3.01e-01 0.0737 0.071 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0233 0.0691 0.299 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0816 0.0779 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0436 0.0889 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 2.87e-01 0.0835 0.0783 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0759 0.0901 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0316 0.0885 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 2.89e-02 0.199 0.0906 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 4.36e-01 0.0658 0.0842 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0166 0.0912 0.3 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 349404 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0228 0.0667 0.297 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 300362 sc-eQTL 2.73e-01 0.101 0.0917 0.297 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 888219 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0279 0.0537 0.297 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 644213 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0158 0.0627 0.297 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 862572 sc-eQTL 1.35e-01 0.127 0.0848 0.297 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 978219 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0847 0.085 0.297 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 948172 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0225 0.0639 0.297 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 794683 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0115 0.0717 0.297 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116350 SRSF4 349404 eQTL 0.00452 0.0321 0.0113 0.0 0.0 0.284
ENSG00000116353 MECR 300362 eQTL 0.000992 0.0681 0.0206 0.00608 0.00509 0.284
ENSG00000188060 RAB42 939104 eQTL 4.22e-02 -0.0873 0.0429 0.00166 0.0 0.284
ENSG00000274978 RNU11 882704 eQTL 0.0324 -0.0755 0.0352 0.0 0.0 0.284
ENSG00000279443 AL513497.1 986844 eQTL 0.0644 0.0713 0.0385 0.0014 0.0 0.284

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116353 MECR 300362 1.65e-06 2.43e-06 3.23e-07 1.63e-06 6.13e-07 7.89e-07 1.55e-06 6.75e-07 1.8e-06 9.63e-07 2.12e-06 1.26e-06 3.44e-06 8.78e-07 8.08e-07 1.63e-06 9.63e-07 1.79e-06 9.64e-07 1.27e-06 1.21e-06 2.76e-06 2e-06 9.95e-07 2.95e-06 1.33e-06 1.34e-06 1.78e-06 1.86e-06 1.68e-06 1.21e-06 5.26e-07 5.2e-07 1.23e-06 9.18e-07 9.85e-07 7.47e-07 4.58e-07 1.12e-06 3.96e-07 1.52e-07 2.78e-06 5.89e-07 1.64e-07 3.63e-07 2.94e-07 8.93e-07 2.41e-07 1.74e-07