logo

Genes within 1Mb (chr6:24427323:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 8.13e-01 0.0268 0.113 0.15 B L1
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 7.44e-02 -0.209 0.117 0.15 B L1
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 3.71e-02 0.117 0.0557 0.15 B L1
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 2.04e-01 0.13 0.102 0.15 B L1
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0757 0.0756 0.15 B L1
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.91e-01 0.0283 0.107 0.15 B L1
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.18e-02 0.189 0.0922 0.15 B L1
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 4.16e-02 0.156 0.0759 0.15 B L1
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 6.87e-01 0.0441 0.109 0.15 CD4T L1
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0752 0.0868 0.15 CD4T L1
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 4.60e-01 0.0497 0.0671 0.15 CD4T L1
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 3.52e-01 0.0777 0.0833 0.15 CD4T L1
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 2.85e-01 0.0888 0.0829 0.15 CD4T L1
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00172 0.108 0.15 CD4T L1
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 6.85e-01 0.0383 0.0942 0.15 CD4T L1
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 2.38e-02 0.153 0.0673 0.15 CD4T L1
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 7.40e-01 0.0315 0.0949 0.15 CD8T L1
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 2.36e-01 -0.119 0.1 0.15 CD8T L1
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 4.56e-01 0.0451 0.0604 0.15 CD8T L1
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 2.79e-02 0.178 0.0802 0.15 CD8T L1
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 4.25e-01 0.0725 0.0907 0.15 CD8T L1
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0603 0.104 0.15 CD8T L1
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0977 0.103 0.15 CD8T L1
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 2.84e-02 0.199 0.0902 0.15 CD8T L1
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0154 0.134 0.14 DC L1
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 6.22e-02 0.256 0.137 0.14 DC L1
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 4.75e-01 0.077 0.108 0.14 DC L1
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 1.08e-01 0.138 0.0858 0.14 DC L1
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 1.93e-01 -0.175 0.134 0.14 DC L1
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 5.75e-01 0.0726 0.129 0.14 DC L1
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 9.75e-01 -0.0043 0.136 0.14 DC L1
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.55e-02 0.288 0.118 0.14 DC L1
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 6.44e-01 0.0447 0.0965 0.15 Mono L1
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 6.03e-01 0.0302 0.0579 0.15 Mono L1
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 9.79e-01 0.00245 0.0947 0.15 Mono L1
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.61e-01 0.0286 0.0941 0.15 Mono L1
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 1.55e-01 -0.175 0.123 0.15 Mono L1
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 4.50e-17 0.872 0.0951 0.15 Mono L1
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0198 0.119 0.15 NK L1
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 8.09e-01 0.0144 0.0596 0.15 NK L1
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 4.91e-01 0.0778 0.113 0.15 NK L1
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 1.52e-01 -0.124 0.0863 0.15 NK L1
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 6.72e-01 0.0432 0.102 0.15 NK L1
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0645 0.0889 0.15 NK L1
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 2.79e-01 0.106 0.098 0.15 NK L1
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 7.45e-01 0.0438 0.135 0.15 Other_T L1
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 7.95e-01 0.0179 0.0687 0.15 Other_T L1
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0942 0.132 0.15 Other_T L1
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 2.48e-01 -0.097 0.0838 0.15 Other_T L1
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0319 0.126 0.15 Other_T L1
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 6.39e-01 0.0312 0.0664 0.15 Other_T L1
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 6.19e-01 0.0568 0.114 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 9.37e-01 0.00886 0.113 0.156 B_Activated L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0669 0.139 0.156 B_Activated L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 7.73e-01 0.0263 0.0911 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0616 0.133 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0562 0.126 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 1.82e-01 0.189 0.141 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 1.37e-01 0.181 0.121 0.156 B_Activated L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 2.56e-01 0.144 0.127 0.156 B_Activated L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0916 0.122 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0542 0.142 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 6.42e-02 0.136 0.0731 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0823 0.118 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0877 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 4.66e-01 -0.092 0.126 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 2.14e-01 0.161 0.129 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 4.60e-02 0.224 0.112 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 6.22e-01 0.057 0.116 0.149 B_Memory L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 3.46e-01 -0.133 0.14 0.149 B_Memory L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 1.94e-01 0.0996 0.0764 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 5.10e-01 -0.082 0.124 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 4.19e-01 0.0965 0.119 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 3.35e-01 -0.123 0.127 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0185 0.131 0.149 B_Memory L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.61e-02 0.293 0.121 0.149 B_Memory L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 4.95e-01 0.0826 0.121 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 2.20e-01 -0.143 0.116 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 7.51e-01 0.0202 0.0634 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 2.67e-01 0.125 0.112 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 3.46e-02 -0.242 0.114 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0378 0.12 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 5.71e-01 0.0667 0.117 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 7.44e-01 0.0329 0.101 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0509 0.119 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 9.65e-01 0.00589 0.132 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 2.09e-02 0.166 0.0714 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 3.08e-02 0.259 0.119 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0275 0.128 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 2.91e-01 0.122 0.115 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.60e-01 0.0928 0.125 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 5.19e-01 0.0743 0.115 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0088 0.0942 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 5.03e-01 0.086 0.128 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 1.34e-02 0.244 0.0977 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 8.10e-01 0.0289 0.12 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0632 0.131 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.15e-01 0.0462 0.126 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0916 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0696 0.132 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 1.68e-01 0.148 0.107 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 1.78e-01 -0.122 0.0901 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 6.10e-01 0.0357 0.0698 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 2.68e-01 0.106 0.0955 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 2.71e-01 0.104 0.0945 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.11e-01 0.0427 0.115 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 7.53e-01 0.0313 0.0992 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.23e-01 0.116 0.0746 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 1.27e-01 -0.202 0.132 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00216 0.116 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 3.05e-01 0.0771 0.0749 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 1.35e-01 -0.178 0.118 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.106 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0431 0.116 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.39e-01 0.094 0.121 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.78e-02 0.213 0.0894 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 1.93e-01 0.171 0.131 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0118 0.122 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 4.21e-01 0.0674 0.0836 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 1.44e-01 0.184 0.125 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 6.65e-01 0.0521 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 9.67e-01 0.00532 0.128 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 5.35e-01 0.0794 0.128 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00545 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0932 0.104 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0136 0.13 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 4.14e-01 0.0623 0.0761 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 9.76e-01 0.00386 0.127 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 8.97e-01 0.0145 0.111 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.31e-01 0.0409 0.119 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 9.48e-02 -0.178 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 9.22e-03 0.298 0.113 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 7.24e-01 0.0397 0.112 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 1.94e-01 -0.147 0.113 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 3.55e-01 0.0769 0.083 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 1.05e-01 0.173 0.106 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 5.97e-01 0.0542 0.103 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00277 0.113 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 7.79e-01 0.0324 0.115 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0908 0.106 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 4.06e-01 -0.106 0.127 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0977 0.142 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 6.24e-01 0.0492 0.1 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 5.78e-02 0.248 0.13 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 1.30e-02 0.323 0.129 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00254 0.137 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 1.87e-01 0.176 0.133 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0572 0.121 0.153 CD8_TCM L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00755 0.111 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00352 0.139 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 7.86e-01 0.0274 0.101 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 5.78e-02 0.238 0.125 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 9.54e-01 0.00744 0.129 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0611 0.139 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 5.20e-01 0.0839 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0958 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 7.89e-01 0.0338 0.126 0.152 MAIT L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 6.40e-01 0.0458 0.0979 0.152 MAIT L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0716 0.126 0.152 MAIT L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0627 0.119 0.152 MAIT L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 5.70e-01 0.0687 0.121 0.152 MAIT L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 5.21e-02 0.229 0.117 0.152 MAIT L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0349 0.129 0.152 MAIT L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 8.26e-01 -0.029 0.131 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 5.32e-01 0.0547 0.0874 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 3.86e-01 -0.112 0.129 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 4.77e-01 -0.082 0.115 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0525 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0282 0.117 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 7.85e-01 0.035 0.128 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0175 0.132 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 8.17e-01 0.0162 0.0701 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 8.08e-01 0.0268 0.11 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 6.14e-01 0.0517 0.102 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.87e-01 0.0302 0.112 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0775 0.105 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.81e-01 0.146 0.109 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 3.85e-01 0.121 0.139 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 5.52e-01 0.0715 0.12 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 6.40e-01 0.0598 0.128 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 2.67e-01 -0.136 0.122 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 1.46e-01 -0.186 0.127 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 2.52e-01 -0.14 0.121 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 2.84e-01 0.142 0.132 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0145 0.135 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 8.77e-02 0.132 0.0769 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 2.61e-02 0.264 0.118 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 1.41e-01 -0.167 0.113 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 3.62e-01 0.104 0.114 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 7.94e-01 0.028 0.107 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0471 0.114 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 8.41e-01 0.0278 0.138 0.148 PB L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 5.42e-01 -0.104 0.17 0.148 PB L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 4.83e-01 0.073 0.104 0.148 PB L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0569 0.153 0.148 PB L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 9.85e-01 0.00218 0.117 0.148 PB L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 2.26e-01 0.203 0.167 0.148 PB L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 2.08e-01 0.158 0.125 0.148 PB L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 9.36e-01 0.012 0.15 0.148 PB L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 6.72e-02 0.252 0.137 0.152 Pro_T L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0334 0.0905 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 1.60e-01 0.182 0.129 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0167 0.0971 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00205 0.136 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 6.63e-01 0.0328 0.0752 0.152 Pro_T L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 8.75e-03 0.325 0.123 0.152 Pro_T L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 7.60e-01 0.0385 0.126 0.15 Treg L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 1.06e-01 0.213 0.131 0.15 Treg L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 2.58e-02 0.215 0.0956 0.15 Treg L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 5.16e-01 0.0863 0.133 0.15 Treg L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 1.81e-01 0.163 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 2.55e-01 -0.143 0.125 0.15 Treg L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.20e-01 0.102 0.126 0.15 Treg L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 4.32e-02 0.258 0.127 0.15 Treg L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 9.91e-01 0.0013 0.111 0.144 cDC L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 5.33e-02 0.277 0.142 0.144 cDC L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 7.32e-01 0.0388 0.113 0.144 cDC L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 8.27e-01 0.0211 0.0964 0.144 cDC L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 2.88e-01 -0.147 0.138 0.144 cDC L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 1.61e-01 0.193 0.137 0.144 cDC L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00757 0.136 0.144 cDC L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 4.16e-03 0.347 0.12 0.144 cDC L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0469 0.111 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0147 0.0591 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00574 0.0986 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0746 0.104 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 6.51e-02 -0.233 0.126 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.19e-09 0.65 0.102 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 2.61e-01 0.13 0.115 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 3.61e-01 0.0677 0.074 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 7.33e-01 0.0378 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 6.05e-01 0.0567 0.109 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 3.80e-01 0.111 0.126 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.83e-08 0.687 0.117 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 6.01e-02 -0.289 0.153 0.152 gdT L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 5.78e-01 0.0636 0.114 0.152 gdT L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 7.78e-01 0.0445 0.157 0.152 gdT L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 1.81e-01 -0.193 0.144 0.152 gdT L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0716 0.145 0.152 gdT L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 1.93e-02 -0.346 0.146 0.152 gdT L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0187 0.155 0.152 gdT L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0956 0.135 0.151 intMono L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 8.33e-01 0.0188 0.0894 0.151 intMono L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 8.77e-01 0.019 0.122 0.151 intMono L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.01e-01 0.0509 0.133 0.151 intMono L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 1.36e-01 -0.192 0.128 0.151 intMono L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 2.51e-02 0.299 0.133 0.151 intMono L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0289 0.133 0.143 ncMono L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 2.10e-01 -0.106 0.084 0.143 ncMono L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 2.58e-01 -0.149 0.131 0.143 ncMono L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0525 0.123 0.143 ncMono L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.12e-01 -0.11 0.134 0.143 ncMono L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 5.15e-02 0.251 0.128 0.143 ncMono L2
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 5.69e-01 0.0842 0.148 0.138 pDC L2
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 3.19e-01 -0.155 0.155 0.138 pDC L2
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 3.52e-01 0.138 0.147 0.138 pDC L2
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 8.90e-02 0.188 0.11 0.138 pDC L2
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 8.31e-01 0.0315 0.147 0.138 pDC L2
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 3.30e-01 0.142 0.145 0.138 pDC L2
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 4.42e-01 -0.106 0.138 0.138 pDC L2
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 2.87e-02 0.335 0.152 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0108 0.122 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 2.41e-01 -0.161 0.137 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 1.15e-01 0.098 0.062 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 1.62e-01 -0.164 0.117 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 8.72e-01 0.0161 0.0997 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.93e-01 -0.031 0.118 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 2.59e-01 0.147 0.129 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 9.24e-04 0.332 0.0989 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079691 CARMIL1 -851755 sc-eQTL 3.58e-01 0.107 0.116 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 2.01e-01 -0.147 0.115 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 1.90e-01 0.0858 0.0653 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 3.30e-02 0.222 0.103 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 6.77e-02 -0.197 0.107 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.23e-01 0.0398 0.112 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 3.29e-01 0.113 0.116 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 5.40e-01 0.0575 0.0937 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 4.99e-01 0.0664 0.0979 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 6.27e-01 0.0289 0.0594 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 7.44e-01 0.0325 0.0992 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 7.13e-01 0.0359 0.0977 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 3.60e-01 -0.112 0.122 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.76e-14 0.813 0.0986 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 4.15e-01 -0.104 0.128 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 8.64e-01 -0.013 0.0761 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 3.33e-01 -0.112 0.116 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0846 0.121 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 1.54e-01 -0.184 0.128 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.13e-04 0.48 0.122 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111802 TDP2 -239607 sc-eQTL 8.49e-01 0.0237 0.124 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111913 RIPOR2 -614847 sc-eQTL 6.00e-01 0.0333 0.0634 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67544 sc-eQTL 1.87e-01 0.143 0.108 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0874 0.0928 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112308 C6orf62 -292675 sc-eQTL 5.67e-01 0.0599 0.105 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112312 GMNN -347608 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0362 0.0927 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000124532 MRS2 24415 sc-eQTL 1.76e-01 0.132 0.0975 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111802 TDP2 -239607 eQTL 0.0454 0.0352 0.0176 0.0 0.0 0.151
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67529 eQTL 0.004 0.0689 0.0239 0.0 0.0 0.151
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 eQTL 0.00108 0.0664 0.0203 0.0 0.0 0.151
ENSG00000124532 MRS2 24415 eQTL 1.29e-85 0.417 0.0191 0.0 0.00412 0.151
ENSG00000137261 KIAA0319 -218868 eQTL 0.0138 -0.0553 0.0224 0.0 0.0 0.151
ENSG00000272345 AL031775.1 -274470 eQTL 0.0217 0.0941 0.0409 0.0 0.0 0.151

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111802 TDP2 -239607 3.61e-06 4.79e-06 7.29e-07 1.96e-06 7.65e-07 7.43e-07 2.47e-06 9.69e-07 3.73e-06 1.97e-06 3.5e-06 2.2e-06 5.6e-06 2.04e-06 1.06e-06 3.3e-06 2.07e-06 2.12e-06 1.43e-06 1.21e-06 2.95e-06 4.23e-06 3.49e-06 1.01e-06 4.95e-06 1.21e-06 1.87e-06 1.46e-06 3.41e-06 2.5e-06 2.7e-06 3.8e-07 5.88e-07 1.24e-06 1.63e-06 8.93e-07 9.6e-07 4.37e-07 1.16e-06 2.26e-07 2.72e-07 5.03e-06 8.3e-07 1.99e-07 2.97e-07 3.64e-07 8.08e-07 2.32e-07 2.62e-07
ENSG00000112294 ALDH5A1 -67529 1.41e-05 1.9e-05 3.07e-06 9.47e-06 2.97e-06 6.85e-06 2.04e-05 3.4e-06 1.74e-05 8.95e-06 2.18e-05 8.18e-06 2.82e-05 7.35e-06 4.91e-06 1.06e-05 8.88e-06 1.41e-05 4.42e-06 4.22e-06 8.59e-06 1.71e-05 1.51e-05 4.69e-06 2.73e-05 5.31e-06 8.02e-06 7.8e-06 1.59e-05 1.27e-05 1.29e-05 1.26e-06 1.51e-06 4.09e-06 6.94e-06 3.76e-06 2.02e-06 2.73e-06 2.7e-06 1.89e-06 1.12e-06 2.33e-05 2.68e-06 2.03e-07 1.41e-06 2.56e-06 3.02e-06 9.11e-07 5.93e-07
ENSG00000112304 ACOT13 -239712 3.61e-06 4.79e-06 7.29e-07 1.96e-06 7.65e-07 7.43e-07 2.47e-06 9.69e-07 3.73e-06 1.97e-06 3.41e-06 2.2e-06 5.6e-06 2.04e-06 1.06e-06 3.36e-06 2.07e-06 2.12e-06 1.43e-06 1.21e-06 2.95e-06 4.23e-06 3.49e-06 1.01e-06 4.95e-06 1.21e-06 1.9e-06 1.46e-06 3.27e-06 2.5e-06 2.7e-06 3.8e-07 5.88e-07 1.24e-06 1.63e-06 8.93e-07 9.6e-07 4.37e-07 1.16e-06 2.26e-07 2.72e-07 5.03e-06 8.3e-07 1.99e-07 2.97e-07 3.64e-07 8.08e-07 2.32e-07 2.62e-07
ENSG00000124532 MRS2 24415 3.44e-05 3.3e-05 6.39e-06 1.6e-05 6.08e-06 1.59e-05 4.36e-05 5.47e-06 3.43e-05 1.69e-05 4.36e-05 1.87e-05 5.15e-05 1.48e-05 7.14e-06 2.12e-05 1.83e-05 2.66e-05 8.18e-06 7.07e-06 1.72e-05 3.46e-05 3.09e-05 9.15e-06 4.78e-05 9.01e-06 1.61e-05 1.43e-05 3.09e-05 2.47e-05 2.48e-05 1.65e-06 2.95e-06 7.77e-06 1.26e-05 6.2e-06 3.64e-06 3.54e-06 5.18e-06 3.6e-06 1.77e-06 3.94e-05 4.22e-06 4.33e-07 2.74e-06 4.68e-06 4.55e-06 1.84e-06 1.53e-06
ENSG00000218186 \N -170689 4.9e-06 8.42e-06 1.24e-06 3.42e-06 1.66e-06 1.56e-06 5.71e-06 1.31e-06 4.88e-06 3.29e-06 7.02e-06 3.12e-06 8.92e-06 2.85e-06 9.49e-07 5.43e-06 3.71e-06 3.99e-06 1.58e-06 1.41e-06 3.52e-06 7.11e-06 4.77e-06 1.34e-06 9.17e-06 2.16e-06 2.97e-06 2.13e-06 4.56e-06 4.31e-06 4.13e-06 4.51e-07 7.27e-07 1.71e-06 2.09e-06 1.17e-06 1.19e-06 5.43e-07 8.69e-07 3.81e-07 2.25e-07 8.15e-06 1.47e-06 1.78e-07 5.79e-07 1.16e-06 9.67e-07 4.43e-07 2.55e-07
ENSG00000272345 AL031775.1 -274470 2.41e-06 3.93e-06 7.87e-07 1.84e-06 4.71e-07 8.2e-07 1.65e-06 8.31e-07 2.33e-06 1.35e-06 2.46e-06 1.4e-06 3.61e-06 1.24e-06 9.13e-07 2.23e-06 1.59e-06 2.25e-06 1.42e-06 1.13e-06 1.87e-06 3.44e-06 2.38e-06 1.01e-06 4.32e-06 1.36e-06 1.49e-06 1.75e-06 1.96e-06 1.86e-06 2.05e-06 2.62e-07 5.18e-07 8.37e-07 1.05e-06 8.84e-07 8.92e-07 4.75e-07 6.97e-07 2.97e-07 2.88e-07 3.89e-06 5.97e-07 1.74e-07 3.57e-07 3.1e-07 8.56e-07 2.49e-07 1.91e-07