Genes within 1Mb (chr6:139915511:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0194 0.141 0.06 B L1
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0745 0.124 0.06 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 2.86e-01 0.0778 0.0728 0.06 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 3.76e-01 -0.158 0.179 0.06 B L1
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0538 0.113 0.06 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 8.84e-01 0.0183 0.125 0.06 B L1
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.99e-01 0.000134 0.134 0.06 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 2.51e-01 -0.121 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00576 0.0775 0.06 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.98e-01 0.017 0.132 0.06 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 3.30e-01 0.127 0.13 0.06 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 3.36e-01 -0.122 0.126 0.06 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0212 0.119 0.06 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 5.41e-01 0.0413 0.0676 0.06 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0904 0.128 0.06 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 5.44e-01 0.0948 0.156 0.06 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 4.63e-01 -0.111 0.15 0.059 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.93e-01 0.0586 0.148 0.059 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 5.18e-01 0.0939 0.145 0.059 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.04e-01 0.0428 0.172 0.059 DC L1
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0536 0.117 0.06 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0422 0.0985 0.06 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 3.62e-01 0.117 0.128 0.06 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 4.03e-01 -0.113 0.135 0.06 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 4.04e-01 -0.113 0.135 0.06 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0608 0.129 0.06 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 9.80e-01 0.00238 0.0939 0.06 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 4.97e-01 0.0848 0.125 0.06 NK L1
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0148 0.133 0.06 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 7.68e-01 -0.042 0.142 0.06 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0162 0.0933 0.06 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 5.24e-01 0.0697 0.109 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 2.06e-01 0.265 0.209 0.056 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 2.99e-01 -0.228 0.219 0.056 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0312 0.199 0.056 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 4.48e-01 0.129 0.17 0.056 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 2.67e-01 0.238 0.214 0.056 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 2.35e-01 0.254 0.213 0.056 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00777 0.156 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 1.56e-01 -0.239 0.168 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 5.23e-01 0.0917 0.143 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 9.05e-02 -0.297 0.174 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 2.82e-01 0.174 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0798 0.175 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0341 0.158 0.06 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 1.19e-01 -0.266 0.17 0.06 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0521 0.135 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 4.86e-02 0.339 0.171 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 2.76e-01 0.173 0.158 0.06 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 3.51e-01 0.182 0.194 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0116 0.15 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 4.23e-01 -0.112 0.139 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 7.19e-01 0.035 0.0973 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 4.03e-01 -0.152 0.182 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 6.52e-01 0.0598 0.132 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0783 0.174 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0171 0.16 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 5.42e-02 0.293 0.152 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 1.42e-01 0.165 0.112 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 2.07e-01 -0.225 0.177 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 4.07e-01 -0.151 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0727 0.167 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 3.88e-01 0.154 0.178 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 9.43e-01 0.0123 0.173 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 9.92e-01 0.00155 0.158 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 5.79e-01 0.0881 0.158 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0894 0.163 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00989 0.13 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0532 0.115 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00253 0.0778 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00417 0.132 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0688 0.133 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.28e-01 0.0121 0.133 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 2.11e-03 -0.385 0.124 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 7.94e-01 0.0254 0.0973 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.82e-02 0.246 0.144 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 2.35e-03 0.471 0.153 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0117 0.145 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 3.46e-01 0.149 0.157 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 1.11e-01 0.179 0.112 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 3.50e-01 0.138 0.147 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 2.00e-01 0.198 0.154 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 5.90e-01 0.0754 0.14 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 7.70e-01 0.0438 0.15 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 3.25e-01 0.119 0.121 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 2.40e-01 -0.166 0.141 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 7.42e-01 0.0557 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0964 0.139 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 1.64e-01 -0.194 0.139 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0323 0.0731 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 1.77e-01 -0.199 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 6.05e-01 0.0875 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0307 0.147 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 9.10e-01 0.0173 0.153 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 8.92e-01 0.0207 0.152 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.12e-01 0.0372 0.156 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 3.19e-01 0.165 0.165 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000382 0.179 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0641 0.186 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 3.89e-01 0.124 0.143 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0981 0.156 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 6.27e-01 0.0861 0.177 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.79e-01 0.00394 0.153 0.061 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 4.05e-01 -0.137 0.164 0.061 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 4.75e-01 0.0865 0.121 0.061 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 5.98e-01 0.0751 0.142 0.061 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.33e-01 0.0357 0.169 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 2.80e-01 -0.171 0.157 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 3.55e-01 -0.134 0.145 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 9.03e-01 0.0191 0.156 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0964 0.144 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000276 0.137 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 4.28e-01 0.0736 0.0927 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 3.62e-01 0.113 0.124 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 4.24e-01 0.15 0.188 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 4.36e-01 -0.145 0.185 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 4.47e-01 0.116 0.152 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 9.71e-01 0.00601 0.163 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.11e-01 0.0167 0.149 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 1.35e-01 -0.23 0.153 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0489 0.099 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 4.81e-01 0.0913 0.129 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.20e-01 -0.058 0.255 0.056 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.77e-01 0.0943 0.226 0.056 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 9.28e-01 0.0144 0.158 0.056 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 5.62e-02 -0.439 0.227 0.056 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 6.38e-01 0.0821 0.174 0.056 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 8.00e-01 0.0592 0.233 0.056 PB L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 6.83e-01 -0.066 0.162 0.059 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 7.16e-01 0.0693 0.19 0.059 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 3.00e-01 -0.127 0.122 0.059 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 9.72e-01 0.00509 0.146 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.56e-01 -0.027 0.148 0.06 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.64e-01 0.0668 0.153 0.06 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 8.49e-01 -0.025 0.131 0.06 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.39e-01 0.0296 0.146 0.06 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 675858 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0876 0.167 0.06 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 1.46e-01 -0.266 0.182 0.051 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.81e-01 0.0851 0.207 0.051 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 4.20e-01 -0.136 0.169 0.051 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0759 0.179 0.051 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0773 0.118 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 7.37e-02 -0.274 0.153 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 2.85e-01 0.138 0.129 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0424 0.135 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 6.38e-01 0.0653 0.139 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0198 0.166 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 1.41e-01 0.213 0.144 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.75e-01 0.0226 0.143 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 4.40e-01 -0.181 0.233 0.052 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 2.80e-01 0.261 0.241 0.052 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0105 0.182 0.052 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 6.38e-01 0.0989 0.21 0.052 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0109 0.161 0.056 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.04e-01 0.0951 0.183 0.056 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 5.33e-01 0.104 0.167 0.056 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 1.61e-01 -0.228 0.162 0.056 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 5.46e-02 -0.319 0.165 0.054 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 2.42e-01 0.154 0.132 0.054 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0624 0.159 0.054 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 1.19e-02 -0.337 0.133 0.054 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.61e-01 0.027 0.154 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.57e-03 -0.43 0.156 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 6.60e-01 0.0486 0.11 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 2.17e-01 0.226 0.182 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 2.59e-01 0.175 0.155 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 6.88e-01 0.0724 0.18 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0596 0.15 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 7.64e-01 0.0386 0.128 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 6.63e-01 0.0392 0.0898 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 623513 sc-eQTL 1.05e-01 -0.305 0.187 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.60e-01 0.0242 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 644149 sc-eQTL 8.26e-01 0.0353 0.16 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 8.69e-01 0.0195 0.118 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 1.80e-01 -0.19 0.141 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 4.38e-01 0.0977 0.126 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0261 0.138 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 3.32e-01 -0.151 0.155 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.56e-01 0.0482 0.108 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 4.08e-01 0.131 0.158 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 4.50e-02 -0.272 0.135 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 780431 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0404 0.139 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 927250 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0694 0.136 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 886766 sc-eQTL 2.75e-01 0.0956 0.0873 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 540863 sc-eQTL 4.27e-01 0.101 0.126 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 \N 780431 2.8e-07 1.35e-07 5.93e-08 1.89e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.6e-07 5.66e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.08e-07 1.53e-07 7.37e-08 5.72e-08 7.74e-08 4.18e-08 1.44e-07 6.75e-08 4.92e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.44e-07 2.79e-08 1.63e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.04e-07 1.22e-07 9.49e-08 1.02e-07 3.99e-08 3.59e-08 8.72e-08 3.81e-08 2.79e-08 5.7e-08 8.89e-08 6.57e-08 4.19e-08 5e-08 1.46e-07 5.12e-08 1.19e-08 3.41e-08 1.68e-08 1.11e-07 1.96e-09 4.69e-08