Genes within 1Mb (chr6:139770398:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 2.63e-01 0.0982 0.0874 0.184 B L1
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 6.99e-01 0.033 0.0853 0.184 B L1
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 4.73e-01 0.0541 0.0753 0.184 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0253 0.0442 0.184 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 8.32e-01 0.023 0.108 0.184 B L1
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 3.15e-01 0.0686 0.0682 0.184 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 1.51e-01 -0.109 0.0756 0.184 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 8.53e-01 0.018 0.0969 0.184 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 2.09e-01 -0.102 0.0805 0.184 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0444 0.0634 0.184 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0707 0.0463 0.184 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0806 0.0793 0.184 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 6.00e-01 0.0412 0.0784 0.184 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0279 0.107 0.184 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0678 0.0764 0.184 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 4.26e-01 0.0574 0.0719 0.184 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0466 0.0409 0.184 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0895 0.0776 0.184 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 1.31e-01 0.143 0.0941 0.184 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 3.43e-01 0.106 0.111 0.178 DC L1
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 1.61e-02 0.219 0.0904 0.178 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0347 0.0903 0.178 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 7.94e-01 0.0231 0.0884 0.178 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 9.03e-01 0.0128 0.105 0.178 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 3.07e-01 0.0773 0.0755 0.184 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0303 0.0691 0.184 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 2.62e-01 0.0649 0.0578 0.184 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 7.61e-02 -0.133 0.0748 0.184 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 5.50e-04 -0.272 0.0775 0.184 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0928 0.094 0.182 NK L1
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 2.03e-01 -0.104 0.0811 0.182 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 8.30e-01 0.0167 0.0775 0.182 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 8.60e-01 -0.01 0.0566 0.182 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0276 0.0752 0.182 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0146 0.111 0.184 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0879 0.0801 0.184 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 1.44e-01 -0.126 0.0859 0.184 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0759 0.0563 0.184 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 4.19e-01 0.0535 0.0661 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0709 0.122 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 6.00e-01 0.0613 0.117 0.181 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0259 0.122 0.181 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0771 0.11 0.181 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0183 0.0947 0.181 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0525 0.119 0.181 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0133 0.119 0.181 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 5.56e-01 0.0656 0.111 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 1.62e-01 0.135 0.096 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0681 0.104 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 2.34e-01 -0.105 0.0883 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 7.02e-01 0.0415 0.108 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.40e-01 0.0332 0.0998 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 7.69e-02 -0.191 0.107 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 5.28e-01 0.0715 0.113 0.177 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000255 0.0979 0.177 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0502 0.106 0.177 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 2.04e-01 -0.107 0.0836 0.177 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 1.62e-01 0.15 0.107 0.177 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 4.11e-01 0.0809 0.0982 0.177 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 7.72e-01 0.035 0.121 0.177 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 5.92e-01 0.0564 0.105 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0279 0.0917 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0532 0.0848 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0499 0.0592 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 7.68e-01 0.0329 0.111 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 1.58e-01 0.114 0.0805 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0944 0.106 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 2.97e-01 0.109 0.104 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0962 0.0978 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 2.02e-01 0.119 0.0932 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 1.40e-01 0.101 0.0685 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0534 0.109 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 2.15e-01 -0.138 0.111 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 7.10e-01 0.038 0.102 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.105 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 5.58e-01 0.0625 0.106 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 9.23e-01 0.00996 0.103 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00789 0.0942 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 1.43e-01 -0.138 0.0941 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0554 0.0975 0.184 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 7.74e-01 0.0293 0.102 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 1.49e-01 -0.114 0.0787 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0344 0.0701 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 3.22e-02 -0.101 0.0467 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 1.07e-01 -0.129 0.0797 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0632 0.081 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0786 0.0999 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0769 0.0798 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 3.38e-02 -0.16 0.075 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 9.51e-02 -0.0972 0.058 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0378 0.0867 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 1.83e-01 0.125 0.0933 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 3.15e-01 -0.114 0.113 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0737 0.0878 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 9.87e-01 0.00162 0.0958 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 2.66e-01 0.0761 0.0681 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.54e-01 0.0281 0.0897 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 4.15e-01 0.0765 0.0937 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00465 0.116 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0877 0.0839 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0621 0.09 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 5.97e-01 0.0385 0.0728 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0539 0.0848 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 7.57e-02 0.18 0.101 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0413 0.11 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 1.47e-01 -0.123 0.0843 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 7.33e-01 -0.029 0.0849 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0682 0.0443 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 5.98e-02 -0.169 0.0893 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 4.61e-01 0.0761 0.103 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 3.78e-01 0.109 0.123 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0167 0.0903 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0103 0.0938 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0762 0.0934 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 6.55e-01 -0.043 0.096 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 4.43e-01 0.0778 0.101 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0051 0.117 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 4.49e-01 0.0831 0.109 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 8.87e-02 0.194 0.113 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0179 0.0879 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 2.87e-02 -0.208 0.0944 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 6.07e-01 0.0559 0.109 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 9.78e-01 0.00333 0.123 0.18 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 9.50e-01 0.00592 0.0934 0.18 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 1.21e-01 -0.156 0.1 0.18 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0129 0.074 0.18 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 3.03e-01 0.0898 0.0869 0.18 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 1.47e-01 -0.161 0.11 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0109 0.101 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0211 0.0938 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0493 0.0864 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0239 0.0927 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0755 0.101 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0793 0.0869 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.85e-01 0.0335 0.0825 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 8.07e-01 0.0137 0.0558 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 5.22e-01 0.0477 0.0744 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0797 0.116 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 5.91e-02 -0.204 0.107 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 1.82e-01 -0.143 0.107 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0861 0.0878 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0681 0.0939 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 9.52e-01 0.00627 0.105 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0562 0.0901 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 5.54e-01 0.0551 0.0931 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 9.82e-01 0.00137 0.06 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0848 0.0781 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0144 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 6.88e-01 0.0568 0.141 0.181 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 5.63e-01 0.0728 0.125 0.181 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0228 0.0879 0.181 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0864 0.128 0.181 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 5.52e-01 0.0575 0.0965 0.181 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 2.18e-01 0.16 0.129 0.181 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0739 0.114 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 1.94e-01 -0.117 0.0895 0.185 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0406 0.106 0.185 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 2.08e-02 -0.157 0.0674 0.185 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 8.45e-01 -0.016 0.0813 0.185 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 7.95e-01 0.0287 0.11 0.184 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0811 0.0913 0.184 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0316 0.0947 0.184 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 1.62e-01 -0.113 0.0803 0.184 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0344 0.09 0.184 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 530745 sc-eQTL 9.57e-01 0.00552 0.103 0.184 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 4.27e-03 0.325 0.112 0.156 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 4.83e-01 0.0766 0.109 0.156 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.79e-01 0.051 0.123 0.156 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0478 0.101 0.156 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0551 0.107 0.156 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 7.33e-02 0.149 0.083 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0676 0.0689 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 4.00e-01 0.0757 0.0897 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0565 0.0754 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 3.55e-03 -0.228 0.0774 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 4.75e-01 -0.069 0.0963 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 9.60e-01 0.00405 0.0815 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0438 0.0977 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 1.36e-01 -0.126 0.0845 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 2.63e-02 -0.186 0.0832 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0547 0.132 0.173 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 9.66e-01 0.00531 0.126 0.173 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0475 0.13 0.173 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0512 0.0978 0.173 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 6.01e-01 -0.059 0.113 0.173 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 2.89e-02 0.245 0.111 0.176 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 6.90e-01 0.0369 0.0924 0.176 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 4.13e-01 0.0863 0.105 0.176 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 4.02e-02 -0.196 0.095 0.176 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.03e-02 -0.168 0.0925 0.176 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0129 0.106 0.179 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0504 0.0964 0.179 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 1.17e-01 0.12 0.0759 0.179 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 3.69e-02 -0.191 0.091 0.179 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 1.34e-02 -0.192 0.0769 0.179 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 1.44e-01 -0.184 0.126 0.172 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.172 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 2.86e-01 -0.106 0.0988 0.172 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 5.62e-01 0.063 0.108 0.172 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 4.15e-01 0.104 0.127 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 4.10e-01 0.0868 0.105 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 1.39e-01 0.139 0.0932 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 2.28e-01 -0.117 0.0968 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 4.98e-02 -0.132 0.0667 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 2.63e-01 0.125 0.111 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 5.51e-01 0.0564 0.0945 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 2.50e-01 -0.126 0.11 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 4.15e-01 0.0802 0.0982 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0338 0.0919 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.55e-01 0.0351 0.0783 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0302 0.0549 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 478400 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00137 0.115 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 3.51e-01 0.0781 0.0834 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 499036 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0264 0.0982 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 3.37e-01 0.0737 0.0766 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0324 0.0688 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.92e-01 0.0328 0.0828 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 1.36e-01 -0.11 0.0733 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 2.08e-03 -0.246 0.0789 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 5.29e-01 0.0656 0.104 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 7.19e-01 -0.032 0.089 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 1.84e-01 0.0819 0.0614 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 2.45e-02 -0.202 0.0891 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.47e-03 -0.206 0.0764 0.179 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0657 0.0973 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 635318 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0944 0.0828 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 782137 sc-eQTL 6.61e-01 0.0356 0.0811 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 741653 sc-eQTL 9.89e-01 0.000702 0.0524 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 395750 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0196 0.0757 0.181 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 996889 eQTL 0.0488 -0.0382 0.0193 0.0 0.0 0.188
ENSG00000164442 CITED2 395750 eQTL 0.00391 -0.0789 0.0273 0.00389 0.00198 0.188


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina