Genes within 1Mb (chr6:139644663:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0857 0.119 0.1 B L1
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 3.22e-01 0.115 0.116 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 7.92e-01 0.027 0.103 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 5.03e-02 0.118 0.0597 0.1 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 6.52e-01 0.0667 0.148 0.1 B L1
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.28e-01 0.0203 0.093 0.1 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00949 0.103 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0625 0.131 0.1 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.76e-01 0.0456 0.109 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 9.22e-01 0.00838 0.0858 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00427 0.063 0.1 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 6.98e-01 0.0418 0.107 0.1 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0445 0.106 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 1.30e-01 -0.219 0.144 0.1 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 4.85e-01 0.0725 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 3.46e-01 0.0919 0.0974 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0193 0.0555 0.1 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 6.70e-01 -0.045 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 5.77e-01 0.0715 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 6.62e-01 0.0629 0.144 0.101 DC L1
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 8.01e-01 0.0298 0.118 0.101 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0481 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 6.04e-01 0.0605 0.116 0.101 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 9.34e-01 0.00951 0.114 0.101 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 1.82e-02 -0.318 0.133 0.101 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 4.61e-01 -0.102 0.137 0.101 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0642 0.103 0.1 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 4.56e-01 0.07 0.0938 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 3.96e-01 0.114 0.134 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 3.82e-01 0.0688 0.0786 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 1.31e-01 -0.155 0.102 0.1 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 1.35e-01 -0.162 0.108 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0123 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0371 0.129 0.099 NK L1
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 2.57e-01 0.126 0.111 0.099 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 4.45e-01 0.0809 0.106 0.099 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 6.18e-01 0.0386 0.0772 0.099 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 9.43e-01 0.0074 0.103 0.099 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 5.29e-01 0.097 0.154 0.1 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 2.58e-01 -0.126 0.111 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.85e-01 0.128 0.119 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 2.26e-01 0.0948 0.0781 0.1 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0967 0.0915 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 8.36e-01 -0.034 0.165 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 4.58e-01 0.116 0.157 0.105 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 3.02e-01 0.169 0.164 0.105 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 4.68e-01 0.108 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 1.89e-03 0.39 0.124 0.105 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 4.22e-01 0.128 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 8.71e-01 0.0261 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 2.16e-01 0.178 0.144 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.21e-01 0.0618 0.125 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 6.33e-02 0.25 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 6.57e-01 -0.051 0.115 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 8.02e-01 0.0352 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0315 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 7.68e-01 0.0414 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 4.52e-01 0.111 0.148 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 9.74e-01 0.00424 0.128 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0621 0.139 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 2.36e-01 -0.13 0.109 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0216 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0118 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 7.24e-01 0.0559 0.158 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00718 0.141 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 1.97e-01 0.158 0.122 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 8.83e-01 0.0168 0.113 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 1.73e-01 0.108 0.079 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0343 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0191 0.108 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 2.10e-01 -0.178 0.141 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0839 0.134 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0132 0.126 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.76e-01 -0.131 0.12 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 2.86e-02 0.194 0.0878 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0948 0.141 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 6.97e-01 0.056 0.143 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.132 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 5.70e-01 0.0823 0.145 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 3.93e-01 0.125 0.146 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 3.57e-01 -0.131 0.142 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 2.00e-01 0.165 0.129 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.07e-01 0.0318 0.13 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0979 0.134 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0668 0.137 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.66e-01 0.0459 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.85e-01 -0.101 0.0941 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0415 0.0634 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.66e-01 0.0182 0.108 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 9.78e-01 0.00301 0.109 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 4.68e-01 0.0989 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0463 0.109 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.06e-01 0.131 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 4.82e-01 0.0559 0.0794 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 5.94e-01 -0.063 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0735 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 8.67e-02 -0.264 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0619 0.12 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 3.19e-01 -0.131 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 8.61e-01 0.0164 0.0934 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 1.03e-01 -0.199 0.122 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0922 0.128 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 2.25e-01 0.187 0.154 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 4.95e-01 0.0769 0.113 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 4.38e-01 0.0937 0.12 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 6.79e-01 0.0405 0.0975 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0254 0.114 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 1.95e-01 0.176 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 1.22e-01 -0.232 0.15 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 7.11e-01 0.0431 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 6.79e-01 0.0483 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 4.20e-01 0.0493 0.061 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 6.11e-01 0.0628 0.123 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 6.07e-01 0.0728 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0827 0.162 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 2.67e-01 0.131 0.118 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0694 0.123 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 3.78e-01 0.108 0.122 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 6.83e-02 -0.229 0.125 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 9.91e-01 0.00144 0.133 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 1.21e-01 -0.241 0.155 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 5.48e-01 0.0877 0.146 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.55e-01 0.173 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 8.92e-01 0.0159 0.117 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0242 0.127 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 3.77e-01 0.128 0.144 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 7.72e-01 0.0481 0.166 0.097 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 1.23e-01 -0.194 0.125 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 3.28e-01 0.133 0.136 0.097 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 1.04e-01 0.162 0.0993 0.097 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 2.01e-01 -0.15 0.117 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 3.32e-01 -0.148 0.152 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0122 0.138 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0853 0.129 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 5.38e-01 0.0731 0.119 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 6.43e-01 -0.059 0.127 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 7.29e-01 -0.048 0.138 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.01e-02 0.223 0.118 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 1.20e-01 0.175 0.112 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 2.26e-01 0.0926 0.0762 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0176 0.102 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 4.04e-01 0.136 0.162 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 9.79e-01 0.00408 0.152 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.44e-01 0.175 0.15 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0361 0.124 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.53e-01 0.0246 0.132 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 5.29e-01 0.0885 0.14 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 3.04e-01 -0.124 0.121 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0816 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00588 0.0805 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0289 0.105 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 2.02e-01 0.193 0.15 0.115 PB L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 4.66e-01 -0.12 0.164 0.115 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.14e-01 -0.181 0.145 0.115 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 7.08e-04 0.338 0.0971 0.115 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 1.09e-01 0.239 0.148 0.115 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 8.87e-01 -0.016 0.112 0.115 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 5.78e-01 0.084 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 3.11e-02 0.326 0.15 0.102 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.45e-01 0.0552 0.119 0.102 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 4.29e-01 -0.111 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 5.18e-01 0.0588 0.0907 0.102 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 7.73e-01 0.0313 0.108 0.102 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0114 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0511 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 5.65e-01 0.072 0.125 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0462 0.106 0.1 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0967 0.119 0.1 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 405010 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00442 0.136 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 7.04e-01 -0.054 0.142 0.102 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 8.46e-01 0.0263 0.135 0.102 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 8.05e-01 0.0326 0.132 0.102 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 1.30e-01 -0.23 0.151 0.102 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00254 0.124 0.102 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 5.04e-02 -0.257 0.13 0.102 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 2.41e-01 -0.171 0.145 0.102 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 6.66e-01 0.0481 0.111 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 9.39e-01 0.00701 0.0919 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 5.48e-01 0.0805 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 9.32e-01 0.0102 0.119 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 1.02e-01 -0.164 0.0998 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 7.04e-02 -0.19 0.104 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0744 0.14 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 8.01e-01 0.0325 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 5.63e-01 0.0629 0.109 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 4.31e-01 0.109 0.138 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 4.91e-01 0.09 0.13 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0414 0.113 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0924 0.112 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0251 0.151 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 9.72e-02 -0.313 0.188 0.103 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 1.98e-01 -0.231 0.179 0.103 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 4.69e-01 -0.135 0.186 0.103 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 7.26e-01 0.0491 0.14 0.103 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 2.70e-01 0.178 0.161 0.103 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 6.88e-02 -0.269 0.147 0.1 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 2.01e-01 0.156 0.121 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0506 0.134 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0676 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0903 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 3.73e-01 0.109 0.123 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 3.96e-01 0.128 0.15 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 2.80e-01 -0.151 0.139 0.095 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 1.53e-02 0.308 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 7.34e-02 0.24 0.133 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 1.48e-01 0.146 0.101 0.095 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 6.58e-01 0.054 0.122 0.095 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 3.66e-01 0.0937 0.103 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 1.67e-01 -0.206 0.148 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 8.09e-01 0.0399 0.165 0.096 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 3.83e-01 0.122 0.139 0.096 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 2.26e-01 -0.154 0.127 0.096 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 5.57e-01 0.0759 0.129 0.096 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 5.11e-01 -0.093 0.141 0.096 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 4.28e-01 -0.132 0.166 0.096 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 1.35e-01 0.191 0.127 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 1.57e-01 0.197 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 6.41e-01 0.0579 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.26e-01 0.155 0.128 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0566 0.089 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 1.27e-01 0.225 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 9.61e-01 0.00616 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 8.79e-01 0.0222 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 3.88e-01 -0.114 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 1.55e-01 0.175 0.122 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 9.73e-01 0.00352 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 1.60e-02 0.176 0.0726 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 352665 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0928 0.154 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00975 0.112 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 373301 sc-eQTL 1.87e-01 -0.173 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 6.24e-01 0.0505 0.103 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 8.67e-01 0.0155 0.0923 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 3.69e-01 0.121 0.135 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 7.52e-01 0.0352 0.111 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 1.82e-01 -0.132 0.0983 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 2.36e-01 -0.128 0.108 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 7.99e-01 -0.037 0.145 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 2.31e-02 -0.32 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 2.64e-02 0.267 0.119 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 952092 sc-eQTL 6.24e-01 0.0659 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 6.99e-01 0.0324 0.0835 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0565 0.122 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 3.12e-01 0.107 0.105 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 952115 sc-eQTL 9.38e-01 0.0115 0.148 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 871154 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0197 0.134 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 509583 sc-eQTL 3.12e-01 0.115 0.114 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 656402 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 615918 sc-eQTL 4.51e-01 0.0541 0.0717 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 270015 sc-eQTL 9.78e-01 0.00287 0.104 0.099 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 270015 eQTL 0.00775 -0.104 0.0391 0.00219 0.0 0.0839


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina