logo

Genes within 1Mb (chr6:139641050:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0857 0.119 0.1 B L1
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 3.22e-01 0.115 0.116 0.1 B L1
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 7.92e-01 0.027 0.103 0.1 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 5.03e-02 0.118 0.0597 0.1 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 6.52e-01 0.0667 0.148 0.1 B L1
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.28e-01 0.0203 0.093 0.1 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00949 0.103 0.1 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0625 0.131 0.1 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.76e-01 0.0456 0.109 0.1 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 9.22e-01 0.00838 0.0858 0.1 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00427 0.063 0.1 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 6.98e-01 0.0418 0.107 0.1 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0445 0.106 0.1 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 1.30e-01 -0.219 0.144 0.1 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 4.85e-01 0.0725 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 3.46e-01 0.0919 0.0974 0.1 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0193 0.0555 0.1 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 6.70e-01 -0.045 0.105 0.1 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 5.77e-01 0.0715 0.128 0.1 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 6.62e-01 0.0629 0.144 0.101 DC L1
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 8.01e-01 0.0298 0.118 0.101 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0481 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 6.04e-01 0.0605 0.116 0.101 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 9.34e-01 0.00951 0.114 0.101 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 1.82e-02 -0.318 0.133 0.101 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 4.61e-01 -0.102 0.137 0.101 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0642 0.103 0.1 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 4.56e-01 0.07 0.0938 0.1 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 3.96e-01 0.114 0.134 0.1 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 3.82e-01 0.0688 0.0786 0.1 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 1.31e-01 -0.155 0.102 0.1 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 1.35e-01 -0.162 0.108 0.1 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0123 0.14 0.1 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0371 0.129 0.099 NK L1
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 2.57e-01 0.126 0.111 0.099 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 4.45e-01 0.0809 0.106 0.099 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 6.18e-01 0.0386 0.0772 0.099 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 9.43e-01 0.0074 0.103 0.099 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 5.29e-01 0.097 0.154 0.1 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 2.58e-01 -0.126 0.111 0.1 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.85e-01 0.128 0.119 0.1 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 2.26e-01 0.0948 0.0781 0.1 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0967 0.0915 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 8.36e-01 -0.034 0.165 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 4.58e-01 0.116 0.157 0.105 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 3.02e-01 0.169 0.164 0.105 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 4.68e-01 0.108 0.148 0.105 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 1.89e-03 0.39 0.124 0.105 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 4.22e-01 0.128 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 8.71e-01 0.0261 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 2.16e-01 0.178 0.144 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.21e-01 0.0618 0.125 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 6.33e-02 0.25 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 6.57e-01 -0.051 0.115 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 8.02e-01 0.0352 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0315 0.129 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 7.68e-01 0.0414 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 4.52e-01 0.111 0.148 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 9.74e-01 0.00424 0.128 0.101 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0621 0.139 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 2.36e-01 -0.13 0.109 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0216 0.14 0.101 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0118 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 7.24e-01 0.0559 0.158 0.101 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00718 0.141 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 1.97e-01 0.158 0.122 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 8.83e-01 0.0168 0.113 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 1.73e-01 0.108 0.079 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0343 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0191 0.108 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 2.10e-01 -0.178 0.141 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0839 0.134 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0132 0.126 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.76e-01 -0.131 0.12 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 2.86e-02 0.194 0.0878 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0948 0.141 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 6.97e-01 0.056 0.143 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 3.66e-01 -0.119 0.132 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 5.70e-01 0.0823 0.145 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 3.93e-01 0.125 0.146 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 3.57e-01 -0.131 0.142 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 2.00e-01 0.165 0.129 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.07e-01 0.0318 0.13 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0979 0.134 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0668 0.137 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.66e-01 0.0459 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.85e-01 -0.101 0.0941 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0415 0.0634 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.66e-01 0.0182 0.108 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 9.78e-01 0.00301 0.109 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 4.68e-01 0.0989 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0463 0.109 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.06e-01 0.131 0.103 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 4.82e-01 0.0559 0.0794 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 5.94e-01 -0.063 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0735 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 8.67e-02 -0.264 0.153 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0619 0.12 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 3.19e-01 -0.131 0.131 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 8.61e-01 0.0164 0.0934 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 1.03e-01 -0.199 0.122 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0922 0.128 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 2.25e-01 0.187 0.154 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 4.95e-01 0.0769 0.113 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 4.38e-01 0.0937 0.12 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 6.79e-01 0.0405 0.0975 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0254 0.114 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 1.95e-01 0.176 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 1.22e-01 -0.232 0.15 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 7.11e-01 0.0431 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 6.79e-01 0.0483 0.116 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 4.20e-01 0.0493 0.061 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 6.11e-01 0.0628 0.123 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 6.07e-01 0.0728 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0827 0.162 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 2.67e-01 0.131 0.118 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0694 0.123 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 3.78e-01 0.108 0.122 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 6.83e-02 -0.229 0.125 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 9.91e-01 0.00144 0.133 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 1.21e-01 -0.241 0.155 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 5.48e-01 0.0877 0.146 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.55e-01 0.173 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 8.92e-01 0.0159 0.117 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0242 0.127 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 3.77e-01 0.128 0.144 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 7.72e-01 0.0481 0.166 0.097 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 1.23e-01 -0.194 0.125 0.097 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 3.28e-01 0.133 0.136 0.097 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 1.04e-01 0.162 0.0993 0.097 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 2.01e-01 -0.15 0.117 0.097 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 3.32e-01 -0.148 0.152 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0122 0.138 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0853 0.129 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 5.38e-01 0.0731 0.119 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 6.43e-01 -0.059 0.127 0.098 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 7.29e-01 -0.048 0.138 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.01e-02 0.223 0.118 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 1.20e-01 0.175 0.112 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 2.26e-01 0.0926 0.0762 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0176 0.102 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 4.04e-01 0.136 0.162 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 9.79e-01 0.00408 0.152 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.44e-01 0.175 0.15 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0361 0.124 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.53e-01 0.0246 0.132 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 5.29e-01 0.0885 0.14 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 3.04e-01 -0.124 0.121 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0816 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00588 0.0805 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0289 0.105 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 2.02e-01 0.193 0.15 0.115 PB L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 4.66e-01 -0.12 0.164 0.115 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.14e-01 -0.181 0.145 0.115 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 7.08e-04 0.338 0.0971 0.115 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 1.09e-01 0.239 0.148 0.115 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 8.87e-01 -0.016 0.112 0.115 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 5.78e-01 0.084 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 3.11e-02 0.326 0.15 0.102 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.45e-01 0.0552 0.119 0.102 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 4.29e-01 -0.111 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 5.18e-01 0.0588 0.0907 0.102 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 7.73e-01 0.0313 0.108 0.102 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0114 0.145 0.1 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0511 0.121 0.1 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 5.65e-01 0.072 0.125 0.1 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0462 0.106 0.1 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0967 0.119 0.1 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 401397 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00442 0.136 0.1 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 7.04e-01 -0.054 0.142 0.102 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 8.46e-01 0.0263 0.135 0.102 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 8.05e-01 0.0326 0.132 0.102 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 1.30e-01 -0.23 0.151 0.102 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00254 0.124 0.102 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 5.04e-02 -0.257 0.13 0.102 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 2.41e-01 -0.171 0.145 0.102 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 6.66e-01 0.0481 0.111 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 9.39e-01 0.00701 0.0919 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 5.48e-01 0.0805 0.134 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 9.32e-01 0.0102 0.119 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 1.02e-01 -0.164 0.0998 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 7.04e-02 -0.19 0.104 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0744 0.14 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 8.01e-01 0.0325 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 5.63e-01 0.0629 0.109 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 4.31e-01 0.109 0.138 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 4.91e-01 0.09 0.13 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0414 0.113 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0924 0.112 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0251 0.151 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 9.72e-02 -0.313 0.188 0.103 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 1.98e-01 -0.231 0.179 0.103 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 4.69e-01 -0.135 0.186 0.103 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 7.26e-01 0.0491 0.14 0.103 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 2.70e-01 0.178 0.161 0.103 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 6.88e-02 -0.269 0.147 0.1 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 2.01e-01 0.156 0.121 0.1 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0506 0.134 0.1 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0676 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0903 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 3.73e-01 0.109 0.123 0.1 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 3.96e-01 0.128 0.15 0.1 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 2.80e-01 -0.151 0.139 0.095 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 1.53e-02 0.308 0.126 0.095 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 7.34e-02 0.24 0.133 0.095 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 1.48e-01 0.146 0.101 0.095 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 6.58e-01 0.054 0.122 0.095 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 3.66e-01 0.0937 0.103 0.095 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 1.67e-01 -0.206 0.148 0.095 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 8.09e-01 0.0399 0.165 0.096 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 3.83e-01 0.122 0.139 0.096 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 2.26e-01 -0.154 0.127 0.096 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 5.57e-01 0.0759 0.129 0.096 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 5.11e-01 -0.093 0.141 0.096 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 4.28e-01 -0.132 0.166 0.096 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 1.35e-01 0.191 0.127 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 1.57e-01 0.197 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 6.41e-01 0.0579 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.26e-01 0.155 0.128 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0566 0.089 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 1.27e-01 0.225 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 9.61e-01 0.00616 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 8.79e-01 0.0222 0.146 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 3.88e-01 -0.114 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 1.55e-01 0.175 0.122 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 9.73e-01 0.00352 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 1.60e-02 0.176 0.0726 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 349052 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0928 0.154 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00975 0.112 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 369688 sc-eQTL 1.87e-01 -0.173 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 6.24e-01 0.0505 0.103 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 8.67e-01 0.0155 0.0923 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 3.69e-01 0.121 0.135 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 7.52e-01 0.0352 0.111 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 1.82e-01 -0.132 0.0983 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 2.36e-01 -0.128 0.108 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 7.99e-01 -0.037 0.145 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 2.31e-02 -0.32 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 2.64e-02 0.267 0.119 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 948479 sc-eQTL 6.24e-01 0.0659 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 6.99e-01 0.0324 0.0835 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0565 0.122 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 3.12e-01 0.107 0.105 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 948502 sc-eQTL 9.38e-01 0.0115 0.148 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 867541 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0197 0.134 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 505970 sc-eQTL 3.12e-01 0.115 0.114 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 652789 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 612305 sc-eQTL 4.51e-01 0.0541 0.0717 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 266402 sc-eQTL 9.78e-01 0.00287 0.104 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 266402 eQTL 0.00713 -0.105 0.0389 0.00228 0.0 0.0849

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina