logo

Genes within 1Mb (chr6:139639564:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0262 0.103 0.145 B L1
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 5.89e-01 0.0543 0.1 0.145 B L1
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 4.43e-02 0.178 0.0879 0.145 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 6.90e-01 0.0208 0.0521 0.145 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 6.64e-01 0.0555 0.128 0.145 B L1
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0342 0.0804 0.145 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 4.52e-02 0.178 0.0886 0.145 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0596 0.114 0.145 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 2.11e-01 0.119 0.0946 0.145 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0828 0.0744 0.145 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 3.75e-02 -0.113 0.0542 0.145 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.75e-01 0.0829 0.0933 0.145 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 1.03e-01 -0.15 0.0916 0.145 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 1.43e-01 0.179 0.122 0.145 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 4.26e-01 0.0698 0.0876 0.145 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 3.50e-01 0.0771 0.0823 0.145 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.25e-01 -0.057 0.0468 0.145 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 2.75e-01 0.0973 0.0889 0.145 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0177 0.108 0.145 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 1.74e-01 0.166 0.122 0.14 DC L1
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 6.64e-01 0.0438 0.101 0.14 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 1.33e-01 0.169 0.112 0.14 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 1.66e-01 0.137 0.0988 0.14 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0532 0.0971 0.14 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 1.40e-01 0.17 0.115 0.14 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 7.59e-01 -0.036 0.117 0.14 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0902 0.0892 0.145 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0257 0.0816 0.145 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 7.96e-01 0.0302 0.117 0.145 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.64e-01 0.0206 0.0684 0.145 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 3.28e-04 -0.315 0.0863 0.145 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 2.85e-01 -0.101 0.0939 0.145 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0637 0.121 0.145 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 6.39e-01 0.0517 0.11 0.146 NK L1
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 5.20e-01 0.0612 0.0951 0.146 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.24e-01 0.0321 0.0906 0.146 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 8.39e-02 -0.114 0.0657 0.146 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0198 0.0879 0.146 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 5.60e-01 0.0743 0.127 0.145 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 2.69e-01 0.102 0.092 0.145 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00157 0.0992 0.145 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0861 0.0647 0.145 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 5.17e-03 0.211 0.0747 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 8.69e-01 0.024 0.145 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 8.88e-01 0.0195 0.138 0.143 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 6.90e-01 0.0578 0.145 0.143 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 6.51e-01 0.0593 0.131 0.143 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0926 0.112 0.143 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0991 0.141 0.143 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 2.12e-01 0.176 0.14 0.143 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 7.40e-01 0.0415 0.125 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0427 0.108 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 2.14e-01 0.145 0.116 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0831 0.0993 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 4.15e-02 0.247 0.121 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0278 0.112 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 5.94e-01 0.0647 0.121 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0187 0.127 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 7.66e-01 0.0327 0.11 0.147 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 5.22e-01 0.0762 0.119 0.147 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 6.25e-01 -0.046 0.094 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0357 0.12 0.147 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 1.89e-01 -0.145 0.11 0.147 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00187 0.135 0.147 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 3.82e-01 0.105 0.12 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 1.63e-01 0.145 0.104 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.08e-01 0.0363 0.0966 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 1.85e-01 0.0895 0.0673 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 3.26e-01 0.124 0.126 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0943 0.0919 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0418 0.121 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00839 0.118 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 1.81e-01 0.149 0.111 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 3.02e-01 0.11 0.106 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 8.26e-02 0.135 0.0775 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0926 0.123 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.50e-01 -0.118 0.126 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 5.15e-01 0.0755 0.116 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0435 0.121 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 7.16e-01 0.0445 0.122 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 8.14e-01 0.028 0.119 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 3.00e-01 0.112 0.108 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.29e-01 0.106 0.108 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 9.99e-01 0.000195 0.112 0.148 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 2.53e-01 -0.136 0.118 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 2.72e-01 0.101 0.092 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0366 0.0818 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.52e-01 -0.063 0.0549 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 1.87e-01 0.123 0.0931 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 1.46e-01 -0.138 0.0941 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 7.91e-01 0.0315 0.118 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 1.09e-01 0.151 0.0941 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0943 0.0896 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 5.95e-02 -0.13 0.0685 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 1.59e-01 0.145 0.102 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 2.61e-01 -0.125 0.111 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 2.44e-01 0.153 0.131 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0112 0.102 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0185 0.111 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 1.63e-01 -0.111 0.0791 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 9.04e-01 0.0126 0.104 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 5.25e-01 0.0694 0.109 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 7.67e-01 0.0391 0.132 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0289 0.096 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0264 0.103 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0384 0.0831 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 2.99e-01 0.101 0.0966 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0404 0.116 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 1.98e-01 0.164 0.127 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 1.21e-01 0.153 0.098 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 5.92e-01 0.053 0.0987 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0616 0.0517 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 4.80e-01 0.0739 0.105 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 8.79e-01 0.0183 0.12 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 3.45e-01 0.136 0.144 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 3.47e-01 0.0991 0.105 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00144 0.11 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 8.03e-01 0.0272 0.109 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.79e-01 0.0988 0.112 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 1.22e-01 -0.183 0.118 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 5.05e-01 0.0865 0.13 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 8.47e-01 0.0235 0.121 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 5.02e-01 0.0849 0.126 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.94e-01 -0.102 0.0971 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.80e-01 0.093 0.106 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0935 0.12 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 8.76e-01 0.0218 0.14 0.143 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00408 0.106 0.143 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0288 0.114 0.143 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 5.95e-01 0.0447 0.0839 0.143 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.50e-03 0.286 0.0969 0.143 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0511 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0149 0.116 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 1.55e-02 0.259 0.106 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0757 0.0991 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 6.80e-01 -0.044 0.106 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 3.34e-01 0.115 0.119 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 5.82e-01 0.0565 0.103 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0356 0.0973 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 5.47e-02 -0.126 0.0653 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0296 0.0878 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 5.23e-02 0.261 0.134 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00191 0.126 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 2.42e-01 0.146 0.124 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.51e-01 -0.117 0.102 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0386 0.109 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0748 0.121 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 8.37e-01 0.0215 0.104 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0143 0.108 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0519 0.0693 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 8.00e-01 0.023 0.0906 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 6.98e-01 0.0558 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 1.67e-01 0.215 0.155 0.152 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 3.88e-01 -0.12 0.138 0.152 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.91e-01 -0.102 0.0965 0.152 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 8.05e-01 0.0349 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 1.52e-01 0.152 0.106 0.152 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 1.80e-01 0.192 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 2.35e-01 -0.157 0.132 0.148 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 9.97e-01 0.000387 0.104 0.148 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 6.69e-01 0.0524 0.123 0.148 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0671 0.0789 0.148 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 9.16e-01 0.00998 0.0942 0.148 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 1.64e-01 -0.176 0.126 0.145 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0822 0.105 0.145 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0741 0.109 0.145 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 8.83e-02 -0.158 0.0923 0.145 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 9.53e-01 0.00611 0.104 0.145 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 399911 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0679 0.119 0.145 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 4.81e-01 0.0875 0.124 0.149 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 1.14e-01 0.186 0.117 0.149 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 3.05e-01 0.119 0.115 0.149 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 6.23e-01 0.0656 0.133 0.149 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0763 0.109 0.149 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.60e-01 0.106 0.115 0.149 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 9.92e-01 0.00124 0.127 0.149 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00559 0.0981 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 8.43e-01 -0.016 0.081 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 7.02e-01 0.0452 0.118 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 1.09e-01 0.169 0.105 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 8.78e-05 -0.342 0.0855 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0329 0.0927 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0719 0.123 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 1.40e-02 -0.273 0.11 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 6.83e-01 0.0385 0.0944 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 2.48e-01 -0.138 0.119 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0998 0.113 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 1.00e-02 -0.252 0.0969 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0977 0.0972 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0673 0.131 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 9.05e-03 0.405 0.153 0.136 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 2.00e-01 0.19 0.148 0.136 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 4.09e-01 -0.127 0.154 0.136 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00646 0.116 0.136 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 9.34e-01 -0.011 0.134 0.136 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 4.31e-01 0.104 0.132 0.142 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 2.14e-01 0.135 0.108 0.142 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 8.94e-01 0.016 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.08e-01 0.0463 0.124 0.142 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.68e-03 -0.335 0.11 0.142 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 9.84e-01 0.00225 0.11 0.142 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 2.89e-01 -0.142 0.134 0.142 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00554 0.12 0.147 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 3.36e-01 -0.106 0.11 0.147 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 3.65e-01 0.105 0.115 0.147 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0207 0.0871 0.147 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 2.54e-01 -0.12 0.105 0.147 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 2.32e-01 -0.106 0.0888 0.147 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 6.37e-01 0.0606 0.128 0.147 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 3.89e-02 0.288 0.138 0.138 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0745 0.118 0.138 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0452 0.108 0.138 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 2.03e-02 0.253 0.108 0.138 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 3.95e-01 0.102 0.12 0.138 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 2.52e-01 0.161 0.141 0.138 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0209 0.109 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 8.99e-01 0.0152 0.12 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0252 0.107 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 1.48e-01 0.16 0.11 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0191 0.0767 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 5.15e-01 0.0827 0.127 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0819 0.108 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 2.93e-01 0.132 0.125 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 8.67e-01 0.0188 0.112 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 1.30e-01 0.159 0.105 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 4.12e-01 0.0735 0.0895 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 1.76e-01 0.0851 0.0626 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 347566 sc-eQTL 8.68e-01 0.022 0.132 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0512 0.0956 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 368202 sc-eQTL 8.40e-01 0.0228 0.112 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 7.06e-02 -0.162 0.0894 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 9.84e-01 0.00158 0.0808 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0181 0.118 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 3.21e-01 0.0965 0.097 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 1.57e-04 -0.322 0.0836 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0596 0.0946 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0747 0.127 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 5.57e-01 0.072 0.122 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00541 0.104 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 946993 sc-eQTL 3.41e-01 0.111 0.116 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.08e-01 0.0271 0.0723 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 8.57e-03 -0.276 0.104 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 1.32e-01 -0.137 0.0907 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 947016 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0275 0.128 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 866055 sc-eQTL 5.01e-01 0.0768 0.114 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 504484 sc-eQTL 4.19e-01 0.0787 0.0971 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 651303 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0283 0.095 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 610819 sc-eQTL 5.42e-02 -0.118 0.0608 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 264916 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00474 0.0886 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 264916 eQTL 0.0286 -0.0668 0.0305 0.00133 0.0 0.147
ENSG00000218565 AL592429.1 301546 eQTL 0.0308 0.064 0.0296 0.0 0.0 0.147

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 CITED2 264916 5.51e-05 1.07e-06 3.05e-07 1e-06 9.72e-08 8.28e-07 1.49e-06 7.79e-08 1.11e-06 2.81e-07 1.25e-06 5.22e-07 2.47e-06 2.09e-07 4.98e-07 8.62e-07 3.93e-07 1.21e-06 6.68e-07 1.82e-07 2.61e-07 1.97e-06 7.76e-07 2.68e-07 1.85e-06 2.4e-07 7.12e-07 2.98e-07 9.81e-07 1e-06 4.65e-07 3.55e-08 1.05e-07 4.29e-07 3.37e-07 6.33e-08 5.02e-08 6.98e-08 6.72e-08 8.66e-09 5.03e-08 3.49e-06 5.37e-07 1.44e-08 4e-08 3.41e-08 8.01e-08 3.81e-09 5.58e-08