logo

Genes within 1Mb (chr6:139638040:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 9.91e-01 0.000853 0.074 0.53 B L1
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0869 0.0717 0.53 B L1
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0573 0.0635 0.53 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 6.45e-02 -0.0689 0.0371 0.53 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0541 0.0915 0.53 B L1
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 1.18e-01 0.0901 0.0573 0.53 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 6.88e-01 0.0258 0.0641 0.53 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 3.90e-02 0.171 0.0824 0.53 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 1.47e-01 -0.101 0.0691 0.53 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0467 0.0545 0.53 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 3.26e-01 0.0393 0.0399 0.53 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 3.07e-01 0.0698 0.0682 0.53 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0492 0.0673 0.53 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 6.01e-01 0.047 0.0899 0.53 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0614 0.0642 0.53 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 7.18e-01 0.0219 0.0605 0.53 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 3.03e-01 0.0355 0.0344 0.53 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 3.63e-01 0.0595 0.0653 0.53 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 5.46e-02 -0.152 0.0788 0.53 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 2.33e-01 -0.105 0.0881 0.529 DC L1
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 1.49e-02 -0.176 0.0718 0.529 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 4.20e-02 -0.164 0.0802 0.529 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0776 0.0715 0.529 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 2.42e-01 0.0821 0.07 0.529 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0615 0.0832 0.529 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 5.21e-01 0.0544 0.0847 0.529 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 3.93e-02 0.132 0.0636 0.53 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0544 0.0585 0.53 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 1.37e-01 0.125 0.0836 0.53 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 7.37e-02 -0.0877 0.0488 0.53 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 5.07e-03 0.178 0.0628 0.53 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 9.34e-02 0.113 0.0673 0.53 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0396 0.0873 0.53 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 3.76e-01 -0.07 0.079 0.53 NK L1
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0743 0.0682 0.53 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 3.34e-01 -0.063 0.065 0.53 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 5.25e-01 0.0303 0.0475 0.53 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0488 0.0631 0.53 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 6.96e-02 0.17 0.0933 0.53 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0762 0.0678 0.53 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0467 0.0731 0.53 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 8.49e-01 0.00914 0.0479 0.53 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0879 0.0558 0.53 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 7.80e-01 0.0292 0.104 0.546 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0109 0.0995 0.546 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 1.91e-01 0.136 0.104 0.546 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 5.25e-01 0.06 0.0941 0.546 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 5.70e-01 0.0459 0.0806 0.546 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 5.68e-01 0.0581 0.101 0.546 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 7.33e-01 0.0346 0.101 0.546 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 1.81e-01 0.119 0.0889 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0633 0.0772 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 8.59e-02 -0.143 0.0828 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0711 0.0709 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 4.27e-02 -0.176 0.0862 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0156 0.0801 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 1.22e-01 0.134 0.0862 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 7.56e-02 0.162 0.091 0.532 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0343 0.0792 0.532 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 2.45e-01 0.0998 0.0857 0.532 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.78e-01 0.0914 0.0677 0.532 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 4.65e-02 -0.172 0.0859 0.532 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00113 0.0797 0.532 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 5.52e-01 0.0583 0.0977 0.532 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0241 0.0861 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0667 0.0749 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 9.82e-01 0.00157 0.0695 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 8.72e-03 -0.127 0.0478 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0334 0.091 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 1.54e-01 0.0943 0.0659 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 1.56e-01 0.123 0.0865 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0976 0.084 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 1.66e-01 -0.11 0.0789 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0617 0.0756 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 6.30e-03 -0.151 0.0547 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 2.84e-01 0.0945 0.088 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 8.43e-02 0.155 0.0894 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0153 0.0826 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 2.01e-01 0.113 0.0877 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0903 0.0887 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0488 0.0863 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0886 0.0784 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0866 0.0788 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0846 0.0813 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 5.60e-02 0.166 0.0862 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0758 0.0674 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.68e-02 -0.119 0.0594 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 2.92e-01 0.0425 0.0402 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 2.77e-01 0.0745 0.0683 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 7.28e-01 0.0242 0.0693 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 6.06e-02 0.159 0.0843 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0794 0.0678 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 2.86e-02 0.141 0.0638 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 3.00e-01 0.0514 0.0495 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 7.54e-01 0.0231 0.0737 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0345 0.0796 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 4.04e-01 0.0787 0.0942 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 8.68e-01 0.0122 0.0734 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 7.64e-01 0.0241 0.0799 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 2.50e-01 0.0655 0.0568 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0918 0.0746 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 9.25e-02 -0.131 0.0778 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 5.23e-01 0.0615 0.0962 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0598 0.07 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 5.91e-01 0.0404 0.075 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 2.58e-01 0.0687 0.0605 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0661 0.0705 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0919 0.0846 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 8.43e-01 0.0184 0.0929 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0547 0.0716 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 1.37e-01 0.107 0.0715 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 6.42e-02 0.0696 0.0374 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 8.86e-02 0.13 0.0757 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 9.85e-02 -0.144 0.0867 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.106 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 8.32e-01 0.0166 0.078 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 5.92e-01 0.0435 0.081 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0425 0.0808 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 5.00e-01 -0.056 0.083 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 6.26e-02 -0.163 0.0869 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 3.75e-01 0.0827 0.093 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.21e-01 0.107 0.0869 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.75e-01 0.0649 0.0907 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 4.04e-01 0.0584 0.0699 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 6.09e-01 -0.039 0.076 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0162 0.0865 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 1.33e-02 0.245 0.0983 0.532 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0306 0.0758 0.532 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 7.34e-01 0.0278 0.0816 0.532 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0363 0.06 0.532 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0727 0.0705 0.532 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0206 0.094 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 7.87e-01 -0.023 0.0852 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.52e-01 0.0599 0.0794 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 7.87e-01 0.0198 0.0732 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 8.59e-01 0.0139 0.0786 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0558 0.0857 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 1.61e-01 -0.103 0.0735 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000353 0.07 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 3.50e-01 0.0443 0.0473 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0524 0.0631 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 7.88e-01 0.0264 0.098 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.46e-01 -0.106 0.0913 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0922 0.0902 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 2.40e-01 0.0874 0.0741 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00786 0.0794 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0396 0.0875 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0768 0.0752 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0946 0.0776 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 9.51e-01 0.00306 0.0501 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0609 0.0653 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 3.70e-01 0.102 0.113 0.526 PB L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 6.79e-02 -0.224 0.122 0.526 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 5.57e-01 0.0645 0.109 0.526 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 3.13e-01 0.0775 0.0764 0.526 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 5.42e-01 0.0684 0.112 0.526 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00136 0.0844 0.526 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 1.55e-01 -0.161 0.112 0.526 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 1.03e-01 0.158 0.0968 0.524 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00444 0.0767 0.524 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 1.50e-01 -0.13 0.0899 0.524 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.36e-01 0.0867 0.058 0.524 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0359 0.0694 0.524 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 5.39e-01 0.0561 0.0912 0.53 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0975 0.0755 0.53 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0857 0.0783 0.53 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.50e-01 0.0961 0.0665 0.53 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 2.28e-01 0.09 0.0744 0.53 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 398387 sc-eQTL 1.27e-01 -0.13 0.0849 0.53 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 1.74e-01 -0.122 0.0896 0.544 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 5.10e-02 -0.167 0.0848 0.544 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 1.02e-01 -0.137 0.0832 0.544 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 1.75e-01 -0.131 0.0961 0.544 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 2.55e-01 0.09 0.0787 0.544 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0588 0.0837 0.544 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 9.34e-01 0.00772 0.0925 0.544 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 4.21e-01 0.0568 0.0704 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 9.81e-01 0.00142 0.0582 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 6.78e-01 0.0353 0.0848 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 3.80e-02 -0.156 0.0749 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.59e-02 0.153 0.0628 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 8.80e-02 0.113 0.0661 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 9.76e-02 -0.147 0.0882 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 8.00e-02 0.141 0.0801 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 1.32e-01 -0.103 0.0678 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 3.67e-02 0.18 0.0855 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0279 0.0817 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.90e-02 0.166 0.0701 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 8.69e-02 0.12 0.0699 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 5.28e-01 0.0598 0.0946 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0944 0.107 0.57 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0351 0.102 0.57 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 2.82e-01 0.113 0.105 0.57 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 9.53e-01 0.00469 0.0793 0.57 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0256 0.0914 0.57 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 5.30e-01 0.0581 0.0923 0.54 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0645 0.0757 0.54 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 7.57e-01 0.0259 0.0836 0.54 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0693 0.0863 0.54 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.13e-01 0.125 0.0783 0.54 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0052 0.0765 0.54 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 5.60e-01 0.0547 0.0937 0.54 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 2.40e-02 0.195 0.0859 0.532 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0411 0.0795 0.532 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 2.69e-01 0.0923 0.0833 0.532 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 9.76e-01 0.00186 0.063 0.532 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 4.77e-01 0.0541 0.0758 0.532 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 2.33e-01 0.0768 0.0642 0.532 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 9.05e-01 0.011 0.0928 0.532 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0722 0.102 0.559 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0162 0.0867 0.559 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 8.46e-01 0.0154 0.0792 0.559 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0648 0.0801 0.559 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 6.71e-01 0.0373 0.0876 0.559 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0672 0.103 0.559 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 2.80e-01 0.086 0.0793 0.559 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 1.13e-01 0.136 0.0855 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0492 0.0765 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0198 0.0794 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 5.73e-01 0.031 0.055 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 3.02e-02 -0.197 0.0901 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 5.23e-01 0.0494 0.0772 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 5.29e-01 0.0567 0.0898 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0676 0.0807 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0868 0.0753 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 8.44e-01 0.0127 0.0644 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.42e-02 -0.11 0.0445 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 346042 sc-eQTL 9.82e-01 0.00211 0.0946 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 1.55e-01 0.0975 0.0684 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 366678 sc-eQTL 4.93e-01 0.0554 0.0807 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 7.15e-02 0.117 0.0644 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0428 0.0581 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 1.01e-01 0.139 0.0845 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.32e-02 -0.141 0.0693 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 5.36e-03 0.172 0.0611 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 4.34e-02 0.137 0.0675 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0955 0.091 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 2.68e-02 0.192 0.0859 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0898 0.074 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 945469 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0103 0.0825 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0351 0.0513 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 1.04e-01 0.122 0.0748 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 3.29e-01 0.0633 0.0646 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 945492 sc-eQTL 4.72e-01 0.0657 0.0911 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 864531 sc-eQTL 4.48e-01 -0.062 0.0816 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 502960 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0945 0.0694 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 649779 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0617 0.068 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 609295 sc-eQTL 3.49e-01 0.0411 0.0439 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 263392 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0705 0.0633 0.532 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000218565 AL592429.1 300022 eQTL 0.00526 -0.0585 0.0209 0.0 0.00101 0.45

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 \N 263392 1.24e-06 9.79e-07 3.45e-07 1.14e-06 3.45e-07 5.15e-07 1.59e-06 3.31e-07 1.42e-06 4.44e-07 1.76e-06 7.04e-07 2.15e-06 2.63e-07 5.36e-07 8.79e-07 8.37e-07 6.58e-07 8.18e-07 6.52e-07 6.81e-07 1.42e-06 8.31e-07 6.31e-07 2.28e-06 4.27e-07 8.29e-07 7.24e-07 1.32e-06 1.28e-06 7.05e-07 2.39e-07 2.53e-07 6.89e-07 6.02e-07 4.82e-07 6.17e-07 2.26e-07 4.67e-07 2.97e-07 2.58e-07 1.56e-06 5.04e-08 5.7e-08 3.17e-07 1.22e-07 2.45e-07 2.77e-08 1.47e-07