logo

Genes within 1Mb (chr6:139636359:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 9.91e-01 0.000853 0.074 0.53 B L1
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0869 0.0717 0.53 B L1
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0573 0.0635 0.53 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 6.45e-02 -0.0689 0.0371 0.53 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0541 0.0915 0.53 B L1
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 1.18e-01 0.0901 0.0573 0.53 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 6.88e-01 0.0258 0.0641 0.53 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 3.90e-02 0.171 0.0824 0.53 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 1.47e-01 -0.101 0.0691 0.53 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0467 0.0545 0.53 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 3.26e-01 0.0393 0.0399 0.53 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 3.07e-01 0.0698 0.0682 0.53 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0492 0.0673 0.53 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 6.01e-01 0.047 0.0899 0.53 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0614 0.0642 0.53 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 7.18e-01 0.0219 0.0605 0.53 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 3.03e-01 0.0355 0.0344 0.53 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 3.63e-01 0.0595 0.0653 0.53 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 5.46e-02 -0.152 0.0788 0.53 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 2.33e-01 -0.105 0.0881 0.529 DC L1
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 1.49e-02 -0.176 0.0718 0.529 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 4.20e-02 -0.164 0.0802 0.529 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0776 0.0715 0.529 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 2.42e-01 0.0821 0.07 0.529 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0615 0.0832 0.529 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 5.21e-01 0.0544 0.0847 0.529 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 3.93e-02 0.132 0.0636 0.53 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0544 0.0585 0.53 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 1.37e-01 0.125 0.0836 0.53 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 7.37e-02 -0.0877 0.0488 0.53 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 5.07e-03 0.178 0.0628 0.53 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 9.34e-02 0.113 0.0673 0.53 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0396 0.0873 0.53 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 3.76e-01 -0.07 0.079 0.53 NK L1
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0743 0.0682 0.53 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 3.34e-01 -0.063 0.065 0.53 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 5.25e-01 0.0303 0.0475 0.53 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0488 0.0631 0.53 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 6.96e-02 0.17 0.0933 0.53 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0762 0.0678 0.53 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0467 0.0731 0.53 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 8.49e-01 0.00914 0.0479 0.53 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0879 0.0558 0.53 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 7.80e-01 0.0292 0.104 0.546 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0109 0.0995 0.546 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 1.91e-01 0.136 0.104 0.546 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 5.25e-01 0.06 0.0941 0.546 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 5.70e-01 0.0459 0.0806 0.546 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 5.68e-01 0.0581 0.101 0.546 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 7.33e-01 0.0346 0.101 0.546 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 1.81e-01 0.119 0.0889 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0633 0.0772 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 8.59e-02 -0.143 0.0828 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0711 0.0709 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 4.27e-02 -0.176 0.0862 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0156 0.0801 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 1.22e-01 0.134 0.0862 0.53 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 7.56e-02 0.162 0.091 0.532 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0343 0.0792 0.532 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 2.45e-01 0.0998 0.0857 0.532 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.78e-01 0.0914 0.0677 0.532 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 4.65e-02 -0.172 0.0859 0.532 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00113 0.0797 0.532 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 5.52e-01 0.0583 0.0977 0.532 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0241 0.0861 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0667 0.0749 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 9.82e-01 0.00157 0.0695 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 8.72e-03 -0.127 0.0478 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0334 0.091 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 1.54e-01 0.0943 0.0659 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 1.56e-01 0.123 0.0865 0.53 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0976 0.084 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 1.66e-01 -0.11 0.0789 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0617 0.0756 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 6.30e-03 -0.151 0.0547 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 2.84e-01 0.0945 0.088 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 8.43e-02 0.155 0.0894 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0153 0.0826 0.532 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 2.01e-01 0.113 0.0877 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0903 0.0887 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0488 0.0863 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0886 0.0784 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0866 0.0788 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0846 0.0813 0.536 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 5.60e-02 0.166 0.0862 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0758 0.0674 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.68e-02 -0.119 0.0594 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 2.92e-01 0.0425 0.0402 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 2.77e-01 0.0745 0.0683 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 7.28e-01 0.0242 0.0693 0.53 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 6.06e-02 0.159 0.0843 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0794 0.0678 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 2.86e-02 0.141 0.0638 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 3.00e-01 0.0514 0.0495 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 7.54e-01 0.0231 0.0737 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0345 0.0796 0.53 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 4.04e-01 0.0787 0.0942 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 8.68e-01 0.0122 0.0734 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 7.64e-01 0.0241 0.0799 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 2.50e-01 0.0655 0.0568 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0918 0.0746 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 9.25e-02 -0.131 0.0778 0.53 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 5.23e-01 0.0615 0.0962 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0598 0.07 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 5.91e-01 0.0404 0.075 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 2.58e-01 0.0687 0.0605 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0661 0.0705 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0919 0.0846 0.53 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 8.43e-01 0.0184 0.0929 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0547 0.0716 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 1.37e-01 0.107 0.0715 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 6.42e-02 0.0696 0.0374 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 8.86e-02 0.13 0.0757 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 9.85e-02 -0.144 0.0867 0.53 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 2.23e-01 -0.13 0.106 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 8.32e-01 0.0166 0.078 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 5.92e-01 0.0435 0.081 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0425 0.0808 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 5.00e-01 -0.056 0.083 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 6.26e-02 -0.163 0.0869 0.544 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 3.75e-01 0.0827 0.093 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.21e-01 0.107 0.0869 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.75e-01 0.0649 0.0907 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 4.04e-01 0.0584 0.0699 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 6.09e-01 -0.039 0.076 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0162 0.0865 0.532 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 1.33e-02 0.245 0.0983 0.532 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0306 0.0758 0.532 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 7.34e-01 0.0278 0.0816 0.532 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0363 0.06 0.532 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0727 0.0705 0.532 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0206 0.094 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 7.87e-01 -0.023 0.0852 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.52e-01 0.0599 0.0794 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 7.87e-01 0.0198 0.0732 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 8.59e-01 0.0139 0.0786 0.529 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0558 0.0857 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 1.61e-01 -0.103 0.0735 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000353 0.07 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 3.50e-01 0.0443 0.0473 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0524 0.0631 0.532 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 7.88e-01 0.0264 0.098 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.46e-01 -0.106 0.0913 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0922 0.0902 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 2.40e-01 0.0874 0.0741 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00786 0.0794 0.534 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0396 0.0875 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0768 0.0752 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0946 0.0776 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 9.51e-01 0.00306 0.0501 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0609 0.0653 0.532 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 3.70e-01 0.102 0.113 0.526 PB L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 6.79e-02 -0.224 0.122 0.526 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 5.57e-01 0.0645 0.109 0.526 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 3.13e-01 0.0775 0.0764 0.526 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 5.42e-01 0.0684 0.112 0.526 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00136 0.0844 0.526 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 1.55e-01 -0.161 0.112 0.526 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 1.03e-01 0.158 0.0968 0.524 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00444 0.0767 0.524 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 1.50e-01 -0.13 0.0899 0.524 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.36e-01 0.0867 0.058 0.524 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0359 0.0694 0.524 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 5.39e-01 0.0561 0.0912 0.53 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0975 0.0755 0.53 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0857 0.0783 0.53 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.50e-01 0.0961 0.0665 0.53 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 2.28e-01 0.09 0.0744 0.53 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 396706 sc-eQTL 1.27e-01 -0.13 0.0849 0.53 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 1.74e-01 -0.122 0.0896 0.544 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 5.10e-02 -0.167 0.0848 0.544 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 1.02e-01 -0.137 0.0832 0.544 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 1.75e-01 -0.131 0.0961 0.544 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 2.55e-01 0.09 0.0787 0.544 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0588 0.0837 0.544 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 9.34e-01 0.00772 0.0925 0.544 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 4.21e-01 0.0568 0.0704 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 9.81e-01 0.00142 0.0582 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 6.78e-01 0.0353 0.0848 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 3.80e-02 -0.156 0.0749 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.59e-02 0.153 0.0628 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 8.80e-02 0.113 0.0661 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 9.76e-02 -0.147 0.0882 0.53 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 8.00e-02 0.141 0.0801 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 1.32e-01 -0.103 0.0678 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 3.67e-02 0.18 0.0855 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0279 0.0817 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.90e-02 0.166 0.0701 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 8.69e-02 0.12 0.0699 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 5.28e-01 0.0598 0.0946 0.53 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0944 0.107 0.57 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0351 0.102 0.57 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 2.82e-01 0.113 0.105 0.57 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 9.53e-01 0.00469 0.0793 0.57 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0256 0.0914 0.57 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 5.30e-01 0.0581 0.0923 0.54 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0645 0.0757 0.54 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 7.57e-01 0.0259 0.0836 0.54 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0693 0.0863 0.54 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.13e-01 0.125 0.0783 0.54 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0052 0.0765 0.54 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 5.60e-01 0.0547 0.0937 0.54 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 2.40e-02 0.195 0.0859 0.532 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0411 0.0795 0.532 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 2.69e-01 0.0923 0.0833 0.532 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 9.76e-01 0.00186 0.063 0.532 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 4.77e-01 0.0541 0.0758 0.532 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 2.33e-01 0.0768 0.0642 0.532 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 9.05e-01 0.011 0.0928 0.532 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0722 0.102 0.559 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0162 0.0867 0.559 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 8.46e-01 0.0154 0.0792 0.559 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0648 0.0801 0.559 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 6.71e-01 0.0373 0.0876 0.559 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0672 0.103 0.559 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 2.80e-01 0.086 0.0793 0.559 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 1.13e-01 0.136 0.0855 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0492 0.0765 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0198 0.0794 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 5.73e-01 0.031 0.055 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 3.02e-02 -0.197 0.0901 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 5.23e-01 0.0494 0.0772 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 5.29e-01 0.0567 0.0898 0.53 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0676 0.0807 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0868 0.0753 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 8.44e-01 0.0127 0.0644 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.42e-02 -0.11 0.0445 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 344361 sc-eQTL 9.82e-01 0.00211 0.0946 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 1.55e-01 0.0975 0.0684 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 364997 sc-eQTL 4.93e-01 0.0554 0.0807 0.53 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 7.15e-02 0.117 0.0644 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0428 0.0581 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 1.01e-01 0.139 0.0845 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.32e-02 -0.141 0.0693 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 5.36e-03 0.172 0.0611 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 4.34e-02 0.137 0.0675 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0955 0.091 0.53 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 2.68e-02 0.192 0.0859 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0898 0.074 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 943788 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0103 0.0825 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0351 0.0513 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 1.04e-01 0.122 0.0748 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 3.29e-01 0.0633 0.0646 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 943811 sc-eQTL 4.72e-01 0.0657 0.0911 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 862850 sc-eQTL 4.48e-01 -0.062 0.0816 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 501279 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0945 0.0694 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 648098 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0617 0.068 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 607614 sc-eQTL 3.49e-01 0.0411 0.0439 0.532 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 261711 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0705 0.0633 0.532 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000218565 AL592429.1 298341 eQTL 0.0053 -0.0585 0.0209 0.0 0.001 0.449

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 \N 261711 1.31e-06 9.83e-07 3.45e-07 7.82e-07 3.57e-07 4.77e-07 1.28e-06 3.54e-07 1.35e-06 4.19e-07 1.39e-06 6.01e-07 2e-06 2.76e-07 5.65e-07 8.48e-07 8.13e-07 6.25e-07 7.52e-07 6.49e-07 6.17e-07 1.28e-06 9.28e-07 6.47e-07 2.01e-06 4.28e-07 8.29e-07 7.08e-07 1.24e-06 1.25e-06 5.77e-07 2.1e-07 2.08e-07 6.38e-07 5.2e-07 4.23e-07 5.17e-07 2.04e-07 3.43e-07 3.21e-07 2.87e-07 1.52e-06 5.77e-08 6.48e-08 2.49e-07 1.23e-07 2.3e-07 7e-08 1.23e-07