logo

Genes within 1Mb (chr6:139632440:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.86e-01 0.0152 0.106 0.132 B L1
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 3.67e-01 0.0929 0.103 0.132 B L1
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 8.87e-01 0.013 0.0911 0.132 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 8.45e-01 0.0105 0.0535 0.132 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 4.31e-01 0.103 0.131 0.132 B L1
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 4.11e-01 0.0679 0.0825 0.132 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 4.25e-01 0.0733 0.0917 0.132 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0364 0.116 0.132 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 3.34e-01 0.0934 0.0965 0.132 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0212 0.0761 0.132 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 3.93e-02 0.115 0.0552 0.132 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 5.20e-01 0.0613 0.0952 0.132 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 9.87e-01 0.00156 0.0939 0.132 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 1.66e-01 -0.176 0.126 0.132 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 3.47e-01 0.0856 0.0907 0.132 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.92e-01 0.0459 0.0855 0.132 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 2.55e-01 0.0554 0.0486 0.132 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 2.80e-01 0.0999 0.0922 0.132 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 8.73e-01 0.0179 0.112 0.132 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 6.35e-01 0.0606 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 8.38e-01 0.0215 0.105 0.133 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 8.94e-01 0.0156 0.117 0.133 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 2.36e-01 0.122 0.103 0.133 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 7.25e-01 0.0356 0.101 0.133 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 1.00e-01 -0.197 0.119 0.133 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 5.36e-01 0.0757 0.122 0.133 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0918 0.0918 0.132 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.54e-01 0.119 0.0835 0.132 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 1.19e-01 0.187 0.12 0.132 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 6.36e-01 0.0334 0.0703 0.132 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.30e-01 0.139 0.0911 0.132 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 1.10e-02 -0.245 0.0954 0.132 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 5.93e-01 0.067 0.125 0.132 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 2.39e-02 0.253 0.111 0.131 NK L1
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 8.15e-02 0.169 0.0964 0.131 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 6.42e-01 0.043 0.0924 0.131 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 3.08e-02 0.145 0.0668 0.131 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 6.78e-01 0.0373 0.0897 0.131 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 1.87e-01 0.176 0.133 0.132 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.33e-01 -0.145 0.0962 0.132 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.46e-01 0.0629 0.104 0.132 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.00e-01 0.112 0.0677 0.132 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0173 0.0798 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.81e-01 0.0218 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 3.26e-01 0.136 0.138 0.14 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 1.27e-01 0.221 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0141 0.131 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 3.79e-02 0.232 0.111 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 8.35e-01 0.0295 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 3.40e-01 0.135 0.141 0.14 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 6.94e-01 0.0513 0.13 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.09e-01 0.142 0.112 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 6.92e-01 0.0482 0.122 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.104 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0729 0.127 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 4.45e-01 0.0893 0.117 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 2.23e-01 0.154 0.126 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 1.30e-01 0.2 0.132 0.134 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 7.75e-01 0.0328 0.115 0.134 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 9.10e-01 0.0141 0.124 0.134 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 8.65e-01 0.0168 0.0982 0.134 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 2.85e-01 -0.134 0.125 0.134 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0669 0.115 0.134 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 2.62e-01 0.158 0.141 0.134 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 7.21e-01 0.0443 0.124 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.27e-01 0.165 0.107 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.36e-01 0.0619 0.0999 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0157 0.0699 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00474 0.131 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 6.36e-01 0.0452 0.0952 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0372 0.125 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0764 0.121 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 7.59e-01 0.0351 0.114 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0667 0.109 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 6.69e-01 0.0344 0.0803 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 7.99e-02 0.222 0.126 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 7.46e-01 -0.042 0.13 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 3.67e-01 0.107 0.119 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.21e-01 0.0285 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.91e-01 0.135 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 1.63e-01 -0.173 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 3.67e-01 0.102 0.113 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 6.98e-01 0.044 0.113 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0145 0.117 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0672 0.122 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 3.16e-01 0.0949 0.0944 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0153 0.0839 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.54e-01 0.0804 0.0562 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 5.15e-01 0.0626 0.0959 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 4.95e-01 0.0663 0.097 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 5.94e-01 0.0638 0.12 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 7.66e-01 0.0286 0.0957 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.40e-01 0.0556 0.0907 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 4.92e-02 0.137 0.0691 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0266 0.104 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0142 0.112 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0148 0.135 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 7.41e-01 0.0348 0.105 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0681 0.114 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 8.69e-02 0.139 0.081 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 2.03e-01 -0.136 0.107 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 1.87e-01 -0.148 0.112 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 3.35e-01 0.132 0.137 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.85e-01 0.107 0.0997 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0117 0.107 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 2.32e-01 0.103 0.0863 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0162 0.101 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0328 0.121 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 1.94e-01 -0.173 0.133 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 4.30e-01 0.0811 0.103 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 9.07e-02 0.174 0.102 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.12e-02 0.136 0.0532 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 1.09e-01 0.175 0.109 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 8.46e-01 0.0243 0.125 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 5.96e-01 -0.077 0.145 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.78e-01 0.115 0.106 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0472 0.11 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 2.94e-01 0.115 0.11 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0112 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 3.74e-01 0.106 0.119 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00408 0.138 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 4.88e-01 0.0895 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 8.43e-01 0.0266 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.86e-01 0.137 0.103 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 7.56e-01 0.035 0.112 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 4.19e-01 0.104 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 5.54e-01 0.0873 0.147 0.13 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0919 0.112 0.13 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.97e-01 0.0637 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 6.75e-01 0.0372 0.0886 0.13 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0533 0.104 0.13 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 2.38e-01 0.159 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 3.13e-01 0.123 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 7.03e-02 -0.205 0.113 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 6.75e-01 0.0439 0.105 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 5.77e-01 0.0628 0.112 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 2.11e-01 0.151 0.121 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 9.42e-02 0.174 0.104 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 9.93e-02 0.163 0.0982 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.39e-02 0.164 0.066 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 9.89e-01 0.00127 0.0893 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 1.28e-01 0.214 0.14 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 4.94e-01 0.0901 0.131 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0572 0.13 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 2.13e-01 0.133 0.106 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000235 0.114 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.68e-02 0.212 0.123 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.80e-01 0.115 0.106 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0418 0.11 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 4.03e-01 0.0593 0.0708 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 7.42e-01 0.0306 0.0926 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 3.03e-01 0.147 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00486 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0268 0.138 0.156 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 2.51e-01 0.111 0.0962 0.156 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 3.29e-01 0.138 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 1.65e-01 -0.148 0.105 0.156 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 1.53e-01 0.203 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 7.48e-02 0.242 0.135 0.133 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 4.07e-01 -0.089 0.107 0.133 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 3.97e-01 -0.107 0.126 0.133 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.17e-01 0.127 0.0809 0.133 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0423 0.0969 0.133 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 1.93e-01 0.17 0.13 0.132 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 8.77e-01 0.0168 0.109 0.132 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000265 0.112 0.132 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.99e-02 0.222 0.0945 0.132 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0629 0.107 0.132 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392787 sc-eQTL 4.61e-01 -0.09 0.122 0.132 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 3.44e-01 -0.121 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0534 0.121 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 5.10e-01 0.0783 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0333 0.137 0.137 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 7.60e-01 0.0343 0.112 0.137 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 3.19e-01 -0.118 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 8.30e-01 0.0282 0.131 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.58e-01 0.0179 0.1 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.63e-01 0.115 0.0824 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 1.32e-01 0.181 0.12 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 8.22e-01 0.0243 0.108 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.95e-01 0.117 0.0902 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 1.51e-02 -0.229 0.0934 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00239 0.126 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0246 0.115 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 3.83e-01 0.085 0.0973 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 1.88e-01 0.162 0.123 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00412 0.117 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.20e-01 0.158 0.101 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 2.92e-01 -0.106 0.1 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 8.48e-01 -0.026 0.135 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0416 0.155 0.127 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.70e-01 -0.162 0.147 0.127 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.94e-01 0.0813 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.127 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.132 0.127 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 1.49e-01 -0.191 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 5.04e-01 0.0729 0.109 0.131 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 1.83e-01 0.16 0.12 0.131 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0316 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.31e-01 0.171 0.113 0.131 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 1.61e-01 -0.154 0.109 0.131 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 3.49e-01 0.126 0.134 0.131 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 7.64e-01 0.0377 0.126 0.127 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.04e-01 0.186 0.114 0.127 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 3.27e-01 0.118 0.12 0.127 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 2.07e-01 0.115 0.0906 0.127 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 6.45e-02 0.202 0.109 0.127 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 5.42e-02 -0.178 0.0921 0.127 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0198 0.134 0.127 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 2.37e-01 0.17 0.143 0.138 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.07e-01 0.196 0.121 0.138 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 6.59e-01 0.0491 0.111 0.138 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 3.64e-01 0.102 0.112 0.138 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 5.95e-01 0.0655 0.123 0.138 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 2.59e-01 -0.164 0.144 0.138 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 3.85e-01 0.0971 0.112 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 9.37e-02 0.209 0.124 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.83e-01 0.119 0.111 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 4.44e-01 0.0883 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 8.92e-01 0.0109 0.08 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0414 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 5.35e-01 0.0697 0.112 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 2.36e-01 0.155 0.13 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0275 0.116 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.54e-01 0.155 0.108 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 5.87e-01 0.0505 0.0928 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 6.75e-01 0.0274 0.0651 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 340442 sc-eQTL 6.63e-01 0.0595 0.136 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 9.99e-01 0.000168 0.0991 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 361078 sc-eQTL 9.95e-01 0.00073 0.116 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0203 0.0922 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 2.35e-01 0.0983 0.0824 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 1.18e-01 0.188 0.12 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00654 0.0995 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.36e-01 0.132 0.088 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 6.30e-02 -0.18 0.0961 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 9.95e-01 0.000865 0.13 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 2.79e-01 -0.136 0.125 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.64e-01 0.149 0.106 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 939869 sc-eQTL 2.35e-01 0.141 0.119 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 7.82e-01 0.0205 0.0741 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.34e-01 0.162 0.108 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 6.10e-02 -0.174 0.0926 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 939892 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.131 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858931 sc-eQTL 2.65e-02 0.257 0.115 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497360 sc-eQTL 1.12e-01 0.157 0.0988 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644179 sc-eQTL 3.37e-01 0.0932 0.0969 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603695 sc-eQTL 1.01e-02 0.16 0.0617 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257792 sc-eQTL 9.07e-01 0.0106 0.0905 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 644179 eQTL 0.0439 -0.0507 0.0251 0.00123 0.0 0.123
ENSG00000164442 CITED2 257792 eQTL 0.0399 -0.069 0.0335 0.00104 0.0 0.123

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000231329 \N 392787 1.24e-06 7.46e-07 2.41e-07 4.31e-07 1.16e-07 3.28e-07 6.52e-07 2.64e-07 8.08e-07 3.11e-07 1.04e-06 5.28e-07 1.05e-06 1.59e-07 3.35e-07 4.29e-07 6.15e-07 4.95e-07 3.3e-07 2.78e-07 2.26e-07 5.83e-07 4.96e-07 3.21e-07 1.28e-06 2.4e-07 4.83e-07 3.9e-07 6.62e-07 8.51e-07 4.08e-07 4.21e-08 6.78e-08 2.46e-07 3.8e-07 2.56e-07 1.89e-07 1.21e-07 8.06e-08 8.15e-09 1.15e-07 7.7e-07 6.11e-08 5.74e-09 1.95e-07 3.54e-08 1.67e-07 4.47e-08 4.9e-08