logo

Genes within 1Mb (chr6:139632437:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0131 0.106 0.139 B L1
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 6.33e-01 0.0492 0.103 0.139 B L1
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 2.76e-02 0.199 0.0899 0.139 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 8.24e-01 0.0119 0.0534 0.139 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 3.34e-01 0.126 0.131 0.139 B L1
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0726 0.0823 0.139 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 7.67e-02 0.162 0.091 0.139 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0825 0.117 0.139 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.82e-01 0.13 0.0972 0.139 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 1.77e-01 -0.103 0.0764 0.139 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 8.63e-02 -0.0963 0.0559 0.139 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 6.45e-01 0.0444 0.096 0.139 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 1.22e-01 -0.146 0.0942 0.139 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 2.00e-01 0.162 0.126 0.139 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 4.29e-01 0.0715 0.0902 0.139 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 5.89e-01 0.046 0.085 0.139 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0432 0.0483 0.139 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 5.54e-01 0.0544 0.0918 0.139 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0178 0.112 0.139 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 2.05e-01 0.16 0.126 0.133 DC L1
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 4.79e-01 0.0738 0.104 0.133 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 3.31e-02 0.246 0.115 0.133 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 2.07e-01 0.129 0.102 0.133 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0262 0.101 0.133 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 2.43e-01 0.139 0.119 0.133 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 7.61e-01 -0.037 0.121 0.133 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0987 0.0917 0.139 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0197 0.0839 0.139 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 8.30e-01 0.0258 0.12 0.139 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 8.08e-01 0.0172 0.0704 0.139 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 2.02e-03 -0.28 0.0896 0.139 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0923 0.0967 0.139 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0688 0.125 0.139 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 7.29e-01 0.0392 0.113 0.139 NK L1
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 5.27e-01 0.0618 0.0975 0.139 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.77e-01 0.0264 0.093 0.139 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0815 0.0676 0.139 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000865 0.0902 0.139 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 9.51e-01 0.00814 0.131 0.139 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.58e-01 0.134 0.0945 0.139 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 6.80e-01 0.0422 0.102 0.139 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0584 0.0668 0.139 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.32e-03 0.228 0.0767 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 8.71e-01 0.0237 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 7.91e-01 0.037 0.139 0.14 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 6.06e-01 0.0753 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 5.81e-01 0.0729 0.132 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0929 0.113 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0501 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 3.04e-01 0.146 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 6.38e-01 0.0607 0.129 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0618 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 1.06e-01 0.194 0.12 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 4.29e-01 -0.081 0.102 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 2.74e-02 0.275 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0167 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 7.34e-01 0.0425 0.125 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0439 0.131 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 7.98e-01 0.0291 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 6.69e-01 0.0526 0.123 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0712 0.097 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 8.74e-01 0.0196 0.124 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 1.77e-01 -0.154 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 9.45e-01 0.00969 0.14 0.14 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 3.43e-01 0.117 0.123 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 2.18e-01 0.132 0.107 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 3.55e-01 0.0917 0.0989 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 2.31e-01 0.083 0.0691 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 2.91e-01 0.137 0.13 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 2.40e-01 -0.111 0.0942 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0593 0.124 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 7.32e-01 0.0415 0.121 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 2.03e-01 0.145 0.113 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 4.02e-01 0.091 0.108 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 5.41e-02 0.153 0.0792 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0527 0.126 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 1.67e-01 -0.178 0.129 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 4.43e-01 0.0909 0.118 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 8.18e-01 0.0288 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 3.45e-01 0.119 0.126 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0342 0.123 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.88e-01 0.147 0.111 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 5.54e-01 0.0666 0.112 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 8.70e-01 0.019 0.116 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 2.20e-01 -0.149 0.121 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 2.33e-01 0.113 0.0944 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 6.26e-01 -0.041 0.0839 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0507 0.0564 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.48e-01 0.0902 0.0958 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 1.60e-01 -0.136 0.0967 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 9.69e-01 0.00467 0.122 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.06e-01 0.157 0.0966 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 2.54e-01 -0.105 0.0919 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0948 0.0706 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 2.97e-01 0.11 0.105 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 2.42e-01 -0.133 0.114 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 2.23e-01 0.165 0.135 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 9.43e-01 0.00756 0.106 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.95e-01 -0.03 0.115 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0894 0.0818 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 8.16e-01 0.0251 0.108 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 4.93e-01 0.0773 0.112 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 8.18e-01 0.0313 0.136 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 9.74e-01 0.00327 0.0989 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0168 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0112 0.0857 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.68e-01 0.0898 0.0996 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0229 0.12 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 3.23e-01 0.13 0.131 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.07e-01 0.163 0.101 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.18e-01 0.0368 0.102 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0445 0.0533 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 8.29e-01 0.0233 0.108 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 8.91e-01 0.0169 0.123 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 1.82e-01 0.199 0.148 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 4.31e-01 0.086 0.109 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0612 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 5.60e-01 0.0659 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 5.31e-01 0.0727 0.116 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 1.59e-01 -0.173 0.122 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 5.15e-01 0.0872 0.134 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 7.22e-01 0.0447 0.125 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 9.15e-01 0.0139 0.131 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.1 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 7.14e-01 0.0401 0.109 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0659 0.124 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 9.91e-01 0.0016 0.144 0.136 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 8.72e-01 0.0176 0.109 0.136 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 8.68e-01 0.0196 0.118 0.136 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 4.06e-01 0.0719 0.0864 0.136 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.49e-03 0.295 0.0998 0.136 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 3.72e-01 -0.117 0.131 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 9.42e-01 0.00872 0.119 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 3.96e-02 0.227 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0581 0.102 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0503 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 2.72e-01 0.134 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 5.33e-01 0.0657 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0256 0.0998 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0945 0.0672 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00584 0.0901 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 1.50e-01 0.2 0.138 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 7.49e-01 0.0417 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 3.25e-01 0.126 0.128 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0925 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0223 0.113 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 3.26e-01 -0.123 0.125 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 8.45e-01 0.0211 0.108 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0315 0.111 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0241 0.0715 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 6.38e-01 0.0439 0.0933 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 6.98e-01 0.0558 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.67e-01 0.215 0.155 0.152 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 3.88e-01 -0.12 0.138 0.152 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 2.91e-01 -0.102 0.0965 0.152 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 8.05e-01 0.0349 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 1.52e-01 0.152 0.106 0.152 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 1.80e-01 0.192 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 9.27e-02 -0.228 0.135 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 8.67e-01 0.018 0.107 0.141 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.19e-01 0.0455 0.126 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0676 0.0812 0.141 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 8.17e-01 0.0224 0.0969 0.141 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 1.09e-01 -0.21 0.13 0.139 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0853 0.109 0.139 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0616 0.113 0.139 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.85e-01 -0.127 0.0956 0.139 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0358 0.107 0.139 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 392784 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0624 0.123 0.139 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 7.22e-01 0.0457 0.128 0.141 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 6.25e-02 0.226 0.121 0.141 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 1.18e-01 0.186 0.118 0.141 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 4.65e-01 0.1 0.137 0.141 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0476 0.112 0.141 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 2.65e-01 0.133 0.119 0.141 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 8.19e-01 0.0302 0.132 0.141 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 9.14e-01 0.0109 0.101 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 9.78e-01 0.00229 0.0833 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 6.13e-01 0.0615 0.121 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 1.46e-01 0.157 0.108 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.14e-03 -0.293 0.0889 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0449 0.0952 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0564 0.127 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 6.87e-03 -0.309 0.113 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 8.21e-01 0.0221 0.0972 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 1.74e-01 -0.167 0.123 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 3.25e-01 -0.115 0.116 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.66e-02 -0.242 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0833 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0701 0.135 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 4.37e-02 0.324 0.159 0.127 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.87e-01 0.202 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 3.74e-01 -0.141 0.158 0.127 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0517 0.119 0.127 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 9.88e-01 0.00208 0.138 0.127 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 6.04e-01 0.0706 0.136 0.136 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.49e-01 0.161 0.111 0.136 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 9.99e-01 0.000194 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.13e-01 0.0468 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 4.31e-03 -0.328 0.114 0.136 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 9.27e-01 0.0103 0.113 0.136 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 1.99e-01 -0.177 0.137 0.136 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0239 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 4.55e-01 -0.085 0.114 0.14 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 2.49e-01 0.138 0.119 0.14 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00244 0.0901 0.14 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0798 0.108 0.14 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0944 0.0919 0.14 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 5.86e-01 0.0724 0.133 0.14 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 2.62e-02 0.321 0.143 0.13 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0885 0.123 0.13 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0265 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 9.58e-02 0.19 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 3.54e-01 0.116 0.124 0.13 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 5.76e-01 0.0821 0.147 0.13 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0981 0.113 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 9.11e-01 0.0138 0.123 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0526 0.11 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 1.34e-01 0.17 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0337 0.0788 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 2.75e-01 0.142 0.13 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0684 0.111 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 3.76e-01 0.114 0.128 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 6.12e-01 0.0585 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 1.42e-01 0.158 0.107 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 3.42e-01 0.0874 0.0918 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.86e-01 0.0852 0.0642 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 340439 sc-eQTL 5.98e-01 0.0713 0.135 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0979 0.0979 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 361075 sc-eQTL 9.20e-01 0.0116 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 7.98e-02 -0.162 0.0919 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 9.59e-01 0.00429 0.0831 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0211 0.121 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 4.16e-01 0.0813 0.0997 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 9.55e-04 -0.29 0.0866 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0609 0.0972 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0623 0.13 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 6.72e-01 0.0534 0.126 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 8.11e-01 0.0257 0.108 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 939866 sc-eQTL 2.69e-01 0.132 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 6.63e-01 0.0325 0.0745 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 2.58e-02 -0.242 0.108 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 1.85e-01 -0.124 0.0935 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 939889 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0369 0.132 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 858928 sc-eQTL 5.58e-01 0.0686 0.117 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 497357 sc-eQTL 4.29e-01 0.0789 0.0997 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 644176 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0279 0.0975 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 603692 sc-eQTL 1.62e-01 -0.088 0.0626 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 257789 sc-eQTL 8.47e-01 0.0175 0.091 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 257789 eQTL 0.0307 -0.0651 0.0301 0.00128 0.0 0.151
ENSG00000218565 AL592429.1 294419 eQTL 0.0317 0.0629 0.0292 0.0 0.0 0.151

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina