logo

Genes within 1Mb (chr6:139628325:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0131 0.106 0.139 B L1
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 6.33e-01 0.0492 0.103 0.139 B L1
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 2.76e-02 0.199 0.0899 0.139 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 8.24e-01 0.0119 0.0534 0.139 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 3.34e-01 0.126 0.131 0.139 B L1
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0726 0.0823 0.139 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 7.67e-02 0.162 0.091 0.139 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0825 0.117 0.139 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.82e-01 0.13 0.0972 0.139 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 1.77e-01 -0.103 0.0764 0.139 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 8.63e-02 -0.0963 0.0559 0.139 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 6.45e-01 0.0444 0.096 0.139 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 1.22e-01 -0.146 0.0942 0.139 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 2.00e-01 0.162 0.126 0.139 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 4.29e-01 0.0715 0.0902 0.139 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 5.89e-01 0.046 0.085 0.139 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0432 0.0483 0.139 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 5.54e-01 0.0544 0.0918 0.139 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0178 0.112 0.139 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 2.05e-01 0.16 0.126 0.133 DC L1
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 4.79e-01 0.0738 0.104 0.133 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 3.31e-02 0.246 0.115 0.133 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 2.07e-01 0.129 0.102 0.133 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0262 0.101 0.133 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 2.43e-01 0.139 0.119 0.133 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 7.61e-01 -0.037 0.121 0.133 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0987 0.0917 0.139 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0197 0.0839 0.139 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 8.30e-01 0.0258 0.12 0.139 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 8.08e-01 0.0172 0.0704 0.139 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 2.02e-03 -0.28 0.0896 0.139 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0923 0.0967 0.139 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0688 0.125 0.139 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 7.29e-01 0.0392 0.113 0.139 NK L1
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 5.27e-01 0.0618 0.0975 0.139 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.77e-01 0.0264 0.093 0.139 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0815 0.0676 0.139 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000865 0.0902 0.139 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 9.51e-01 0.00814 0.131 0.139 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.58e-01 0.134 0.0945 0.139 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 6.80e-01 0.0422 0.102 0.139 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0584 0.0668 0.139 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.32e-03 0.228 0.0767 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 8.71e-01 0.0237 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 7.91e-01 0.037 0.139 0.14 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 6.06e-01 0.0753 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 5.81e-01 0.0729 0.132 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0929 0.113 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0501 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 3.04e-01 0.146 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 6.38e-01 0.0607 0.129 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0618 0.111 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 1.06e-01 0.194 0.12 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 4.29e-01 -0.081 0.102 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 2.74e-02 0.275 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0167 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 7.34e-01 0.0425 0.125 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0439 0.131 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 7.98e-01 0.0291 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 6.69e-01 0.0526 0.123 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0712 0.097 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 8.74e-01 0.0196 0.124 0.14 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 1.77e-01 -0.154 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 9.45e-01 0.00969 0.14 0.14 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 3.43e-01 0.117 0.123 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 2.18e-01 0.132 0.107 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 3.55e-01 0.0917 0.0989 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 2.31e-01 0.083 0.0691 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 2.91e-01 0.137 0.13 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 2.40e-01 -0.111 0.0942 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0593 0.124 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 7.32e-01 0.0415 0.121 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 2.03e-01 0.145 0.113 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 4.02e-01 0.091 0.108 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 5.41e-02 0.153 0.0792 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0527 0.126 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 1.67e-01 -0.178 0.129 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 4.43e-01 0.0909 0.118 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 8.18e-01 0.0288 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 3.45e-01 0.119 0.126 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0342 0.123 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.88e-01 0.147 0.111 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 5.54e-01 0.0666 0.112 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 8.70e-01 0.019 0.116 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 2.20e-01 -0.149 0.121 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 2.33e-01 0.113 0.0944 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 6.26e-01 -0.041 0.0839 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0507 0.0564 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.48e-01 0.0902 0.0958 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 1.60e-01 -0.136 0.0967 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 9.69e-01 0.00467 0.122 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.06e-01 0.157 0.0966 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 2.54e-01 -0.105 0.0919 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0948 0.0706 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 2.97e-01 0.11 0.105 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 2.42e-01 -0.133 0.114 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 2.23e-01 0.165 0.135 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 9.43e-01 0.00756 0.106 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.95e-01 -0.03 0.115 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0894 0.0818 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 8.16e-01 0.0251 0.108 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 4.93e-01 0.0773 0.112 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 8.18e-01 0.0313 0.136 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 9.74e-01 0.00327 0.0989 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0168 0.106 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0112 0.0857 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.68e-01 0.0898 0.0996 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0229 0.12 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 3.23e-01 0.13 0.131 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.07e-01 0.163 0.101 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.18e-01 0.0368 0.102 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0445 0.0533 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 8.29e-01 0.0233 0.108 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 8.91e-01 0.0169 0.123 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 1.82e-01 0.199 0.148 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 4.31e-01 0.086 0.109 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0612 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 5.60e-01 0.0659 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 5.31e-01 0.0727 0.116 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 1.59e-01 -0.173 0.122 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 5.15e-01 0.0872 0.134 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 7.22e-01 0.0447 0.125 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 9.15e-01 0.0139 0.131 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.1 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 7.14e-01 0.0401 0.109 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0659 0.124 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 9.91e-01 0.0016 0.144 0.136 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 8.72e-01 0.0176 0.109 0.136 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 8.68e-01 0.0196 0.118 0.136 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 4.06e-01 0.0719 0.0864 0.136 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.49e-03 0.295 0.0998 0.136 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 3.72e-01 -0.117 0.131 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 9.42e-01 0.00872 0.119 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 3.96e-02 0.227 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0581 0.102 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0503 0.11 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 2.72e-01 0.134 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 5.33e-01 0.0657 0.105 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0256 0.0998 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0945 0.0672 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00584 0.0901 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 1.50e-01 0.2 0.138 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 7.49e-01 0.0417 0.13 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 3.25e-01 0.126 0.128 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0925 0.105 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0223 0.113 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 3.26e-01 -0.123 0.125 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 8.45e-01 0.0211 0.108 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0315 0.111 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0241 0.0715 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 6.38e-01 0.0439 0.0933 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 6.98e-01 0.0558 0.143 0.152 PB L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.67e-01 0.215 0.155 0.152 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 3.88e-01 -0.12 0.138 0.152 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 2.91e-01 -0.102 0.0965 0.152 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 8.05e-01 0.0349 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 1.52e-01 0.152 0.106 0.152 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 1.80e-01 0.192 0.142 0.152 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 9.27e-02 -0.228 0.135 0.141 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 8.67e-01 0.018 0.107 0.141 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.19e-01 0.0455 0.126 0.141 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0676 0.0812 0.141 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 8.17e-01 0.0224 0.0969 0.141 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 1.09e-01 -0.21 0.13 0.139 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0853 0.109 0.139 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0616 0.113 0.139 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.85e-01 -0.127 0.0956 0.139 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0358 0.107 0.139 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388672 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0624 0.123 0.139 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 7.22e-01 0.0457 0.128 0.141 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 6.25e-02 0.226 0.121 0.141 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 1.18e-01 0.186 0.118 0.141 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 4.65e-01 0.1 0.137 0.141 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0476 0.112 0.141 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 2.65e-01 0.133 0.119 0.141 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 8.19e-01 0.0302 0.132 0.141 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 9.14e-01 0.0109 0.101 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 9.78e-01 0.00229 0.0833 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 6.13e-01 0.0615 0.121 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 1.46e-01 0.157 0.108 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.14e-03 -0.293 0.0889 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0449 0.0952 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0564 0.127 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 6.87e-03 -0.309 0.113 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 8.21e-01 0.0221 0.0972 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 1.74e-01 -0.167 0.123 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 3.25e-01 -0.115 0.116 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.66e-02 -0.242 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0833 0.1 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0701 0.135 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 4.37e-02 0.324 0.159 0.127 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.87e-01 0.202 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 3.74e-01 -0.141 0.158 0.127 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0517 0.119 0.127 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 9.88e-01 0.00208 0.138 0.127 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 6.04e-01 0.0706 0.136 0.136 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.49e-01 0.161 0.111 0.136 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 9.99e-01 0.000194 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.13e-01 0.0468 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 4.31e-03 -0.328 0.114 0.136 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 9.27e-01 0.0103 0.113 0.136 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 1.99e-01 -0.177 0.137 0.136 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0239 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 4.55e-01 -0.085 0.114 0.14 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 2.49e-01 0.138 0.119 0.14 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00244 0.0901 0.14 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0798 0.108 0.14 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0944 0.0919 0.14 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 5.86e-01 0.0724 0.133 0.14 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 2.62e-02 0.321 0.143 0.13 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0885 0.123 0.13 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0265 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 9.58e-02 0.19 0.113 0.13 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 3.54e-01 0.116 0.124 0.13 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 5.76e-01 0.0821 0.147 0.13 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0981 0.113 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 9.11e-01 0.0138 0.123 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0526 0.11 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 1.34e-01 0.17 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0337 0.0788 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 2.75e-01 0.142 0.13 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0684 0.111 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 3.76e-01 0.114 0.128 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 6.12e-01 0.0585 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 1.42e-01 0.158 0.107 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 3.42e-01 0.0874 0.0918 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.86e-01 0.0852 0.0642 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 336327 sc-eQTL 5.98e-01 0.0713 0.135 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0979 0.0979 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 356963 sc-eQTL 9.20e-01 0.0116 0.115 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 7.98e-02 -0.162 0.0919 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 9.59e-01 0.00429 0.0831 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0211 0.121 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 4.16e-01 0.0813 0.0997 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 9.55e-04 -0.29 0.0866 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0609 0.0972 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0623 0.13 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 6.72e-01 0.0534 0.126 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 8.11e-01 0.0257 0.108 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 935754 sc-eQTL 2.69e-01 0.132 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 6.63e-01 0.0325 0.0745 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 2.58e-02 -0.242 0.108 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 1.85e-01 -0.124 0.0935 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 935777 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0369 0.132 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854816 sc-eQTL 5.58e-01 0.0686 0.117 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 493245 sc-eQTL 4.29e-01 0.0789 0.0997 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 640064 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0279 0.0975 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599580 sc-eQTL 1.62e-01 -0.088 0.0626 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253677 sc-eQTL 8.47e-01 0.0175 0.091 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 253677 eQTL 0.0306 -0.0651 0.0301 0.00129 0.0 0.151
ENSG00000218565 AL592429.1 290307 eQTL 0.0318 0.0629 0.0292 0.0 0.0 0.151

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 CITED2 253677 4.04e-06 2.6e-06 2.43e-07 1.74e-06 3.73e-07 8.16e-07 1.36e-06 3.95e-07 1.77e-06 7.72e-07 1.92e-06 1.45e-06 3.53e-06 1.15e-06 8.27e-07 1.1e-06 9.43e-07 1.55e-06 5.55e-07 7.68e-07 6.27e-07 1.96e-06 1.68e-06 9.28e-07 2.58e-06 1.02e-06 1.1e-06 1.06e-06 1.63e-06 1.61e-06 1.18e-06 2.62e-07 3.7e-07 1.2e-06 9.09e-07 5.35e-07 6.87e-07 3.1e-07 7.85e-07 2.57e-07 3.03e-07 3.03e-06 4.96e-07 3.39e-08 4.11e-07 3.28e-07 2.71e-07 1.42e-07 1.82e-07