logo

Genes within 1Mb (chr6:139627910:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.99e-01 -0.027 0.106 0.141 B L1
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 6.79e-01 0.0427 0.103 0.141 B L1
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 3.51e-02 0.191 0.0899 0.141 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 7.70e-01 0.0156 0.0534 0.141 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 2.49e-01 0.151 0.13 0.141 B L1
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0526 0.0823 0.141 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 5.95e-02 0.172 0.0908 0.141 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0942 0.117 0.141 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 1.52e-01 0.14 0.0975 0.141 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 2.03e-01 -0.098 0.0767 0.141 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0884 0.0562 0.141 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 6.94e-01 0.038 0.0964 0.141 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 1.05e-01 -0.154 0.0945 0.141 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 2.71e-01 0.139 0.126 0.141 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 4.12e-01 0.0743 0.0904 0.141 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 4.70e-01 0.0616 0.0851 0.141 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0477 0.0484 0.141 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 5.47e-01 0.0555 0.092 0.141 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0145 0.112 0.141 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 2.63e-01 0.142 0.126 0.135 DC L1
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 3.70e-01 0.0936 0.104 0.135 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 2.44e-02 0.26 0.115 0.135 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 2.16e-01 0.127 0.102 0.135 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0265 0.101 0.135 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.25e-01 0.118 0.119 0.135 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0395 0.121 0.135 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 2.54e-01 -0.105 0.092 0.141 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0416 0.0841 0.141 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 8.57e-01 0.0217 0.121 0.141 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 7.18e-01 0.0256 0.0706 0.141 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.19e-03 -0.268 0.09 0.141 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0961 0.097 0.141 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0788 0.125 0.141 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 6.84e-01 0.0462 0.113 0.142 NK L1
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 5.05e-01 0.0652 0.0977 0.142 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 7.14e-01 0.0342 0.0932 0.142 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0689 0.0678 0.142 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0123 0.0904 0.142 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00185 0.132 0.141 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 1.66e-01 0.132 0.0948 0.141 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.75e-01 0.0429 0.102 0.141 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0524 0.067 0.141 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 2.86e-03 0.232 0.0769 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 8.71e-01 0.0237 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 7.91e-01 0.037 0.139 0.14 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.06e-01 0.0753 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 5.81e-01 0.0729 0.132 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0929 0.113 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0501 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 3.04e-01 0.146 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 6.45e-01 0.0595 0.129 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 5.62e-01 -0.065 0.112 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 8.10e-02 0.21 0.12 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 5.09e-01 -0.068 0.103 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 3.43e-02 0.266 0.125 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0397 0.116 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 7.36e-01 0.0424 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0492 0.131 0.142 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 7.93e-01 0.0299 0.114 0.142 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.71e-01 0.0523 0.123 0.142 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0782 0.0973 0.142 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 7.91e-01 0.033 0.124 0.142 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 1.83e-01 -0.152 0.114 0.142 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 9.75e-01 0.0044 0.14 0.142 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 4.36e-01 0.0958 0.123 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 2.84e-01 0.115 0.107 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 3.55e-01 0.0916 0.0989 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.48e-01 0.1 0.069 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 2.81e-01 0.14 0.129 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 1.98e-01 -0.122 0.0941 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0623 0.124 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.68e-01 0.0357 0.121 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 2.24e-01 0.138 0.113 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 4.10e-01 0.0893 0.108 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.07e-02 0.172 0.0789 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0216 0.126 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 1.12e-01 -0.204 0.128 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 4.24e-01 0.0947 0.118 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.71e-01 0.0366 0.126 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 3.90e-01 0.109 0.127 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0488 0.123 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.87e-01 0.148 0.112 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 5.78e-01 0.0629 0.113 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 9.04e-01 0.0141 0.116 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 1.81e-01 -0.163 0.122 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 2.09e-01 0.119 0.0946 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0343 0.0842 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0455 0.0566 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.95e-01 0.082 0.0962 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 1.32e-01 -0.146 0.0969 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 9.93e-01 0.00112 0.122 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 9.01e-02 0.165 0.0971 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0962 0.0924 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0835 0.071 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.18e-01 0.106 0.106 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 2.00e-01 -0.147 0.114 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 2.12e-01 0.17 0.136 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 9.47e-01 0.0071 0.106 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0235 0.116 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0818 0.0822 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 8.62e-01 0.0188 0.108 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 5.02e-01 0.0761 0.113 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 9.68e-01 0.00539 0.136 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00021 0.099 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0117 0.106 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0175 0.0858 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.90e-01 0.0859 0.0997 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0266 0.12 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 3.74e-01 0.117 0.131 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 9.80e-02 0.168 0.101 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.78e-01 0.0423 0.102 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0465 0.0533 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 8.57e-01 0.0195 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 8.34e-01 0.0259 0.124 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 1.97e-01 0.193 0.149 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 4.32e-01 0.086 0.109 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0469 0.114 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 5.18e-01 0.0733 0.113 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 6.24e-01 0.0571 0.116 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 1.62e-01 -0.171 0.122 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 4.31e-01 0.106 0.134 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 7.19e-01 0.0454 0.126 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 9.67e-01 0.00546 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 2.56e-01 -0.115 0.101 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 7.07e-01 0.0414 0.11 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0813 0.125 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 9.50e-01 0.00903 0.144 0.139 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 8.60e-01 0.0193 0.109 0.139 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 8.08e-01 0.0286 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.43e-01 0.0822 0.0865 0.139 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.74e-03 0.293 0.1 0.139 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 2.91e-01 -0.139 0.131 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 8.27e-01 0.026 0.119 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 3.06e-02 0.239 0.11 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0444 0.102 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0741 0.11 0.144 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 2.09e-01 0.154 0.122 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 5.34e-01 0.0656 0.105 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0215 0.0999 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0927 0.0674 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0194 0.0902 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 1.29e-01 0.211 0.139 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 7.13e-01 0.0481 0.13 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 2.34e-01 0.153 0.128 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0784 0.106 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0244 0.113 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 2.52e-01 -0.144 0.125 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 7.90e-01 0.0288 0.108 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0252 0.111 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0181 0.0718 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 7.14e-01 0.0344 0.0937 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.09e-01 0.0535 0.143 0.156 PB L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 2.07e-01 0.196 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 3.18e-01 -0.138 0.137 0.156 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 2.56e-01 -0.11 0.0961 0.156 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 9.09e-01 0.0162 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 1.67e-01 0.147 0.105 0.156 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 1.76e-01 0.193 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.69e-02 -0.241 0.136 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 8.95e-01 0.0142 0.108 0.143 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 7.69e-01 0.0373 0.127 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0574 0.0817 0.143 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 8.82e-01 0.0144 0.0974 0.143 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 1.26e-01 -0.201 0.131 0.141 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0832 0.109 0.141 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0411 0.113 0.141 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 2.31e-01 -0.115 0.0961 0.141 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 6.03e-01 -0.056 0.108 0.141 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 388257 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0347 0.123 0.141 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 8.68e-01 0.0213 0.128 0.144 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 5.35e-02 0.235 0.121 0.144 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 8.86e-02 0.203 0.119 0.144 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 5.28e-01 0.0871 0.138 0.144 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0434 0.113 0.144 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.63e-01 0.109 0.119 0.144 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 8.32e-01 0.0281 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 9.89e-01 0.00133 0.101 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0178 0.0835 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 6.34e-01 0.058 0.122 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 1.06e-01 0.175 0.108 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.98e-03 -0.28 0.0893 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0501 0.0955 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0603 0.127 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.97e-03 -0.304 0.113 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 9.70e-01 0.00371 0.0974 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.123 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 3.17e-01 -0.117 0.117 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 2.04e-02 -0.234 0.1 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.25e-01 -0.099 0.1 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0717 0.135 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 5.49e-02 0.308 0.159 0.13 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 1.64e-01 0.213 0.152 0.13 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 4.12e-01 -0.13 0.158 0.13 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0355 0.119 0.13 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 9.19e-01 0.014 0.138 0.13 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 5.80e-01 0.0754 0.136 0.138 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 1.90e-01 0.146 0.111 0.138 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 8.81e-01 0.0184 0.123 0.138 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.60e-01 0.056 0.127 0.138 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 6.40e-03 -0.314 0.114 0.138 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 8.94e-01 0.015 0.113 0.138 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 1.58e-01 -0.195 0.137 0.138 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0455 0.125 0.143 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0938 0.114 0.143 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 2.78e-01 0.13 0.119 0.143 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 9.55e-01 0.0051 0.0902 0.143 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0817 0.109 0.143 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0891 0.092 0.143 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 5.26e-01 0.0843 0.133 0.143 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 3.07e-02 0.312 0.143 0.133 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0559 0.123 0.133 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 8.18e-01 -0.026 0.112 0.133 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 1.00e-01 0.187 0.113 0.133 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.21e-01 0.124 0.124 0.133 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 6.60e-01 0.0644 0.146 0.133 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0973 0.113 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 8.55e-01 0.0226 0.124 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0567 0.11 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 1.29e-01 0.173 0.113 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0357 0.079 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 2.22e-01 0.16 0.13 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0716 0.111 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 3.49e-01 0.121 0.129 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.57e-01 0.0356 0.115 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 1.76e-01 0.146 0.107 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 3.68e-01 0.0826 0.0916 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.03e-01 0.105 0.064 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 335912 sc-eQTL 4.54e-01 0.101 0.135 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 2.49e-01 -0.113 0.0976 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 356548 sc-eQTL 9.56e-01 0.00638 0.115 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.68e-02 -0.164 0.0921 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 8.29e-01 -0.018 0.0832 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0334 0.122 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 3.48e-01 0.094 0.0999 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.48e-03 -0.28 0.0869 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0673 0.0974 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0653 0.131 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 7.73e-01 0.0366 0.126 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 8.64e-01 0.0185 0.108 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 935339 sc-eQTL 2.33e-01 0.143 0.12 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 6.15e-01 0.0376 0.0746 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 3.06e-02 -0.235 0.108 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 2.01e-01 -0.12 0.0938 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 935362 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0448 0.133 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 854401 sc-eQTL 5.17e-01 0.076 0.117 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 492830 sc-eQTL 4.33e-01 0.0785 0.0999 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 639649 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0169 0.0978 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 599165 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0818 0.0629 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 253262 sc-eQTL 9.54e-01 0.00522 0.0912 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000164442 CITED2 253262 eQTL 0.0281 -0.0662 0.0301 0.00135 0.0 0.151
ENSG00000218565 AL592429.1 289892 eQTL 0.0372 0.0611 0.0293 0.0 0.0 0.151

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000164442 CITED2 253262 1.24e-06 1.08e-06 3.25e-07 1.16e-06 2.98e-07 5.96e-07 1.6e-06 3.54e-07 1.42e-06 4.32e-07 1.84e-06 6.63e-07 2.27e-06 2.77e-07 5.08e-07 8.11e-07 8.9e-07 6.8e-07 8.01e-07 6.84e-07 5.61e-07 1.35e-06 8.76e-07 6.54e-07 2.18e-06 3.91e-07 7.73e-07 7.01e-07 1.29e-06 1.25e-06 7.05e-07 1.3e-07 2.16e-07 6.99e-07 5.3e-07 4.59e-07 5.22e-07 1.66e-07 3.43e-07 2.93e-07 2.82e-07 1.62e-06 5.66e-08 7.3e-08 1.74e-07 1.17e-07 1.93e-07 7.75e-08 9.13e-08