logo

Genes within 1Mb (chr6:139626381:C:CTCT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.86e-01 0.0152 0.106 0.132 B L1
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 3.67e-01 0.0929 0.103 0.132 B L1
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 8.87e-01 0.013 0.0911 0.132 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 8.45e-01 0.0105 0.0535 0.132 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 4.31e-01 0.103 0.131 0.132 B L1
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 4.11e-01 0.0679 0.0825 0.132 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 4.25e-01 0.0733 0.0917 0.132 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0364 0.116 0.132 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 3.34e-01 0.0934 0.0965 0.132 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0212 0.0761 0.132 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 3.93e-02 0.115 0.0552 0.132 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 5.20e-01 0.0613 0.0952 0.132 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 9.87e-01 0.00156 0.0939 0.132 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 1.66e-01 -0.176 0.126 0.132 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 3.47e-01 0.0856 0.0907 0.132 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.92e-01 0.0459 0.0855 0.132 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 2.55e-01 0.0554 0.0486 0.132 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 2.80e-01 0.0999 0.0922 0.132 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 8.73e-01 0.0179 0.112 0.132 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 6.35e-01 0.0606 0.127 0.133 DC L1
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 8.38e-01 0.0215 0.105 0.133 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 8.94e-01 0.0156 0.117 0.133 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 2.36e-01 0.122 0.103 0.133 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 7.25e-01 0.0356 0.101 0.133 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 1.00e-01 -0.197 0.119 0.133 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 5.36e-01 0.0757 0.122 0.133 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0918 0.0918 0.132 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.54e-01 0.119 0.0835 0.132 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 1.19e-01 0.187 0.12 0.132 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 6.36e-01 0.0334 0.0703 0.132 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.30e-01 0.139 0.0911 0.132 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 1.10e-02 -0.245 0.0954 0.132 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 5.93e-01 0.067 0.125 0.132 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 2.39e-02 0.253 0.111 0.131 NK L1
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 8.15e-02 0.169 0.0964 0.131 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 6.42e-01 0.043 0.0924 0.131 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 3.08e-02 0.145 0.0668 0.131 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 6.78e-01 0.0373 0.0897 0.131 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 1.87e-01 0.176 0.133 0.132 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.33e-01 -0.145 0.0962 0.132 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.46e-01 0.0629 0.104 0.132 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.00e-01 0.112 0.0677 0.132 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0173 0.0798 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.81e-01 0.0218 0.146 0.14 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 3.26e-01 0.136 0.138 0.14 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 1.27e-01 0.221 0.144 0.14 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0141 0.131 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 3.79e-02 0.232 0.111 0.14 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 8.35e-01 0.0295 0.142 0.14 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 3.40e-01 0.135 0.141 0.14 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 6.94e-01 0.0513 0.13 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.09e-01 0.142 0.112 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 6.92e-01 0.0482 0.122 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.104 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0729 0.127 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 4.45e-01 0.0893 0.117 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 2.23e-01 0.154 0.126 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 1.30e-01 0.2 0.132 0.134 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 7.75e-01 0.0328 0.115 0.134 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 9.10e-01 0.0141 0.124 0.134 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 8.65e-01 0.0168 0.0982 0.134 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 2.85e-01 -0.134 0.125 0.134 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0669 0.115 0.134 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 2.62e-01 0.158 0.141 0.134 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 7.21e-01 0.0443 0.124 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.27e-01 0.165 0.107 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.36e-01 0.0619 0.0999 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0157 0.0699 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00474 0.131 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 6.36e-01 0.0452 0.0952 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0372 0.125 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0764 0.121 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 7.59e-01 0.0351 0.114 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0667 0.109 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 6.69e-01 0.0344 0.0803 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 7.99e-02 0.222 0.126 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 7.46e-01 -0.042 0.13 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 3.67e-01 0.107 0.119 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.21e-01 0.0285 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.91e-01 0.135 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 1.63e-01 -0.173 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 3.67e-01 0.102 0.113 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 6.98e-01 0.044 0.113 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0145 0.117 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0672 0.122 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 3.16e-01 0.0949 0.0944 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0153 0.0839 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.54e-01 0.0804 0.0562 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 5.15e-01 0.0626 0.0959 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 4.95e-01 0.0663 0.097 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 5.94e-01 0.0638 0.12 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 7.66e-01 0.0286 0.0957 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.40e-01 0.0556 0.0907 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 4.92e-02 0.137 0.0691 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0266 0.104 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0142 0.112 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0148 0.135 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 7.41e-01 0.0348 0.105 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0681 0.114 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 8.69e-02 0.139 0.081 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 2.03e-01 -0.136 0.107 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 1.87e-01 -0.148 0.112 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 3.35e-01 0.132 0.137 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.85e-01 0.107 0.0997 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0117 0.107 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 2.32e-01 0.103 0.0863 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0162 0.101 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0328 0.121 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 1.94e-01 -0.173 0.133 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 4.30e-01 0.0811 0.103 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 9.07e-02 0.174 0.102 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.12e-02 0.136 0.0532 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 1.09e-01 0.175 0.109 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 8.46e-01 0.0243 0.125 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 5.96e-01 -0.077 0.145 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.78e-01 0.115 0.106 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0472 0.11 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 2.94e-01 0.115 0.11 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0112 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 3.74e-01 0.106 0.119 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00408 0.138 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 4.88e-01 0.0895 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 8.43e-01 0.0266 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.86e-01 0.137 0.103 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 7.56e-01 0.035 0.112 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 4.19e-01 0.104 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 5.54e-01 0.0873 0.147 0.13 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0919 0.112 0.13 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.97e-01 0.0637 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 6.75e-01 0.0372 0.0886 0.13 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0533 0.104 0.13 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 2.38e-01 0.159 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 3.13e-01 0.123 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 7.03e-02 -0.205 0.113 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 6.75e-01 0.0439 0.105 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 5.77e-01 0.0628 0.112 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 2.11e-01 0.151 0.121 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 9.42e-02 0.174 0.104 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 9.93e-02 0.163 0.0982 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.39e-02 0.164 0.066 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 9.89e-01 0.00127 0.0893 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 1.28e-01 0.214 0.14 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 4.94e-01 0.0901 0.131 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0572 0.13 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 2.13e-01 0.133 0.106 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000235 0.114 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.68e-02 0.212 0.123 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.80e-01 0.115 0.106 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0418 0.11 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 4.03e-01 0.0593 0.0708 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 7.42e-01 0.0306 0.0926 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 3.03e-01 0.147 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00486 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0268 0.138 0.156 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 2.51e-01 0.111 0.0962 0.156 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 3.29e-01 0.138 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 1.65e-01 -0.148 0.105 0.156 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 1.53e-01 0.203 0.141 0.156 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 7.48e-02 0.242 0.135 0.133 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 4.07e-01 -0.089 0.107 0.133 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 3.97e-01 -0.107 0.126 0.133 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.17e-01 0.127 0.0809 0.133 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0423 0.0969 0.133 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 1.93e-01 0.17 0.13 0.132 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 8.77e-01 0.0168 0.109 0.132 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000265 0.112 0.132 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.99e-02 0.222 0.0945 0.132 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0629 0.107 0.132 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 386728 sc-eQTL 4.61e-01 -0.09 0.122 0.132 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 3.44e-01 -0.121 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0534 0.121 0.137 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 5.10e-01 0.0783 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0333 0.137 0.137 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 7.60e-01 0.0343 0.112 0.137 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 3.19e-01 -0.118 0.119 0.137 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 8.30e-01 0.0282 0.131 0.137 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.58e-01 0.0179 0.1 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.63e-01 0.115 0.0824 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 1.32e-01 0.181 0.12 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 8.22e-01 0.0243 0.108 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.95e-01 0.117 0.0902 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 1.51e-02 -0.229 0.0934 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00239 0.126 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0246 0.115 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 3.83e-01 0.085 0.0973 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 1.88e-01 0.162 0.123 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00412 0.117 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.20e-01 0.158 0.101 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 2.92e-01 -0.106 0.1 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 8.48e-01 -0.026 0.135 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0416 0.155 0.127 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.70e-01 -0.162 0.147 0.127 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.94e-01 0.0813 0.152 0.127 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.127 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 3.57e-01 0.122 0.132 0.127 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 1.49e-01 -0.191 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 5.04e-01 0.0729 0.109 0.131 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 1.83e-01 0.16 0.12 0.131 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0316 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.31e-01 0.171 0.113 0.131 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 1.61e-01 -0.154 0.109 0.131 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 3.49e-01 0.126 0.134 0.131 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 7.64e-01 0.0377 0.126 0.127 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.04e-01 0.186 0.114 0.127 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 3.27e-01 0.118 0.12 0.127 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 2.07e-01 0.115 0.0906 0.127 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 6.45e-02 0.202 0.109 0.127 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 5.42e-02 -0.178 0.0921 0.127 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0198 0.134 0.127 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 2.37e-01 0.17 0.143 0.138 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.07e-01 0.196 0.121 0.138 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 6.59e-01 0.0491 0.111 0.138 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 3.64e-01 0.102 0.112 0.138 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 5.95e-01 0.0655 0.123 0.138 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 2.59e-01 -0.164 0.144 0.138 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 3.85e-01 0.0971 0.112 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 9.37e-02 0.209 0.124 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.83e-01 0.119 0.111 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 4.44e-01 0.0883 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 8.92e-01 0.0109 0.08 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0414 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 5.35e-01 0.0697 0.112 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 2.36e-01 0.155 0.13 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0275 0.116 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.54e-01 0.155 0.108 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 5.87e-01 0.0505 0.0928 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 6.75e-01 0.0274 0.0651 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 334383 sc-eQTL 6.63e-01 0.0595 0.136 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 9.99e-01 0.000168 0.0991 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 355019 sc-eQTL 9.95e-01 0.00073 0.116 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0203 0.0922 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 2.35e-01 0.0983 0.0824 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 1.18e-01 0.188 0.12 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00654 0.0995 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.36e-01 0.132 0.088 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 6.30e-02 -0.18 0.0961 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 9.95e-01 0.000865 0.13 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 2.79e-01 -0.136 0.125 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.64e-01 0.149 0.106 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 933810 sc-eQTL 2.35e-01 0.141 0.119 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 7.82e-01 0.0205 0.0741 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.34e-01 0.162 0.108 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 6.10e-02 -0.174 0.0926 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 933833 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.131 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 852872 sc-eQTL 2.65e-02 0.257 0.115 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 491301 sc-eQTL 1.12e-01 0.157 0.0988 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 638120 sc-eQTL 3.37e-01 0.0932 0.0969 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 597636 sc-eQTL 1.01e-02 0.16 0.0617 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 251733 sc-eQTL 9.07e-01 0.0106 0.0905 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135597 REPS1 638120 eQTL 0.0379 -0.0522 0.0251 0.0014 0.0 0.123
ENSG00000164442 CITED2 251733 eQTL 0.0329 -0.0716 0.0335 0.00115 0.0 0.123

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000231329 \N 386728 1.29e-06 1.08e-06 6.28e-08 2.96e-07 1.07e-07 3.24e-07 7e-07 5.33e-08 3.82e-07 1.11e-07 1.38e-06 3.91e-07 1.55e-06 1.84e-07 4.91e-07 1.46e-07 9.53e-08 3.79e-07 7.53e-08 4.95e-08 1.33e-07 5.5e-07 3.69e-07 3.23e-08 8.09e-07 1.51e-07 1.48e-07 1.54e-07 3.86e-07 2.52e-07 4.48e-07 3.52e-08 3.26e-08 9.76e-08 4.41e-08 3.76e-08 5.01e-08 9.49e-08 6.33e-08 4.19e-08 4.36e-08 3.87e-06 5.21e-08 7.61e-09 5.19e-08 1.55e-08 1.24e-07 4.7e-09 4.77e-08