logo

Genes within 1Mb (chr6:139620433:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 6.54e-01 0.0619 0.138 0.075 B L1
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0802 0.134 0.075 B L1
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 2.13e-01 -0.148 0.118 0.075 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 4.78e-01 0.0496 0.0697 0.075 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 4.59e-01 -0.127 0.171 0.075 B L1
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0993 0.107 0.075 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 9.97e-01 0.00051 0.12 0.075 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 4.02e-01 -0.127 0.151 0.075 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 7.64e-01 0.0378 0.126 0.075 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.70e-01 0.136 0.0987 0.075 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 9.81e-01 0.00175 0.0727 0.075 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0999 0.124 0.075 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 1.01e-01 0.2 0.122 0.075 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00144 0.164 0.075 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0565 0.117 0.075 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0929 0.11 0.075 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0357 0.0627 0.075 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 1.16e-01 -0.187 0.118 0.075 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 6.17e-01 0.0725 0.145 0.075 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0317 0.158 0.079 DC L1
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 3.68e-01 0.117 0.13 0.079 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 1.30e-01 0.219 0.144 0.079 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 6.78e-01 0.0533 0.128 0.079 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.79e-01 -0.111 0.125 0.079 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 5.19e-02 -0.289 0.148 0.079 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 3.76e-01 0.134 0.151 0.079 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0118 0.119 0.075 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 1.03e-01 0.176 0.108 0.075 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 7.68e-01 0.0458 0.155 0.075 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.13e-01 0.143 0.0902 0.075 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 8.74e-02 0.201 0.117 0.075 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 1.81e-01 -0.167 0.124 0.075 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 8.84e-02 0.274 0.16 0.075 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 6.99e-01 0.0563 0.145 0.075 NK L1
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 4.93e-01 0.086 0.125 0.075 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.94e-01 0.155 0.119 0.075 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.80e-01 0.117 0.0869 0.075 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 5.18e-01 0.075 0.116 0.075 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 8.96e-03 -0.448 0.17 0.075 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 2.99e-01 0.13 0.125 0.075 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 5.63e-02 0.256 0.133 0.075 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.49e-01 0.0824 0.0879 0.075 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0498 0.103 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 2.26e-01 -0.246 0.203 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0301 0.194 0.066 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.17e-02 -0.508 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00699 0.184 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0803 0.157 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 9.70e-01 0.00757 0.198 0.066 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0594 0.198 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 6.20e-01 -0.086 0.173 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0563 0.15 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 4.39e-01 -0.126 0.162 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0247 0.138 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 4.43e-01 0.13 0.169 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 8.78e-01 0.0238 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 8.92e-01 0.0229 0.168 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0286 0.177 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 2.00e-01 0.196 0.153 0.073 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 9.23e-01 0.0162 0.166 0.073 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.21e-01 0.0651 0.131 0.073 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 4.57e-01 0.125 0.168 0.073 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0763 0.154 0.073 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 9.91e-01 0.00217 0.189 0.073 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 2.55e-01 -0.19 0.166 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 2.68e-01 -0.161 0.145 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 9.25e-01 0.0127 0.135 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0312 0.0941 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 1.95e-01 -0.228 0.176 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0972 0.128 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 5.49e-01 -0.101 0.168 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 9.14e-01 -0.018 0.166 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 2.03e-01 0.199 0.156 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 2.29e-01 -0.179 0.149 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.60e-01 0.154 0.109 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 5.19e-01 -0.112 0.174 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 1.60e-01 -0.249 0.177 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0383 0.163 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 1.61e-01 -0.233 0.166 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 2.49e-01 0.194 0.168 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 6.75e-01 0.0686 0.163 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.42e-01 0.0694 0.149 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 8.08e-01 0.0365 0.15 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 2.16e-01 0.191 0.154 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 1.87e-01 -0.211 0.159 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 9.07e-01 0.0146 0.124 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.17e-01 0.172 0.11 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0964 0.0739 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 2.38e-01 -0.149 0.126 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0604 0.127 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 5.26e-01 0.099 0.156 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 4.42e-01 0.0959 0.125 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0336 0.118 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 5.25e-01 0.0579 0.0909 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 1.96e-01 -0.175 0.135 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 5.38e-02 0.281 0.145 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 1.43e-01 -0.26 0.177 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 8.82e-01 0.0206 0.139 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 3.58e-01 0.139 0.151 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.02e-01 -0.111 0.107 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 8.63e-01 0.0244 0.141 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 1.54e-01 0.211 0.147 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0983 0.177 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 5.61e-01 0.0752 0.129 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 5.91e-02 0.26 0.137 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0241 0.112 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0342 0.13 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 7.01e-01 -0.06 0.156 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 2.28e-01 0.202 0.167 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0683 0.129 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 8.59e-02 -0.223 0.129 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0445 0.0681 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 1.22e-01 -0.213 0.137 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 7.10e-01 0.0586 0.158 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 1.65e-01 -0.269 0.193 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0763 0.142 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 2.66e-01 0.164 0.147 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.25e-01 0.0718 0.147 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0216 0.151 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 3.09e-01 0.162 0.159 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 1.99e-01 -0.229 0.177 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0732 0.167 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 4.05e-01 -0.145 0.173 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.69e-01 0.0572 0.134 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 4.95e-01 0.0992 0.145 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 4.60e-01 0.122 0.165 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 5.51e-02 -0.361 0.187 0.076 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 7.39e-01 0.048 0.144 0.076 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.13e-01 0.245 0.154 0.076 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.52e-01 -0.106 0.113 0.076 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0457 0.134 0.076 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 3.10e-02 0.361 0.166 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 6.28e-01 0.0741 0.152 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 4.30e-01 -0.112 0.142 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.27e-02 0.325 0.129 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 6.13e-01 0.0713 0.141 0.078 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 5.15e-01 -0.102 0.156 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 5.75e-01 0.0754 0.134 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 4.51e-01 0.096 0.127 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.65e-01 0.0782 0.0861 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 4.24e-01 0.0919 0.115 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 5.36e-01 -0.111 0.179 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 1.06e-01 0.27 0.166 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 5.25e-01 0.105 0.165 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 2.15e-01 -0.169 0.135 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 3.94e-01 0.124 0.145 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 5.17e-01 -0.104 0.161 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 3.11e-01 0.141 0.138 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.35e-01 0.214 0.143 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.75e-01 0.125 0.0919 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 7.04e-01 0.0458 0.12 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 6.82e-01 0.0765 0.186 0.078 PB L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 3.13e-01 0.205 0.202 0.078 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 6.88e-01 0.0726 0.18 0.078 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 4.91e-01 0.087 0.126 0.078 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0249 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 5.65e-02 -0.263 0.137 0.078 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 8.43e-01 -0.037 0.186 0.078 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 3.99e-01 -0.15 0.178 0.076 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 9.36e-02 0.235 0.139 0.076 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 8.64e-01 0.0283 0.165 0.076 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 7.12e-02 0.192 0.106 0.076 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 8.38e-01 0.0259 0.127 0.076 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 3.42e-01 0.16 0.168 0.075 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 4.34e-01 0.109 0.139 0.075 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.10e-01 0.23 0.144 0.075 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.09e-01 0.197 0.122 0.075 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0672 0.137 0.075 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 sc-eQTL 5.35e-01 0.0974 0.157 0.075 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 4.89e-01 -0.111 0.159 0.08 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 8.63e-01 0.0263 0.152 0.08 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 7.20e-01 0.0533 0.148 0.08 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 7.69e-01 0.0504 0.171 0.08 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0675 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0691 0.148 0.08 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 4.98e-01 0.111 0.164 0.08 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 8.41e-01 -0.026 0.129 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 3.16e-01 0.107 0.107 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 9.43e-01 0.0111 0.156 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.99e-01 0.178 0.138 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 2.95e-02 0.253 0.115 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 2.13e-02 0.373 0.161 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 3.56e-01 0.138 0.149 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 1.90e-01 0.165 0.126 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 7.76e-01 0.0456 0.16 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.17e-01 0.237 0.151 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.80e-01 0.116 0.131 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 3.51e-01 -0.121 0.13 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 2.78e-01 0.19 0.175 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 9.68e-01 0.00872 0.215 0.058 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 1.61e-01 0.286 0.203 0.058 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 7.08e-01 0.0794 0.212 0.058 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.61e-01 -0.145 0.159 0.058 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 7.86e-01 0.0498 0.184 0.058 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 3.13e-01 -0.172 0.17 0.078 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 1.95e-01 0.181 0.139 0.078 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 1.84e-01 0.205 0.154 0.078 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00768 0.159 0.078 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.30e-01 0.22 0.145 0.078 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 1.03e-01 -0.229 0.14 0.078 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0798 0.173 0.078 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 1.00e+00 -2.5e-05 0.158 0.077 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 1.00e-02 0.369 0.142 0.077 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 3.84e-01 -0.132 0.151 0.077 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.114 0.077 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.72e-02 0.251 0.136 0.077 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 9.94e-02 -0.192 0.116 0.077 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0833 0.168 0.077 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 5.85e-02 0.39 0.205 0.062 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0185 0.175 0.062 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 5.07e-02 0.312 0.158 0.062 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 3.17e-01 -0.162 0.162 0.062 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.64e-01 0.0771 0.177 0.062 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 7.65e-02 -0.368 0.206 0.062 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 4.38e-01 0.125 0.161 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0086 0.165 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00289 0.147 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 3.06e-01 -0.156 0.152 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 7.90e-01 0.0281 0.105 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 6.84e-01 0.0711 0.174 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 4.45e-01 -0.113 0.148 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 8.07e-01 0.042 0.172 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0702 0.153 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 3.64e-01 -0.13 0.143 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 2.53e-01 -0.14 0.122 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0181 0.0858 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 328435 sc-eQTL 1.81e-01 -0.24 0.179 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0415 0.13 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 349071 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0182 0.153 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 6.48e-01 0.0547 0.12 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 2.89e-01 0.114 0.107 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00602 0.157 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 4.83e-02 0.254 0.128 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 6.96e-02 0.208 0.114 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 2.00e-01 -0.161 0.125 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 2.69e-02 0.371 0.167 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 1.88e-01 -0.211 0.16 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 5.55e-03 0.377 0.134 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 927862 sc-eQTL 1.37e-01 0.226 0.151 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0243 0.0948 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 1.62e-01 0.194 0.138 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 6.80e-02 -0.218 0.119 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 927885 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0958 0.168 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 846924 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0382 0.15 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 485353 sc-eQTL 5.22e-01 0.0823 0.128 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 632172 sc-eQTL 1.46e-01 0.182 0.125 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 591688 sc-eQTL 3.81e-01 0.0709 0.0808 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 245785 sc-eQTL 5.58e-01 0.0686 0.117 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146386 ABRACL 591688 eQTL 0.00305 0.139 0.0469 0.0 0.0 0.0623
ENSG00000231329 AL031772.1 380780 eQTL 0.017 0.0879 0.0368 0.00106 0.0 0.0623

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina