logo

Genes within 1Mb (chr6:139617779:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 5.41e-01 0.0929 0.152 0.06 B L1
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 5.58e-01 0.0866 0.147 0.06 B L1
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 4.19e-01 0.105 0.13 0.06 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0671 0.0764 0.06 B L1
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 4.09e-01 0.155 0.187 0.06 B L1
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.68e-01 0.00473 0.118 0.06 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 2.14e-01 0.163 0.131 0.06 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 7.92e-01 0.0446 0.169 0.06 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.60e-01 0.129 0.141 0.06 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0622 0.111 0.06 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 2.53e-02 0.181 0.0803 0.06 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 8.93e-01 0.0186 0.139 0.06 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 5.57e-01 0.0803 0.137 0.06 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 8.59e-01 0.0326 0.183 0.06 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 5.84e-01 0.072 0.131 0.06 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 1.41e-01 -0.182 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 9.70e-02 0.116 0.0698 0.06 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 3.52e-01 0.124 0.133 0.06 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0551 0.162 0.06 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00335 0.185 0.061 DC L1
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 8.97e-01 0.0197 0.153 0.061 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 5.57e-01 0.1 0.17 0.061 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 7.25e-01 0.0529 0.15 0.061 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0399 0.147 0.061 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 7.06e-01 0.066 0.175 0.061 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 1.88e-01 0.234 0.177 0.061 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0672 0.133 0.06 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 2.98e-02 0.262 0.12 0.06 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 3.65e-01 0.157 0.173 0.06 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 8.46e-01 0.0197 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 4.66e-02 0.262 0.131 0.06 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 2.19e-01 -0.171 0.139 0.06 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 2.84e-01 0.193 0.18 0.06 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 1.29e-03 0.511 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 1.22e-01 0.214 0.138 0.06 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0983 0.132 0.06 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 4.53e-02 0.192 0.0956 0.06 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.97e-01 0.0679 0.128 0.06 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 4.09e-01 0.161 0.194 0.06 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0305 0.141 0.06 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0821 0.151 0.06 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 2.19e-01 0.122 0.0987 0.06 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.22e-01 0.0114 0.116 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 3.68e-01 -0.189 0.209 0.066 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0183 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 2.66e-01 0.233 0.208 0.066 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 9.24e-01 0.0181 0.189 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 3.71e-01 0.145 0.162 0.066 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 4.99e-01 -0.138 0.204 0.066 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 5.05e-01 0.136 0.204 0.066 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 5.99e-01 0.0983 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.09e-01 0.164 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.82e-01 -0.096 0.174 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0351 0.149 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 4.51e-01 -0.137 0.182 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.01e-01 0.113 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 7.91e-02 0.318 0.18 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 4.32e-01 0.149 0.189 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 4.94e-01 0.112 0.164 0.06 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 3.28e-01 0.174 0.177 0.06 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 4.86e-01 0.0979 0.14 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 5.77e-01 -0.1 0.179 0.06 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.11e-01 -0.108 0.165 0.06 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 1.53e-01 0.289 0.201 0.06 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 7.11e-01 0.0658 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 1.11e-01 0.246 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 4.43e-01 0.11 0.143 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 1.48e-01 -0.144 0.0995 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 6.29e-01 0.0906 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 4.59e-01 0.101 0.136 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 6.12e-01 0.0908 0.179 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 8.05e-01 -0.043 0.174 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 5.68e-01 0.0933 0.163 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0501 0.156 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 9.39e-02 -0.192 0.114 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 6.23e-02 0.338 0.18 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.61e-01 -0.108 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 6.72e-02 0.311 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0317 0.187 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 1.83e-01 0.251 0.188 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 2.06e-01 -0.232 0.183 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 8.43e-01 0.0331 0.167 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 7.86e-01 0.0457 0.168 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 4.13e-01 0.142 0.173 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0583 0.177 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.00e-01 0.143 0.137 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.94e-01 0.0652 0.122 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 6.53e-02 0.151 0.0816 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 8.60e-01 0.0247 0.14 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 5.20e-01 0.0909 0.141 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 8.71e-01 0.0283 0.174 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 7.09e-01 0.0521 0.139 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0525 0.132 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 9.95e-02 0.167 0.101 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.99e-01 0.000282 0.151 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 8.90e-01 0.0225 0.163 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 1.78e-01 0.26 0.193 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 4.94e-01 0.103 0.151 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 8.13e-01 0.0388 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 9.38e-03 0.302 0.115 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0883 0.154 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0583 0.161 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 2.04e-01 0.255 0.2 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.22e-01 0.144 0.146 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 1.36e-01 -0.233 0.156 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 8.61e-02 0.217 0.126 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00183 0.147 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 4.39e-01 -0.137 0.176 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 9.19e-01 0.0196 0.193 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 2.92e-01 0.157 0.148 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 2.40e-01 0.175 0.149 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 1.51e-02 0.189 0.0772 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 3.23e-01 0.156 0.158 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0934 0.181 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 8.11e-01 -0.052 0.217 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 8.15e-01 0.0372 0.159 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0726 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0433 0.165 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 4.75e-01 0.121 0.169 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 2.73e-01 0.196 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 4.62e-01 0.147 0.199 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 2.72e-01 0.205 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.37e-01 -0.12 0.194 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 3.58e-01 0.138 0.149 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.65e-01 0.00713 0.163 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 9.20e-01 0.0185 0.185 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 4.48e-01 -0.163 0.214 0.058 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 6.90e-01 0.065 0.163 0.058 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 4.71e-01 -0.127 0.175 0.058 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 1.18e-01 -0.201 0.128 0.058 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0186 0.152 0.058 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 7.34e-03 0.504 0.186 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 1.39e-01 0.254 0.171 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 1.47e-02 -0.389 0.158 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0634 0.148 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 3.16e-01 0.159 0.158 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 9.27e-02 0.291 0.172 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 5.17e-01 0.0967 0.149 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.10e-01 0.0933 0.141 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 6.39e-02 0.177 0.095 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 8.92e-01 0.0174 0.128 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 8.00e-02 0.355 0.202 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 7.96e-01 0.0494 0.19 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 7.01e-03 -0.502 0.184 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 1.35e-02 0.379 0.152 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0785 0.165 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 1.55e-01 0.254 0.178 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 2.21e-03 0.466 0.15 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 9.77e-01 0.00451 0.159 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.102 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 4.36e-01 0.104 0.133 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 5.01e-01 0.138 0.204 0.067 PB L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 1.85e-01 0.294 0.221 0.067 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 1.36e-01 0.294 0.195 0.067 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0777 0.138 0.067 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000303 0.202 0.067 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 6.87e-02 -0.275 0.15 0.067 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 2.43e-01 0.238 0.203 0.067 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 3.02e-01 0.208 0.2 0.059 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.29e-01 -0.154 0.158 0.059 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 7.11e-01 -0.069 0.186 0.059 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 5.51e-02 0.23 0.119 0.059 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 2.60e-01 -0.161 0.143 0.059 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 2.62e-02 0.425 0.19 0.06 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.03e-01 0.164 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 4.75e-01 -0.118 0.165 0.06 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 2.26e-03 0.425 0.137 0.06 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0913 0.157 0.06 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 378126 sc-eQTL 5.19e-01 -0.116 0.179 0.06 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 3.54e-01 -0.173 0.186 0.063 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.063 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 3.45e-01 0.164 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.14e-01 0.131 0.2 0.063 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 8.08e-01 0.0398 0.164 0.063 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.12e-01 0.114 0.174 0.063 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 1.23e-01 0.296 0.191 0.063 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 8.59e-01 0.0258 0.145 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 2.00e-02 0.277 0.118 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 7.03e-01 0.0666 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 6.15e-02 0.244 0.13 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 3.86e-01 -0.119 0.137 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 3.51e-01 0.17 0.182 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 3.53e-01 -0.155 0.167 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 1.92e-01 0.184 0.141 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 4.24e-01 0.143 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.10e-01 -0.111 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 2.24e-01 0.179 0.147 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 7.52e-01 -0.046 0.146 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0984 0.196 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 1.43e-01 0.338 0.23 0.055 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 8.40e-01 0.0444 0.22 0.055 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 4.89e-01 0.157 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 1.99e-01 0.219 0.17 0.055 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 6.56e-01 0.0881 0.197 0.055 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0729 0.197 0.06 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 5.98e-01 0.0851 0.161 0.06 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 8.77e-02 0.303 0.177 0.06 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 8.55e-01 0.0338 0.184 0.06 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 8.43e-03 0.439 0.165 0.06 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 8.24e-02 -0.282 0.162 0.06 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 6.26e-01 0.0973 0.199 0.06 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 7.41e-02 0.318 0.177 0.061 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 4.17e-01 0.132 0.163 0.061 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0318 0.171 0.061 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 6.37e-01 0.0609 0.129 0.061 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 1.91e-01 0.203 0.155 0.061 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 1.95e-02 -0.307 0.13 0.061 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 1.80e-01 0.255 0.189 0.061 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 2.93e-01 0.215 0.204 0.071 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 2.37e-01 0.205 0.172 0.071 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 4.32e-01 0.124 0.158 0.071 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 8.32e-01 0.034 0.16 0.071 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 6.64e-01 0.0761 0.175 0.071 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0249 0.206 0.071 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 2.94e-01 -0.167 0.158 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 4.32e-01 0.141 0.179 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 4.47e-01 0.121 0.159 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 5.37e-01 0.102 0.165 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 5.02e-01 0.0768 0.114 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 2.79e-01 -0.205 0.189 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 8.33e-01 0.0339 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 7.97e-02 0.327 0.186 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 6.71e-01 0.0711 0.167 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 2.36e-01 0.185 0.156 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 3.63e-01 0.121 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 9.37e-02 -0.156 0.0927 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB 325781 sc-eQTL 4.42e-01 0.15 0.195 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00271 0.142 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 346417 sc-eQTL 3.32e-01 0.162 0.166 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0846 0.134 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.67e-02 0.249 0.119 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 6.39e-01 0.0822 0.175 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00645 0.144 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 6.91e-02 0.232 0.127 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0947 0.14 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 7.10e-01 0.0699 0.188 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 3.57e-01 0.167 0.18 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 3.34e-01 0.149 0.154 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 925208 sc-eQTL 1.32e-01 0.258 0.171 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 7.44e-01 0.0348 0.107 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 7.93e-02 0.274 0.155 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 1.87e-02 -0.315 0.133 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 925231 sc-eQTL 1.76e-01 0.257 0.189 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 844270 sc-eQTL 4.85e-03 0.465 0.163 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 482699 sc-eQTL 1.79e-01 0.191 0.141 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 629518 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0354 0.139 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 589034 sc-eQTL 1.77e-02 0.211 0.0883 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 243131 sc-eQTL 8.30e-01 0.0278 0.129 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 925208 eQTL 0.0432 0.111 0.0549 0.0 0.0 0.0496

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina